Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07051
- Subject:
- XM_017312657.1
- Aligned Length:
- 1239
- Identities:
- 1069
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ATGGCAGAAGATGCCGGTCTAATTGAAGCCAACGGAGAACTCAAGGTCTTCATAGACCAGAACCTTAGTCCCGG 74
||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGGCAAAAGATGCCAGTCTAATTGAAGCCAACGGAGAACTAAAGGTCTTTATAGACCAGAATCTTAGTCCTGG 74
Query 75 GAAAGGCGTGGTGTCCCTCGTGGCCGTTCACCCCTCCACCGTCAACCCGCTCGGGAAGCAGCTCTTGCCAAAAA 148
||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||.|.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 75 GAAAGGTGTGGTATCTCTTGTAGCCGTCCACCCGTCCACAGTCAACACACTTGGGAAGCAGCTTTTGCCAAAAA 148
Query 149 CCTTTGGACAGTCCAATGTCAACATTGCCCAGCAAGTGGTAATTGGTACGCCTCAGAGACCGGCAGCGTCAAAC 222
||||.|||||||||||||||||.||..|.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 149 CCTTCGGACAGTCCAATGTCAATATCACACAGCAAGTGGTGATTGGCACGCCTCAGAGACCGGCAGCATCCAAC 222
Query 223 ACCCTGGTGGTAGGAAGCCCACACACCCCCAGCACTCACTTTGCCTCTCAGAACCAGCCTTCCGACTCCTCACC 296
||..|.||||||||||||||||||||.||||.|||.||.||||..||.|||||||||.|.||.|||||||||||
Sbjct 223 ACTATTGTGGTAGGAAGCCCACACACTCCCAACACGCATTTTGTGTCACAGAACCAGACGTCTGACTCCTCACC 296
Query 297 TTGGTCTGC------CGGGAAGCGCAACAGGAAAGGAGAGAAGAATGGCAAGGGCCTACGGCATTTCTCCATGA 364
||||||||| |.|||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 297 TTGGTCTGCTGGGCACAGGAAGCGGAACAGGAAGGGCGAGAAGAATGGCAAGGGCCTGCGGCATTTCTCCATGA 370
Query 365 AGGTCTGCGAGAAGGTGCAGAGGAAAGGGACCACTTCCTACAACGAAGTGGCAGACGAGCTGGTTGCGGAGTTC 438
||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 371 AGGTGTGTGAGAAGGTGCAGAGGAAAGGAACCACCTCCTACAATGAGGTGGCTGACGAGCTGGTGGCAGAGTTC 444
Query 439 AGTGCTGCCGACAACCACATCTTACCAAACGAGTCAGCTTATGACCAGAAAAACATAAGACGGCGCGTCTACGA 512
||.|||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||.||||||||
Sbjct 445 AGCGCTGCCGACAACCACATTCTACCAAACGAATCAGCTTATGACCAGAAGAACATCCGGCGGCGTGTCTACGA 518
Query 513 TGCCTTAAACGTGCTAATGGCCATGAACATCATCTCCAAGGAGAAGAAGGAGATCAAGTGGATTGGTCTGCCCA 586
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 519 TGCCTTAAATGTGCTAATGGCCATGAACATCATCTCCAAGGAGAAGAAGGAGATCAAATGGATCGGCCTGCCCA 592
Query 587 CCAACTCGGCTCAGGAATGTCAGAACTTAGAGGTGGAAAGACAGAGGAGACTTGAAAGAATAAAACAGAAACAG 660
|||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.||.||||||||.|||
Sbjct 593 CCAACTCAGCTCAGGAGTGCCAGAACTTAGAGGTAGAGAGGCAGAGGAGGCTGGAGAGGATCAAACAGAAGCAG 666
Query 661 TCTCAACTTCAAGAACTTATTCTACAGCAAATTGCCTTCAAGAACCTGGTGCAGAGAAACCGGCATGCGGAGCA 734
||.||.||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 667 TCACAGCTCCAGGAGCTCATCCTGCAGCAAATTGCCTTCAAGAACTTGGTGCAGAGAAATCGCCAAGCTGAGCA 740
Query 735 GCAGGCCAGCCGGCCACCGCCACCCAACTCAGTCATCCACCTGCCCTTCATCATCGTCAACACCAGCAAGAAGA 808
|||||||.||.||||.||.||.||||||||.|||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||.|||||
Sbjct 741 GCAGGCCCGCAGGCCGCCTCCTCCCAACTCTGTCATCCACTTGCCCTTCATCATTGTCAACACCAGCAGGAAGA 814
Query 809 CGGTCATCGACTGCAGCATCTCCAATGACAAATTTGAGTATCTGTTTAATTTTGACAACACATTTGAAATCCAC 882
|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 815 CAGTCATTGACTGCAGCATCTCCAATGACAAATTTGAGTATCTGTTTAACTTTGACAACACGTTTGAGATCCAC 888
Query 883 GATGACATAGAAGTGCTGAAGCGGATGGGCATGGCTTGCGGGCTGGAGTCGGGGAGCTGCTCTGCCGAAGACCT 956
||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|.|||||||||.||||||||
Sbjct 889 GATGACATTGAGGTGCTCAAGCGCATGGGCATGGCATGTGGGCTGGAGTCTGGCAACTGCTCTGCTGAAGACCT 962
Query 957 TAAAATGGCCAGAAGTCTGGTCCCCAAGGCTCTGGAGCCATACGTGACAGAAATGGCTCAGGGAACTGTTGGAG 1030
.||..|||||||||||.||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|..||||.|
Sbjct 963 CAAGGTGGCCAGAAGTTTGGTACCAAAAGCTCTAGAACCATACGTGACAGAAATGGCTCAGGGATCCATTGGTG 1036
Query 1031 GCGTGTTCATCACGACGGCAGGTTCCACGTCTAACGGCACAAGGTTCTCTGCCAGTGACCTGACCAACGGTGCA 1104
|.||.|||.|||||||..|||||||.||.||.||.|||||||||.|.|||||||||||..|||.|||.||||||
Sbjct 1037 GAGTATTCGTCACGACAACAGGTTCTACATCCAATGGCACAAGGCTTTCTGCCAGTGATTTGAGCAATGGTGCA 1110
Query 1105 GATGGGATGCTGGCCACAAGCTCCAATGGGTCTCAGTACAGCGGCTCCAGGGTGGAGACTCCGGTGTCCTACGT 1178
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 1111 GATGGGATGCTGGCCACGAGCTCCAATGGGTCTCAGTACAGCGGCTCCAGGGTCGAGACCCCTGTGTCCTACGT 1184
Query 1179 CGGGGAGGACGACGAGGAGGACGATGACTTCAACGAGAATGACGACGACGCG--- 1230
.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.|||| |||||||.|.|
Sbjct 1185 TGGGGAGGATGATGACGACGATGATGACTTTAATGAGA---ACGACGAGGAGGAT 1236