Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07125
• Subject: NM_001305678.1
• Aligned Length: 930
• Identities: 674
• Gaps: 177

Alignment

Query   1  ATGAAGGGGCAGCAGAAAACAGCTGAAACGGAAGAGGGGACAGTGCAGATTCAGGAAGGTGCAGTGGCTANTGG  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  GGAAGACCCAACCAGTGTGGCTATTGCCAGCATCCAGTCAGCTGCCACCTTCCCTGACCCCAACGTCAAGTACG  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  TCTTCCGAACTGAGAATGGGGGCCAGGTGATGTACAGGGTGATCCAGGTGTCTGAGGGGCAGCTGGATGGCCAA  222
                                        |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct   1  -----------------------------ATGTACAGGGTGATCCAGGTGTCAGAGGGGCAGCTGGATGGCCAG  45

Query 223  ACTGAGGGAACTGGCGCCATCAGTGGCTACCCTGCCACTCAATCCATGACCCAGGCGGTGATCCAGGGTGCTTT  296
           ||.|||||..||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  46  ACAGAGGGCTCTGGCGCCATCAGTGGTTACCCTGCCACTCAGTCTATGACCCAGGCAGTGATCCAGGGAGCTTT  119

Query 297  CACCAGTGATGATGCAGTTGACACGGAGGGGACAGCTGCTGAGACGCACTATACTTACTTCCCCAGCACGGCAG  370
           |||||||||.|||||.||||||||||||||..|||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 120  CACCAGTGACGATGCCGTTGACACGGAGGGAGCAGCTGCTGAGACACATTATACATATTTCCCCAGCACCGCAG  193

Query 371  TGGGAGATGGGGCAGGGGGTACCACATCGGGGAGTACAGCTGCTGTTGTTACTACCCAGGGCTCAGAGGCACTG  444
           |||||||||||.||||||||||||||||.||||||||..|.|||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 194  TGGGAGATGGGTCAGGGGGTACCACATCTGGGAGTACTACAGCTGTTGTTACCACCCAGGGCTCAGAGGCACTA  267

Query 445  CTGGGGCAGGCGACCCCTCCTGGCACTGGTCAATTCTTTGTGATGATGTCACCACAAGAAGTACTGCAGGGAGG  518
           |||||||||||.|||||.||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 268  CTGGGGCAGGCAACCCCGCCCAGCACAGGTCAATTCTTTGTGATGATGTCACCACAAGAAGTATTGCAGGGAGG  341

Query 519  AAGCCAGCGCTCAATTGCCCCTAGGACTCACCCTTATTCCCCGAAGTCAGAAGCTCCCCGGACGACTCGGGATG  592
           .||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||.||||
Sbjct 342  GAGCCAGCGATCGATTGCCCCCAGGACCCACCCTTATTCCCCGAAGTCAGAGGCTCCCAGGACAACTCGAGATG  415

Query 593  AGAAACGCAGGGCTCAGCATAATGAAGTGGAGCGTCGCCGCCGAGACAAGATCAACAACTGGATCGTGCAGCTC  666
           |||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 416  AGAAACGGAGGGCTCAACATAACGAAGTGGAGCGCCGCCGCCGGGACAAGATCAACAACTGGATTGTACAGCTG  489

Query 667  TCCAAGATAATCCCAGACTGCTCTATGGAGAGCACCAAGTCTGGCCAGAGTAAAGGTGGGATTCTATCCAAAGC  740
           |||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 490  TCCAAAATCATCCCAGACTGCTCTATGGAGAGCACCAAGTCTGGCCAGAGTAAAGGTGGAATCCTGTCCAAAGC  563

Query 741  TTGTGATTATATCCAGGAGCTTCGGCAGAGTAACCACCGCTTGTCTGAAGAACTGCAGGGACTTGACCAACTGC  814
           .||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||..||||||||||.||||||||..|.||.||..|||
Sbjct 564  CTGTGATTATATCCAGGAGCTGCGGCAGAGCAACCACCGGCTGTCTGAAGAGCTGCAGGGGTTAGATCAGTTGC  637

Query 815  AGCTGGACAATGACGTGCTTCGACAACAGGTGGAAGATCTTAAAAACAAGAATCTGCTGCTTCGAGCTCAGTTG  888
           ||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||.|.
Sbjct 638  AGCTGGACAACGATGTGCTCCGGCAACAGGTGGAAGATCTCAAGAACAAGAACCTGCTCCTGCGAGCTCAGCTT  711

Query 889  CGGCACCACGGATTAGAGGTCGTCATCAAGAATGACAGCAAC  930
           ||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 712  CGGCACCACGGACTCGAGGTCGTCATCAAGAATGACAGCAAC  753