Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07166
- Subject:
- NM_011980.3
- Aligned Length:
- 877
- Identities:
- 752
- Gaps:
- 2
Alignment
Query 1 ATGTCACACCTCAGCCAGCAGAAAAT-TTACAGTGGGGAAAACCCCTTTGCCTGTAAGGTATGTGGAAAAGTCT 73
||||||||.|||||||||||||.||| ||| ||.||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||.|||
Sbjct 1 ATGTCACAGCTCAGCCAGCAGAGAATCTTA-AGCGGGGGAAGCCCCTTTGCCTGTAAGGTATGTGGGAAACTCT 73
Query 74 TCAGCCACAAATCAAACCTCACTGAGCATGAGCATTTTCACACGAGAGAGAAACCTTTTGAATGTAACGAGTGT 147
|||||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.|..|||||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 74 TCAGCCACAAATCGAATCTTACAGAGCACGAACATTTCCATAGTAGAGAGAAACCGTTTGAGTGTAACGAGTGC 147
Query 148 GGAAAAGCCTTTAGCCAAAAGCAGTATGTCATTAAACATCAGAACACCCATACTGGCGAGAAGCTTTTCGAATG 221
||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||.|||.||.|..||.||||||||.|||||.||
Sbjct 148 GGGAAAGCCTTTAGCCAGAAACAGTATGTCATCAAGCACCAGAGCACTCACAGCGGAGAGAAGCTATTCGAGTG 221
Query 222 TAATGAATGTGGAAAATCATTTAGCCAGAAGGAAAACCTCCTTACGCACCAGAAAATTCACACTGGAGAAAAAC 295
.|.|||.||.||||||.|.||||||||||||||||||.|.||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 222 CAGTGACTGCGGAAAAGCCTTTAGCCAGAAGGAAAACTTGCTTACGCATCAGAAAATTCACACTGGAGAGAAAC 295
Query 296 CTTTTGAGTGTAAAGATTGCGGGAAAGCTTTCATTCAGAAGTCAAACCTCATCAGACACCAGAGAACTCACACA 369
||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 296 CTTTTGAGTGCAAAGATTGTGGGAAAGCCTTCATTCAGAAGTCAAACCTCATCAGACATCAGAGAACTCACACG 369
Query 370 GGAGAGAAGCCCTTTGTATGTAAGGAGTGTGGAAAAACCTTCAGTGGCAAATCCAACCTTACTGAGCATGAGAA 443
||.|||||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 370 GGGGAGAAGCCCTTCATATGTAAGGAGTGTGGGAAAACCTTCAGTGGCAAATCCAATCTGACGGAGCACGAGAA 443
Query 444 AATCCATATTGGAGAGAAGCCTTTTAAATGTAGTGAATGTGGAACAGCCTTTGGCCAGAAGAAGTACCTCATAA 517
.||.||.||.|||||||||||.||.||.||.|..||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 444 GATTCACATCGGAGAGAAGCCCTTCAAGTGCAACGAGTGCGGAACGGCTTTTGGCCAGAAAAAGTACCTGATAA 517
Query 518 AACATCAGAACATTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAACGAATGTGGAAAAGCCTTCTCTCAGCGAACA 591
|.||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||.||.
Sbjct 518 AGCACCAAAACATCCACACCGGGGAGAAGCCGTACGAGTGCAACGAGTGCGGCAAGGCCTTCTCGCAGCGCACG 591
Query 592 TCACTTATTGTACATGTGAGGATTCATTCAGGTGATAAACCTTACGAATGCAATGTTTGTGGAAAAGCCTTCTC 665
||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 592 TCGCTGATTGTGCATGTGAGAATCCATTCAGGCGATAAGCCTTACGAGTGCAATGTATGTGGGAAAGCCTTCTC 665
Query 666 TCAGAGCTCATCTCTCACTGTGCATGTGAGAAGCCATACAGGGGAGAAGCCCTATGGTTGTAATGAATGTGGGA 739
|||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 666 TCAGAGCTCATCTCTAACCGTGCATGTGAGGAGCCATACGGGTGAGAAACCCTACGGGTGCAATGAATGTGGGA 739
Query 740 AAGCTTTCTCTCAGTTCTCAACCCTTGCTCTGCATTTGAGAATACACACAGGTAAGAAGCCTTATCAGTGCAGT 813
|.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 740 AGGCCTTTTCTCAGTTCTCAACCCTGGCCCTGCATCTGAGAATACACACAGGTAAAAAGCCTTATCAGTGCAGT 813
Query 814 GAATGTGGGAAAGCTTTCAGCCAGAAGTCACACCACATTAGACACCAGAAAATTCATACTCAC 876
||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 814 GAGTGTGGGAAGGCTTTCAGCCAGAAGTCCCATCACATTAGACACCAGAAAATCCATACTCAT 876