Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07177
- Subject:
- XM_005259223.3
- Aligned Length:
- 2223
- Identities:
- 1529
- Gaps:
- 456
Alignment
Query 1 ATGACCACGTTCAAGGAGGCAATGACCTTCAAGGACGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAAGAGCTGGGGCTGCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGACCTTGCTCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGACATC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AAGCATTCCACAGGGATACTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGATTTGGATGATGAAGACAGCAATCCAAAGG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAAGGGAATTCAGGAGACAAGATCCAAACTGAGATGGAGACTGTTTCAGAAGCAGGAACACATCAAGAGTGGTC 296
|..|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||..|.||.
Sbjct 1 ---------------------------ATGGAGATGGAGACTGTTTCAGAATCAGGAACACATGAAGGCTTGTT 47
Query 297 CTTCCAGCAAATCTGGGAAAAAATTGCAAGTGATTTAACCAGGTCTCAAGACTTGGTGATAAATAGCTCTCAGT 370
|...||.||||.|||||||.|||||.|||||||.||||||||||.||||||||...||.||||.||||.|||||
Sbjct 48 CAGTCATCAAACCTGGGAACAAATTTCAAGTGACTTAACCAGGTTTCAAGACTCCATGGTAAACAGCTTTCAGT 121
Query 371 TCTCCAAAGAAGGTGATTTCCCCTGCCAGACTGAGGCAGGACTATCTGTAATTCACACAAGACAGAAATCTTCC 444
||||||||.|||.||||.|.|||||||||..|||.||||||||||||.||||||||..||||||||||.||||.
Sbjct 122 TCTCCAAACAAGATGATATGCCCTGCCAGGTTGATGCAGGACTATCTATAATTCACGTAAGACAGAAACCTTCT 195
Query 445 CAGGGCAATGGA--TATAAACCATCCTTCAGTGATGTCTCCCTCTTTGATTTTCATCAACAATTACACTCAGGA 516
.||||.| ||| |.||||...|||||.||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||.|||.||
Sbjct 196 GAGGGTA--GGACGTGTAAAAAGTCCTTTAGTGATGTCTCCGTCCTTGATCTTCATCAACAACTACAGTCAAGA 267
Query 517 GAGAAATCTCATACGTGTGATGAGTGTGGAAAGAACTTTTGTTACATCTCAGCCCTTCGTATTCATCAGAGAGT 590
|||||.||||||||.||||||||.||||||||||..||.|||||.|.||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 268 GAGAAGTCTCATACATGTGATGAATGTGGAAAGAGTTTCTGTTATAGCTCAGCTCTTCGTATTCATCAGAGAGT 341
Query 591 CCACATGGGAGAGAAATGCTATAAGTGTGACGTGTGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGTTCACATCTGCAAACTC 664
.||||||||.||||||..||||||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||
Sbjct 342 TCACATGGGGGAGAAACTCTATAATTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTCAATCAGAGCTCACATCTGCAAATTC 415
Query 665 ATCAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCGTTCAAATGTGTGGAATGTGGGAAAGGCTTCAGTCGTAGATCAGCA 738
||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||.|.|.||||||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct 416 ATCAGAGAATCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTTAGTCGTAGATCAGGA 489
Query 739 CTTAATGTTCATCACAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGGAATGCGGGAAGGCCTTCATTCA 812
|||.|||||||||..||||||||||||||||.|||||||.|||.|||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct 490 CTTTATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGTGAAACCTCATATTTGTGAGAAATGTGGGAAGGCCTTCATTCA 563
Query 813 CGATTCCCAGCTTCAAGAACATCAGAGAATCCATACGGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGA 886
.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 564 TGATTCCCAGCTTCAGGAACATCAAAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTTGTAAGA 637
Query 887 GCTTCTGTGGTAGATCAAGACTTAATAGGCATTCCATGGTTCACACGGCAGAGAAACCATTCCGATGTGATACG 960
|||||.||.|||||.|||..|||||||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||.||||||||||.
Sbjct 638 GCTTCCGTAGTAGAGCAAATCTTAATAGGCATTCCATGGTTCACATGCGAGAGAAACCATTCAGATGTGATACA 711
Query 961 TGTGATAAGAGCTTTCGTCAGAGATCAGCACTTAATAGTCATCGCATGATCCACACAGGAGAGAAACCATACAA 1034
||||.||||||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..|||||
Sbjct 712 TGTGGTAAGAGCTTTGGTCTGAAATCAGCACTTAATAGTCATCGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACGGTACAA 785
Query 1035 ATGTGAGGAGTGTGGAAAAGGCTTTATTTGTAGGCGAGATCTTTATACGCATCATATGGTCCACACGGGAGAAA 1108
|||||||||.|||||||||.||||.||||.|||||.|||||||||||.||||||.||.|.||||||.||.||.|
Sbjct 786 ATGTGAGGAATGTGGAAAACGCTTCATTTATAGGCAAGATCTTTATAAGCATCAGATAGACCACACAGGGGAGA 859
Query 1109 AGCCATATAATTGTAAAGAGTGTGGGAAGAGCTTCAGATGGGCCTCGTGTCTTTTGAAACATCAGCGAGTCCAC 1182
|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||..||||||..|.||||..||||||||||
Sbjct 860 AGCCATATAATTGTAAAGAATGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAGGTCTTTCAAGACATGTGCGAGTCCAC 933
Query 1183 AGTGGAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAAGGATTTTACACAAATTCACAATGCTATTCCCACCA 1256
||||||||.|.|.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.|||||.|||||
Sbjct 934 AGTGGAGAGACAACATTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACGTTATTCTCACCA 1007
Query 1257 GAGATCCCATAGTGGAGAAAAACCATACAAATGTGTGGAGTGTGGGAAGGGCTACAAAAGGAGGTTGGATCTTG 1330
||||.|.||.|||||||||||.|||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008 GAGAGCGCACAGTGGAGAAAAGCCATATAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACAAAAGGAGGTTGGATCTTG 1081
Query 1331 ACTTTCACCAGCGCGTCCATACAGGAGAGAAACTGTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGTCGGGCC 1404
|||||||.|||.|.|||||.|.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||
Sbjct 1082 ACTTTCATCAGAGGGTCCACAGAGGAGAGAAACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTGGCTGGGCC 1155
Query 1405 CCATGTCTTTTGAAACATGAG----------------------------------------------------- 1425
.|.|||||||||||.|||.||
Sbjct 1156 TCGTGTCTTTTGAATCATCAGAGAATCCACAGTGGAGAAAAACCATTTAAATGTGAAGAATGTGGGAAAAGATT 1229
Query 1426 -------------------------------AGACTCCACAGTGGAGAAAAACCATTCCAATGTGAAGAGTGTG 1468
|||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1230 TACTCAGAATTCACAACTTTATACCCATCGTAGAGTCCACAGTGGAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAGTGTG 1303
Query 1469 GGAAGAGATTTACTCAAAATTCACATCTTCATTCCCATCAGAGAGTTCACACTGGAGAAAAGCCATACAAATGT 1542
||||.|||||||||||.||||||||.|||.||||.||||..|||||.||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1304 GGAAAAGATTTACTCAGAATTCACAACTTTATTCTCATCGCAGAGTCCACACTGGAGTAAAGCCATACAAATGT 1377
Query 1543 GAGAAGTGTGGAAAGGGCTACAATAGTAAGTTTAATCTTGATATGCACCAGAAGGTCCACACAGGAGAGAGACC 1616
||..|||||||.|||||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||
Sbjct 1378 GAAGAGTGTGGGAAGGGCTTCAACAGTAAGTTTAATCTTGACATGCACCAGAGGGTCCACACCGGAGAGAGACC 1451
Query 1617 ATACAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTGGCTGGGCCTCGTGTCTTTTGAAACATCAGAGACTGCACAGTG 1690
.||.||||||||.||||||||||||||||||.||.|||||||..||.|||||||.|||.|||||||.||..|||
Sbjct 1452 TTATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCATGGTG 1525
Query 1691 GAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAAAGATTTACTCAGAATTCACAGCTTCATTCTCATCAAAGA 1764
..|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1526 ATGAAAAGCCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAGAGATTTACTGAGAATTCACAGCTTCATTCCCATCAGAGG 1599
Query 1765 GTGCACACTGGAGAAAAGCCATACAAATGTGATGAGTGTGGGAAGGGCTTCAGCTGGTCCTCAACTCGTCTGAC 1838
||.||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||.|||.|||||||.|||.|||||||||.|||.||
Sbjct 1600 GTTCACACTGGGGAAAAGCCATACAAATGTGAGAAGTGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAACTCATCTAAC 1673
Query 1839 CCATCAGAGACGCCACAGCAGAGAAACACCTCTCAAATGTGAGCAGCATGGGAAGAACATTGTACAGAATTCAT 1912
|||||||||||.||||||.|||||||.||..||..||||||||.|...||||||||.||||||.||.|.|||||
Sbjct 1674 CCATCAGAGACTCCACAGTAGAGAAAAACTACTTCAATGTGAGGACTGTGGGAAGAGCATTGTGCACAGTTCAT 1747
Query 1913 TCTCTAAAGTGCAAGAAAAAGTTCACAGTGTAGAAAAGCCATACAAATGTGAGGACTGTGGGAAGGGCTACAAC 1986
.|..|||||..|||.|||.||..||.||||.|||.||..|||..|||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 1748 GCCTTAAAGACCAACAAAGAGACCAAAGTGGAGAGAAAACATCTAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAG 1821
Query 1987 AGGCGCTTGAATCTTGATATGC----ATCA------------GAGGGTCCACATGGGAGAGAAAACATGGAAGT 2044
|||||||||||||||||||.|| .||| || ||||
Sbjct 1822 AGGCGCTTGAATCTTGATACGCTTTTGTCATTATTTTTAAATGA-----CACA--------------------- 1869
Query 2045 GTAGGGAGTGTGATATGTGCTTTAGTCAGGCCTCAAGCCTTCGACTTCATCAGAATGTTCATGTTGGAGAAAAA 2118
Sbjct 1870 -------------------------------------------------------------------------- 1869
Query 2119 CCT 2121
Sbjct 1870 --- 1869