Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07185
• Subject: XM_011513116.3
• Aligned Length: 1217
• Identities: 970
• Gaps: 229

Alignment

Query    1  ATGCAAGTCTCCATAGCCTGCACAGAGCACAATTTGAAGAGTCGGAATGGTGAGGACCGACTTCTGAGCAAGCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAGCTCCACCGCCCCCAATGTGGTAAACGCAGCCCGGGCCAAATTCCGCACGGTCGCTATCATCGCGCGCAGCC  148
                                                                         ||     ||||  
Sbjct    1  -------------------------------------------------------------AT-----GCAG--  6

Query  149  TGGGGACGTTCACGCCTCAGCATC-----ACATTTCTCTCAAAGAGTCCACC-------GCAAAGCAGACTGGC  210
             |.|||.|          || |||     |||        |||   ||.|||       |||||.|        
Sbjct    7  -GAGGAGG----------AG-ATCCCAGAACA--------AAA---TCAACCCCATTTTGCAAACC--------  49

Query  211  ATGAAATATAGGAATCTTGGAAAATCAGGACTCAGAGTTTCTTGCTTGGGTCTTGGAACATGGGTGACATTTG-  283
                     |||||.||   |||.|.|     |||||          .||||     |.|||      ||||| 
Sbjct   50  ---------AGGAAGCT---AAATTTA-----CAGAG----------AGGTC-----AGATG------ATTTGC  85

Query  284  -GAGGTCAAATTTCAGATGAGGTTGCTGAACGGCTGATGACCATCGCCTATGAAAGTGGTGTTAACCTCTTTGA  356
             .|.||..|.|||    |...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   86  CTACGTTTATTTT----TCTAGTTGCTGAACGGCTGATGACCATCGCCTATGAAAGTGGTGTTAACCTCTTTGA  155

Query  357  TACTGCCGAAGTCTATGCTGCTGGAAAGGCTGAAGTGATTCTGGGGAGCATCATCAAGAAGAAAGGCTGGAGGA  430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  156  TACTGCCGAAGTCTATGCTGCTGGAAAGGCTGAAGTGATTCTGGGGAGCATCATCAAGAAGAAAGGCTGGAGGA  229

Query  431  GGTCCAGTCTGGTCATAACAACCAAACTCTACTGGGGTGGAAAAGCTGAAACAGAAAGAGGGCTGTCAAGAAAG  504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  230  GGTCCAGTCTGGTCATAACAACCAAACTCTACTGGGGTGGAAAAGCTGAAACAGAAAGAGGGCTGTCAAGAAAG  303

Query  505  CATATTATTGAAGGATTGAAGGGCTCCCTCCAGAGGCTGCAGCTCGAGTATGTGGATGTGGTCTTTGCAAATCG  578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  304  CATATTATTGAAGGATTGAAGGGCTCCCTCCAGAGGCTGCAGCTCGAGTATGTGGATGTGGTCTTTGCAAATCG  377

Query  579  ACCGGACAGTAACACTCCCATGGAAGAAATTGTCCGAGCCATGACACATGTGATAAACCAAGGCATGGCGATGT  652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  378  ACCGGACAGTAACACTCCCATGGAAGAAATTGTCCGAGCCATGACACATGTGATAAACCAAGGCATGGCGATGT  451

Query  653  ACTGGGGCACCTCGAGATGGAGTGCTATGGAGATCATGGAAGCCTATTCTGTAGCAAGACAGTTCAATATGATC  726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  452  ACTGGGGCACCTCGAGATGGAGTGCTATGGAGATCATGGAAGCCTATTCTGTAGCAAGACAGTTCAATATGATC  525

Query  727  CCACCGGTCTGTGAACAAGCTGAGTACCATCTTTTCCAGAGAGAGAAAGTGGAGGTCCAGCTGCCAGAGCTCTA  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  526  CCACCGGTCTGTGAACAAGCTGAGTACCATCTTTTCCAGAGAGAGAAAGTGGAGGTCCAGCTGCCAGAGCTCTA  599

Query  801  CCACAAAATAGGTGTTGGCGCAATGACATGGTCTCCACTTGCCTGTGGAATCATCTCAGGAAAATACGGAAACG  874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600  CCACAAAATAGGTGTTGGCGCAATGACATGGTCTCCACTTGCCTGTGGAATCATCTCAGGAAAATACGGAAACG  673

Query  875  GGGTGCCTGAAAGTTCCAGGGCTTCACTGAAGTGCTACCAGTGGTTGAAAGAAAGAATTGTAAGTGAAGAAGGG  948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  674  GGGTGCCTGAAAGTTCCAGGGCTTCACTGAAGTGCTACCAGTGGTTGAAAGAAAGAATTGTAAGTGAAGAAGGG  747

Query  949  AGAAAACAGCAAAACAAGCTAAAAGACCTTTCCCCAATTGCGGAGCGTCTGGGATGCACACTACCTCAGCTAGC  1022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  748  AGAAAACAGCAAAACAAGCTAAAAGACCTTTCCCCAATTGCGGAGCGTCTGGGATGCACACTACCTCAGCTAGC  821

Query 1023  TGTTGCGTGGTGCCTGAGAAACGAAGGTGTGAGTTCTGTGCTCCTGGGATCATCCACTCCTGAACAACTCATTG  1096
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  822  TGTTGCGTGGTGCCTGAGAAATGAAGGTGTGAGTTCTGTGCTCCTGGGATCATCCACTCCTGAACAACTCATTG  895

Query 1097  AAAACCTTGGTGCCATTCAGGTTCTCCCAAAGATGACATCACATGTGGTAAATGAGATTGATAACATACTGCGC  1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  896  AAAACCTTGGTGCCATTCAGGTTCTCCCAAAGATGACATCACATGTGGTAAATGAGATTGATAACATACTGCGC  969

Query 1171  AACAAGCCCTACAGCAAGAAGGACTATAGATCA  1203
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  970  AACAAGCCCTACAGCAAGAAGGACTATAGATCA  1002