Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07198
Subject:
NM_001161618.1
Aligned Length:
855
Identities:
741
Gaps:
102

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MRSLAWAGRGDHVAGKPEEARLPGTSSALTARRSGVPRIPRRGLRGPAGNPGLSRRPGPERRQVSPRLARVQVE  74

Query   1  -MATSNLLKNKGSLQFEDKWDFMRPIVLKLLRQESVTKQQWFDLFSDVHAVCLWDDKGPAKIHQALKEDILEFI  73
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct  75  NMATSNLLKNKGSLQFEDKWDFMHPIVLKLLRQESVTKQQWFDLFSDVHAVCLWDDKGSSKIHQALKEDILEFI  148

Query  74  KQAQARVLSHQDDTALLKAYIVEWRKFFTQCDILPKPFCQLEITLMGKQGSNKKSNVEDSIVRKLMLDTWNESI  147
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 149  KQAQARVLSHQDDTALLKAYIVEWRKFFTQCDILPKPFCQLEVTLLGKQSSNKKSNMEDSIVRKLMLDTWNESI  222

Query 148  FSNIKNRLQDSAMKLVHAERLGEAFDSQLVIGVRESYVNLCSNPEDKLQIYRDNFEKAYLDSTERFYRTQAPSY  221
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  FSNIKNRLQDSAMKLVHAERLGEAFDSQLVIGVRESYVNLCSNPEDKLQIYRDNFEKAYLDSTERFYRTQAPSY  296

Query 222  LQQNGVQNYMKYADAKLKEEEKRALRYLETRRECNSVEALMECCVNALVTSFKETILAECQGMIKRNETEKLHL  295
           ||||||||||||                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  LQQNGVQNYMKY---------------------------LMECCVNALVTSFKETILAECQGMIKRNETEKLHL  343

Query 296  MFSLMDKVPNGIEPMLKDLEEHIISAGLADMVAAAETITTDSEKYVEQLLTLFNRFSKLVKEAFQDDPRFLTAR  369
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 344  MFSLMDKVPNGIEPMLKDLEEHIISAGLADMVAAAETITTDSEKYVEQLLTLFNRFSKLVKEAFQDDPRFLTAR  417

Query 370  DKAYKAVVNDATIFKLELPLKQKGVGLKTQPESKCPELLANYCDMLLRKTPLSKKLTSEEIEAKLKEVLLVLKY  443
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 418  DKAYKAVVNDATIFKLELPLKQKGVGLKTQPESKCPELLANYCDMLLRKTPLSKKLTSEEIEAKLKEVLLVLKY  491

Query 444  VQNKDVFMRYHKAHLTRRLILDISADSEIEENMVEWLREVGMPADYVNKLARMFQDIKVSEDLNQAFKEMHKNN  517
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 492  VQNKDVFMRYHKAHLTRRLILDISADSEIEENMVEWLREVGMPADYVNKLARMFQDIKVSEDLNQAFKEMHKNN  565

Query 518  KLALPADSVNIKILNAGAWSRSSEKVFVSLPTELEDLIPEVEEFYKKNHSGRKLHWHHLMSNGIITFKNEVGQY  591
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 566  KLALPADSVNIKILNAGAWSRSSEKVFVSLPTELEDLIPEVEEFYKKNHSGRKLHWHHLMSNGIITFKNEVGQY  639

Query 592  DLEVTTFQLAVLFAWNQRPREKISFENLKLATELPDAELRRTLWSLVAFPKLKRQVLLYEPQVNSPKDFTEGTL  665
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 640  DLEVTTFQLAVLFAWNQRPREKISFENLKLATELPDAELRRTLWSLVAFPKLKRQVLLYDPQVNSPKDFTEGTL  713

Query 666  FSVNQEFSLIKNAKVQKRGKINLIGRLQLTTERMREEENEGIVQLRILRTQEAIIQIMKMRKKISNAQLQTELV  739
           |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 714  FSVNQDFSLIKNAKVQKRGKINLIGRLQLTTERMREEENEGIVQLRILRTQEAIIQIMKMRKKISNAQLQTELV  787

Query 740  EILKNMFLPQKKMIKEQIEWLIEHKYIRRDESDINTFIYMA  780
           |||||||||||||||||.||||||.||||||.|||||||||
Sbjct 788  EILKNMFLPQKKMIKEQMEWLIEHRYIRRDEADINTFIYMA  828