Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07198
• Subject: XM_017018363.2
• Aligned Length: 2343
• Identities: 2206
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ATGGCGACGTCTAATCTGTTAAAGAATAAAGGTTCTCTTCAGTTTGAAGACAAATGGGATTTTATGCGCCCGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGACGTCTAATCTGTTAAAGAATAAAGGTTCTCTTCAGTTTGAAGACAAATGGGATTTTATGCGCCCGAT  74

Query   75  TGTTTTGAAGCTTTTACGCCAGGAATCTGTTACAAAACAGCAGTGGTTTGATCTGTTTTCGGATGTGCATGCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTTTTGAAGCTTTTACGCCAGGAATCTGTTACAAAACAGCAGTGGTTTGATCTGTTTTCGGATGTGCATGCAG  148

Query  149  TCTGTCTTTGGGATGATAAAGGCCCAGCAAAAATTCATCAGGCTTTAAAAGAAGATATTCTTGAGTTTATTAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTGTCTTTGGGATGATAAAGGCCCAGCAAAAATTCATCAGGCTTTAAAAGAAGATATTCTTGAGTTTATTAAG  222

Query  223  CAGGCACAGGCACGAGTACTGAGCCATCAAGATGATACGGCTTTGCTAAAAGCATATATTGTTGAATGGCGAAA  296
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGCACAGGCACGAGTACTGAGCCATCAAGATGATACGGCTTTGCTAAAAGCATATATTGTTGAATGGCGAAA  296

Query  297  GTTCTTTACACAATGTGATATTTTACCAAAACCTTTTTGTCAACTAGAGATTACTTTAATGGGTAAACAGGGCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTTCTTTACACAATGTGATATTTTACCAAAACCTTTTTGTCAACTAGAGATTACTTTAATGGGTAAACAGGGCA  370

Query  371  GCAATAAAAAATCAAATGTGGAAGACAGTATTGTTCGAAAGCTTATGCTTGATACATGGAATGAGTCAATCTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCAATAAAAAATCAAATGTGGAAGACAGTATTGTTCGAAAGCTTATGCTTGATACATGGAATGAGTCAATCTTT  444

Query  445  TCAAACATAAAAAACAGACTCCAAGATAGTGCAATGAAGCTGGTACATGCTGAGAGATTGGGAGAAGCTTTTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCAAACATAAAAAACAGACTCCAAGATAGTGCAATGAAGCTGGTACATGCTGAGAGATTGGGAGAAGCTTTTGA  518

Query  519  TTCTCAGCTGGTTATTGGAGTAAGAGAATCCTATGTTAACCTTTGTTCTAATCCTGAGGATAAACTTCAAATTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTCTCAGCTGGTTATTGGAGTAAGAGAATCCTATGTTAACCTTTGTTCTAATCCTGAGGATAAACTTCAAATTT  592

Query  593  ATAGGGACAATTTTGAGAAGGCATACTTGGATTCAACAGAGAGATTTTATAGAACACAAGCACCCTCGTATTTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATAGGGACAATTTTGAGAAGGCATACTTGGATTCAACAGAGAGATTTTATAGAACACAAGCACCCTCGTATTTA  666

Query  667  CAACAAAATGGTGTACAGAATTATATGAAATATGCAGATGCTAAATTAAAAGAAGAAGAAAAACGAGCACTACG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAACAAAATGGTGTACAGAATTATATGAAATATGCAGATGCTAAATTAAAAGAAGAAGAAAAACGAGCACTACG  740

Query  741  TTATTTAGAAACAAGACGAGAATGTAACTCCGTTGAAGCACTCATGGAATGCTGTGTAAATGCCCTGGTGACAT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTATTTAGAAACAAGACGAGAATGTAACTCCGTTGAAGCACTCATGGAATGCTGTGTAAATGCCCTGGTGACAT  814

Query  815  CATTTAAAGAGACTATCTTAGCTGAGTGCCAAGGCATGATCAAGAGAAATGAAACTGAAAAATTACATTTAATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CATTTAAAGAGACTATCTTAGCTGAGTGCCAAGGCATGATCAAGAGAAATGAAACTGAAAAATTACATTTAATG  888

Query  889  TTTTCATTGATGGACAAAGTTCCTAATGGTATAGAGCCAATGTTGAAAGACTTGGAGGAACATATCATTAGTGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTTCATTGATGGACAAAGTTCCTAATGGTATAGAGCCAATGTTGAAAGACTTGGAGGAACATATCATTAGTGC  962

Query  963  TGGCCTGGCAGATATGGTAGCAGCTGCTGAAACTATTACTACTGACTCTGAGAAATACGTTGAGCAGTTACTTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGCCTGGCAGATATGGTAGCAGCTGCTGAAACTATTACTACTGACTCTGAGAAATACGTTGAGCAGTTACTTA  1036

Query 1037  CACTATTTAATAGATTTAGTAAACTCGTCAAAGAAGCTTTTCAAGATGATCCACGATTTCTTACTGCAAGAGAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACTATTTAATAGATTTAGTAAACTCGTCAAAGAAGCTTTTCAAGATGATCCACGATTTCTTACTGCAAGAGAT  1110

Query 1111  AAGGCGTATAAAGCAGTTGTTAATGATGCTACCATATTTAAACTTGAATTACCTTTGAAGCAGAAGGGGGTGGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGGCGTATAAAGCAGTTGTTAATGATGCTACCATATTTAAACTTGAATTACCTTTGAAGCAGAAGGGGGTGGG  1184

Query 1185  ATTAAAAACTCAGCCTGAATCAAAATGCCCTGAGCTGCTTGCCAATTACTGTGACATGTTGCTAAGAAAAACAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATTAAAAACTCAGCCTGAATCAAAATGCCCTGAGCTGCTTGCCAATTACTGTGACATGTTGCTAAGAAAAACAC  1258

Query 1259  CATTAAGCAAAAAACTAACCTCTGAAGAGATTGAAGCAAAGCTTAAAGAAGTGCTCTTGGTACTTAAGTATGTA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CATTAAGCAAAAAACTAACCTCTGAAGAGATTGAAGCAAAGCTTAAAGAAGTGCTCTTGGTACTTAAGTATGTA  1332

Query 1333  CAGAACAAAGATGTTTTTATGAGGTATCATAAAGCTCATTTGACACGACGTCTTATATTAGACATCTCTGCCGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGAACAAAGATGTTTTTATGAGGTATCATAAAGCTCATTTGACACGACGTCTTATATTAGACATCTCTGCCGA  1406

Query 1407  TAGTGAAATTGAAGAAAACATGGTAGAGTGGCTAAGAGAAGTTGGTATGCCAGCGGATTATGTAAACAAGCTTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TAGTGAAATTGAAGAAAACATGGTAGAGTGGCTAAGAGAAGTTGGTATGCCAGCGGATTATGTAAACAAGCTTG  1480

Query 1481  CTAGAATGTTTCAGGACATAAAAGTATCTGAAGATTTGAACCAAGCTTTTAAGGAAATGCACAAAAATAATAAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTAGAATGTTTCAGGACATAAAAGTATCTGAAGATTTGAACCAAGCTTTTAAGGAAATGCACAAAAATAATAAA  1554

Query 1555  TTGGCATTACCAGCTGATTCAGTTAATATAAAAATTCTGAATGCTGGCGCCTGGTCAAGAAGTTCTGAGAAAGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTGGCATTACCAGCTGATTCAGTTAATATAAAAATTCTGAATGCTGGCGCCTGGTCAAGAAGTTCTGAGAAAGT  1628

Query 1629  CTTTGTCTCACTTCCTACTGAACTGGAGGACTTGATACCGGAAGTAGAAGAATTCTACAAAAAAAATCATAGTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTTTGTCTCACTTCCTACTGAACTGGAGGACTTGATACCGGAAGTAGAAGAATTCTACAAAAAAAATCATAGTG  1702

Query 1703  GTAGAAAATTACATTGGCATCATCTCATGTCAAATGGAATTATAACATTTAAGAATGAAGTTGGTCAATATGAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTAGAAAATTACATTGGCATCATCTCATGTCAAATGGAATTATAACATTTAAGAATGAAGTTGGTCAATATGAT  1776

Query 1777  TTGGAGGTAACCACGTTTCAGCTCGCTGTATTGTTTGCATGGAACCAAAGACCCAGAGAGAAAATCAGCTTTGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTGGAGGTAACCACGTTTCAGCTCGCTGTATTGTTTGCATGGAACCAAAGACCCAGAGAGAAAATCAGCTTTGA  1850

Query 1851  AAATCTTAAGCTTGCAACTGAACTCCCTGATGCTGAACTTAGGAGGACTTTATGGTCTTTAGTAGCTTTCCCAA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AAATCTTAAGCTTGCAACTGAACTCCCTGATGCTGAACTTAGGAGGACTTTATGGTCTTTAGTAGCTTTCCCAA  1924

Query 1925  AACTCAAACGGCAAGTTTTGTTGTATGAACCTCAAGTCAACTCACCCAAAGACTTTACAGAAGGTACCCTCTTC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AACTCAAACGGCAAGTTTTGTTGTATGAACCTCAAGTCAACTCACCCAAAGACTTTACAGAAGGTACCCTCTTC  1998

Query 1999  TCAGTGAACCAGGAGTTCAGTTTAATAAAAAATGCAAAGGTTCAGAAAAGGGGTAAAATCAACTTGATTGGACG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TCAGTGAACCAGGAGTTCAGTTTAATAAAAAATGCAAAGGTTCAGAAAAGGGGTAAAATCAACTTGATTGGACG  2072

Query 2073  TTTGCAGCTCACTACAGAAAGGATGAGAGAAGAAGAGAATGAAGGAATAGTTCAACTACGAATACTAAGAACCC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TTTGCAGCTCACTACAGAAAGGATGAGAGAAGAAGAGAATGAAGGAATAGTTCAACTACGAATACTAAGAACCC  2146

Query 2147  AGGAAGCTATCATACAAATAATGAAAATGAGAAAGAAAATTAGTAATGCTCAGCTGCAGACTGAATT--AGTAG  2218
            ||               |||||                           |||||          |||  .||| 
Sbjct 2147  AG---------------ATAAT---------------------------TCAGC----------ATTGGCGTA-  2167

Query 2219  AAATTTTGAAAAACATGTTCTTGCCACAAAAGAA-AATGATAAAAGAGCAAATAGAGTGGCTAATAGAGCACAA  2291
                ||||           ||||.|.|||.|.|| ||||..|||.|||.|||.||                   
Sbjct 2168  ----TTTG-----------CTTGTCCCAATACAAGAATGCCAAAGGAGGAAACAG-------------------  2207

Query 2292  ATACATCAGAAGAGATGAATCTGATATCAACACTTTCATATATATGGCA  2340
                    |||      ||..||...||  ||.||              
Sbjct 2208  --------GAA------AAATTGCCGTC--CATTT--------------  2226