Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07198
• Subject: XM_017018364.1
• Aligned Length: 2340
• Identities: 1557
• Gaps: 783

Alignment

Query    1  ATGGCGACGTCTAATCTGTTAAAGAATAAAGGTTCTCTTCAGTTTGAAGACAAATGGGATTTTATGCGCCCGAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGTTTTGAAGCTTTTACGCCAGGAATCTGTTACAAAACAGCAGTGGTTTGATCTGTTTTCGGATGTGCATGCAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCTGTCTTTGGGATGATAAAGGCCCAGCAAAAATTCATCAGGCTTTAAAAGAAGATATTCTTGAGTTTATTAAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CAGGCACAGGCACGAGTACTGAGCCATCAAGATGATACGGCTTTGCTAAAAGCATATATTGTTGAATGGCGAAA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GTTCTTTACACAATGTGATATTTTACCAAAACCTTTTTGTCAACTAGAGATTACTTTAATGGGTAAACAGGGCA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  GCAATAAAAAATCAAATGTGGAAGACAGTATTGTTCGAAAGCTTATGCTTGATACATGGAATGAGTCAATCTTT  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  TCAAACATAAAAAACAGACTCCAAGATAGTGCAATGAAGCTGGTACATGCTGAGAGATTGGGAGAAGCTTTTGA  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  TTCTCAGCTGGTTATTGGAGTAAGAGAATCCTATGTTAACCTTTGTTCTAATCCTGAGGATAAACTTCAAATTT  592
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  593  ATAGGGACAATTTTGAGAAGGCATACTTGGATTCAACAGAGAGATTTTATAGAACACAAGCACCCTCGTATTTA  666
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  667  CAACAAAATGGTGTACAGAATTATATGAAATATGCAGATGCTAAATTAAAAGAAGAAGAAAAACGAGCACTACG  740
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  741  TTATTTAGAAACAAGACGAGAATGTAACTCCGTTGAAGCACTCATGGAATGCTGTGTAAATGCCCTGGTGACAT  814
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------ATGGAATGCTGTGTAAATGCCCTGGTGACAT  31

Query  815  CATTTAAAGAGACTATCTTAGCTGAGTGCCAAGGCATGATCAAGAGAAATGAAACTGAAAAATTACATTTAATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   32  CATTTAAAGAGACTATCTTAGCTGAGTGCCAAGGCATGATCAAGAGAAATGAAACTGAAAAATTACATTTAATG  105

Query  889  TTTTCATTGATGGACAAAGTTCCTAATGGTATAGAGCCAATGTTGAAAGACTTGGAGGAACATATCATTAGTGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  106  TTTTCATTGATGGACAAAGTTCCTAATGGTATAGAGCCAATGTTGAAAGACTTGGAGGAACATATCATTAGTGC  179

Query  963  TGGCCTGGCAGATATGGTAGCAGCTGCTGAAACTATTACTACTGACTCTGAGAAATACGTTGAGCAGTTACTTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  180  TGGCCTGGCAGATATGGTAGCAGCTGCTGAAACTATTACTACTGACTCTGAGAAATACGTTGAGCAGTTACTTA  253

Query 1037  CACTATTTAATAGATTTAGTAAACTCGTCAAAGAAGCTTTTCAAGATGATCCACGATTTCTTACTGCAAGAGAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  254  CACTATTTAATAGATTTAGTAAACTCGTCAAAGAAGCTTTTCAAGATGATCCACGATTTCTTACTGCAAGAGAT  327

Query 1111  AAGGCGTATAAAGCAGTTGTTAATGATGCTACCATATTTAAACTTGAATTACCTTTGAAGCAGAAGGGGGTGGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  328  AAGGCGTATAAAGCAGTTGTTAATGATGCTACCATATTTAAACTTGAATTACCTTTGAAGCAGAAGGGGGTGGG  401

Query 1185  ATTAAAAACTCAGCCTGAATCAAAATGCCCTGAGCTGCTTGCCAATTACTGTGACATGTTGCTAAGAAAAACAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  402  ATTAAAAACTCAGCCTGAATCAAAATGCCCTGAGCTGCTTGCCAATTACTGTGACATGTTGCTAAGAAAAACAC  475

Query 1259  CATTAAGCAAAAAACTAACCTCTGAAGAGATTGAAGCAAAGCTTAAAGAAGTGCTCTTGGTACTTAAGTATGTA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  476  CATTAAGCAAAAAACTAACCTCTGAAGAGATTGAAGCAAAGCTTAAAGAAGTGCTCTTGGTACTTAAGTATGTA  549

Query 1333  CAGAACAAAGATGTTTTTATGAGGTATCATAAAGCTCATTTGACACGACGTCTTATATTAGACATCTCTGCCGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  550  CAGAACAAAGATGTTTTTATGAGGTATCATAAAGCTCATTTGACACGACGTCTTATATTAGACATCTCTGCCGA  623

Query 1407  TAGTGAAATTGAAGAAAACATGGTAGAGTGGCTAAGAGAAGTTGGTATGCCAGCGGATTATGTAAACAAGCTTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  624  TAGTGAAATTGAAGAAAACATGGTAGAGTGGCTAAGAGAAGTTGGTATGCCAGCGGATTATGTAAACAAGCTTG  697

Query 1481  CTAGAATGTTTCAGGACATAAAAGTATCTGAAGATTTGAACCAAGCTTTTAAGGAAATGCACAAAAATAATAAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  698  CTAGAATGTTTCAGGACATAAAAGTATCTGAAGATTTGAACCAAGCTTTTAAGGAAATGCACAAAAATAATAAA  771

Query 1555  TTGGCATTACCAGCTGATTCAGTTAATATAAAAATTCTGAATGCTGGCGCCTGGTCAAGAAGTTCTGAGAAAGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  772  TTGGCATTACCAGCTGATTCAGTTAATATAAAAATTCTGAATGCTGGCGCCTGGTCAAGAAGTTCTGAGAAAGT  845

Query 1629  CTTTGTCTCACTTCCTACTGAACTGGAGGACTTGATACCGGAAGTAGAAGAATTCTACAAAAAAAATCATAGTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  846  CTTTGTCTCACTTCCTACTGAACTGGAGGACTTGATACCGGAAGTAGAAGAATTCTACAAAAAAAATCATAGTG  919

Query 1703  GTAGAAAATTACATTGGCATCATCTCATGTCAAATGGAATTATAACATTTAAGAATGAAGTTGGTCAATATGAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  920  GTAGAAAATTACATTGGCATCATCTCATGTCAAATGGAATTATAACATTTAAGAATGAAGTTGGTCAATATGAT  993

Query 1777  TTGGAGGTAACCACGTTTCAGCTCGCTGTATTGTTTGCATGGAACCAAAGACCCAGAGAGAAAATCAGCTTTGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  994  TTGGAGGTAACCACGTTTCAGCTCGCTGTATTGTTTGCATGGAACCAAAGACCCAGAGAGAAAATCAGCTTTGA  1067

Query 1851  AAATCTTAAGCTTGCAACTGAACTCCCTGATGCTGAACTTAGGAGGACTTTATGGTCTTTAGTAGCTTTCCCAA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068  AAATCTTAAGCTTGCAACTGAACTCCCTGATGCTGAACTTAGGAGGACTTTATGGTCTTTAGTAGCTTTCCCAA  1141

Query 1925  AACTCAAACGGCAAGTTTTGTTGTATGAACCTCAAGTCAACTCACCCAAAGACTTTACAGAAGGTACCCTCTTC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1142  AACTCAAACGGCAAGTTTTGTTGTATGAACCTCAAGTCAACTCACCCAAAGACTTTACAGAAGGTACCCTCTTC  1215

Query 1999  TCAGTGAACCAGGAGTTCAGTTTAATAAAAAATGCAAAGGTTCAGAAAAGGGGTAAAATCAACTTGATTGGACG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1216  TCAGTGAACCAGGAGTTCAGTTTAATAAAAAATGCAAAGGTTCAGAAAAGGGGTAAAATCAACTTGATTGGACG  1289

Query 2073  TTTGCAGCTCACTACAGAAAGGATGAGAGAAGAAGAGAATGAAGGAATAGTTCAACTACGAATACTAAGAACCC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290  TTTGCAGCTCACTACAGAAAGGATGAGAGAAGAAGAGAATGAAGGAATAGTTCAACTACGAATACTAAGAACCC  1363

Query 2147  AGGAAGCTATCATACAAATAATGAAAATGAGAAAGAAAATTAGTAATGCTCAGCTGCAGACTGAATTAGTAGAA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1364  AGGAAGCTATCATACAAATAATGAAAATGAGAAAGAAAATTAGTAATGCTCAGCTGCAGACTGAATTAGTAGAA  1437

Query 2221  ATTTTGAAAAACATGTTCTTGCCACAAAAGAAAATGATAAAAGAGCAAATAGAGTGGCTAATAGAGCACAAATA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438  ATTTTGAAAAACATGTTCTTGCCACAAAAGAAAATGATAAAAGAGCAAATAGAGTGGCTAATAGAGCACAAATA  1511

Query 2295  CATCAGAAGAGATGAATCTGATATCAACACTTTCATATATATGGCA  2340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1512  CATCAGAAGAGATGAATCTGATATCAACACTTTCATATATATGGCA  1557