Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07233
Subject:
NM_008847.3
Aligned Length:
548
Identities:
457
Gaps:
50

Alignment

Query   1  MASASSGPSSSVGFSSFDPAVPSCTLSSASGIKRPMASEVPYASGMPIKKIGHRSVDSSGETTYKKTTSSALKG  74
           ||||||||... ||||.|...|..| ..||||||...||.|.||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MASASSGPAAA-GFSSLDAGAPAGT-AAASGIKRATVSEGPSASVMPVKKIGHRSVDSSGETTYKKTTSSALKG  72

Query  75  AIQLGITHTVGSLSTKPERDVLMQDFYVVESIFFPSEGSNLTPAHHYNDFRFKTYAPVAFRYFRELFGIRPDDY  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  73  AIQLGITHTVGSLSTKPERDVLMQDFYVVESIFFPSEGSNLTPAHHYNDFRFKTYAPVAFRYFRELFGIRPDDY  146

Query 149  LYSLCSEPLIELCSSGASGSLFYVSSDDEFIIKTVQHKEAEFLQKLLPGYYMNLNQNPRTLLPKFYGLYCVQAG  222
           ||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 147  LYSLCSEPLIELSNSGASGSLFYVSSDDEFIIKTVQHKEAEFLQKLLPGYYMNLNQNPRTLLPKFYGLYCVQAG  220

Query 223  GKNIRIVVMNNLLPRSVKMHIKYDLKGSTYKRRASQKEREKPLPTFKDLDFLQDIPDGLFLDADMYNALCKTLQ  296
           ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 221  GKNIRIVVMNNLLPRSVKMHMKYDLKGSTYKRRASQKEREKTLPTFKDLDFLQDIPDGLFLDADMYSALCKTLQ  294

Query 297  RDCLVLQSFKIMDYSLLMSIHNIDHAQREPLSSETQYSVDTRRPAPQKALYSTAMESIQGEARRGGTMETDDHM  370
           ||||||||||||||||||||||.|||||||.|..||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 295  RDCLVLQSFKIMDYSLLMSIHNMDHAQREPTSNDTQYSADTRRPAPQKALYSTAMESIQGEARRGGTVETEDHM  368

Query 371  GGIPARNSKGERLLLYIGIIDILQSYRFVKKLEHSWKALVHDGDTVSVHRPGFYAERFQRFMCNTVFKKIP---  441
           |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 369  GGIPARNNKGERLLLYIGIIDILQSYRFVKKLEHSWKALVHDGDTVSVHRPGFYAERFQRFMCNTVFKKIPLKP  442

Query 442  ----------------------C-----------------------VHLGRPDVLPQTPPLEEISEGSPIPDPS  470
                                 |                       |||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 443  SPTKKFRSGPSFSRRSGPSGNSCTSQLMASGEHRAQVTTKAEVEPDVHLGRPDVLPQTPPLEEISEGSPVPGPS  516

Query 471  FSPLVGETLQMLTTSTTLEKLEVAESEFTH  500
           |||.||..||.|..|.|||||.||||||||
Sbjct 517  FSPVVGQPLQILNLSSTLEKLDVAESEFTH  546