Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07248
• Subject: XM_011545317.2
• Aligned Length: 3681
• Identities: 3599
• Gaps: 75

Alignment

Query    1  ATGATGTGCGAGGTGATGCCGACCATCAGCGAAGCAGAAGGCCCCCCTGGAGGAGGTGGAGGCCATGGTTCCGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGTGCGAGGTGATGCCGACCATCAGCGAAGCAGAAGGCCCCCCTGGAGGAGGTGGAGGCCATGGTTCCGG  74

Query   75  CTCCCCTTCACAGCCAGATGCAGATTCACATTTTGAACAGTTGATGGTCTCCATGCTAGAAGAAAGGGACCGCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCCCCTTCACAGCCAGATGCAGATTCACATTTTGAACAGTTGATGGTCTCCATGCTAGAAGAAAGGGACCGCC  148

Query  149  TTCTTGATACACTGAGAGAGACTCAAGAAACGCTGGCCTTAACCCAGGGGAAGTTACACGAGGTTGGTCATGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTCTTGATACACTGAGAGAGACTCAAGAAACGCTGGCCTTAACCCAGGGGAAGTTACACGAGGTTGGTCATGAA  222

Query  223  AGAGATTCCTTGCAGAGACAGCTCAACACAGCACTTCCACAGGAGTTCGCAGCACTTACTAAAGAACTCAATGT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAGATTCCTTGCAGAGACAGCTCAACACGGCACTTCCACAGGAGTTCGCAGCACTTACTAAAGAACTCAATGT  296

Query  297  ATGCAGGGAACAGCTCCTTGAAAGGGAAGAAGAAATTGCTGAACTGAAAGCAGAAAGGAATAACACCAGGCTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATGCAGGGAACAGCTCCTTGAAAGGGAAGAAGAAATTGCTGAACTGAAAGCAGAAAGGAATAACACCAGGCTGC  370

Query  371  TGTTAGAGCATTTGGAATGCCTTGTCTCCAGGCATGAGCGGTCTCTTAGGATGACCGTGGTGAAGAGACAAGCG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGTTAGAGCATTTGGAATGCCTTGTCTCCAGGCATGAGCGGTCTCTTAGGATGACCGTGGTGAAGAGACAAGCG  444

Query  445  CAGTCTCCAGCAGGCGTGTCCAGCGAAGTGGAAGTGCTGAAAGCACTGAAGTCCTTATTTGAACACCACAAAGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGTCTCCAGCAGGCGTGTCCAGCGAAGTGGAAGTGCTGAAAGCACTGAAGTCCTTATTTGAACACCACAAAGC  518

Query  519  TCTGGATGAAAAGGTGAGAGAGCGATTACGAGTAGCACTTGAAAGATGTAGTTTGTTAGAAGAGGAATTAGGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCTGGATGAAAAGGTGAGAGAGCGATTACGAGTAGCACTTGAAAGATGTAGTTTGTTAGAAGAGGAATTAGGTG  592

Query  593  CCACACACAAAGAGCTAATGATTCTTAAAGAACAGAATAATCAGAAAAAAACTCTAACAGATGGAGTGCTGGAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCACACACAAAGAGCTAATGATTCTTAAAGAACAGAATAATCAGAAAAAAACTCTAACAGATGGAGTGCTGGAC  666

Query  667  ATAAACCATGAACAAGAAAATACACCAAGCACGAGTGGAAAGAGATCTTCTGATGGTTCTTTAAGCCACGAGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATAAACCATGAACAAGAAAATACACCAAGCACGAGTGGAAAGAGATCTTCTGATGGTTCTTTAAGCCACGAGGA  740

Query  741  AGACCTTGCTAAAGTAATTGAGCTCCAAGAAATCATAAGTAAGCAGTCAAGGGAACAGAGCCAAATGAAAGAAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGACCTTGCTAAAGTAATTGAGCTCCAAGAAATCATAAGTAAGCAGTCAAGGGAACAGAGCCAAATGAAAGAAC  814

Query  815  GCCTGGCTTCCCTTTCCAGTCATGTGACAGAACTGGAAGAGGATCTGGACACGGCTAGAAAAGATCTCATCAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCTGGCTTCCCTTTCCAGTCATGTGACAGAACTGGAAGAGGATCTGGACACGGCTAGAAAAGATCTCATCAAA  888

Query  889  TCTGAAGAAATGAACACAAAATTGCAACGAGATGTCCGTGAAGCCATGGCCCAAAAGGAAGATATGGAAGAGAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCTGAAGAAATGAACACAAAATTGCAACGAGATGTCCGTGAAGCCATGGCCCAAAAGGAAGATATGGAAGAGAG  962

Query  963  AATCACTACTCTTGAAAAACGCTACCTCGCTGCACAGCGTGAAGCCACATCTGTGCATGACCTCAATGATAAAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AATCACTACTCTTGAAAAACGCTACCTCGCTGCACAGCGTGAAGCCACATCTGTGCATGACCTCAATGATAAAC  1036

Query 1037  TTGAAAATGAAATTGCAAATAAAGATTCTATGCATCGACAGACTGAAGATAAAAACCGCCAGTTACAGGAGCGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGAAAATGAAATTGCAAATAAAGATTCTATGCATCGACAGACTGAAGATAAAAACCGCCAGTTACAGGAGCGC  1110

Query 1111  TTGGAATTGGCAGAGCAAAAGCTGCAACAGACACTGAGGAAGGCAGAGACGCTCCCGGAGGTGGAGGCGGAGCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTGGAATTGGCAGAGCAAAAGCTGCAACAGACACTGAGGAAGGCAGAGACGCTCCCGGAGGTGGAGGCGGAGCT  1184

Query 1185  GGCCCAGAGGGTGGCAGCGCTTTCC-------------------------------------------------  1209
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct 1185  GGCCCAGAGGGTGGCAGCGCTTTCCAAGTCTGACCTTTTGTCTTCTGGGAGCTCTGCTGCTAAGGAAGCTAAAC  1258

Query 1210  --------------------------AAGGCTGAAGAGAGACACGGCAACATTGAAGAAAGGTTACGACAGATG  1257
                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGTTGGAACTTACTTCCAAGCTTAGGAAGGCTGAAGAGAGACACGGCAACATTGAAGAAAGGTTACGACAGATG  1332

Query 1258  GAAGCACAGTTGGAGGAGAAGAATCAAGAACTGCAGCGGGCAAGGCAAAGAGAAAAAATGAACGAAGAACATAA  1331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAAGCACAGTTGGAGGAGAAGAATCAAGAACTGCAGCGGGCAAGGCAAAGAGAAAAAATGAACGAAGAACATAA  1406

Query 1332  TAAACGTTTATCAGACACTGTTGACAAGCTGCTTTCAGAATCTAATGAGAGGCTTCAACTTCATCTTAAAGAGA  1405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TAAACGTTTATCAGACACTGTTGACAAGCTGCTTTCAGAATCTAATGAGAGGCTTCAACTTCATCTTAAAGAGA  1480

Query 1406  GAATGGCTGCTTTGGAAGATAAGAACTCTCTTTTAAGAGAAGTTGAAAGTGCAAAAAAGCAGTTAGAAGGAACA  1479
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1481  GAATGGCTGCTTTGGAAGATAAGAACTCTCTTTTAAGAGAAGTTGAAAGTGCAAAAAAGCAGTTAGAAGAAACA  1554

Query 1480  CAACACGATAAGGATCAGCTTGTCCTAAACATTGAAGCACTGAGGGCTGAACTAGACCACATGAGACTAAGAGG  1553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAACACGATAAGGATCAGCTTGTCCTAAACATTGAAGCACTGAGGGCTGAACTAGACCACATGAGACTAAGAGG  1628

Query 1554  TGCTTCACTTCATCATGGCCGACCCCACTTGGGCAGTGTCCCAGATTTCAGGTTCCCCATGGCAGATGGCCACA  1627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1629  TGCTTCACTTCATCATGGCCGACCCCACTTGGGCAGTGTCCCAGATTTCAGGTTCCCCATGGCAGACGGCCACA  1702

Query 1628  CAGACTCCTACAGCACCAGTGCAGTGCTGCGGCGCACACAGAAAGGCCGGCTGGCAGCCCTGCGAGATGAGCCT  1701
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAGACTCCTACAGCACCAGTGCAGTGCTGCGGCGCCCACAGAAAGGCCGGCTGGCAGCCCTGCGAGATGAGCCT  1776

Query 1702  TCCAAGGTACAAACTCTTAATGAGCAGGATTGGGAACGTGCCCAGCAAGCTAGTGTCTTGGCAAATGTAGCACA  1775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCCAAGGTACAAACTCTTAATGAGCAGGATTGGGAACGTGCCCAGCAAGCTAGTGTCTTGGCAAATGTAGCACA  1850

Query 1776  AGCATTCGAGAGTGATGCTGACGTGTCTGATGGTGAAGATGACAGGGACACTCTCCTCAGCTCAGTTGACCTGC  1849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGCATTCGAGAGTGATGCTGACGTGTCTGATGGTGAAGATGACAGGGACACTCTCCTCAGCTCAGTTGACCTGC  1924

Query 1850  TATCGCCCAGCGGGCAGGCCGACGCGCACACACTAGCCATGATGCTTCAGGAGCAGCTGGACGCCATCAACAAA  1923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TATCGCCCAGCGGGCAGGCCGACGCGCACACACTAGCCATGATGCTTCAGGAGCAGCTGGACGCCATCAACAAA  1998

Query 1924  GAGATCAGGTTGATTCAGGAAGAAAAAGAAAATACAGAGCAGCGGGCAGAGGAGATTGAAAGTCGAGTTGGCAG  1997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAGATCAGGTTGATTCAGGAAGAAAAAGAAAATACAGAGCAGCGGGCAGAGGAGATTGAAAGTCGAGTTGGCAG  2072

Query 1998  TGGAAGTCTAGACAATCTTGGTCGTTTTAGATCAATGAGCTCCATTCCCCCCTACCCTGCTTCCTCGCTTGCTA  2071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGGAAGTCTAGACAATCTTGGTCGTTTTAGATCAATGAGCTCCATTCCCCCCTACCCTGCTTCCTCGCTTGCTA  2146

Query 2072  GCTCCTCCCCTCCGGGCAGTGGGCGCTCCACCCCACGAAGGATCCCTCACAGCCCAGCTCGGGAAGTGGACAGA  2145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GCTCCTCCCCTCCGGGCAGTGGGCGCTCCACCCCACGAAGGATCCCTCACAGCCCAGCTCGGGAAGTGGACAGA  2220

Query 2146  CTGGGCGTCATGACCCTTTTGCCACCTTCCAGAGAAGAGGTACGAGATGACAAGACAACCATAAAGTGTGAAAC  2219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTGGGCGTCATGACCCTTTTGCCACCTTCCAGAGAAGAGGTACGAGATGACAAGACAACCATAAAGTGTGAAAC  2294

Query 2220  CTCCCCGCCTTCCTCCCCGAGAGCCCTTCGGTTAGACCGGCTGCACAAAGGGGCGCTGCACACCGTTAGCCACG  2293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2295  CTCCCCGCCTTCCTCCCCGAGAGCCCTTCGGTTAGACCGGCTGCACAAAGGGGCGCTGCACACCGTCAGCCACG  2368

Query 2294  AGGACATCAGGGACATAAGGAACTCCACAGGCTCCCAGGATGGTCCCGTGAGCAACCCCAGCAGTAGCAACAGT  2367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGGACATCAGGGACATAAGGAACTCCACAGGCTCCCAGGATGGTCCCGTGAGCAACCCCAGCAGTAGCAACAGT  2442

Query 2368  AGCCAGGACTCGCTCCACAAAGCCCCAAAGAAGAAAGGCATTAAGTCCTCCATTGGCCGCTTGTTTGGCAAGAA  2441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AGCCAGGACTCGCTCCACAAAGCCCCAAAGAAGAAAGGCATTAAGTCCTCCATTGGCCGCTTGTTTGGCAAGAA  2516

Query 2442  AGAAAAGGGCCGACCTGGACAAACTGGCAAAGAAGCATTAGGACAAGCTGGTGTTTCCGAGACGGATAACTCAT  2515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  AGAAAAGGGCCGACCTGGACAAACTGGCAAAGAAGCATTAGGACAAGCTGGTGTTTCCGAGACGGATAACTCAT  2590

Query 2516  CTCAGGATGCCTTGGGACTTAGCAAATTGGGGGGACAGGCTGAAAAAAATCGTAAACTTCAAAAAAAGCATGAA  2589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CTCAGGATGCCTTGGGACTTAGCAAATTGGGGGGACAGGCTGAAAAAAATCGTAAACTTCAAAAAAAGCATGAA  2664

Query 2590  TTGCTGGGGGAAGCCCGGAGACAAGGTTTACCTTTTGCCCAATGGGACGGGCCAACGGTTGTGGTCTGGCTAGA  2663
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  TTGCTGGAGGAAGCCCGGAGACAAGGTTTACCTTTTGCCCAATGGGACGGGCCAACGGTTGTGGTCTGGCTAGA  2738

Query 2664  GCTCTGGGTTGGGATGCCAGCCTGGTATGTGGCTGCCTGCCGAGCAAACGTGAAAAGCGGGGCCATCATGTCGG  2737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GCTCTGGGTTGGGATGCCAGCCTGGTATGTGGCTGCCTGCCGAGCAAACGTGAAAAGCGGGGCCATCATGTCGG  2812

Query 2738  CCCTGTCCGACACAGAGATCCAGCGTGAGATTGGCATCAGCAACCCCCTGCACAGGCTGAAGCTGAGGCTGGCC  2811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CCCTGTCCGACACAGAGATCCAGCGTGAGATTGGCATCAGCAACCCCCTGCACAGGCTGAAGCTGAGGCTGGCC  2886

Query 2812  ATCCAGGAGATCATGTCGCTGACCAGCCCGTCTGCCCCGCCCACATCTAGAACGACACTCGCCTATGGGGACAT  2885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  ATCCAGGAGATCATGTCGCTGACCAGCCCGTCTGCCCCGCCCACATCTAGAACGACACTCGCCTATGGGGACAT  2960

Query 2886  GAACCACGAGTGGATCGGCAACGAGTGGCTCCCCAGCCTGGGCCTCCCCCAGTACCGCAGCTACTTCATGGAGT  2959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  GAACCACGAGTGGATCGGCAACGAGTGGCTCCCCAGCCTGGGCCTCCCCCAGTACCGCAGCTACTTCATGGAGT  3034

Query 2960  GCCTTGTAGACGCCAGGATGCTGGACCACTTGACCAAGAAAGACCTTCGAGGGCAGCTGAAAATGGTCGACAGT  3033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  GCCTTGTAGACGCCAGGATGCTGGACCACTTGACCAAGAAAGACCTTCGAGGGCAGCTGAAAATGGTCGACAGT  3108

Query 3034  TTTCACAGAAACAGTTTCCAGTGTGGAATTATGTGCCTGAGAAGGTTAAATTATGACCGGAAAGAACTGGAAAG  3107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  TTTCACAGAAACAGTTTCCAGTGTGGAATTATGTGCCTGAGAAGGTTAAATTATGACCGGAAAGAACTGGAAAG  3182

Query 3108  AAAAAGAGAAGAAAGTCAGAGTGAAATAAAAGACGTGCTTGTTTGGAGCAATGATCGAGTGATTCGCTGGATCC  3181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  AAAAAGAGAAGAAAGTCAGAGTGAAATAAAAGACGTGCTTGTTTGGAGCAATGATCGAGTGATTCGCTGGATCC  3256

Query 3182  TGTCAATTGGCCTTAAAGAATATGCAAACAATCTTATAGAGAGTGGTGTTCACGGAGCACTTCTGGCCTTAGAT  3255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  TGTCAATTGGCCTTAAAGAATATGCAAACAATCTTATAGAGAGTGGTGTTCACGGAGCACTTCTGGCCTTAGAT  3330

Query 3256  GAAACCTTCGACTTCAGTGCACTGGCACTGCTGTTACAGATCCCAACGCAGAACACACAGGCTCGTGCTGTCTT  3329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  GAAACCTTCGACTTCAGTGCACTGGCACTGCTGTTACAGATCCCGACGCAGAACACACAGGCTCGTGCTGTCTT  3404

Query 3330  GGAAAGAGAATTTAACAACCTTTTGGTCATGGGGACTGATAGAAGGTTTGATGAAGATGATGATAAAAGCTTTA  3403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  GGAAAGAGAATTTAACAACCTTTTGGTCATGGGGACTGATAGAAGGTTTGATGAAGATGATGATAAAAGCTTTA  3478

Query 3404  GGAGAGCACCTTCATGGAGAAAAAAGTTTAGACCAAAGGACATTCGTGGCTTAGCTGCTGGGTCAGCAGAGACT  3477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479  GGAGAGCACCTTCATGGAGAAAAAAGTTTAGACCAAAGGACATTCGTGGCTTAGCTGCTGGGTCAGCAGAGACT  3552

Query 3478  CTCCCTGCAAACTTCCGGGTGACTTCTTCTATGTCTTCCCCCTCTATGCAGCCAAAGAAGATGCAGATGGACGG  3551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553  CTCCCTGCAAACTTCCGGGTGACTTCTTCTATGTCTTCCCCCTCTATGCAGCCAAAGAAGATGCAGATGGACGG  3626

Query 3552  CAATGTATCAGGAACACAGAGGTTGGATTCTGCTACAGTCAGGACTTACTCCTGC  3606
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627  CAATGTATCAGGAACACAGAGGTTGGATTCTGCTACAGTCAGGACTTACTCCTGC  3681