Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07248
Subject:
XM_017322222.1
Aligned Length:
3701
Identities:
3098
Gaps:
103

Alignment

Query    1  ATGATGTGCGAGGTGATGCCGACCATCAGCGAAGCAGAAGGCCCCCCTGGAGGAGGTGGAGGCCATGGTTCCGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||..|||||||.||.||
Sbjct    1  ATGATGTGCGAGGTGATGCCGACCATTAGTGAAGCAGAAGGCCCTCCAGGAGGAGGTGGGAGCCATGGGTCAGG  74

Query   75  CTCCCCTTCACAGCCAGATGCAGATTCACATTTTGAACAGTTGATGGTCTCCATGCTAGAAGAAAGGGACCGCC  148
            |||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||.|.|||||.||||||.|.||||||.|||||||||
Sbjct   75  CTCCCCTTCACAGCCAGATGCTGATTCGCATTTTGAGCAGCTCATGGTTTCCATGTTGGAAGAACGGGACCGCC  148

Query  149  TTCTTGATACACTGAGAGAGACTCAAGAAACGCTGGCCTTAACCCAGGGGAAGTTACACGAGGTTGGTCATGAA  222
            ||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct  149  TTCTGGACACACTAAGAGAGACACAAGAAACACTGGCATTAACCCAGGGGAAGTTGCATGAAGTTGGTCATGAA  222

Query  223  AGAGATTCCTTGCAGAGACAGCTCAACACAGCACTTCCACAGGAGTTCGCAGCACTTACTAAAGAACTCAATGT  296
            ||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct  223  AGAGATTCTTTGCAGAGGCAGCTCAATACTGCACTTCCACAGGAGTTTGCTGCGCTCACGAAGGAACTCAATGT  296

Query  297  ATGCAGGGAACAGCTCCTTGAAAGGGAAGAAGAAATTGCTGAACTGAAAGCAGAAAGGAATAACACCAGGCTGC  370
            .||||||||.|||||.||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct  297  GTGCAGGGAGCAGCTTCTAGAGAGAGAGGAAGAAATCGCCGAGCTGAAGGCAGAGAGGAACAACACTAGGCTGC  370

Query  371  TGTTAGAGCATTTGGAATGCCTTGTCTCCAGGCATGAGCGGTCTCTTAGGATGACCGTGGTGAAGAGACAAGCG  444
            ||||.|||||..|.||.|||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||.|||||.|||||.||.||.
Sbjct  371  TGTTGGAGCACCTAGAGTGCCTTGTCTCCAGGCATGAGCGCTCTCTCCGGATGACAGTGGTAAAGAGGCAGGCA  444

Query  445  CAGTCTCCAGCAGGCGTGTCCAGCGAAGTGGAAGTGCTGAAAGCACTGAAGTCCTTATTTGAACACCACAAAGC  518
            |||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||..|.|||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGTCACCTGCAGGCGTGTCCAGTGAGGTGGAAGTGCTGAAAGCCCTGAAGTCACTGTTTGAACACCACAAAGC  518

Query  519  TCTGGATGAAAAGGTGAGAGAGCGATTACGAGTAGCACTTGAAAGATGTAGTTTGTTAGAAGAGGAATTAGGTG  592
            ..|||||||.|||||..||||||||.|||||||.||.||.||.||.||.||.||||||||||||||..|.||||
Sbjct  519  CTTGGATGAGAAGGTACGAGAGCGACTACGAGTGGCTCTGGAGAGGTGCAGCTTGTTAGAAGAGGAGCTGGGTG  592

Query  593  CCACACACAAAGAGCTAATGATTCTTAAAGAACAGAATAATCAGAAAAAAACTCTAACAGATGGAGTGCTGGAC  666
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.||||.|||
Sbjct  593  CCACCCACAAAGAGCTAATGATTCTTAAAGAACAGAATAATCAGAAGAAAACACTAACAGATGGACTGCTTGAC  666

Query  667  ATAAACCATGAACAAGAAAATACACCAAGCACGAGTGGAAAGAGATCTTCTGATGGTTCTTTAAGCCACGAGGA  740
            ..||||||||||||.||||.|.||||||||||.|..||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.|||  
Sbjct  667  GGAAACCATGAACAGGAAAGTGCACCAAGCACCAACGGCAAGAGATCTTCTGATGGCTCCTTGAGTCATGAG--  738

Query  741  AGACCTTGCTAAAGTAATTGAGCTCCAAGAAATCATAAGTAAGCAGTCAAGGGAACAGAGCCAAATGAAAGAAC  814
             ||.|||||.|||||..|.|||||.||.|||.|||||...|.||||.|.||.||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct  739  -GATCTTGCCAAAGTGCTGGAGCTGCAGGAAGTCATAGACAGGCAGGCGAGAGAGCAGAGCCAGATGAAGGAGC  811

Query  815  GCCTGGCTTCCCTTTCCAGTCATGTGACAGAACTGGAAGAGGATCTGGACACGGCTAGAAAAGATCTCATCAAA  888
            |||||||.|||||.||||||||||...|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct  812  GCCTGGCCTCCCTGTCCAGTCATGCAGCAGAACTAGAAGAGGATCTGGACACAGCTAGAAAAGACCTCATCAAG  885

Query  889  TCTGAAGAAATGAACACAAAATTGCAACGAGATGTCCGTGAAGCCATGGCCCAAAAGGAAGATATGGAAGAGAG  962
            ||||||||.|||||.||.|||.||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  886  TCTGAAGAGATGAATACGAAACTGCAGCGAGAAGTCCGTGAAGCAATGGCCCAGAAGGAGGATATGGAAGAGAG  959

Query  963  AATCACTACTCTTGAAAAACGCTACCTCGCTGCACAGCGTGAAGCCACATCTGTGCATGACCTCAATGATAAAC  1036
            ||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  960  AATCACCACCCTTGAGAAACGCTACCTCGCCGCACAGCGTGAAGCCACGTCTGTGCATGACCTCAATGACAAAC  1033

Query 1037  TTGAAAATGAAATTGCAAATAAAGATTCTATGCATCGACAGACTGAAGATAAAAACCGCCAGTTACAGGAGCGC  1110
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1034  TTGAAAATGAAATTGCAAATAAAGACTCCATGCACCGACAGACAGAAGACAAGAACCGCCAGTTGCAAGAGCGT  1107

Query 1111  TTGGAATTGGCAGAGCAAAAGCTGCAACAGACACTGAGGAAGGCAGAGACGCTCCCGGAGGTGGAGGCGGAGCT  1184
            .||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||.|.||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1108  CTGGAGTTGGCCGAGCAGAAGCTGCAGCAGACCCTGCGCAAAGCTGAGACGCTGCCAGAGGTGGAGGCTGAGCT  1181

Query 1185  GGCCCAGAGGGTGGCAGCGCTTTCCAAGGCTGAAGAGAGACACGGCAACATTGAAGAAAGGTTACGACAGATGG  1258
            |||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||.|.||.|||||||
Sbjct 1182  GGCCCAGAGGGTGGCTGCACTCTCCAAGGCTGAGGAGAGACATGGCAATATTGAAGAGAGGCTGCGGCAGATGG  1255

Query 1259  AAGCACAGTTGGAGGAGAAGAATCAAGAACTGCAGCGGGCAAGGCAAAGAGAAAAAATGAACGAAGAACATAAT  1332
            |.||||||.||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1256  AGGCACAGCTGGAGGAGAAAAATCAGGAGCTGCAGCGGGCAAGGCAGAGAGAAAAGATGAACGAGGAACATAAT  1329

Query 1333  AAACGTTTATCAGACACTGTTGACAAGCTGCTTTCAGAATCTAATGAGAGGCTTCAACTTCATCTTAAAGAGAG  1406
            ||.||..|.||.||||||||.||.|||.||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 1330  AAGCGCCTGTCTGACACTGTGGATAAGTTGCTCTCAGAATCCAATGAGAGGCTGCAGCTGCATCTGAAGGAGAG  1403

Query 1407  AATGGCTGCTTTGGAAGATAAGAACTCTCTTTTAAGAGAAGTTGAAAGTGCAAAAAAGCAGTTAGAAGGAACAC  1480
            ||||||.||..||||.||.|||||.|||||..||||.||||||||||.||||||.|||||..||||||..||.|
Sbjct 1404  AATGGCGGCGCTGGAGGACAAGAATTCTCTACTAAGGGAAGTTGAAAATGCAAAGAAGCAACTAGAAGAGACCC  1477

Query 1481  AACACGATAAGGATCAGCTTGTCCTAAACATTGAAGCACTGAGGGCTGAACTAGACCACATGAGACTAAGAGGT  1554
            |.||.||||||||.||.||||||.|.|..||||||||.||||.||||||.||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1478  AGCATGATAAGGACCAACTTGTCGTGACTATTGAAGCCCTGAAGGCTGAGCTGGAGCAGATGAGACTGAGAGGT  1551

Query 1555  GCTTCACTTCATCATGGCCGACCCCACTTGGGCAGTGTCCCAGATTTCAGGTTCCCCATGGCAGATGGCCACAC  1628
            .|||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||.|..|||||||.||    ||
Sbjct 1552  CCTTCACTCCATCATGGCCGACCCCATTTGGGCAGCGTCCCGGACTTCAGGTTCTCTGTGGCAGACGG----AC  1621

Query 1629  A----GACTCCTACAGCACCAGTGCAGTGCTGCGGCGCACACAGAAAGGCCGGCTGGCAGCCCTGCGAGATGAG  1698
            |    ||..|.||||||||||||||||||.||||||||.|.|||||.|||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1622  ATGTGGATGCTTACAGCACCAGTGCAGTGTTGCGGCGCCCCCAGAAGGGCCGACTGGCAGCGCTGCGGGATGAG  1695

Query 1699  CCTTCCAAGGTACAAACTCTTAATGAGCAGGATTGGGAACGTGCCCAGCAAGCTAGTGTCTTGGCAAATGTAGC  1772
            ||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1696  CCCTCCAAGGTGCAGACCCTCAATGAGCAGGACTGGGAACGGGCCCAACAAGCCAGCGTCTTGGCAAATGTGGC  1769

Query 1773  ACAAGCATTCGAGAGTGATGCTGACGTGTCTGATGGTGAAGATGACAGGGACACTCTCCTCAGCTCAGTTGACC  1846
            |||.|||||.||||||||||..||.|||||||||||||||||||||.|.||.||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1770  ACAGGCATTTGAGAGTGATGTCGATGTGTCTGATGGTGAAGATGACCGAGATACACTGCTCAGCTCAGTTGATC  1843

Query 1847  TGCTATCGCCCAGCGGGCAGGCCGACGCGCACACACTAGCCATGATGCTTCAGGAGCAGCTGGACGCCATCAAC  1920
            ||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 1844  TGCTGTCACCCAGTGGACAGGCTGATGCCCAGACACTGGCCATGATGCTTCAGGAACAGCTGGATGCTATCAAC  1917

Query 1921  AAAGAGATCAGGTTGATTCAGGAAGAAAAAGAAAATACAGAGCAGCGGGCAGAGGAGATTGAAAGTCGAGTTGG  1994
            ||||||||||||.||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||..||||.||
Sbjct 1918  AAAGAGATCAGGCTGATACAAGAAGAGAAGGAGAATACAGAACAGCGGGCAGAGGAGATCGAGAGCAGAGTGGG  1991

Query 1995  CAGTGGAAGTCTAGACAATCTTGGTCGTTTTAGATCAATGAGCTCCATTCCCCCCTACCCTGCTTCCTCGCTTG  2068
            |||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1992  CAGTGGAAGCTTGGACAATCTTGGTCGTTTTAGATCAATGAGCTCCATTCCCCCCTACCCTGCTTCCTCGCTTG  2065

Query 2069  CTAGCTCCTCCCCTCCGGGCAGTGGGCGCTCCACCCCACGAAGGATCCCTCACAGCCCAGCTCGGGAAGTGGAC  2142
            ||.|||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||.|||||.||||||||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 2066  CTGGCTCCTCTCCTCCAGGCAGTGGTCGGTCCACACCAAGAAGGGTCCCTCACAGTCCTGCCCGGGAGGTGGAC  2139

Query 2143  AGACTGGGCGTCATGACCCTTTTGCCACCTTCCAGAGAAGAGGTACGAGATGACAAGACAACCATAAAGTGTGA  2216
            ||.|||||.||||||||.||.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 2140  AGGCTGGGTGTCATGACTCTGTTGCCAGCTTCCAGAGAAGAGGTACGAGACGACAAGACGACGATAAAATGTGA  2213

Query 2217  AACCTCCCCGCCTTCCTCCCCGAGAGCCCTTCGGTTAGACCGGCTGCACAAAGGGGCGCTGCACACCGTTAGCC  2290
            ||||||.||.||.|||||||||||..||||.||.||||||.||.|||||||.||.||.|.||||||.||.||||
Sbjct 2214  AACCTCTCCCCCCTCCTCCCCGAGGCCCCTGCGCTTAGACAGGATGCACAAGGGCGCACCGCACACGGTCAGCC  2287

Query 2291  ACGAGGACATCAGGGACATAAGGAACTCCACAGGCTCCCAGGATGGTCCCGTGAGCAACCCCAGCAGTAGCAAC  2364
            |.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.
Sbjct 2288  ATGAGGACATCAGGGACCTGAGGAACTCCACAGGCTCCCAGGATGGTCCCGTGAGCAACCCTAGCAGCAGTAAT  2361

Query 2365  AGTAGCCAGGACTCGCTCCACAAAGCCCCAAAGAAGAAAGGCATTAAGTCCTCCATTGGCCGCTTGTTTGGCAA  2438
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2362  AGTAGCCAGGACTCCCTCCACAAAGCCCCAAAGAAGAAGGGTATCAAATCCTCCATTGGCCGCTTGTTTGGGAA  2435

Query 2439  GAAAGAAAAGGGCCGACCTGGACAAACT-GGCAAAGAAGCATTAGGACAAGCTGGTGTTTCCGAGACGGATAAC  2511
            |||.|||||||||||.|||||.| .||| |||||.||..||..|||.||||.|||||||||.|||||.||.||.
Sbjct 2436  GAAGGAAAAGGGCCGGCCTGGTC-CACTGGGCAAGGAGTCACCAGGGCAAGTTGGTGTTTCAGAGACAGAAAAT  2508

Query 2512  TCATCTCAGGATGCCTTGGGACTTAGCAAATTGGGGGGACAGGCTGAAAAAAATCGTAAACTTCAAAAAAAGCA  2585
            ||||||||.||||||.|||||||.||||||.||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 2509  TCATCTCAAGATGCCCTGGGACTCAGCAAACTGGGAGGACAAGCTGAGAAAAACCGTAAACTTCAGAAAAAGCA  2582

Query 2586  TGAATTGCTGGGGGAAGCCCGGAGACAAGGTTTACCTTTTGCCCAATGGGACGGGCCAACGGTTGTGGTCTGGC  2659
            .||..||||||.|||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.||.|||.
Sbjct 2583  CGAGCTGCTGGAGGAGGCCCGCAGGCAAGGCTTGCCTTTTGCACAGTGGGATGGGCCCACAGTGGTAGTGTGGT  2656

Query 2660  TAGAGCTCTGGGTTGGGATGCCAGCCTGGTATGTGGCTGCCTGCCGAGCAAACGTGAAAAGCGGGGCCATCATG  2733
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 2657  TAGAGCTCTGGGTTGGGATGCCTGCCTGGTATGTGGCTGCTTGCCGAGCAAATGTCAAGAGTGGTGCCATCATG  2730

Query 2734  TCGGCCCTGTCCGACACAGAGATCCAGCGTGAGATTGGCATCAGCAACCCCCTGCACAGGCTGAAGCTGAGGCT  2807
            ||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct 2731  TCAGCCCTGTCAGACACTGAGATCCAGCGGGAGATTGGCATCAGCAACCCCCTGCATAGGCTGAAGCTGCGGCT  2804

Query 2808  GGCCATCCAGGAGATCATGTCGCTGACCAGCCCGTCTGCCCCGCCCACATCTAGAACGAC--------------  2867
            |||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||              
Sbjct 2805  GGCCATCCAAGAGATAATGTCACTGACTAGCCCTTCTGCTCCACCCACATCCAGGACGACCACAGGAAATGTCT  2878

Query 2868  --------------------------------------------------------------------------  2867
                                                                                      
Sbjct 2879  GGTTGACACATGAAGAGATGGAAACGCTTACAGCCACGCCACAAACGGAAGACGAGGAGGGAAGCTGGGCTCAG  2952

Query 2868  ACTC--GCCTATGGGGACATGAACCACGAGTGGATCGGCAACGAGTGGCTCCCCAGCCTGGGCCTCCCCCAGTA  2939
            ||||  ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 2953  ACTCTAGCATATGGGGACATGAACCACGAGTGGATCGGCAATGAGTGGCTGCCCAGCCTGGGCCTGCCGCAGTA  3026

Query 2940  CCGCAGCTACTTCATGGAGTGCCTTGTAGACGCCAGGATGCTGGACCACTTGACCAAGAAAGACCTTCGAGGGC  3013
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 3027  CCGCAGCTACTTTATGGAGTGCCTTGTAGATGCCCGGATGCTGGACCACTTGACCAAGAAAGACTTGCGAGGGC  3100

Query 3014  AGCTGAAAATGGTCGACAGTTTTCACAGAAACAGTTTCCAGTGTGGAATTATGTGCCTGAGAAGGTTAAATTAT  3087
            |||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 3101  AGCTGAAGATGGTCGACAGCTTCCACAGAAACAGTTTCCAGTGTGGAATTATGTGCCTGAGAAGGCTAAATTAT  3174

Query 3088  GACCGGAAAGAACTGGAAAGAAAAAGAGAAGAAAGTCAGAGTGAAATAAAAGACGTGCTTGTTTGGAGCAATGA  3161
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|.||.|||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 3175  GACCGAAAAGAACTGGAAAGAAAAAGAGAAGAGAGTCAGAATGAGACAAGAGATGTGCTTGTGTGGAGCAATGA  3248

Query 3162  TCGAGTGATTCGCTGGATCCTGTCAATTGGCCTTAAAGAATATGCAAACAATCTTATAGAGAGTGGTGTTCACG  3235
            .||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 3249  CCGGGTGATTCGCTGGATCCTGTCGATTGGCCTTAAAGAGTATGCCAACAACCTAATAGAGAGCGGTGTTCACG  3322

Query 3236  GAGCACTTCTGGCCTTAGATGAAACCTTCGACTTCAGTGCACTGGCACTGCTGTTACAGATCCCAACGCAGAAC  3309
            |.|||||||||||.||.||.||.||.|||||.||||||||.||||||||..||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 3323  GTGCACTTCTGGCTTTGGACGAGACTTTCGATTTCAGTGCCCTGGCACTCTTGTTACAGATTCCAACACAGAAT  3396

Query 3310  ACACAGGCTCGTGCTGTCTTGGAAAGAGAATTTAACAACCTTTTGGTCATGGGGACTGATAGAAGGTTTGATGA  3383
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||.||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct 3397  ACGCAGGCTCGAGCTGTCTTGGAAAGAGAATTCAACAACCTTTTGATCACGGGGACTGATCGGAGGTTTGATGA  3470

Query 3384  AGATGATGATAAAAGCTTTAGGAGAGCACCTTCATGGAGAAAAAAGTTTAGACCAAAGGACATTCGTGGCTTAG  3457
            .||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 3471  GGATGATGACAAAAGCTTCAGGAGGGCGCCTTCCTGGAGGAAGAAGTTCAGACCAAAGGACATTCGTGGCTTGG  3544

Query 3458  CTGCTGGGTCAGCAGAGACTCTCCCTGCAAACTTCCGGGTGACTTCTTCTATGTCTTCCCCCTCTATGCAGCCA  3531
            |..||||.||.||||||||..|.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 3545  CCTCTGGCTCTGCAGAGACGTTGCCTGCCAACTTCCGGGTCACCTCCTCAATGTCATCTCCCTCTATGCAGCCA  3618

Query 3532  AAGAAGATGCAGATGGACGGCAATGTATCAGGAACACAGAGGTTGGATTCTGCTACAGTCAGGACTTACTCCTG  3605
            ||||||.|.|||||||||||.|.|||.||.|||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 3619  AAGAAGGTTCAGATGGACGGTAGTGTGTCCGGAGCACAGAGGTTGGACTCTGCCACAGTCAGGACTTACTCCTG  3692

Query 3606  C  3606
            |
Sbjct 3693  C  3693