Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07269
• Subject: XM_006537837.1
• Aligned Length: 1143
• Identities: 984
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ATGGGCGCCGCAGCCGCTGAGGCGCCGCTCCGGCTGCCTGCCGCGCCTCCGCTCGCCTTCTGCTGCTACACGTC  74
            |||||||||         .|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCGCC---------CAGGCGCCGCTCCGGCTGCCGGCCGCGCCCCCGCTCGCCGTCTGCGGCTACACGTC  65

Query   75  GGTGCTTCTGCTCTTCGCCTTCTCTCTGCCAGGGAGCCGCGCGTCCAACCAGCCCCCGGGTGGTGGCGGCGGCA  148
            |||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||||||||||||||||||.||            |||.
Sbjct   66  GGTGCTTCTGCTCTTCGCCTTCTGCCTGCCCGGGAGCCGCGCGTCCAACCAGCCCGCG------------GGCG  127

Query  149  GCGGCGGGGACTGTCCCGGCGGCAAAGGCAAGAGCATCAACTGCTCAGAATTAAATGTGAGGGAGTCTGACGTA  222
            ||||||||||||||||.||.||||.|||||||||   |||||||||||||||||||.||||.||.||||||.|.
Sbjct  128  GCGGCGGGGACTGTCCGGGAGGCAGAGGCAAGAG---CAACTGCTCAGAATTAAATCTGAGAGAATCTGACATC  198

Query  223  AGAGTTTGTGATGAGTCATCATGTAAATATGGAGGAGTCTGTAAAGAAGATGGAGATGGTTTGAAATGTGCATG  296
            |||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  199  AGAGTGTGTGATGAATCATCTTGTAAATATGGAGGTGTCTGCAAAGAAGATGGAGATGGTTTGAAATGCGCATG  272

Query  297  CCAATTTCAGTGCCATACAAATTATATTCCTGTCTGTGGATCAAATGGGGACACTTATCAAAATGAATGCTTTC  370
            |||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.|||||||
Sbjct  273  CCAGTTTCAGTGCCATACAAATTACATCCCTGTCTGTGGGTCAAACGGGGACACCTACCAGAATGAGTGCTTTC  346

Query  371  TCAGAAGGGCTGCTTGTAAGCACCAGAAAGAGATAACAGTAATAGCAAGAGGACCATGCTACTCTGATAATGGA  444
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||..|.||..|.|||||.||||||||||||||.||.
Sbjct  347  TCAGGAGGGCTGCTTGCAAGCACCAGAAAGACATAACCGTGGTGGCGCGTGGACCTTGCTACTCTGATAACGGC  420

Query  445  TCTGGATCTGGAGAAGG---AGAAGAGGAAGGGTCAGGGGCAGAAGTTCACAGAAAACACTCCAAGTGTGGACC  515
            |||||||||||||||||   |||.||||||||.|||||.||||..|.||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  421  TCTGGATCTGGAGAAGGAGCAGAGGAGGAAGGCTCAGGAGCAGGGGCTCACAGGAAACATTCCAAGTGTGGACC  494

Query  516  CTGCAAATATAAAGCTGAGTGTGATGAAGATGCAGAAAATGTTGGGTGTGTATGTAATATAGATTGCAGTGGAT  589
            .|||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  495  GTGCAAGTACAAGGCCGAGTGTGACGAGGATGCGGAGAACGTTGGGTGTGTATGTAATATAGACTGCAGTGGGT  568

Query  590  ACAGTTTTAATCCTGTGTGTGCTTCTGATGGGAGTTCCTATAACAATCCCTGTTTTGTTCGAGAAGCATCTTGT  663
            ||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||
Sbjct  569  ACAGCTTTAACCCTGTGTGCGCTTCCGACGGGAGTTCCTATAACAATCCCTGTTTCGTCCGAGAAGCGTCGTGT  642

Query  664  ATAAAGCAAGAACAAATTGATATAAGGCATCTTGGTCATTGCACAGATACAGATGACACTAGTTTGTTGGGAAA  737
            ||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||....|||||.||||||||
Sbjct  643  ATAAAGCAAGAACAGATCGACATAAGGCATCTCGGCCACTGCACAGACACAGATGATGTGAGTTTATTGGGAAA  716

Query  738  GAAAGATGATGGACTACAATATCGACCAGATGTGAAAGATGCTAGTGATCAAAGAGAAGATGTTTATATTGGAA  811
            |||.||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||||      |||||.||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  717  GAAGGACGACGGGCTGCAGTATCGGCCAGATGTGAAAG------GTGATGAAAGGGAAGATGTTTATATCGGAA  784

Query  812  ACCACATGCCTTGCCCTGAAAACCTCAATGGTTACTGCATCCATGGAAAATGTGAATTCATCTATTCTACTCAG  885
            .||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  785  GCCACATGCCTTGCCCTGAAAACCTCAATGGGTACTGCATCCATGGGAAATGTGAATTCATCTACTCTACTCAG  858

Query  886  AAGGCTTCTTGTAGATGTGAATCTGGCTACACTGGACAGCACTGTGAAAAGACAGACTTTAGTATTCTCTATGT  959
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  859  AAGGCCTCTTGTAGATGTGAATCTGGTTACACTGGACAGCACTGTGAGAAGACGGACTTTAGTATTCTCTATGT  932

Query  960  AGTGCCAAGTAGGCAAAAGCTCACTCATGTTCTTATTGCAGCAATTATTGGAGCTGTACAGATTGCCATCATAG  1033
            |||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  933  AGTACCAAGTAGGCAGAAGCTCACCCATGTTCTTATCGCAGCCATTATTGGAGCAGTACAGATCGCCATTATAG  1006

Query 1034  TAGCAATTGTAATGTGCATAACAAGAAAATGCCCCAAAAACAATAGAGGACGTCGACAGAAGCAAAACCTAGGT  1107
            |||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||..|.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1007  TAGCAATCGTCATGTGCATAACAAGGAAATGCCCCAAGAACAATAGAGGGCGGAGGCAGAAGCAGAACCTGGGT  1080

Query 1108  CATTTTACTTCAGATACGTCATCCAGAATGGTT  1140
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1081  CATTTTACTTCAGACACTTCATCCAGAATGGTC  1113