Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07308
• Subject: NM_001317034.1
• Aligned Length: 885
• Identities: 777
• Gaps: 105

Alignment

Query   1  ATGGCCTCCTTGGAGGTCAGTCGTGGTCCTCGCAGGTCTCGGCGGGAGCTGGAAGTGCGCAGTCCACGACAGAA  74
           ||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCCTCCTTGGAAGTCAGTCGTAGTCCTCGCAGGTCTCGGCGGGAGCTGGAAGTGCGCAGTCCACGACAGAA  74

Query  75  CAAATATTCGGTGCTTTTACCTACCTACAACGAGCGCGAGAACCTGCCGCTCATCGTGTGGCTGCTGGTGAAAA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CAAATATTCGGTGCTTTTACCTACCTACAACGAGCGCGAGAACCTGCCGCTCATCGTGTGGCTGCTGGTGAAAA  148

Query 149  GCTTCTCCGAGAGTGGAATCAACTATGAAATTATAATCATAGATGATGGAAGCCCAGATGGAACAAGGGATGTT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GCTTCTCCGAGAGTGGAATCAACTATGAAATTATAATCATAGATGATGGAAGCCCAGATGGAACAAGGGATGTT  222

Query 223  GCTGAACAGTTGGAGAAGATCTATGGGTCAGACAGAATTCTTCTAAGACCACGAGAGAAAAAGTTGGGACTAGG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GCTGAACAGTTGGAGAAGATCTATGGGTCAGACAGAATTCTTCTAAGACCACGAGAGAAAAAGTTGGGACTAGG  296

Query 297  AACTGCATATATTCATGGAATGAAACATGCCACAGGAAACTACATCATTATTATGGATGCTGATCTCTCACACC  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AACTGCATATATTCATGGAATGAAACATGCCACAGGAAACTACATCATTATTATGGATGCTGATCTCTCACACC  370

Query 371  ATCCAAAATTTATTCCTGAATTTATTAGGAAGCAAAAGGAGGGTAATTTTGATATTGTCTCTGGAACTCGCTAC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ATCCAAAATTTATTCCTGAATTTATTAGGAAGCAAAAGGAGGGTAATTTTGATATTGTCTCTGGAACTCGCTAC  444

Query 445  AAAGGAAATGGAGGTGTATATGGCTGGGATTTGAAAAGAAAAATAAT---------------------------  491
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct 445  AAAGGAAATGGAGGTGTATATGGCTGGGATTTGAAAAGAAAAATAATCAGTGATGGAGTTTTGCCATGTTGCCC  518

Query 492  --------------------------------------------------------------------------  491
                                                                                     
Sbjct 519  AGGCTGGTCACTCCTGGGCTCAAGTGATCCAGCCATCTTGGCCTCCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCC  592

Query 492  ----CAGCCGTGGGGCCAATTTTTTAACTCAGATCTTGCTGAGACCAGGAGCATCTGATTTAACAGGAAGTTTC  561
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  TAGCCAGCCGTGGGGCCAATTTTTTAACTCAGATCTTGCTGAGACCAGGAGCATCTGATTTAACAGGAAGTTTC  666

Query 562  AGATTATACCGAAAAGAAGTTCTAGAGAAATTAATAGAAAAATGTGTTTCTAAAGGCTACGTCTTCCAGATGGA  635
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  AGATTATACCGAAAAGAAGTTCTAGAGAAATTAATAGAAAAATGTGTTTCTAAAGGCTACGTCTTCCAGATGGA  740

Query 636  GATGATTGTTCGGGCAAGACAGATGAATTATACTATTGGCGAGGTTCCAATATCATTTGTGGATCGTGTTTATG  709
           ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  GATGATTGTTCGGGCAAGACAGTTGAATTATACTATTGGCGAGGTTCCAATATCATTTGTGGATCGTGTTTATG  814

Query 710  GTGAATCCAAGTTGGGAGGAAATGAAATAGTATCTTTCTTGAAAGGATTATTGACTCTTTTTGCTACTACA  780
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  GTGAATCCAAGTTGGGAGGAAATGAAATAGTATCTTTCTTGAAAGGATTATTGACTCTTTTTGCTACTACA  885