Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07309
- Subject:
- NM_001310084.1
- Aligned Length:
- 784
- Identities:
- 624
- Gaps:
- 77
Alignment
Query 1 ATGGCCTCCTTGGAAGTCAGTCGTAGTCCTCGCAG-GTCTCGGCGGGAGCTGGAAGTGCGCAGTC--CACGACA 71
|||||.|||..||..|..|||||.||| ||.||.| |||||.||||..||.|.|.|..||| || |.|||||
Sbjct 1 ATGGCTTCCACGGGGGCGAGTCGCAGT-CTTGCTGCGTCTCCGCGGCCGCCGCAGGGCCGC--TCCTCGCGACA 71
Query 72 GAACAAATATTCGGTGCTTTTACCTACCTACAACGAGCGCGAGAACCTGCCGCTCATCGTGTGGCTGCTGGTGA 145
|.||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 72 GGACAAGTACTCGGTGCTGTTGCCCACCTACAACGAACGGGAGAACCTGCCGCTCATCGTGTGGCTGCTGGTGA 145
Query 146 AAAGCTTCTCCGAGAGTGGAATCAACTATGAAATTATAATCATAGATGATGGAAGCCCAGATGGAACAAGGGAT 219
|.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct 146 AGAGCTTCTCCGAGAGTGCAATCAACTATGAAATTATAATCATAGATGATGGAAGCCCAGACGGGACAAGAGAA 219
Query 220 GTTGCTGAACAGTTGG-AGAAGATCTATGGGTCAGACAGAATTCTTCTAAGACCACGAGAGAAAAAGTTGGGAC 292
|||||||||||..||| || |||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct 220 GTTGCTGAACAACTGGCAG-AGATCTATGGGCCCGACAGAATTCTCCTAAGACCACGAGAGAAAAAGCTGGGTC 292
Query 293 TAGGAACTGCATATATTCATGGAATGAAACATGCCACAGGAAACTACATCATTATTATGGATGCTGATCTCTCA 366
|.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||..|.||.||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 293 TCGGAACTGCCTACATTCATGGAATCAAACACGCCACGGGGAACTATGTGATCATCATGGATGCTGACCTCTCC 366
Query 367 CACCATCCAAAATTTATTCCTGAATTTATTAGGAAGCAAAAGGAGGGTAATTTTGATATTGTCTCTGGAACTCG 440
||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367 CACCATCCCAAATTTATTCCTGAATTTATCAGGAAACAAAAGGAGGGTAATTTTGATATTGTCTCTGGAACTCG 440
Query 441 CTACAAAGGAAATGGAGGTGTATATGGCTGGGATTTGAAAAGAAAAATAATCAGCCGTGGGGCCAATTTTTTAA 514
.|||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 441 ATACAAGGGGAATGGGGGTGTTTATGGATGGGATTTGAAAAGAAAGATAA------------------------ 490
Query 515 CTCAGATCTTGCTGAGACCAGGAGCATCTGATTTAACAGGAAGTTTCAGATTATACCGAAAAGAAGTTCTAGAG 588
||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 491 ---------------------------------------------TCAGATTATACCGAAAAGAAGTTCTACAG 519
Query 589 AAATTAATAGAAAAATGTGTTTCTAAAGGCTACGTCTTCCAGATGGAGATGATTGTTCGGGCAAGACAGTTGAA 662
||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 520 AAATTAATAGAAAAATGTGTCTCCAAAGGCTATGTCTTTCAGATGGAAATGATTGTTCGAGCAAGACAGATGAA 593
Query 663 TTATACTATTGGCGAGGTTCCAATATCATTTGTGGATCGTGTTTATGGTGAATCCAAGTTGGGAGGAAATGAAA 736
|||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 594 TTACACTATTGGTGAGGTTCCAATTTCATTTGTGGATCGAGTTTATGGTGAATCCAAGTTGGGAGGAAATGAAA 667
Query 737 TAGTATCTTTCTTGAAAGGATTATTGACTCTTTTTGCTACTATA 780
||||.||.|||.|||||||.|||||||||||.||||||||.|.|
Sbjct 668 TAGTCTCGTTCCTGAAAGGGTTATTGACTCTCTTTGCTACCACA 711