Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07314
• Subject: NM_001098168.1
• Aligned Length: 2898
• Identities: 2507
• Gaps: 39

Alignment

Query    1  ATGCCGGACCAGATCTCCGTGTCGGAATTCGTGGCCGAGACCCATGAGGACTACAAGGCGCCCACGGCCTCCAG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGCCGGACCAGATCTCCGTGTCGGAATTCGTGGCCGAGACCCATGAGGACTACAAGGCGCCCACGGCCTCTAG  74

Query   75  CTTCACCACCCGCACGGCGCAGTGCCGGAACACTGTGGCGGCCATCGAGGAGGCTTTGGACGTGGACCGGATGG  148
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTCACCACGCGCACGGCCCAGTGCCGGAACACCGTGGCGGCCATCGAGGAGGCTTTGGACGTGGACCGGATGG  148

Query  149  TTCTTTACAAAATGAAGAAATCCGTGAAAGCAATCAACAGCTCTGGGCTGGCTCACGTGGAAAATGAAGAGCAG  222
            ||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|.||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||
Sbjct  149  TTCTCTACAAAATGAAGAAATCTGTGAAGGCAATCAATATCTCTGGGCTGGCACACGTGGAGAACGAGGAACAG  222

Query  223  TACACCCAGGCTCTGGAGAAGTTTGGCGGCAACCGTGTATGCAGAGATGACCCAGATTTAGGAAGTGCGTTCCT  296
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  223  TACACCCAGGCTCTGGAGAAGTTCGGTGGCAACTGTGTGTGCAGAGATGATCCAGACTTAGGAAGCGCGTTTCT  296

Query  297  GAAGTTCTCAGTGTTTACAAAGGAGTTGACAGCACTTTTCAAAAACCTGATTCAGAATATGAACAACATAATCT  370
            |||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  297  GAAGTTCTCTGTGTTCACCAAGGAGTTGACGGCACTCTTCAAAAACCTGATTCAGAACATGAACAACATCATCT  370

Query  371  CCTTCCCTTTGGACAGTTTGCTGAAGGGGGACCTGAAAGGAGTGAAAGGGGATCTGAAAAAGCCTTTTGATAAA  444
            |.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  CGTTCCCTTTGGACAGTTTGCTGAAAGGAGATCTGAAAGGAGTAAAAGGGGATCTGAAAAAGCCCTTTGATAAA  444

Query  445  GCTTGGAAGGACTATGAAACAAAAATAACCAAGATAGAAAAGGAGAAAAAGGAACACGCCAAGCTCCATGGGAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct  445  GCTTGGAAGGACTATGAAACAAAAATAACCAAAATAGAAAAGGAGAAAAAGGAGCATGCCAAGCTCCACGGGAT  518

Query  519  GATTCGGACTGAAATAAGCGGAGCGGAAATTGCCGAAGAGATGGAAAAGGAGAGGCGCTTCTTCCAGCTACAGA  592
            ||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  519  GATTCGTACTGAAATAAGCGGGGCTGAGATTGCAGAGGAGATGGAGAAGGAAAGACGGTTCTTCCAGCTGCAGA  592

Query  593  TGTGCGAGTATCTGCTGAAGGTCAACGAAATCAAGATTAAAAAGGGAGTAGATTTACTTCAGAATCTGATCAAA  666
            ||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  593  TGTGTGAGTACCTGCTGAAGGTCAATGAAATCAAGGTGAAAAAGGGAGTGGATTTGCTTCAGAATCTGATCAAG  666

Query  667  TACTTTCATGCCCAATGCAATTTTTTTCAGGATGGACTCAAAGCCGTGGAAAGCCTCAAACCTTCCATTGAAAC  740
            ||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  667  TACTTTCACGCCCAGTGCAATTTTTTCCAGGATGGATTGAAAGCAGTAGAAAGCCTCAAGCCTTCCATCGAGAC  740

Query  741  GCTGTCTACGGATCTTCACACGATCAAACAGGCCCAGGATGAAGAAAGAAGGCAGTTGATACAGCTTCGAGATA  814
            |||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.|..|.|||.|||||||.||||||||||
Sbjct  741  GCTCTCCACGGACCTCCACACCATCAAACAGGCCCAGGATGAGGAACGGCGACAGCTGATACAACTTCGAGATA  814

Query  815  TTTTGAAATCCGCATTGCAGGTTGAACAGAAAGAG---------GACTCCCAAATTCGTCAGAGCACAGCTTAT  879
            |||||||.||.|||||||||||.||||||||||||         |||||.|||.||||.||.||.|||||.||.
Sbjct  815  TTTTGAAGTCAGCATTGCAGGTGGAACAGAAAGAGTCTAGGAGAGACTCACAACTTCGCCAAAGTACAGCCTAC  888

Query  880  AGCTTACATCAGCCTCAGGGAAACAAGGAACATGGGACCGAGCGGAACGGCAGCCTCTACAAGAAGAGTGACGG  953
            |||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.|||||||.|.|||||||||||||||.||.||
Sbjct  889  AGCTTACATCAACCTCAGGGAAACAAGGAGCATGGAACAGAGAGGAACGGGAACCTCTACAAGAAGAGCGATGG  962

Query  954  GATCCGAAAAGTGTGGCAGAAAAGGAAATGTTCAGTTAAAAATGGTTTTCTGACCATATCCCATGGTACCGCTA  1027
            ||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct  963  GATCCGGAAAGTGTGGCAGAAGAGGAAGTGTTCCGTTAAAAATGGCTTCCTCACCATCTCCCACGGCACTGCCA  1036

Query 1028  ACCGGCCTCCTGCAAAGCTCAACCTGCTAACCTGCCAGGTGAAGACCAACCCTGAGGAGAAGAAGTGCTTTGAC  1101
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1037  ACCGGCCACCTGCCAAGCTCAACCTGCTAACCTGCCAGGTGAAGACCAATCCTGAGGAGAAGAAGTGTTTCGAC  1110

Query 1102  CTTATTTCACATGACAGAACTTACCACTTTCAAGCTGAAGATGAACAGGAATGTCAAATATGGATGTCTGTGCT  1175
            ||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1111  CTCATATCACATGACAGGACGTACCACTTCCAAGCGGAAGACGAACAAGAATGTCAGATATGGATGTCTGTACT  1184

Query 1176  GCAAAATAGCAAAGAAGAAGCTTTAAACAATGCATTTAAGGGGGATGACAATACTGGAGAAAATAACATCGTCC  1249
            |||.||.|||||.|||||||||.|.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCAGAACAGCAAGGAAGAAGCTCTGAACAACGCCTTTAAGGGTGATGACAACACTGGAGAAAATAACATCGTCC  1258

Query 1250  AAGAACTGACAAAGGAGATCATCTCAGAAGTGCAGAGGATGACGGGCAATGACGTCTGCTGTGACTGTGGGGCG  1323
            ||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1259  AAGAGCTGACCAAGGAGATCATCTCGGAGGTGCAGAGGATGACGGGCAATGACGTGTGCTGCGACTGTGGGGCA  1332

Query 1324  CCAGATCCTACATGGCTTTCCACCAACCTGGGCATCCTGACCTGCATCGAGTGTTCCGGAATCCACCGAGAGCT  1397
            ||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct 1333  CCAGATCCGACGTGGCTCTCTACCAACCTGGGCATCCTGACTTGCATCGAGTGCTCTGGGATCCACCGGGAGCT  1406

Query 1398  GGGGGTTCATTATTCCAGGATGCAGTCCCTGACCTTAGATGTACTGGGAACATCTGAGCTGCTGCTCGCCAAGA  1471
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1407  GGGGGTTCATTACTCCAGGATGCAGTCCCTGACATTAGATGTATTGGGAACGTCTGAGCTTCTGCTTGCCAAGA  1480

Query 1472  ATATTGGGAATGCAGGCTTTAATGAGATCATGGAATGTTGCCTACCAGCTGAGGACTCAGTCAAACCCAACCCA  1545
            ||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||..||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 1481  ATATCGGGAATGCAGGCTTTAATGAAATTATGGAGTGTTGCCTACCGTCTGAGGACCCAGTCAAGCCCAACCCA  1554

Query 1546  GGCAGCGACATGAATGCAAGAAAGGACTACATCACAGCCAAGTACATCGAGAGGAGATACGCAAGGAAGAAGCA  1619
            |||||.|||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.||||.|||||
Sbjct 1555  GGCAGTGACATGATTGCAAGGAAGGACTACATCACAGCCAAGTACATGGAGAGGAGATATGCACGGAAAAAGCA  1628

Query 1620  CGCGGATAACGCGGCGAAGCTTCACAGTCTTTGCGAGGCCGTCAAAACGAGAGATATTTTTGGATTGCTCCAAG  1693
            .||.||.|.||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 1629  TGCCGACACCGCGGCGAAGCTCCACAGCCTTTGCGAGGCCGTCAAGACCAGAGACATTTTTGGGTTACTCCAAG  1702

Query 1694  CTTATGCTGATGGTGTGGATCTTACGGAAAAAATCCCACTGGCCAACGGACATGAGCCGGATGAAACGGCCCTC  1767
            |||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1703  CTTATGCTGATGGTGTGGACCTGACAGAGAAAATCCCACTGGCCAATGGGCATGAGCCAGATGAGACAGCCCTC  1776

Query 1768  CACCTTGCAGTCAGATCCGTGGATCGAACCTCTCTTCACATTGTAGACTTTTTAGTTCAGAACAGTGGGAACCT  1841
            ||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||..|.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1777  CATCTTGCAGTCAGATCTGTGGACCGGACTTCCCTTCACATTGTAGACTTCCTGGTCCAGAACAGTGGGAACCT  1850

Query 1842  GGATAAACAGACAGGGAAAGGCAGCACAGCCCTGCACTACTGCTGCCTGACCGACAATGCCGAGTGCCTCAAGT  1915
            |||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.
Sbjct 1851  GGATAAACAGACAGGCAAGGGCAGCACAGCCCTGCACTACTGCTGCCTGACAGACAATGCTGAGTGCCTCAAGC  1924

Query 1916  TGCTCCTGCGGGGGAAGGCCTCCATCGAGATAGCAAACGAGTCAGGAGAGACTCCGCTGGACATTGCCAAGCGC  1989
            |.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||.
Sbjct 1925  TCCTCCTGCGGGGAAAAGCCTCCATTGAGATAGCCAATGAGTCAGGAGAGACCCCGTTGGACATTGCTAAGCGG  1998

Query 1990  CTCAAGCACGAGCACTGTGAGGAGCTGCTGACCCAAGCCTTATCTGGAAGATTTAATTCTCACGTTCACGTTGA  2063
            |||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||..|.|||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1999  CTCAAGCACGAACACTGTGAGGAACTGCTCACTCAGGCCTTGTCGGGGCGGTTTAACTCCCATGTTCACGTCGA  2072

Query 2064  ATATGAATGGCGACTACTCCACGAAGACCTGGATGAAAGTGATGACGACATGGATGAGAAATTGCAGCCCAGTC  2137
            .|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||..||||.|||||..|.|||||.||||
Sbjct 2073  GTATGAATGGCGGCTGCTGCACGAGGACCTGGATGAGAGCGACGACGATGTGGACGAGAAGCTACAGCCTAGTC  2146

Query 2138  CCAACCGGCGGGAAGACCGGCCCATCAGCTTCTACCAGCTGGGCTCCAACCAGCTTCAGTCTAACGCTGTATCT  2211
            |||||||.|||||.||||||||..|.|||||||||||||||||.||||.||||.|||||||.||.|||||.|||
Sbjct 2147  CCAACCGACGGGAGGACCGGCCTGTTAGCTTCTACCAGCTGGGGTCCAGCCAGTTTCAGTCCAATGCTGTGTCT  2220

Query 2212  TTGGCCAGAGATGCTGCAAACCTTGCCAAGGACAAGCAGA-GGGCTTTCATGCCCAGCATCTTGCAGAATGAGA  2284
            ||||||||||||.||||||||||..||||||||||||||| ||||||| ..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TTGGCCAGAGATACTGCAAACCTCACCAAGGACAAGCAGAGGGGCTTT-GGGCCCAGCATCTTGCAGAATGAGA  2293

Query 2285  CTTACGGAGCCCTCCTGAGTGGCAGCCCACCTCCCGCCCAGCCTGCAGCCCCCAGCACCACCAGCGCCCCCCCG  2358
            |.||.||||||.||||||||||||||||.||..||.|||||.|...|.|||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2294  CCTATGGAGCCATCCTGAGTGGCAGCCCGCCCTCCTCCCAGTCAATACCCCCCAGCACCACCAGCGCACCCCCG  2367

Query 2359  CTTCCTCCACGGAATGTTGGCAAAGATCCCCTGACCCCCACGCCGCCCCCACCCGTTGCCAAGACGCCCAGC-G  2431
            ||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||||.||.||.||.||||    ||.| |
Sbjct 2368  CTCCCACCTCGGAATGTTGGCAAAGATCCCCTGACCACCACACCACCCCCTCCTGTGGCTAAGA----CATCAG  2437

Query 2432  TAA---TGGAAGCCTTGAGCCAGCCGAGCAAG-CCTGCCCCGCCTGGGATCTCACAGATCAGGCCCCCACCTCT  2501
            .||   |.||||||.|||.||||||||||||| ||| |||..|||||||.||||||||.||.||||||.||.||
Sbjct 2438  GAACTCTAGAAGCCATGAACCAGCCGAGCAAGTCCT-CCCAACCTGGGACCTCACAGAGCAAGCCCCCGCCCCT  2510

Query 2502  GCCCCCACAGCCGCCCAGCCGCCTCCCGCAGAAGAAGCCTGCGCCGGGGGCTGACAAGTCCACCCCACTGACCA  2575
            |||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||..|.|||.||||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct 2511  GCCACCTCAGCCACCCAGCCGCCTGCCTCAGAAGAAACCAGCTTCCGGGACTGACAAGCCAACCCCGCTGACCA  2584

Query 2576  ACAAAGGCCAACCGAGAGGACCTGTGGATCTCTCTGCAACGGAAGCTCTGGGTCCTCTGTCCAATGCTATGGTC  2649
            |||||||.||.||||||||||||                  ||||||..|||||||||||||||.||.||||.|
Sbjct 2585  ACAAAGGACAGCCGAGAGGACCT------------------GAAGCTTCGGGTCCTCTGTCCAACGCCATGGCC  2640

Query 2650  CTGCAGCCCCCTGCACCCATGCCTAGGAAGTCGCAGGCAACCAAGTTGAAGCCTAAGCGGGTGAAAGCGCTCTA  2723
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||..|||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 2641  CTGCAGCCCCCAGCACCCATGCCTAGGAAGTCACAGGCGACCAAGTCAAAGCCCAAGCGAGTGAAAGCACTCTA  2714

Query 2724  TAACTGTGTGGCTGACAACCCCGATGAGCTCACCTTCTCCGAGGGGGATGTGATCATCGTGGACGGGGAGGAGG  2797
            .|||||.||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 2715  CAACTGCGTGGCTGACAACCCAGACGAGCTGACTTTCTCTGAGGGCGACGTGATCATTGTGGATGGGGAAGAGG  2788

Query 2798  ACCAGGAGTGGTGGATTGGCCACATTGATGGAGATCCTGGTCGCAAAGGCGCATTCCCGGTGTCATTTGTGCAC  2871
            |.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||..|.||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 2789  ATCAGGAGTGGTGGATCGGCCACATCGATGGAGAGCCCAGCCGCAAAGGAGCGTTTCCCGTATCGTTTGTGCAC  2862

Query 2872  TTTATCGCTGAC  2883
            |||||.||||||
Sbjct 2863  TTTATTGCTGAC  2874