Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07314
• Subject: XM_006711901.3
• Aligned Length: 3027
• Identities: 2759
• Gaps: 261

Alignment

Query    1  ATGCCGGACCAGATCTCCGTGTCGGAATTCGTGGCCGAGACCCATGAGGACTACAAGGCGCCCACGGCCTCCAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTTCACCACCCGCACGGCGCAGTGCCGGAACACTGTGGCGGCCATCGAGGAGGCTTTGGACGTGGACCGGATGG  148
                                                       ||....|||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------ATGTTAGAGGCTTTGGACGTGGACCGGATGG  31

Query  149  TTCTTTACAAAATGAAGAAATCCGTGAAAGCAATCAACAGCTCTGGGCTGGCTCACGTGGAAAATGAAGAGCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   32  TTCTTTACAAAATGAAGAAATCCGTGAAAGCAATCAACAGCTCTGGGCTGGCTCACGTGGAAAATGAAGAGCAG  105

Query  223  TACACCCAGGCTCTGGAGAAGTTTGGCGGCAACCGTGTATGCAGAGATGACCCAGATTTAGGAAGTGCGTTCCT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  106  TACACCCAGGCTCTGGAGAAGTTTGGCGGCAACTGTGTATGCAGAGATGACCCAGATTTAGGAAGTGCGTTCCT  179

Query  297  GAAGTTCTCAGTGTTTACAAAGGAGTTGACAGCACTTTTCAAAAACCTGATTCAGAATATGAACAACATAATCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  180  GAAGTTCTCAGTGTTTACAAAGGAGTTGACAGCACTTTTCAAAAACCTGATTCAGAATATGAACAACATAATCT  253

Query  371  CCTTCCCTTTGGACAGTTTGCTGAAGGGGGACCTGAAAGGAGTGAAAGGGGATCTGAAAAAGCCTTTTGATAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  254  CCTTCCCTTTGGACAGTTTGCTGAAGGGGGACCTGAAAGGAGTGAAAGGGGATCTGAAAAAGCCTTTTGATAAA  327

Query  445  GCTTGGAAGGACTATGAAACAAAAATAACCAAGATAGAAAAGGAGAAAAAGGAACACGCCAAGCTCCATGGGAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  328  GCTTGGAAGGACTATGAAACAAAAATAACCAAGATAGAAAAGGAGAAAAAGGAACACGCCAAGCTCCATGGGAT  401

Query  519  GATTCGGACTGAAATAAGCGGAGCGGAAATTGCCGAAGAGATGGAAAAGGAGAGGCGCTTCTTCCAGCTACAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  402  GATTCGGACTGAAATAAGCGGAGCGGAAATTGCCGAAGAGATGGAAAAGGAGAGGCGCTTCTTCCAGCTACAGA  475

Query  593  TGTGCGAGTATCTGCTGAAGGTCAACGAAATCAAGATTAAAAAGGGAGTAGATTTACTTCAGAATCTGATCAAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  476  TGTGCGAGTATCTGCTGAAGGTCAACGAAATCAAGATTAAAAAGGGAGTAGATTTACTTCAGAATCTGATCAAA  549

Query  667  TACTTTCATGCCCAATGCAATTTTTTTCAGGATGGACTCAAAGCCGTGGAAAGCCTCAAACCTTCCATTGAAAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  550  TACTTTCATGCCCAATGCAATTTTTTTCAGGATGGACTCAAAGCCGTGGAAAGCCTCAAACCTTCCATTGAAAC  623

Query  741  GCTGTCTACGGATCTTCACACGATCAAACAGGCCCAGGATGAAGAAAGAAGGCAGTTGATACAGCTTCGAGATA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  624  GCTGTCTACGGATCTTCACACGATCAAACAGGCCCAGGATGAAGAAAGAAGGCAGTTGATACAGCTTCGAGATA  697

Query  815  TTTTGAAATCCGCATTGCAGGTTGAACAGAAAGAG---------GACTCCCAAATTCGTCAGAGCACAGCTTAT  879
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  698  TTTTGAAATCCGCATTGCAGGTTGAACAGAAAGAGTCTAGGAGAGACTCCCAAATTCGTCAGAGCACAGCTTAT  771

Query  880  AGCTTACATCAGCCTCAGGGAAACAAGGAACATGGGACCGAGCGGAACGGCAGCCTCTACAAGAAGAGTGACGG  953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  772  AGCTTACATCAGCCTCAGGGAAACAAGGAACATGGGACCGAGCGGAACGGCAGCCTCTACAAGAAGAGTGACGG  845

Query  954  GATCCGAAAAGTGTGGCAGAAAAGGAAATGTTCAGTTAAAAATGGTTTTCTGACCATATCCCATGGTACCGCTA  1027
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  846  GATCCGAAAAGTGTGGCAGAAAAGGAAATGTTCAGTTAAAAATGGTTTTCTGACCATATCCCATGGTACCGCTA  919

Query 1028  ACCGGCCTCCTGCAAAGCTCAACCTGCTAACCTGCCAGGTGAAGACCAACCCTGAGGAGAAGAAGTGCTTTGAC  1101
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  920  ACCGGCCTCCTGCAAAGCTCAACCTGCTAACCTGCCAGGTGAAGACCAACCCTGAGGAGAAGAAGTGCTTTGAC  993

Query 1102  CTTATTTCACATGACAGAACTTACCACTTTCAAGCTGAAGATGAACAGGAATGTCAAATATGGATGTCTGTGCT  1175
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  994  CTCATTTCACATGACAGAACTTACCACTTTCAAGCTGAAGATGAACAGGAATGTCAAATATGGATGTCTGTGCT  1067

Query 1176  GCAAAATAGCAAAGAAGAAGCTTTAAACAATGCATTTAAGGGGGATGACAATACTGGAGAAAATAACATCGTCC  1249
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068  GCAAAATAGCAAAGAAGAAGCTTTAAACAATGCATTTAAGGGGGATGACAATACTGGAGAAAATAACATCGTCC  1141

Query 1250  AAGAACTGACAAAGGAGATCATCTCAGAAGTGCAGAGGATGACGGGCAATGACGTCTGCTGTGACTGTGGGGCG  1323
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1142  AAGAACTGACAAAGGAGATCATCTCAGAAGTGCAGAGGATGACGGGCAATGACGTCTGCTGTGACTGTGGGGCG  1215

Query 1324  CCAGATCCTACATGGCTTTCCACCAACCTGGGCATCCTGACCTGCATCGAGTGTTCCGGAATCCACCGAGAGCT  1397
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1216  CCAGATCCTACATGGCTTTCCACCAACCTGGGCATCCTGACCTGCATCGAGTGTTCCGGAATCCACCGAGAGCT  1289

Query 1398  GGGGGTTCATTATTCCAGGATGCAGTCCCTGACCTTAGATGTACTGGGAACATCTGAGCTGCTGCTCGCCAAGA  1471
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290  GGGGGTTCATTATTCCAGGATGCAGTCCCTGACCTTAGATGTACTGGGAACATCTGAGCTGCTGCTCGCCAAGA  1363

Query 1472  ATATTGGGAATGCAGGCTTTAATGAGATCATGGAATGTTGCCTACCAGCTGAGGACTCAGTCAAACCCAACCCA  1545
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1364  ATATTGGGAATGCAGGCTTTAATGAGATCATGGAATGTTGCCTACCAGCTGAGGACTCAGTCAAACCCAACCCA  1437

Query 1546  GGCAGCGACATGAATGCAAGAAAGGACTACATCACAGCCAAGTACATCGAGAGGAGATACGCAAGGAAGAAGCA  1619
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438  GGCAGCGACATGAATGCAAGAAAGGACTACATCACAGCCAAGTACATCGAGAGGAGATACGCAAGGAAGAAGCA  1511

Query 1620  CGCGGATAACGCGGCGAAGCTTCACAGTCTTTGCGAGGCCGTCAAAACGAGAGATATTTTTGGATTGCTCCAAG  1693
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1512  CGCGGATAACGCGGCGAAGCTTCACAGTCTTTGCGAGGCCGTCAAAACGAGAGATATTTTTGGATTGCTCCAAG  1585

Query 1694  CTTATGCTGATGGTGTGGATCTTACGGAAAAAATCCCACTGGCCAACGGACATGAGCCGGATGAAACGGCCCTC  1767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1586  CTTATGCTGATGGTGTGGATCTTACGGAAAAAATCCCACTGGCCAACGGACATGAGCCGGATGAAACGGCCCTC  1659

Query 1768  CACCTTGCAGTCAGATCCGTGGATCGAACCTCTCTTCACATTGTAGACTTTTTAGTTCAGAACAGTGGGAACCT  1841
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1660  CACCTTGCAGTCAGATCCGTGGATCGAACCTCTCTTCACATTGTAGACTTTTTAGTTCAGAACAGTGGGAACCT  1733

Query 1842  GGATAAACAGACAGGGAAAGGCAGCACAGCCCTGCACTACTGCTGCCTGACCGACAATGCCGAGTGCCTCAAGT  1915
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1734  GGATAAACAGACAGGGAAAGGCAGCACAGCCCTGCACTACTGCTGCCTGACCGACAATGCCGAGTGCCTCAAGT  1807

Query 1916  TGCTCCTGCGGGGGAAGGCCTCCATCGAGATAGCAAACGAGTCAGGAGAGACTCCGCTGGACATTGCCAAGCGC  1989
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1808  TGCTCCTGCGGGGGAAGGCCTCCATCGAGATAGCAAACGAGTCAGGAGAGACTCCGCTGGACATTGCCAAGCGC  1881

Query 1990  CTCAAGCACGAGCACTGTGAGGAGCTGCTGACCCAAGCCTTATCTGGAAGATTTAATTCTCACGTTCACGTTGA  2063
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1882  CTCAAGCACGAGCACTGTGAGGAGCTGCTGACCCAAGCCTTATCTGGAAGATTTAATTCTCACGTTCACGTTGA  1955

Query 2064  ATATGAATGGCGACTACTCCACGAAGACCTGGATGAAAGTGATGACGACATGGATGAGAAATTGCAGCCCAGTC  2137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1956  ATATGAATGGCGACTACTCCACGAAGACCTGGATGAAAGTGATGACGACATGGATGAGAAATTGCAGCCCAGTC  2029

Query 2138  CCAACCGGCGGGAAGACCGGCCCATCAGCTTCTACCAGCTGGGCTCCAACCAGCTTCAGTCTAACGCTGTATCT  2211
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2030  CCAACCGGCGGGAAGACCGGCCCATCAGCTTCTACCAGCTGGGCTCCAACCAGCTTCAGTCTAACGCTGTATCT  2103

Query 2212  TTGGCCAGAGATGCTGCAAACCTTGCCAAGGACAAGCAGAGGGCTTTCATGCCCAGCATCTTGCAGAATGAGAC  2285
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2104  TTGGCCAGAGATGCTGCAAACCTTGCCAAGGAGAAGCAGAGGGCTTTCATGCCCAGCATCTTGCAGAATGAGAC  2177

Query 2286  TTACGGAGCCCTCCTGAGTGGCAGCCCACCTCCCGCCCAGCCTGCAGCCCCCAGCACCACCAGCGCCCCCCCGC  2359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2178  TTACGGAGCCCTCCTGAGTGGCAGCCCACCTCCCGCCCAGCCTGCAGCCCCCAGCACCACCAGCGCCCCCCCGC  2251

Query 2360  TTCCTCCACGGAATGTTGGCAAAG--------------------------------------------------  2383
            ||||||||||||||||||||||||                                                  
Sbjct 2252  TTCCTCCACGGAATGTTGGCAAAGTTCAGACAGCCTCCTCTGCTAACACCCTGTGGAAGACAAACTCTGTAAGT  2325

Query 2384  --------------------------------------------------------------------------  2383
                                                                                      
Sbjct 2326  GTGGACGGTGGAAGCCGGCAGCGATCTTCGTCAGATCCGCCAGCTGTCCATCCACCGCTGCCCCCTCTTCGCGT  2399

Query 2384  -----------ATCCCCTGACCCCCACGCCGCCCCCACCCGTTGCCAAGACGCCCAGCGTAATGGAAGCCTTGA  2446
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2400  GACATCTACCAATCCCCTGACCCCCACGCCGCCCCCACCCGTTGCCAAGACGCCCAGCGTAATGGAAGCCTTGA  2473

Query 2447  GCCAGCCGAGCAAGCCTGCCCCGCCTGGGATCTCACAGATCAGGCCCCCACCTCTGCCCCCACAGCCGCCCAGC  2520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2474  GCCAGCCGAGCAAGCCTGCCCCGCCTGGGATCTCACAGATCAGGCCCCCACCTCTGCCCCCACAGCCGCCCAGC  2547

Query 2521  CGCCTCCCGCAGAAGAAGCCTGCGCCGGGGGCTGACAAGTCCACCCCACTGACCAACAAAGGCCAACCGAGAGG  2594
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2548  CGCCTCCCGCAGAAGAAGCCTGCGCCGGGGGCTGACAAGTCCACCCCACTGACCAACAAAGGCCAACCGAGAGG  2621

Query 2595  ACCTGTGGATCTCTCTGCAACGGAAGCTCTGGGTCCTCTGTCCAATGCTATGGTCCTGCAGCCCCCTGCACCCA  2668
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2622  ACCTGTGGATCTCTCTGCAACGGAAGCTCTGGGTCCTCTGTCCAATGCTATGGTCCTGCAGCCCCCTGCACCCA  2695

Query 2669  TGCCTAGGAAGTCGCAGGCAACCAAGTTGAAGCCTAAGCGGGTGAAAGCGCTCTATAACTGTGTGGCTGACAAC  2742
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2696  TGCCTAGGAAGTCGCAGGCAACCAAGTTGAAGCCTAAGCGGGTGAAAGCGCTCTATAACTGTGTGGCTGACAAC  2769

Query 2743  CCCGATGAGCTCACCTTCTCCGAGGGGGATGTGATCATCGTGGACGGGGAGGAGGACCAGGAGTGGTGGATTGG  2816
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2770  CCCGATGAGCTCACCTTCTCCGAGGGGGATGTGATCATCGTGGACGGGGAGGAGGACCAGGAGTGGTGGATTGG  2843

Query 2817  CCACATTGATGGAGATCCTGGTCGCAAAGGCGCATTCCCGGTGTCATTTGTGCACTTTATCGCTGAC  2883
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2844  CCACATTGATGGAGATCCTGGTCGCAAAGGCGCATTCCCGGTGTCATTTGTGCACTTTATCGCTGAC  2910