Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07314
- Subject:
- XM_011510403.3
- Aligned Length:
- 3060
- Identities:
- 2880
- Gaps:
- 177
Alignment
Query 1 ATGCCGGACCAGATCTCCGTGTCGGAATTCGTGGCCGAGACCCATGAGGACTACAAGGCGCCCACGGCCTCCAG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCGGACCAGATCTCCGTGTCGGAATTCGTGGCCGAGACCCATGAGGACTACAAGGCGCCCACGGCCTCCAG 74
Query 75 CTTCACCACCCGCACGGCGCAGTGCCGGAACACTGTGGCGGCCATCGAGG------------------------ 124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTTCACCACCCGCACGGCGCAGTGCCGGAACACTGTGGCGGCCATCGAGGAGGTGAGGCGGCCTGCGCGGCGGC 148
Query 125 ---------AGGCTTTGGACGTGGACCGGATGGTTCTTTACAAAATGAAGAAATCCGTGAAAGCAATCAACAGC 189
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCCGGCCGCAGGCTTTGGACGTGGACCGGATGGTTCTTTACAAAATGAAGAAATCCGTGAAAGCAATCAACAGC 222
Query 190 TCTGGGCTGGCTCACGTGGAAAATGAAGAGCAGTACACCCAGGCTCTGGAGAAGTTTGGCGGCAACCGTGTATG 263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 223 TCTGGGCTGGCTCACGTGGAAAATGAAGAGCAGTACACCCAGGCTCTGGAGAAGTTTGGCGGCAACTGTGTATG 296
Query 264 CAGAGATGACCCAGATTTAGGAAGTGCGTTCCTGAAGTTCTCAGTGTTTACAAAGGAGTTGACAGCACTTTTCA 337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGAGATGACCCAGATTTAGGAAGTGCGTTCCTGAAGTTCTCAGTGTTTACAAAGGAGTTGACAGCACTTTTCA 370
Query 338 AAAACCTGATTCAGAATATGAACAACATAATCTCCTTCCCTTTGGACAGTTTGCTGAAGGGGGACCTGAAAGGA 411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAAACCTGATTCAGAATATGAACAACATAATCTCCTTCCCTTTGGACAGTTTGCTGAAGGGGGACCTGAAAGGA 444
Query 412 GTGAAAGGGGATCTGAAAAAGCCTTTTGATAAAGCTTGGAAGGACTATGAAACAAAAATAACCAAGATAGAAAA 485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGAAAGGGGATCTGAAAAAGCCTTTTGATAAAGCTTGGAAGGACTATGAAACAAAAATAACCAAGATAGAAAA 518
Query 486 GGAGAAAAAGGAACACGCCAAGCTCCATGGGATGATTCGGACTGAAATAAGCGGAGCGGAAATTGCCGAAGAGA 559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGAGAAAAAGGAACACGCCAAGCTCCATGGGATGATTCGGACTGAAATAAGCGGAGCGGAAATTGCCGAAGAGA 592
Query 560 TGGAAAAGGAGAGGCGCTTCTTCCAGCTACAGATGTGCGAGTATCTGCTGAAGGTCAACGAAATCAAGATTAAA 633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGAAAAGGAGAGGCGCTTCTTCCAGCTACAGATGTGCGAGTATCTGCTGAAGGTCAACGAAATCAAGATTAAA 666
Query 634 AAGGGAGTAGATTTACTTCAGAATCTGATCAAATACTTTCATGCCCAATGCAATTTTTTTCAGGATGGACTCAA 707
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGGGAGTAGATTTACTTCAGAATCTGATCAAATACTTTCATGCCCAATGCAATTTTTTTCAGGATGGACTCAA 740
Query 708 AGCCGTGGAAAGCCTCAAACCTTCCATTGAAACGCTGTCTACGGATCTTCACACGATCAAACAGGCCCAGGATG 781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGCCGTGGAAAGCCTCAAACCTTCCATTGAAACGCTGTCTACGGATCTTCACACGATCAAACAGGCCCAGGATG 814
Query 782 AAGAAAGAAGGCAGTTGATACAGCTTCGAGATATTTTGAAATCCGCATTGCAGGTTGAACAGAAAGAG------ 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGAAAGAAGGCAGTTGATACAGCTTCGAGATATTTTGAAATCCGCATTGCAGGTTGAACAGAAAGAGTCTAGG 888
Query 850 ---GACTCCCAAATTCGTCAGAGCACAGCTTATAGCTTACATCAGCCTCAGGGAAACAAGGAACATGGGACCGA 920
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGAGACTCCCAAATTCGTCAGAGCACAGCTTATAGCTTACATCAGCCTCAGGGAAACAAGGAACATGGGACCGA 962
Query 921 GCGGAACGGCAGCCTCTACAAGAAGAGTGACGGGATCCGAAAAGTGTGGCAGAAAAGGAAATGTTCAGTTAAAA 994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCGGAACGGCAGCCTCTACAAGAAGAGTGACGGGATCCGAAAAGTGTGGCAGAAAAGGAAATGTTCAGTTAAAA 1036
Query 995 ATGGTTTTCTGACCATATCCCATGGTACCGCTAACCGGCCTCCTGCAAAGCTCAACCTGCTAACCTGCCAGGTG 1068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATGGTTTTCTGACCATATCCCATGGTACCGCTAACCGGCCTCCTGCAAAGCTCAACCTGCTAACCTGCCAGGTG 1110
Query 1069 AAGACCAACCCTGAGGAGAAGAAGTGCTTTGACCTTATTTCACATGACAGAACTTACCACTTTCAAGCTGAAGA 1142
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGACCAACCCTGAGGAGAAGAAGTGCTTTGACCTCATTTCACATGACAGAACTTACCACTTTCAAGCTGAAGA 1184
Query 1143 TGAACAGGAATGTCAAATATGGATGTCTGTGCTGCAAAATAGCAAAGAAGAAGCTTTAAACAATGCATTTAAGG 1216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGAACAGGAATGTCAAATATGGATGTCTGTGCTGCAAAATAGCAAAGAAGAAGCTTTAAACAATGCATTTAAGG 1258
Query 1217 GGGATGACAATACTGGAGAAAATAACATCGTCCAAGAACTGACAAAGGAGATCATCTCAGAAGTGCAGAGGATG 1290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGGATGACAATACTGGAGAAAATAACATCGTCCAAGAACTGACAAAGGAGATCATCTCAGAAGTGCAGAGGATG 1332
Query 1291 ACGGGCAATGACGTCTGCTGTGACTGTGGGGCGCCAGATCCTACATGGCTTTCCACCAACCTGGGCATCCTGAC 1364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACGGGCAATGACGTCTGCTGTGACTGTGGGGCGCCAGATCCTACATGGCTTTCCACCAACCTGGGCATCCTGAC 1406
Query 1365 CTGCATCGAGTGTTCCGGAATCCACCGAGAGCTGGGGGTTCATTATTCCAGGATGCAGTCCCTGACCTTAGATG 1438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTGCATCGAGTGTTCCGGAATCCACCGAGAGCTGGGGGTTCATTATTCCAGGATGCAGTCCCTGACCTTAGATG 1480
Query 1439 TACTGGGAACATCTGAGCTGCTGCTCGCCAAGAATATTGGGAATGCAGGCTTTAATGAGATCATGGAATGTTGC 1512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TACTGGGAACATCTGAGCTGCTGCTCGCCAAGAATATTGGGAATGCAGGCTTTAATGAGATCATGGAATGTTGC 1554
Query 1513 CTACCAGCTGAGGACTCAGTCAAACCCAACCCAGGCAGCGACATGAATGCAAGAAAGGACTACATCACAGCCAA 1586
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTACCAGCTGAGGACTCAGTCAAACCCAACCCAGGCAGCGACATGAATGCAAGAAAGGACTACATCACAGCCAA 1628
Query 1587 GTACATCGAGAGGAGATACGCAAGGAAGAAGCACGCGGATAACGCGGCGAAGCTTCACAGTCTTTGCGAGGCCG 1660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GTACATCGAGAGGAGATACGCAAGGAAGAAGCACGCGGATAACGCGGCGAAGCTTCACAGTCTTTGCGAGGCCG 1702
Query 1661 TCAAAACGAGAGATATTTTTGGATTGCTCCAAGCTTATGCTGATGGTGTGGATCTTACGGAAAAAATCCCACTG 1734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TCAAAACGAGAGATATTTTTGGATTGCTCCAAGCTTATGCTGATGGTGTGGATCTTACGGAAAAAATCCCACTG 1776
Query 1735 GCCAACGGACATGAGCCGGATGAAACGGCCCTCCACCTTGCAGTCAGATCCGTGGATCGAACCTCTCTTCACAT 1808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GCCAACGGACATGAGCCGGATGAAACGGCCCTCCACCTTGCAGTCAGATCCGTGGATCGAACCTCTCTTCACAT 1850
Query 1809 TGTAGACTTTTTAGTTCAGAACAGTGGGAACCTGGATAAACAGACAGGGAAAGGCAGCACAGCCCTGCACTACT 1882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TGTAGACTTTTTAGTTCAGAACAGTGGGAACCTGGATAAACAGACAGGGAAAGGCAGCACAGCCCTGCACTACT 1924
Query 1883 GCTGCCTGACCGACAATGCCGAGTGCCTCAAGTTGCTCCTGCGGGGGAAGGCCTCCATCGAGATAGCAAACGAG 1956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GCTGCCTGACCGACAATGCCGAGTGCCTCAAGTTGCTCCTGCGGGGGAAGGCCTCCATCGAGATAGCAAACGAG 1998
Query 1957 TCAGGAGAGACTCCGCTGGACATTGCCAAGCGCCTCAAGCACGAGCACTGTGAGGAGCTGCTGACCCAAGCCTT 2030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TCAGGAGAGACTCCGCTGGACATTGCCAAGCGCCTCAAGCACGAGCACTGTGAGGAGCTGCTGACCCAAGCCTT 2072
Query 2031 ATCTGGAAGATTTAATTCTCACGTTCACGTTGAATATGAATGGCGACTACTCCACGAAGACCTGGATGAAAGTG 2104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 ATCTGGAAGATTTAATTCTCACGTTCACGTTGAATATGAATGGCGACTACTCCACGAAGACCTGGATGAAAGTG 2146
Query 2105 ATGACGACATGGATGAGAAATTGCAGCCCAGTCCCAACCGGCGGGAAGACCGGCCCATCAGCTTCTACCAGCTG 2178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ATGACGACATGGATGAGAAATTGCAGCCCAGTCCCAACCGGCGGGAAGACCGGCCCATCAGCTTCTACCAGCTG 2220
Query 2179 GGCTCCAACCAGCTTCAGTCTAACGCTGTATCTTTGGCCAGAGATGCTGCAAACCTTGCCAAGGACAAGCAGAG 2252
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2221 GGCTCCAACCAGCTTCAGTCTAACGCTGTATCTTTGGCCAGAGATGCTGCAAACCTTGCCAAGGAGAAGCAGAG 2294
Query 2253 GGCTTTCATGCCCAGCATCTTGCAGAATGAGACTTACGGAGCCCTCCTGAGTGGCAGCCCACCTCCCGCCCAGC 2326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GGCTTTCATGCCCAGCATCTTGCAGAATGAGACTTACGGAGCCCTCCTGAGTGGCAGCCCACCTCCCGCCCAGC 2368
Query 2327 CTGCAGCCCCCAGCACCACCAGCGCCCCCCCGCTTCCTCCACGGAATGTTGGCAAAG----------------- 2383
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CTGCAGCCCCCAGCACCACCAGCGCCCCCCCGCTTCCTCCACGGAATGTTGGCAAAGTTCAGACAGCCTCCTCT 2442
Query 2384 -------------------------------------------------------------------------- 2383
Sbjct 2443 GCTAACACCCTGTGGAAGACAAACTCTGTAAGTGTGGACGGTGGAAGCCGGCAGCGATCTTCGTCAGATCCGCC 2516
Query 2384 --------------------------------------------ATCCCCTGACCCCCACGCCGCCCCCACCCG 2413
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 AGCTGTCCATCCACCGCTGCCCCCTCTTCGCGTGACATCTACCAATCCCCTGACCCCCACGCCGCCCCCACCCG 2590
Query 2414 TTGCCAAGACGCCCAGCGTAATGGAAGCCTTGAGCCAGCCGAGCAAGCCTGCCCCGCCTGGGATCTCACAGATC 2487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TTGCCAAGACGCCCAGCGTAATGGAAGCCTTGAGCCAGCCGAGCAAGCCTGCCCCGCCTGGGATCTCACAGATC 2664
Query 2488 AGGCCCCCACCTCTGCCCCCACAGCCGCCCAGCCGCCTCCCGCAGAAGAAGCCTGCGCCGGGGGCTGACAAGTC 2561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AGGCCCCCACCTCTGCCCCCACAGCCGCCCAGCCGCCTCCCGCAGAAGAAGCCTGCGCCGGGGGCTGACAAGTC 2738
Query 2562 CACCCCACTGACCAACAAAGGCCAACCGAGAGGACCTGTGGATCTCTCTGCAACGGAAGCTCTGGGTCCTCTGT 2635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 CACCCCACTGACCAACAAAGGCCAACCGAGAGGACCTGTGGATCTCTCTGCAACGGAAGCTCTGGGTCCTCTGT 2812
Query 2636 CCAATGCTATGGTCCTGCAGCCCCCTGCACCCATGCCTAGGAAGTCGCAGGCAACCAAGTTGAAGCCTAAGCGG 2709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CCAATGCTATGGTCCTGCAGCCCCCTGCACCCATGCCTAGGAAGTCGCAGGCAACCAAGTTGAAGCCTAAGCGG 2886
Query 2710 GTGAAAGCGCTCTATAACTGTGTGGCTGACAACCCCGATGAGCTCACCTTCTCCGAGGGGGATGTGATCATCGT 2783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 GTGAAAGCGCTCTATAACTGTGTGGCTGACAACCCCGATGAGCTCACCTTCTCCGAGGGGGATGTGATCATCGT 2960
Query 2784 GGACGGGGAGGAGGACCAGGAGTGGTGGATTGGCCACATTGATGGAGATCCTGGTCGCAAAGGCGCATTCCCGG 2857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 GGACGGGGAGGAGGACCAGGAGTGGTGGATTGGCCACATTGATGGAGATCCTGGTCGCAAAGGCGCATTCCCGG 3034
Query 2858 TGTCATTTGTGCACTTTATCGCTGAC 2883
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 TGTCATTTGTGCACTTTATCGCTGAC 3060