Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07320
Subject:
NM_003900.5
Aligned Length:
1320
Identities:
1317
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGCGTCGCTCACCGTGAAGGCCTACCTTCTGGGCAAGGAGGACGCGGCGCGCGAGATTCGCCGCTTCAGCTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCGCTCACCGTGAAGGCCTACCTTCTGGGCAAGGAGGACGCGGCGCGCGAGATTCGCCGCTTCAGCTT  74

Query   75  CTGCTGCAGCCCCGAGCCTGAGGCGGAAGCCGAGGCTGCGGCGGGTCCGGGACCCTGCGAGCGGCTGCTGAGCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGCTGCAGCCCCGAGCCTGAGGCGGAAGCCGAGGCTGCGGCGGGTCCGGGACCCTGCGAGCGGCTGCTGAGCC  148

Query  149  GGGTGGCCGCCCTGTTCCCCGCGCTGCGGCCTGGCGGCTTCCAGGCGCACTACCGCGATGAGGACGGGGACTTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGTGGCCGCCCTGTTCCCCGCGCTGCGGCCTGGCGGCTTCCAGGCGCACTACCGCGATGAGGACGGGGACTTG  222

Query  223  GTTGCCTTTTCCAGTGACGAGGAATTGACAATGGCCATGTCCTACGTGAAGGATGACATCTTCCGAATCTACAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTTGCCTTTTCCAGTGACGAGGAATTGACAATGGCCATGTCCTACGTGAAGGATGACATCTTCCGAATCTACAT  296

Query  297  TAAAGAGAAAAAAGAGTGCCGGCGGGACCACCGCCCACCGTGTGCTCAGGAGGCGCCCCGCAACATGGTGCACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAAAGAGAAAAAAGAGTGCCGGCGGGACCACCGCCCACCGTGTGCTCAGGAGGCGCCCCGCAACATGGTGCACC  370

Query  371  CCAATGTGATCTGCGATGGCTGCAATGGGCCTGTGGTAGGAACCCGCTACAAGTGCAGCGTCTGCCCAGACTAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAATGTGATCTGCGATGGCTGCAATGGGCCTGTGGTAGGAACCCGCTACAAGTGCAGCGTCTGCCCAGACTAC  444

Query  445  GACTTGTGTAGCGTCTGCGAGGGAAAGGGCTTGCACCGGGGGCACACCAAGCTCGCATTCCCCAGCCCCTTCGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACTTGTGTAGCGTCTGCGAGGGAAAGGGCTTGCACCGGGGGCACACCAAGCTCGCATTCCCCAGCCCCTTCGG  518

Query  519  GCACCTGTCTGAGGGCTTCTCGCACAGCCGCTGGCTCCGGAAGGTGAAACACGGACACTTCGGGTGGCCAGGAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCACCTGTCTGAGGGCTTCTCGCACAGCCGCTGGCTCCGGAAGGTGAAACACGGACACTTCGGGTGGCCAGGAT  592

Query  593  GGGAAATGGGTCCACCAGGAAACTGGAGCCCACGTCCTCCTCGTGCAGGGGAGGCCCGCCCTGGCCCCACGGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGAAATGGGTCCACCAGGAAACTGGAGCCCACGTCCTCCTCGTGCAGGGGAGGCCCGCCCTGGCCCCACGGCA  666

Query  667  GAATCAGCTTCTGGTCCATCGGAGGATCCGAGTGTGAATTTCCTGAAGAACGTTGGGGAGAGTGTGGCAGCTGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAATCAGCTTCTGGTCCATCGGAGGATCCGAGTGTGAATTTCCTGAAGAACGTTGGGGAGAGTGTGGCAGCTGC  740

Query  741  CCTTAGCCCTCTGGGCATTGAAGTTGATATCGATGTGGAGCACGGAGGGAAAAGAAGCCGCCTGACCCCCGTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTTAGCCCTCTGGGCATTGAAGTTGATATCGATGTGGAGCACGGAGGGAAAAGAAGCCGCCTGACCCCCGTCT  814

Query  815  CTCCAGAGAGTTCCAGCACAGAGGAGAAGAGCAGCTCACAGCCAAGCAGCTGCTGCTCTGATCCCAGCAAGCCG  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  815  CTCCAGAGAGTTCCAGCACAGAGGAGAAGAGCAGCTCACAGCCAAGCAGCTGCTGCTCTGACCCCAGCAAGCCG  888

Query  889  GGTGGGAATGTTGAGGACGCCACGCAGTCTCTGGCGGAGCAGATGAGAAAGATCGCCTTGGAGTCCGAGGGGCG  962
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGTGGGAATGTTGAGGGCGCCACGCAGTCTCTGGCGGAGCAGATGAGGAAGATCGCCTTGGAGTCCGAGGGGCG  962

Query  963  CCCTGAGGAACAGATGGAGTCGGATAACTGTTCAGGAGGAGATGATGACTGGACCCATCTGTCTTCAAAAGAAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCTGAGGAACAGATGGAGTCGGATAACTGTTCAGGAGGAGATGATGACTGGACCCATCTGTCTTCAAAAGAAG  1036

Query 1037  TGGACCCGTCTACAGGTGAACTCCAGTCCCTACAGATGCCAGAATCCGAAGGGCCAAGCTCTCTGGACCCCTCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGACCCGTCTACAGGTGAACTCCAGTCCCTACAGATGCCAGAATCCGAAGGGCCAAGCTCTCTGGACCCCTCC  1110

Query 1111  CAGGAGGGACCCACAGGGCTGAAGGAAGCTGCCTTGTACCCACATCTCCCGCCAGAGGCTGACCCGCGGCTGAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGGAGGGACCCACAGGGCTGAAGGAAGCTGCCTTGTACCCACATCTCCCGCCAGAGGCTGACCCGCGGCTGAT  1184

Query 1185  TGAGTCCCTCTCCCAGATGCTGTCCATGGGCTTCTCTGATGAAGGCGGCTGGCTCACCAGGCTCCTGCAGACCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGAGTCCCTCTCCCAGATGCTGTCCATGGGCTTCTCTGATGAAGGCGGCTGGCTCACCAGGCTCCTGCAGACCA  1258

Query 1259  AGAACTATGACATCGGAGCGGCTCTGGACACCATCCAGTATTCAAAGCATCCCCCGCCGTTG  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGAACTATGACATCGGAGCGGCTCTGGACACCATCCAGTATTCAAAGCATCCCCCGCCGTTG  1320