Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07324
- Subject:
- XM_006529794.3
- Aligned Length:
- 2025
- Identities:
- 1499
- Gaps:
- 276
Alignment
Query 1 ATGTCACACCTGCCGATGAAACTCCTGCGTAAGAAGATCGAGAAGCGGAACCTCAAATTGCGGCAGCGGAACCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AAAGTTTCAGGGGGCCTCAAATCTGACCCTATCGGAAACTCAAAATGGAGATGTATCTGAAGAAACAATGGGAA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GTAGAAAGGTTAAAAAATCAAAACAAAAGCCCATGAATGTGGGCTTATCAGAAACTCAAAATGGAGGCATGTCT 222
|||.||
Sbjct 1 --------------------------------------------------------------------ATGCCT 6
Query 223 CAAGAAGCAGTGGGAAATATAAAAGTTACAAAGTCTCCCCAGAAATCCACTGTATTAAGCAATGGAGAAGCAGC 296
.|.||..|..|||.||||...|||||||.||||||.|||||||||..|||....|||..|||.|||||||||||
Sbjct 7 GAGGAGACCTTGGAAAATGGCAAAGTTAAAAAGTCACCCCAGAAACTCACAACTTTAGCCAACGGAGAAGCAGC 80
Query 297 AATGCAGTCTTCCA-------------ATTCAGAATCAAAAAAGAAAAAGAAGAAAAAGAGAAAAATGGTGAAT 357
| ||| ||||||||..||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||
Sbjct 81 A----------CCAACACCACCTCCTGATTCAGAAGTAAAAAAGAAAAAGAAGAAAAAGAGGAAAATGGCAAAT 144
Query 358 GATGCTGAGCCTGATACGAAAAAAGCAAAAACTGAAAACAAAGGGAAATCTGAAGAAGAAAGTGCCGAGACTAC 431
|||||.|.|||||||||.||||||||.|||||| |||||||||||.|||.||..
Sbjct 145 GATGCCGGGCCTGATACAAAAAAAGCGAAAACT---------------------GAAGAAAGTGCTGAGGCTTG 197
Query 432 TAAAGAAACAGAAAATAATGTGGAGAAGCCAGATAATGATGAAGATGAGAGTGAGGTGCCCAGTCTGCCCCTGG 505
|.|.|||.|||||.||.|||||.|.||| |.||||||.||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 198 TGAGGAACCAGAAGATGATGTGAAAAAG------------GCAGATGACAGCGAGGTGCCCAGCCTGCCCCTAG 259
Query 506 GACTGACAGGAGCTTTTGAGGATACTTCGTTTGCTTCTCTATGTAATCTTGTCAATGAAAACACTCTGAAGGCA 579
||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||..|.|.||||||.||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 260 GACTGACAGGTGCTTTTGAGGACACTTCATTTGCTTCCTTGTCTAATCTCGTCAATGAGAACACCCTGAAGGCC 333
Query 580 ATAAAAGAAATGGGTTTTACAA--ACATGACTGAAATTCAGCATAAAAGTATCAGACCACTTCTGGAAGGCAGG 651
|||.||||||||||.|| ||| .||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 334 ATAGAAGAAATGGGCTT--CAAGCGCATGACGGAGATCCAGCATAAAAGTATCAGGCCACTTCTGGAAGGCAGG 405
Query 652 GATCTTCTAGCAGCTGCAAAAACAGGCAGTGGTAAAACCCTGGCTTTTCTCATCCCTGCAGTTGAACTCATTGT 725
||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||...|.||.||||||||
Sbjct 406 GACCTTCTGGCGGCTGCGAAAACCGGCAGTGGCAAAACCCTCGCTTTCCTCATCCCTGTGATCGAGCTCATTGT 479
Query 726 TAAGTTAAGGTTCATGCCCAGGAATGGAACAGGAGTCCTTATTCTCTCACCTACTAGAGAACTAGCCATGCAAA 799
.|||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 480 CAAGTTGAAGTTCATGCCCAGGAATGGAACAGGAGTCCTGATTCTCTCTCCTACCAGAGAACTGGCCATGCAGA 553
Query 800 CCTTTGGTGTTCTTAAGGAGCTGATGACTCACCACGTGCATACCTATGGCTTGATAATGGGTGGCAGTAACAGA 873
|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||..||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 554 CCTTTGGTGTTCTCAAGGAGCTGATGACGCACCACGTTCACACGTATGGGCTGATCATGGGCGGCAGCAACAGG 627
Query 874 TCTGCTGAAGCACAGAAACTTGGTAATGGGATCAACATCATTGTGGCCACACCAGGCCGTCTGCTGGACCATAT 947
||||||||||..|||||.||....|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 628 TCTGCTGAAGTGCAGAAGCTCCTCAATGGGATCAACATCATCGTGGCCACGCCCGGCCGGCTCCTGGACCACAT 701
Query 948 GCAGAATACCCCAGGATTTATGTATAAAAACCTGCAGTGTCTGGTTATTGATGAAGCTGATCGTATCTTGGATG 1021
||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 702 GCAGAACACGCCAGGGTTTATGTACAAGAACCTGCAGTGTCTGGTTATTGATGAGGCTGACCGTATCTTGGATG 775
Query 1022 TGGGGTTTGAAGAGGAATTAAAGCAAATTATTAAACTTTTGCCAACACGTAGACAGACTATGCTCTTTTCTGCC 1095
|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 776 TTGGGTTTGAAGAAGAATTAAAGCAAATTATTAAACTTTTGCCAGCCCGTAGGCAAACCATGCTCTTTTCTGCC 849
Query 1096 ACCCAAACTCGAAAAGTTGAAGACCTGGCAAGGATTTCTCTGAAAAAGGAGCCATTGTATGTTGGCGTTGATGA 1169
||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 850 ACACAAACTCGAAAAGTTGAAGACTTGGCAAGAATTTCTCTGAAAAAGGAGCCTTTGTACGTGGGTGTTGATGA 923
Query 1170 TGATAAAGCGAATGCAACAGTGGATGGTCTTGAACAGGGATATGTTGTTTGTCCTTCTGAAAAGAGATTCCTTC 1243
.||.||||.|..|||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 924 CGACAAAGAGGTTGCCACAGTGGATGGCCTTGAGCAGGGCTATGTTGTTTGTCCCTCTGAGAAGAGGTTCCTTC 997
Query 1244 TGCTCTTTACATTCCTTAAGAAGAACCGAAAGAAGAAGCTTATGGTCTTCTTTTCATCTTGTATGTCTGTGAAA 1317
||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 998 TGCTTTTCACATTCCTTAAGAAGAACCGGAAGAAGAAAGTGATGGTCTTCTTTTCATCTTGTATGTCTGTGAAA 1071
Query 1318 TACCACTATGAGTTGCTGAACTACATTGATTTGCCCGTCTTGGCCATTCATGGAAAGCAAAAGCAAAATAAGCG 1391
||||||||||||.||.|||||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072 TACCACTATGAGCTGTTGAACTACATTGACCTTCCCGTCTTGGCCATCCATGGAAAGCAAAAGCAAAATAAGCG 1145
Query 1392 TACAACCACATTCTTCCAGTTCTGCAATGCAGATTCGGGAACACTATTGTGTACGGATGTGGCAGCGAGAGGAC 1465
.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||.|||..|||||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 1146 AACAACCACGTTTTTCCAGTTCTGCAACGCGGATTCAGGAATACTGCTGTGTACTGATGTGGCAGCCAGAGGGC 1219
Query 1466 TAGACATTCCTGAAGTCGACTGGATTGTTCAGTATGACCCTCCGGATGACCCTAAGGAATATATTCATCGTGTG 1539
|.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1220 TGGACATCCCCGAAGTGGACTGGATTGTTCAGTACGACCCTCCCGATGACCCCAAGGAATACATTCATCGTGTT 1293
Query 1540 GGTAGAACAGCCAGAGGCCTAAATGGGAGAGGGCATGCCTTGCTCATTTTGCGCCCAGAAGAATTGGGTTTTCT 1613
||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||.|||||||..|||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 1294 GGTAGAACAGCCAGGGGCCTGAATGGAAGAGGGCACGCCCTGCTCATCCTGCGCCCTGAAGAGTTGGGTTTCCT 1367
Query 1614 TCGCTACTTGAAACAATCCAAGGTTCCATTAAGTGAATTTGACTTTTCCTGGTCTAAAATTTCTGACATTCAGT 1687
|||.|||||||||||.||||||||||||||.|.|.|.||||||||.||||||||||||.|||||||.||.||||
Sbjct 1368 TCGTTACTTGAAACAGTCCAAGGTTCCATTGAATCAGTTTGACTTCTCCTGGTCTAAAGTTTCTGATATCCAGT 1441
Query 1688 CTCAGCTTGAGAAATTGATTGAAAAGAATTACTTTCTTCATAAGTCAGCCCAGGAAGCATATAAGTCATACATA 1761
|||||||.||.|||.||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1442 CTCAGCTGGAAAAACTGATCGAAAAGAACTACTTTCTCCACAAGTCTGCCCAGGAAGCATACAAATCCTACATA 1515
Query 1762 CGAGCCTATGATTCCCATTCTCTGAAACAGATCTTTAATGTTAATAACCTAAATTTGCCTCAGGTTGCTCTGTC 1835
.||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||.|||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1516 AGAGCATATGACTCTCACTCTCTCAAGCAGATCTTCAACGTGAACAACTTAAATCTGCCTCAGGTTGCTCTGTC 1589
Query 1836 ATTTGGTTTCAAGGTGCCTCCCTTCGTTGATCTGAACGTCAACAGTAATGAAGGCAAGCAGAAAAAGCGAGGAG 1909
.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.|.|||..||||.|||||||..||.|||.||||.|
Sbjct 1590 TTTTGGTTTTAAGGTCCCTCCTTTTGTTGATCTGAATGTGAGCAGCCATGATGGCAAGCTTAAGAAGAGAGGCG 1663
Query 1910 GTGGTGGTGGATTTGGCTACCAGAAAACCAAGAAAGTTGAGAAATCCAAAATCTTTAAACACATTAGCAAGAAA 1983
|||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1664 GTGGTGGCGGATTCGGCTACCAGAAAACAAAGAAAGTGGAGAAGTCCAAGATCTTTAAACACATCAGTAAGAAG 1737
Query 1984 TCATCTGACAGCAGGCAGTTCTCTCAC 2010
.||.|.|||.|||||||||||||.|||
Sbjct 1738 CCAGCAGACCGCAGGCAGTTCTCACAC 1764