Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07328
- Subject:
- XM_006516583.3
- Aligned Length:
- 3042
- Identities:
- 2351
- Gaps:
- 375
Alignment
Query 1 ATGGCCGCCGCGGAGACCCAGTCGCTACGGGAGCAGCCAGAGATGGAAGATGC---TAATTCTGAAAAGAGTAT 71
|||||||||.|||||.|||.|||.||.||||||||..|.||||||||.||||| ||||||||||||||||.|
Sbjct 1 ATGGCCGCCACGGAGCCCCCGTCCCTGCGGGAGCAAGCTGAGATGGATGATGCTGATAATTCTGAAAAGAGTGT 74
Query 72 AAATGAAGAAAATGGAGAAGTATCAGAAGACCAGTCTCAAAATAAGCACAGTCGTCACAAAAAAAAGAAGCATA 145
||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAATGAAGAAAATGGAGAGGTATCAGAAGACCAATCTCAAAATAAACACAGTCGTCACAAAAAAAAGAAGCATA 148
Query 146 AACACAGAAGTAAACATAAGAAACATAAACATTCCTCAGAAGAAGACAAGGATAAAAAACATAAACATAAGCAT 219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 AACACAGAAGTAAACATAAGAAACATAAACATTCCTCAGAAGAAGATAGGGATAAAAAACACAAACATAAGCAT 222
Query 220 AAACATAAGAAACACAAAAGAAAAGAGGTTATTGATGCTTCTGATAAAGAGGGTATGTCTCCAGCAAAAAGAAC 293
||.||||||||.||||||.|.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||..||||.||.|||||||||||
Sbjct 223 AAGCATAAGAAGCACAAACGGAAAGAAGTTATCGAGGCTTCCGACAAAGAAGGCCTGTCCCCTGCAAAAAGAAC 296
Query 294 TAAACTTGATGATTTAGCTTTGCTAGAAGACTTGGAAAAACAGAGAGCCTTGATTAAGGCCGAACTTGATAATG 367
|||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 297 TAAGCTTGATGATTTAGCTTTGCTGGAAGACTTGGAAAAGCAGAGAGCCTTGATTAAAGCTGAGCTTGATAATG 370
Query 368 AGTTAATGGAAGGAAAGGTCCAGTCTGGTATGGGGCTCATTTTGCAAGGTTATGAGTCTGGCTCTGAAGAAGAG 441
||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 371 AGTTAATGGAGGGGAAGGTCCAGTCTGGAATGGGGCTCATTTTGCAAGGCTATGAGTCTGGCTCCGAAGAAGAA 444
Query 442 GGGGAAATTCATGAAAAGGCAAGAAATGGAAATAGGTCTAGTACTAGATCTTCAAGTACAAAGGGGAAACTTGA 515
||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||...|||.||||||||
Sbjct 445 GGAGAGATTCACGAAAAGGCAAGAAATGGGAACAGGTCCAGTACCAGGTCTTCCAGTACTCGGGGAAAACTTGA 518
Query 516 ACTTGTGGACAATAAAATTACTACAAAGAAACGAAGTAAAAGCAGATCCAAAGAACGGACTAGACATAGGTCTG 589
|.||..||||||.||||.||.|.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|
Sbjct 519 AATTACGGACAACAAAAATAGTGCAAAGAAACGAAGTAAGAGCAGATCCAAAGAACGGACCAGGCACAGATCGG 592
Query 590 ATAAAAAGAAAAGTAAGGGGGGTATTGAAATCGTTAAAGAGAAAACAACTAGGAGCAAGTCAAAGGAGAGGAAA 663
|.||||.||||||.|||||||.|...|||||..|.|.|||||||.|||..|||||||||||.||||||||||.|
Sbjct 593 ACAAAAGGAAAAGCAAGGGGGCTGGGGAAATGCTGAGAGAGAAAGCAAACAGGAGCAAGTCCAAGGAGAGGAGA 666
Query 664 AAATCTAAAAGCCCATCCAAAAGAAGTAAGTCTCAAGATCAAGCAAGGAAATCAAAATCCCCTACCCTTAGAAG 737
|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||.|.||.|||.|
Sbjct 667 AAATCCAAAAGCCCATCCAAAAGAAGCAAGTCTCAAGACCAAGCTAGAAAGTCAAAGTCCCCTCCACTCAGACG 740
Query 738 GCGATCTCAAGAGAAAATTGGTAAGGCCAGATCTCCTACTGATGATAAGGTTAAAATTGAAGATAAAAGTAAAT 811
|||.||.|||||||||.|.||.|||||||||||||||.||||.||.|||.|.||.|.||||||.|||.|.|||.
Sbjct 741 GCGGTCCCAAGAGAAAGTGGGGAAGGCCAGATCTCCTGCTGAGGAGAAGATGAAGAGTGAAGAGAAAGGCAAAA 814
Query 812 CAAAAGATAGGAAAAAATCCCCAATTATAAATGAAAGTAGAAGTCGCGATCGAGGTAAAAAATCCAGATCCCCA 885
.|||.||||||||||||||.||||||.|||||||| ||.|||||.|||.||..|||||||||||..||||||
Sbjct 815 TAAAGGATAGGAAAAAATCACCAATTGTAAATGAA---AGGAGTCGAGATAGATCTAAAAAATCCAAGTCCCCA 885
Query 886 GTTGATTTAAGAGGTAAATCCAAAGACAGAAGGTCACGGTCCAAAGAGAGAAAATCAAAACGGTCTGAAACTGA 959
|||||.|||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||.||||||||.|||||||.|||
Sbjct 886 GTTGACTTAAGAGATAAATCCAAAGACAGAAGGTCAAGGTCCAAAGAGCGGAAGTCAAAACGATCTGAAATTGA 959
Query 960 TAAAGAAAAGAAGCCAATTAAATCTCCCTCTAAAGATGCTTCATCTGGGAAAGAAAATAGGTCACCCAGCAGAA 1033
.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 960 CAAAGAAAAGAAGCCAATTAAATCACCTTCAAAGGATGCTTCTTCTGGGAAGGAAAATAGGTCACCCAGTAGAA 1033
Query 1034 GACCTGGTCGTAGTCCTAAAAGAAGAAGTTTGTCTCCAAAACCACGTGATAAATCAAGAAGAAGCAGGTCTCCA 1107
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.||.||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1034 GACCTGGCCGTAGTCCTAAAAGAAGAAGTTTGTCTCCAAAACTGCGAGACAAGTCAAGAAGAAGTAGGTCTCCG 1107
Query 1108 CTTTTGAATGATAGAAGATCTAAGCAGAGCAAATACCCCTCGCGGACACTGTCTCCTGGGAGAAGAGCCAAGAG 1181
|||.|.|||||.||||||||||||||||||||||..||.||.||.||.||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1108 CTTCTCAATGACAGAAGATCTAAGCAGAGCAAATCGCCTTCTCGAACTCTGTCTCCAGGCAGAAGGGCCAAGAG 1181
Query 1182 CCGATCCTTAGAAAGAAAACGACGAGAACCAGAGAGGAGACGACTTTCTTCTCCAAGAACACGACCTCGAGATG 1255
|||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||
Sbjct 1182 CCGATCCTTAGAAAGAAAACGGAGAGAACCAGAGAGGAGACGACTTTCTTCTCCGAGAACAAGACCTCGAGATG 1255
Query 1256 ATATCCTCAGTAGACGTGAAAGATCAAAAGATGCCAGCCCCATCAATAGATGGTCTCCAACCCGAAGAAGAAGT 1329
|||||||..|||||.|||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 ATATCCTTGGTAGATGTGAACGGTCAAAAGATGCCAGCCCCATCAATAGGTGGTCTCCAACCCGAAGAAGAAGT 1329
Query 1330 AGATCTCCCATTAGAAGGAGGTCTCGTTCCCCACTCAGACGTAGCAGGTCTCCAAGAAGAAGAAGCAGATCTAC 1403
||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.|.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||.|
Sbjct 1330 AGGTCTCCAATTAGAAGGAGGTCCCGTTCCCCATTGAGACGCAGCAGGTCTCCTAGAAGAAGAAGCAGGTCTCC 1403
Query 1404 TCGGAGAAGGGACAGAGGTCGGAGGAGCAGATCACGCTTGCGAAGGCGGTCTCGATCACGCGGTGGTCGTAGAC 1477
|||||||||.||.||..|.||.||||||||.|||||||||.|.||..|||||||||||||.|||||||.|||..
Sbjct 1404 TCGGAGAAGAGATAGGAGCCGAAGGAGCAGGTCACGCTTGAGGAGAAGGTCTCGATCACGGGGTGGTCATAGGA 1477
Query 1478 GAAGGAGCAGAAGCAAAGTAAAGGAAGATAAATTTAAAGGAAGTCTTTCTGAAGGAATGAAAGTTGAGCAGGAA 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1478 GAAGGAGCAGAAGCAAAGTAAAGGAAGATAAATTTAAAGGAAGTCTCTCAGAAGGAATGAAAGTTGAGCAAGAG 1551
Query 1552 TCTTCGTCTGATGATAACCTTGAAGACTTTGATGTAGAGGAAGAAGATGAAGAAGCCCTAATAGAACAGAGAAG 1625
|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1552 TCTTCATCTGATGATAACCTTGAAGATTTTGATGTGGAGGAGGAAGATGAAGAGGCTCTAATAGAACAGAGAAG 1625
Query 1626 AATCCAAAGGCAGGCAATTGTTCAGAAATATAAATACCTTGCTGAAGATAGCAACATGTCTGTGCCATCTGAAC 1699
|||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1626 AATACAGAGGCAAGCAATTGTGCAGAAATATAAATATCTTGCTGAAGATAGCAATATATCTGTGCCATCTGAGC 1699
Query 1700 CAAGCAGCCCCCAGAGCAGTACGAGAACACGATCACCATCTCCAGATGACATTCTGGAGCGAGTAGCTGCTGAT 1773
|||||||||||||||||||.||.|||.|||||||.||.||.|||||.|||||..||||||||||.|||||||||
Sbjct 1700 CAAGCAGCCCCCAGAGCAGCACAAGATCACGATCTCCTTCGCCAGACGACATCTTGGAGCGAGTTGCTGCTGAT 1773
Query 1774 GTTAAAGAGTATGAACGGGAAAATGTTGATACATTTGAGGCCTCAGTGAAAGCCAAGCATAATCTAATGACAGT 1847
||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 GTAAAAGAATATGAGCGGGAGAATGTTGACACCTTTGAGGCCTCAGTAAAAGCCAAGCATAATCTAATGACAGT 1847
Query 1848 TGAACAGAATAATGGTTCATCTCAGAAGAAGTTGTTGGCACCTGATATGTTTACAGAATCTGATGATATGTTTG 1921
|||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1848 TGAACAGAATAATGGCTCATCTCAGAAGAAGATTTTGGCACCTGACATGTTTACAGAATCTGATGACATGTTTG 1921
Query 1922 CTGCGTATTTTGATAGTGCTCGTCTTCGGGCCGCTGGCATTGGAAAAGATTTCAAAGAGAATCCCAACCTCAGA 1995
||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1922 CTGCTTATTTTGATAGTGCTCGTCTCCGAGCTGCTGGCATTGGGAAAGATTTCAAAGAAAATCCCAACCTCAGA 1995
Query 1996 GATAACTGGACCGATGCAGAAGGCTATTATCGTGTGAACATAGGTGAAGTCCTAGATAAACGTTACAATGTGTA 2069
|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1996 GATAATTGGACAGATGCAGAAGGCTATTACCGTGTGAACATCGGGGAAGTCCTAGATAAACGTTATAATGTGTA 2069
Query 2070 TGGCTACACTGGGCAAGGTGTATTCAGTAATGTTGTACGAGCCAGAGATAATGCAAGAGCCAACCAAGAAGTGG 2143
|||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 2070 TGGCTACACTGGGCAGGGTGTGTTCAGCAATGTTGTGCGTGCCAGGGATAATGCGAGAGCCAACCAGGAAGTGG 2143
Query 2144 CTGTAAAGATCATCAGAAACAATGAGCTCATGCAAAAGACTGGTTTAAAAGAATTAGAGTTCTTGAAAAAACTT 2217
||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||
Sbjct 2144 CTGTAAAGATCATCAGGAACAATGAACTCATGCAAAAGACTGGTTTAAAAGAGCTAGAATTCTTGAAAAAACTT 2217
Query 2218 AATGATGCTGATCCTGATGACAAATTTCATTGTCTGAGACTCTTAAGGCACTTCTATCACAAGCAGCATCTTTG 2291
|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||.|.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||.||
Sbjct 2218 AATGATGCTGATCCTGATGACAAGTTCCATTGCCTGCGCCTCTTCAGACACTTTTACCACAAACAGCACCTCTG 2291
Query 2292 TCTGGTATTCGAGCCTCTCAGCATGAACTTACGAGAGGTGTTAAAAAAATATGGTAAAGATGTTGGTCTTCATA 2365
|||.||.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 2292 TCTCGTCTTTGAACCTCTCAGTATGAATTTGCGAGAGGTATTAAAAAAATATGGTAAGGATGTCGGTCTCCATA 2365
Query 2366 TTAAAGCTGTAAGATCCTATAGTCAGCAGTTGTTCCTGGCATTGAAACTCCTTAAAAGATGCAATATCCTACAT 2439
||||.||||||.||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||
Sbjct 2366 TTAAGGCTGTACGATCGTACAGTCAGCAGTTGTTCCTGGCATTGAAACTCCTTAAAAGATGTAATATCTTACAT 2439
Query 2440 GCAGATATCAAGCCAGACAATATCCTGGTTAATGAATCCAAAACTATTTTAAAGCTTTGCGATTTTGGGTCGGC 2513
|||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 2440 GCAGATATCAAACCGGATAATATTCTGGTTAATGAATCCAAAACAATTTTAAAACTTTGTGATTTTGGATCGGC 2513
Query 2514 TTCACATGTTGCGGATAATGACATAACACCTTATCTTTTCAGTAGATTTTATCGTGCTCCTGAAATCATT---A 2584
.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||.| |
Sbjct 2514 CTCACATGTTGCAGATAATGACATTACGCCTTATCTTGTCAGTAGATTTTATCGTGCTCCGGAGATCAGTGGCA 2587
Query 2585 T--AGGTAAAAGCTATGACTATG-GTATAGATATGTGGTC-TGTAG-------GTTGCACCTTATACGAACTCT 2647
| |||| ||.|.|||| |.| ||.| ||||| |||.| ||.||| |||
Sbjct 2588 TGAAGGT---AGTTGTGAC-AGGAGTCT-------TGGTCATGTCGAGCAAGAGTAGCA---------AAC--- 2638
Query 2648 A-TACTGGAAAAATTTTATTCCCTGGCAAAACCAATAACCATATGCTGAAGCTTGCAATGGATCTCAAAGGAAA 2720
| |..|||||| ||||.| ||..|| ||||..||| |||
Sbjct 2639 AGTTGTGGAAA---------CCCTCG-----------ACTTTA----GAAGACTGC------TCT--------- 2673
Query 2721 GATGCCAAATAAGATGATTCGAAAAGGTGTGTTCAA---AGATCAGCATTTTGATCAAAATCTCAACTTCATGT 2791
||.| ||||||| |
Sbjct 2674 --------------TGGT-----------TGTTCAAGTTA---------------------------------- 2688
Query 2792 ACATAGAAGTTGATAAAGTAACAGAGAGGGAGAAAGTTACTGTTATGAGCACCATTAATCCAACTAAGGACCTG 2865
Sbjct 2689 -------------------------------------------------------------------------- 2688
Query 2866 TTGGCTGACTTGATTGGGTGCCAGAGACTTCCTGAAGACCAACGTAAGAAAGTACACCAGCTAAAGGACTTGTT 2939
Sbjct 2689 -------------------------------------------------------------------------- 2688
Query 2940 GGACCAGATTCTGATGTTGGACCCAGCTAAACGAATTAGCATCAACCAGGCCCTACAGCACGCCTTCATCCCGG 3013
Sbjct 2689 -------------------------------------------------------------------------- 2688
Query 3014 AAAAAATT 3021
Sbjct 2689 -------- 2688