Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07330
• Subject: NM_001346715.2
• Aligned Length: 1419
• Identities: 1282
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  ATGCAATTGCCCCGGTGGTGGGAGCTGGGAGACCCCTGTGCTTGGACGGGACAGGGTCGGGGGACACGCAGGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAATTGCCCCGGTGGTGGGAGCTGGGAGACCCCTGTGCTTGGACGGGACAGGGTCGGGGGACACGCAGGAT  74

Query   75  GAGCCCCGCGACCACTGGCACATTCTTGCTGACA----------------------------------------  108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                        
Sbjct   75  GAGCCCCGCGACCACTGGCACATTCTTGCTGACAGCTTTTTTATTAAGCTGTGCTGATGGCATAAATGGAACAG  148

Query  109  --------------------------------------------------------------------GTGTAC  114
                                                                                ||||||
Sbjct  149  TTAACTGGAAGACCAGACAGGCCAACAATTTTATTATCAGCAGAAAAATGGCTGCTGGGATGAAAGATGTGTAC  222

Query  115  AGTATTTTCTCCAAGGTACACTCCGATCGGAGTGTATACCCATCAGCAGGTGTCCTCTTTGTTCATGTTTTGGA  188
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTATTTTCTCCAAGGTACACTCCGATCGGAATGTATACCCATCAGCAGGTGTCCTCTTTGTTCATGTTTTGGA  296

Query  189  AAGAGAATATTTTAAGGGGGAATTTCCACCTTACCCAAAACCTGGCGAGATTAGTAATGATCCCATAACATTTA  262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGAGAATATTTTAAGGGGGAATTTCCACCTTACCCAAAACCTGGCGAGATTAGTAATGATCCCATAACATTTA  370

Query  263  ATACAAATTTAATGGGTTACCCAGACCGACCTGGATGGCTTCGATATATCCAAAGGACACCATATAGTGATGGA  336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATACAAATTTAATGGGTTACCCAGACCGACCTGGATGGCTTCGATATATCCAAAGGACACCATATAGTGATGGA  444

Query  337  GTCCTATATGGGTCCCCAACAGCTGAAAATGTGGGGAAGCCAACAATCATTGAGATAACTGCCTACAACAGGCG  410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTCCTATATGGGTCCCCAACAGCTGAAAATGTGGGGAAGCCAACAATCATTGAGATAACTGCCTACAACAGGCG  518

Query  411  CACCTTTGAGACTGCAAGGCATAATTTGATAATTAATATAATGTCTGCAGAAGACTTCCCGTTGCCATATCAAG  484
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACCTTTGAGACTGCAAGGCATAATTTGATAATTAATATAATGTCTGCAGAAGACTTCCCGTTGCCATATCAAG  592

Query  485  CAGAATTCTTCATTAAGAATATGAATGTAGAAGAAATGTTGGCCAGTGAGGTTCTTGGAGACTTTCTTGGCGCA  558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGAATTCTTCATTAAGAATATGAATGTAGAAGAAATGTTGGCCAGTGAGGTTCTTGGAGACTTTCTTGGCGCA  666

Query  559  GTGAAAAATGTGTGGCAGCCAGAGCGCCTGAACGCCATAAACATCACATCGGCCCTAGACAGGGGTGGCAGGGT  632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGAAAAATGTGTGGCAGCCAGAGCGCCTGAACGCCATAAACATCACATCGGCCCTAGACAGGGGTGGCAGGGT  740

Query  633  GCCACTTCCCATTAATGACCTGAAGGAGGGCGTTTATGTCATGGTTGGTGCAGATGTCCCGTTTTCTTCTTGTT  706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCACTTCCCATTAATGACCTGAAGGAGGGCGTTTATGTCATGGTTGGTGCAGATGTCCCGTTTTCTTCTTGTT  814

Query  707  TACGAGAAGTTGAAAATCCACAGAATCAATTGAGATGTAGTCAAGAAATGGAGCCTGTAATAACATGTGATAAA  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TACGAGAAGTTGAAAATCCACAGAATCAATTGAGATGTAGTCAAGAAATGGAGCCTGTAATAACATGTGATAAA  888

Query  781  AAATTTCGTACTCAATTTTACATTGACTGGTGCAAAATTTCATTGGTTGATAAAACAAAGCAAGTGTCCACCTA  854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAATTTCGTACTCAATTTTACATTGACTGGTGCAAAATTTCATTGGTTGATAAAACAAAGCAAGTGTCCACCTA  962

Query  855  TCAGGAAGTGATTCGTGGAGAGGGGATTTTACCTGATGGTGGAGAATACAAACCCCCTTCTGATTCTTTGAAAA  928
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCAGGAAGTGATTCGTGGAGAGGGGATTTTACCTGATGGTGGAGAATACAAACCCCCTTCTGATTCTTTGAAAA  1036

Query  929  GCAGAGACTATTACACGGATTTCCTAATTACACTGGCTGTGCCCTCGGCAGTGGCACTGGTCCTTTTTCTAATA  1002
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCAGAGACTATTACACGGATTTCCTAATTACACTGGCTGTGCCCTCGGCAGTGGCACTGGTCCTTTTTCTAATA  1110

Query 1003  CTTGCTTATATCATGTGCTGCCGACGGGAAGGCGTGGAAAAGAGAAACATGCAAACACCAGACATCCAACTGGT  1076
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                           ||||||||||||
Sbjct 1111  CTTGCTTATATCATGTGCTGCCGACGGGAAGGCGT---------------------------CATCCAACTGGT  1157

Query 1077  CCATCACAGTGCTATTCAGAAATCTACCAAGGAGCTTCGAGACATGTCCAAGAATAGAGAGATAGCATGGCCCC  1150
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158  CCATCACAGTGCTATTCAGAAATCTACCAAGGAGCTTCGAGACATGTCCAAGAATAGAGAGATAGCATGGCCCC  1231

Query 1151  TGTCAACGCTTCCTGTGTTCCACCCTGTGACTGGGGAAATCATACATCCTTTACACACAGACAACTATGATAGC  1224
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232  TGTCAACGCTTCCTGTGTTCCACCCTGTGACTGGGGAAATCATACCTCCTTTACACACAGACAACTATGATAGC  1305

Query 1225  ACAAACATGCCATTGATGCAAACGCAGCAGAACTTGCCACATCAGACTCAGATTCCCCAACAGCAGACTACAGG  1298
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306  ACAAACATGCCATTGATGCAAACGCAGCAGAACTTGCCACATCAGACTCAGATTCCCCAACAGCAGACTACAGG  1379

Query 1299  TAAATGGTATCCC  1311
            |||||||||||||
Sbjct 1380  TAAATGGTATCCC  1392