Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07330
• Subject: XM_017012763.1
• Aligned Length: 1410
• Identities: 1205
• Gaps: 195

Alignment

Query    1  ATGCAATTGCCCCGGTGGTGGGAGCTGGGAGACCCCTGTGCTTGGACGGGACAGGGTCGGGGGACACGCAGGAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAGCCCCGCGACCACTGGCACATTCTTGCTGACA--------GTGTACAGTATTTTCTCCAAGGTACACTCCGA  140
                          .||||       |||||..|        ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------ATGGC-------TGCTGGGATGAAAGATGTGTACAGTATTTTCTCCAAGGTACACTCCGA  53

Query  141  TCGGAGTGTATACCCATCAGCAGGTGTCCTCTTTGTTCATGTTTTGGAAAGAGAATATTTTAAGGGGGAATTTC  214
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   54  TCGGAATGTATACCCATCAGCAGGTGTCCTCTTTGTTCATGTTTTGGAAAGAGAATATTTTAAGGGGGAATTTC  127

Query  215  CACCTTACCCAAAACCTGGCGAGATTAGTAATGATCCCATAACATTTAATACAAATTTAATGGGTTACCCAGAC  288
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  128  CACCTTACCCAAAACCTGGCGAGATTAGTAATGATCCCATAACATTTAATACAAATTTAATGGGTTACCCAGAC  201

Query  289  CGACCTGGATGGCTTCGATATATCCAAAGGACACCATATAGTGATGGAGTCCTATATGGGTCCCCAACAGCTGA  362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  202  CGACCTGGATGGCTTCGATATATCCAAAGGACACCATATAGTGATGGAGTCCTATATGGGTCCCCAACAGCTGA  275

Query  363  AAATGTGGGGAAGCCAACAATCATTGAGATAACTGCCTACAACAGGCGCACCTTTGAGACTGCAAGGCATAATT  436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  276  AAATGTGGGGAAGCCAACAATCATTGAGATAACTGCCTACAACAGGCGCACCTTTGAGACTGCAAGGCATAATT  349

Query  437  TGATAATTAATATAATGTCTGCAGAAGACTTCCCGTTGCCATATCAAGCAGAATTCTTCATTAAGAATATGAAT  510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  350  TGATAATTAATATAATGTCTGCAGAAGACTTCCCGTTGCCATATCAAGCAGAATTCTTCATTAAGAATATGAAT  423

Query  511  GTAGAAGAAATGTTGGCCAGTGAGGTTCTTGGAGACTTTCTTGGCGCAGTGAAAAATGTGTGGCAGCCAGAGCG  584
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  424  GTAGAAGAAATGTTGGCCAGTGAGGTTCTTGGAGACTTTCTTGGCGCAGTGAAAAATGTGTGGCAGCCAGAGCG  497

Query  585  CCTGAACGCCATAAACATCACATCGGCCCTAGACAGGGGTGGCAGGGTGCCACTTCCCATTAATGACCTGAAGG  658
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  CCTGAACGCCATAAACATCACATCGGCCCTAGACAGGGGTGGCAGGGTGCCACTTCCCATTAATGACCTGAAGG  571

Query  659  AGGGCGTTTATGTCATGGTTGGTGCAGATGTCCCGTTTTCTTCTTGTTTACGAGAAGTTGAAAATCCACAGAAT  732
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  572  AGGGCGTTTATGTCATGGTTGGTGCAGATGTCCCGTTTTCTTCTTGTTTACGAGAAGTTGAAAATCCACAGAAT  645

Query  733  CAATTGAGATGTAGTCAAGAAATGGAGCCTGTAATAACATGTGATAAAAAATTTCGTACTCAATTTTACATTGA  806
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  646  CAATTGAGATGTAGTCAAGAAATGGAGCCTGTAATAACATGTGATAAAAAATTTCGTACTCAATTTTACATTGA  719

Query  807  CTGGTGCAAAATTTCATTGGTTGATAAAACAAAGCAAGTGTCCACCTATCAGGAAGTGATTCGTGGAGAGGGGA  880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  CTGGTGCAAAATTTCATTGGTTGATAAAACAAAGCAAGTGTCCACCTATCAGGAAGTGATTCGTGGAGAGGGGA  793

Query  881  TTTTACCTGATGGTGGAGAATACAAACCCCCTTCTGATTCTTTGAAAAGCAGAGACTATTACACGGATTTCCTA  954
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  TTTTACCTGATGGTGGAGAATACAAACCCCCTTCTGATTCTTTGAAAAGCAGAGACTATTACACGGATTTCCTA  867

Query  955  ATTACACTGGCTGTGCCCTCGGCAGTGGCACTGGTCCTTTTTCTAATACTTGCTTATATCATGTGCTGCCGACG  1028
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  868  ATTACACTGGCTGTGCCCTCGGCAGTGGCACTGGTCCTTTTTCTAATACTTGCTTATATCATGTGCTGCCGACG  941

Query 1029  GGAAGGCGTGGAAAAGAGAAACATGCAAACACCAGACATCCAACTGGTCCATCACAGTGCTATTCAGAAATCTA  1102
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  GGAAGGCGTGGAAAAGAGAAACATGCAAACACCAGACATCCAACTGGTCCATCACAGTGCTATTCAGAAATCTA  1015

Query 1103  CCAAGGAGCTTCGAGACATGTCCAAGAATAGAGAGATAGCATGGCCCCTGTCAACGCTTCCTGTGTTCCACCCT  1176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016  CCAAGGAGCTTCGAGACATGTCCAAGAATAGAGAGATAGCATGGCCCCTGTCAACGCTTCCTGTGTTCCACCCT  1089

Query 1177  GTGACTGGGGAAATCATACATCCTTTACACACAGACAACTATGATAGCACAAACATGCCATTGATGCAAACGCA  1250
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090  GTGACTGGGGAAATCATACCTCCTTTACACACAGACAACTATGATAGCACAAACATGCCATTGATGCAAACGCA  1163

Query 1251  GCAGAACTTGCCACATCAGACTCAGATTCCCCAACAGCAGACTACAGGTAAA---TGGTATCCC----------  1311
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |.|   |.||.|..|          
Sbjct 1164  GCAGAACTTGCCACATCAGACTCAGATTCCCCAACAGCAGACTACAGG-AGATTTTCGTTTGACAACTTTTCAA  1236

Query 1312  --------------------------------------------------------------------------  1311
                                                                                      
Sbjct 1237  AGATTTGAGGCAAGTATAATGAAATTGTTCATCAGATTTCAATTACAAGATGTTTATCAGAATTTTTCCCTACA  1310

Query 1312  ----  1311
                
Sbjct 1311  ATTT  1314