Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07338
Subject:
NM_001201536.1
Aligned Length:
1350
Identities:
1349
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGAGTGATTTCAGTGAAGAATTAAAAGGGCCTGTGACAGATGATGAAGAAGTGGAAACATCTGTGCTCAGTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTGATTTCAGTGAAGAATTAAAAGGGCCTGTGACAGATGATGAAGAAGTGGAAACATCTGTGCTCAGTGG  74

Query   75  TGCAGGAATGCATTTTCCTTGGCTTCAAACATACGTAGAAACTGTGGCCATTGGAGGGAAAAGGAGGAAGGATT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCAGGAATGCATTTTCCTTGGCTTCAAACATACGTAGAAACTGTGGCCATTGGAGGGAAAAGGAGGAAGGATT  148

Query  149  TTGCTCAGACAACAAGTGCTTGTTTAAGTTTTATCCAAGAAGCTCTGCTGAAGCACCAATGGCAGCAAGCTGCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGCTCAGACAACAAGTGCTTGTTTAAGTTTTATCCAAGAAGCTCTGCTGAAGCACCAATGGCAGCAAGCTGCA  222

Query  223  GAATACATGTACAGTTATTTTCAGACCTTGGAAGATTCAGATAGCTACAAAAGGCAGGCTGCACCTGAGATTAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAATACATGTACAGTTATTTTCAGACCTTGGAAGATTCAGATAGCTACAAAAGGCAGGCTGCACCTGAGATTAT  296

Query  297  TTGGAAGCTCGGAAGTGAAATTCTATTTTATCATCCCAAAAGCAACATGGAGAGTTTCAATACTTTTGCTAACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTGGAAGCTCGGAAGTGAAATTCTATTTTATCATCCCAAAAGCAACATGGAGAGTTTCAATACTTTTGCTAACC  370

Query  371  GGATGAAAAATATTGGCGTCATGAATTATTTAAAGATCTCCTTACAACATGCATTATACCTTCTGCATCATGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGATGAAAAATATTGGCGTCATGAATTATTTAAAGATCTCCTTACAACATGCATTATACCTTCTGCATCATGGA  444

Query  445  ATGCTTAAAGATGCTAAGAGAAATCTGAGTGAGGCAGAGACATGGAGACATGGTGAAAATACGTCTTCCCGGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGCTTAAAGATGCTAAGAGAAATCTGAGTGAGGCAGAGACATGGAGACATGGTGAAAATACGTCTTCCCGGGA  518

Query  519  AATATTAATCAACCTTATTCAGGCCTATAAAGGGCTTTTACAGTATTATACCTGGTCTGAAAAGAAGATGGAAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATATTAATCAACCTTATTCAGGCCTATAAAGGGCTTTTACAGTATTATACCTGGTCTGAAAAGAAGATGGAAT  592

Query  593  TGTCAAAGCTTGATAAGGATGATTATGCTTACAATGCAGTAGCCCAGGATGTGTTCAACCACAGCTGGAAGACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGTCAAAGCTTGATAAGGATGATTATGCTTACAATGCAGTAGCCCAGGATGTGTTCAACCACAGCTGGAAGACA  666

Query  667  TCTGCAAATATTTCTGCATTGATTAAAATTCCTGGAGTTTGGGACCCTTTTGTGAAGAGTTATGTAGAAATGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTGCAAATATTTCTGCATTGATTAAAATTCCTGGAGTTTGGGACCCTTTTGTGAAGAGTTATGTAGAAATGCT  740

Query  741  GGAATTCTATGGGGATCGAGATGGAGCCCAAGAGGTACTCACCAATTATGCATATGATGAAAAGTTTCCATCAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAATTCTATGGGGATCGAGATGGAGCCCAAGAGGTACTCACCAATTATGCATATGATGAAAAGTTTCCATCAA  814

Query  815  ATCCAAATGCCCATATCTACTTATACAACTTTCTAAAGAGACAGAAGGCACCAAGATCAAAATTGATAAGTGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATCCAAATGCCCATATCTACTTATACAACTTTCTAAAGAGACAGAAGGCACCAAGATCAAAATTGATAAGTGTG  888

Query  889  CTTAAGATTTTGTATCAGATTGTACCATCTCATAAATTGATGTTGGAATTCCATACATTACTTAGAAAATCAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTAAGATTTTGTATCAGATTGTACCATCTCATAAATTGATGTTGGAATTCCATACATTACTTAGAAAATCAGA  962

Query  963  AAAAGAAGAACACCGTAAACTGGGGTTGGAGGTATTATTTGGAGTCTTAGATTTTGCCGGATGCACTAAGAATA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAAAGAAGAACACCGTAAACTGGGGTTGGAGGTATTATTTGGAGTCTTAGATTTTGCCGGATGCACTAAGAATA  1036

Query 1037  TAACTGCTTGGAAATACTTGGCAAAATATCTGAAAAATATCTTAATGGGAAACCACCTTGCGTGGGTTCAAGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAACTGCTTGGAAATACTTGGCAAAATATCTGAAAAATATCTTAATGGGAAACCACCTTGCGTGGGTTCAAGAA  1110

Query 1111  GAGTGGAACTCCAGGAAAAACTGGTGGCCAGGGTTTCATTTCAGCTACTTTTGGGCAAAAAGTGATTGGAAGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGTGGAACTCCAGGAAAAACTGGTGGCCAGGCTTTCATTTCAGCTACTTTTGGGCAAAAAGTGATTGGAAGGA  1184

Query 1185  AGATACAGCTTTGGCCTGTGAGAAAGCTTTTGTGGCTGGTTTACTGTTAGGAAAAGGTTGTAGATATTTCCGGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGATACAGCTTTGGCCTGTGAGAAAGCTTTTGTGGCTGGTTTACTGTTAGGAAAAGGTTGTAGATATTTCCGGT  1258

Query 1259  ATATTTTAAAGCAAGATCACCAAATCTTAGGGAAGAAAATTAAGCGGATGAAGAGATCTGTGAAAAAATACAGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATATTTTAAAGCAAGATCACCAAATCTTAGGGAAGAAAATTAAGCGGATGAAGAGATCTGTGAAAAAATACAGT  1332

Query 1333  ATTGTAAATCCAAGACTC  1350
            ||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATTGTAAATCCAAGACTC  1350