Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07338
• Subject: XM_005273343.4
• Aligned Length: 1359
• Identities: 920
• Gaps: 435

Alignment

Query    1  ATGAGTGATTTCAGTGAAGAATTAAAAGGGCCTGTGACAGATGATGAAGAAGTGGAAACATCTGTGCTCAGTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTGATTTCAGTGAAGAATTAAAAGGGCCTGTGACAGATGATGAAGAAGTGGAAACATCTGTGCTCAGTGG  74

Query   75  TGCAGGAATGCATTTTCCTTGGCTTCAAACATACGTAGAAACTGTGGCCATTGGAGGGAAAAGGAGGAAGGATT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCAGGAATGCATTTTCCTTGGCTTCAAACATACGTAGAAACTGTGGCCATTGGAGGGAAAAGGAGGAAGGATT  148

Query  149  TTGCTCAGACAACAAGTGCTTGTTTAAGTTTTATCCAAGAAGCTCTGCTGAAGCACCAATGGCAGCAAGCTGCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGCTCAGACAACAAGTGCTTGTTTAAGTTTTATCCAAGAAGCTCTGCTGAAGCACCAATGGCAGCAAGCTGCA  222

Query  223  GAATACATGTACAGTTATTTTCAGACCTTGGAAGATTCAGATAGCTACAAAAGGCAGGCTGCACCTGAGATTAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAATACATGTACAGTTATTTTCAGACCTTGGAAGATTCAGATAGCTACAAAAGGCAGGCTGCACCTGAGATTAT  296

Query  297  TTGGAAGCTCGGAAGTGAAATTCTATTTTATCATCCCAAAAGCAACATGGAGAGTTTCAATACTTTTGCTAACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTGGAAGCTCGGAAGTGAAATTCTATTTTATCATCCCAAAAGCAACATGGAGAGTTTCAATACTTTTGCTAACC  370

Query  371  GGATGAAAAATATTGGCGTCATGAATTATTTAAAGATCTCCTTACAACATGCATTATACCTTCTGCATCATGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGATGAAAAATATTGGCGTCATGAATTATTTAAAGATCTCCTTACAACATGCATTATACCTTCTGCATCATGGA  444

Query  445  ATGCTTAAAGATGCTAAGAGAAATCTGAGTGAGGCAGAGACATGGAGACATGGTGAAAATACGTCTTCCCGGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGCTTAAAGATGCTAAGAGAAATCTGAGTGAGGCAGAGACATGGAGACATGGTGAAAATACGTCTTCCCGGGA  518

Query  519  AATATTAATCAACCTTATTCAGGCCTATAAAGGGCTTTTACAGTATTATACCTGGTCTGAAAAGAAGATGGAAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATATTAATCAACCTTATTCAGGCCTATAAAGGGCTTTTACAGTATTATACCTGGTCTGAAAAGAAGATGGAAT  592

Query  593  TGTCAAAGCTTGATAAGGATGATTATGCTTACAATGCAGTAGCCCAGGATGTGTTCAACCACAGCTGGAAGACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGTCAAAGCTTGATAAGGATGATTATGCTTACAATGCAGTAGCCCAGGATGTGTTCAACCACAGCTGGAAGACA  666

Query  667  TCTGCAAATATTTCTGCATTGATTAAAATTCCTGGAGTTTGGGACCCTTTTGTGAAGAGTTATGTAGAAATGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTGCAAATATTTCTGCATTGATTAAAATTCCTGGAGTTTGGGACCCTTTTGTGAAGAGTTATGTAGAAATGCT  740

Query  741  GGAATTCTATGGGGATCGAGATGGAGCCCAAGAGGTACTCACCAATTATGCATATGATGAAAAGTTTCCATCAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAATTCTATGGGGATCGAGATGGAGCCCAAGAGGTACTCACCAATTATGCATATGATGAAAAGTTTCCATCAA  814

Query  815  ATCCAAATGCCCATATCTACTTATACAACTTTCTAAAGAGACAGAAGGCACCAAGATCAAAATTGATAAGTGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATCCAAATGCCCATATCTACTTATACAACTTTCTAAAGAGACAGAAGGCACCAAGATCAAAATTGATAAGTGTG  888

Query  889  CTTAAGATTTTGTATCAGATTGTACCATCT-CATAAATTGATGTTGGAATTCCA------TACATT--ACTTAG  953
            ||||||                   ||||| ||.||           ||||.||      ||||.|  |||.||
Sbjct  889  CTTAAG-------------------CATCTACAGAA-----------AATTTCAATAATGTACAGTACACTGAG  932

Query  954  AAAATCAGAAAAAGAAGAACACCGTAAACTGGGGTTGGAGGTATTATTTGGAGTCTTAGATTTTGCCGGATGCA  1027
            |                                                                         
Sbjct  933  A-------------------------------------------------------------------------  933

Query 1028  CTAAGAATATAACTGCTTGGAAATACTTGGCAAAATATCTGAAAAATATCTTAATGGGAAACCACCTTGCGTGG  1101
                                                                                      
Sbjct  934  --------------------------------------------------------------------------  933

Query 1102  GTTCAAGAAGAGTGGAACTCCAGGAAAAACTGGTGGCCAGGGTTTCATTTCAGCTACTTTTGGGCAAAAAGTGA  1175
                                                                                      
Sbjct  934  --------------------------------------------------------------------------  933

Query 1176  TTGGAAGGAAGATACAGCTTTGGCCTGTGAGAAAGCTTTTGTGGCTGGTTTACTGTTAGGAAAAGGTTGTAGAT  1249
                                                                                      
Sbjct  934  --------------------------------------------------------------------------  933

Query 1250  ATTTCCGGTATATTTTAAAGCAAGATCACCAAATCTTAGGGAAGAAAATTAAGCGGATGAAGAGATCTGTGAAA  1323
                                                                                      
Sbjct  934  --------------------------------------------------------------------------  933

Query 1324  AAATACAGTATTGTAAATCCAAGACTC  1350
                                       
Sbjct  934  ---------------------------  933