Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07338
• Subject: XM_017002758.1
• Aligned Length: 1350
• Identities: 1235
• Gaps: 114

Alignment

Query    1  ATGAGTGATTTCAGTGAAGAATTAAAAGGGCCTGTGACAGATGATGAAGAAGTGGAAACATCTGTGCTCAGTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTGATTTCAGTGAAGAATTAAAAGGGCCTGTGACAGATGATGAAGAAGTGGAAACATCTGTGCTCAGTGG  74

Query   75  TGCAGGAATGCATTTTCCTTGGCTTCAAACATACGTAGAAACTGTGGCCATTGGAGGGAAAAGGAGGAAGGATT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCAGGAATGCATTTTCCTTGGCTTCAAACATACGTAGAAACTGTGGCCATTGGAGGGAAAAGGAGGAAGGATT  148

Query  149  TTGCTCAGACAACAAGTGCTTGTTTAAGTTTTATCCAAGAAGCTCTGCTGAAGCACCAATGGCAGCAAGCTGCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGCTCAGACAACAAGTGCTTGTTTAAGTTTTATCCAAGAAGCTCTGCTGAAGCACCAATGGCAGCAAGCTGCA  222

Query  223  GAATACATGTACAGTTATTTTCAGACCTTGGAAGATTCAGATAGCTACAAAAGGCAGGCTGCACCTGAGATTAT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  223  GAATACATGTACAGTTATTTTCAGACCTTGGAAGATTCAGATAGCTACAAAAGGCAGGCTGCACCTG-------  289

Query  297  TTGGAAGCTCGGAAGTGAAATTCTATTTTATCATCCCAAAAGCAACATGGAGAGTTTCAATACTTTTGCTAACC  370
                                                                                      
Sbjct  290  --------------------------------------------------------------------------  289

Query  371  GGATGAAAAATATTGGCGTCATGAATTATTTAAAGATCTCCTTACAACATGCATTATACCTTCTGCATCATGGA  444
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  290  ---------------------------------AGATCTCCTTACAACATGCATTATACCTTCTGCATCATGGA  330

Query  445  ATGCTTAAAGATGCTAAGAGAAATCTGAGTGAGGCAGAGACATGGAGACATGGTGAAAATACGTCTTCCCGGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  331  ATGCTTAAAGATGCTAAGAGAAATCTGAGTGAGGCAGAGACATGGAGACATGGTGAAAATACGTCTTCCCGGGA  404

Query  519  AATATTAATCAACCTTATTCAGGCCTATAAAGGGCTTTTACAGTATTATACCTGGTCTGAAAAGAAGATGGAAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  405  AATATTAATCAACCTTATTCAGGCCTATAAAGGGCTTTTACAGTATTATACCTGGTCTGAAAAGAAGATGGAAT  478

Query  593  TGTCAAAGCTTGATAAGGATGATTATGCTTACAATGCAGTAGCCCAGGATGTGTTCAACCACAGCTGGAAGACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479  TGTCAAAGCTTGATAAGGATGATTATGCTTACAATGCAGTAGCCCAGGATGTGTTCAACCACAGCTGGAAGACA  552

Query  667  TCTGCAAATATTTCTGCATTGATTAAAATTCCTGGAGTTTGGGACCCTTTTGTGAAGAGTTATGTAGAAATGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  553  TCTGCAAATATTTCTGCATTGATTAAAATTCCTGGAGTTTGGGACCCTTTTGTGAAGAGTTATGTAGAAATGCT  626

Query  741  GGAATTCTATGGGGATCGAGATGGAGCCCAAGAGGTACTCACCAATTATGCATATGATGAAAAGTTTCCATCAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  627  GGAATTCTATGGGGATCGAGATGGAGCCCAAGAGGTACTCACCAATTATGCATATGATGAAAAGTTTCCATCAA  700

Query  815  ATCCAAATGCCCATATCTACTTATACAACTTTCTAAAGAGACAGAAGGCACCAAGATCAAAATTGATAAGTGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  701  ATCCAAATGCCCATATCTACTTATACAACTTTCTAAAGAGACAGAAGGCACCAAGATCAAAATTGATAAGTGTG  774

Query  889  CTTAAGATTTTGTATCAGATTGTACCATCTCATAAATTGATGTTGGAATTCCATACATTACTTAGAAAATCAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  775  CTTAAGATTTTGTATCAGATTGTACCATCTCATAAATTGATGTTGGAATTCCATACATTACTTAGAAAATCAGA  848

Query  963  AAAAGAAGAACACCGTAAACTGGGGTTGGAGGTATTATTTGGAGTCTTAGATTTTGCCGGATGCACTAAGAATA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  849  AAAAGAAGAACACCGTAAACTGGGGTTGGAGGTATTATTTGGAGTCTTAGATTTTGCCGGATGCACTAAGAATA  922

Query 1037  TAACTGCTTGGAAATACTTGGCAAAATATCTGAAAAATATCTTAATGGGAAACCACCTTGCGTGGGTTCAAGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  923  TAACTGCTTGGAAATACTTGGCAAAATATCTGAAAAATATCTTAATGGGAAACCACCTTGCGTGGGTTCAAGAA  996

Query 1111  GAGTGGAACTCCAGGAAAAACTGGTGGCCAGGGTTTCATTTCAGCTACTTTTGGGCAAAAAGTGATTGGAAGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  997  GAGTGGAACTCCAGGAAAAACTGGTGGCCAGGCTTTCATTTCAGCTACTTTTGGGCAAAAAGTGATTGGAAGGA  1070

Query 1185  AGATACAGCTTTGGCCTGTGAGAAAGCTTTTGTGGCTGGTTTACTGTTAGGAAAAGGTTGTAGATATTTCCGGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071  AGATACAGCTTTGGCCTGTGAGAAAGCTTTTGTGGCTGGTTTACTGTTAGGAAAAGGTTGTAGATATTTCCGGT  1144

Query 1259  ATATTTTAAAGCAAGATCACCAAATCTTAGGGAAGAAAATTAAGCGGATGAAGAGATCTGTGAAAAAATACAGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1145  ATATTTTAAAGCAAGATCACCAAATCTTAGGGAAGAAAATTAAGCGGATGAAGAGATCTGTGAAAAAATACAGT  1218

Query 1333  ATTGTAAATCCAAGACTC  1350
            ||||||||||||||||||
Sbjct 1219  ATTGTAAATCCAAGACTC  1236