Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07366
• Subject: NM_001146013.1
• Aligned Length: 2400
• Identities: 2124
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGGATTGCAGTGCTCCCAAGGAAATGAATAAACTGCCAGCCAACAGCCCGGAGGCGGCGGCGGCGCAGGGCCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|..|||   |||.||||.||..|||||
Sbjct    1  ATGGATTGCAGTGCTCCCAAGGAAATGAATAAACAGCCAGCCAACATCTTGGA---GGCAGCGGTGCCAGGCCA  71

Query   75  CCCGGATGGCCCATGCGCTCCCAGGACGAGCCCGGAGCAGGAGCTTCCCGCGGCTGCCGCCCCG---------C  139
            ||.||||.|.||..|.||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.||.|..|||.||.||         |
Sbjct   72  CCGGGATAGTCCTCGTGCACCTAGGACCAGCCCTGAACAGGATCTTCCTGCTGAGGCCCCCACGGCCACTGTCC  145

Query  140  CGCCGCCACGTGTGCCCAGGTCCGCTTCCACCGGCGCCCAAACTTTCCAGTCAGCGGACGCGCGAGCCTGCGAG  213
            .|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||
Sbjct  146  AGCCGCCACGTGTGCCCAGGTCGGCTTCCACCGGCGCCCAAACTTTCCAGTCTGCGGATGCGAGAGCCTGCGAG  219

Query  214  GCTGAGCGGCCAGGAGTGGGGTCTTGCAAACTCAGTAGCCCGCGGGCGCAGGCGGCCTCTGCAGCTCTGCGGGA  287
            ||..|||.|.|.|||||.||||.|||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||.||||.||.||.||.|||||
Sbjct  220  GCCCAGCAGTCCGGAGTAGGGTTTTGTAATCTCAGCAGCCCCCGGGCACAAGCGACCTCCGCGGCCCTCCGGGA  293

Query  288  CTTGAGAGAGGCGCAAGGCGCGCAGGCCTCGCCCCCTCCCGGGAGCTCCGGGCCCGGCAACGCGTTGCACTGTA  361
            |||.||.||.|.|||..||||.||||||...||||||.|||||..|.|||||.|.||||||||..|||||||.|
Sbjct  294  CTTAAGCGAAGGGCACAGCGCACAGGCCAATCCCCCTTCCGGGCCCGCCGGGGCTGGCAACGCTCTGCACTGCA  367

Query  362  AGATCCCTTCTCTGCGAGGCCCGGAGGGGGATGCGAACGTGAGTGTGGGCAAGGGCACCCTGGAGCGGAACAAT  435
            ||||.||..|||||||.||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||||||
Sbjct  368  AGATTCCAGCTCTGCGTGGCCCGGAGGAGGACGCGAACGTGAGTGTGGGCAAGGGCACGCTGGAGCACAACAAT  441

Query  436  ACCCCTGTTGTGGGCTGGGTGAACATGAGCCAGAGCACCGTGGTGCTGGGCACGGATGGAATCACGTCCGTGCT  509
            |||||.|..||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.||||.||.|||||.|||.||||.|||||
Sbjct  442  ACCCCAGCCGTGGGCTGGGTGAATATGAGCCAGAGCACAGTAGTGTTGGGAACCGATGGCATCGCGTCGGTGCT  515

Query  510  CCCGGGCAGCGTGGCCACCGTTGCCACCCAGGAGGACGAGCAAGGGGATGAGAATAAGGCCCGAGGGAACTGGT  583
            |||||||||||||||||||..|.|||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  CCCGGGCAGCGTGGCCACCACTACCATACCGGAGGACGAGCAAGGGGATGAGAATAAGGCCCGAGGGAACTGGT  589

Query  584  CCAGCAAACTGGACTTCATCCTGTCCATGGTGGGGTACGCAGTGGGGCTGGGCAATGTCTGGAGGTTTCCCTAC  657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  590  CCAGCAAACTGGACTTCATCCTGTCCATGGTGGGGTACGCAGTGGGGCTGGGCAATGTTTGGAGGTTTCCCTAC  663

Query  658  CTGGCCTTCCAGAACGGGGGAGGTGCTTTCCTCATCCCTTACCTGATGATGCTGGCTCTGGCTGGATTACCCAT  731
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  664  CTGGCCTTCCAGAACGGGGGAGGCGCGTTCCTCATCCCTTACTTGATGATGCTGGCACTGGCTGGCTTACCCAT  737

Query  732  CTTCTTCTTGGAGGTGTCGCTGGGCCAGTTTGCCAGCCAGGGACCAGTGTCTGTGTGGAAGGCCATCCCAGCTC  805
            |||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  CTTCTTCCTAGAGGTGTCCCTGGGCCAGTTTGCCAGCCAGGGTCCTGTGTCTGTGTGGAAGGCCATCCCAGCTC  811

Query  806  TACAAGGCTGTGGCATCGCGATGCTGATCATCTCTGTCCTAATAGCCATATACTACAATGTGATTATTTGCTAT  879
            |.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.
Sbjct  812  TGCAGGGTTGTGGCATTGCGATGCTCATCATCTCTGTCCTCATAGCCATATACTACAACGTCATCATCTGCTAC  885

Query  880  ACACTTTTCTACCTGTTTGCCTCCTTTGTGTCTGTACTACCCTGGGGCTCCTGCAACAACCCTTGGAATACACC  953
            ||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  886  ACGCTCTTCTACCTGTTTGCCTCCTTCGTGTCTGTGCTGCCCTGGGGGTCCTGCAACAACCCGTGGAACACACC  959

Query  954  AGAATGCAAAGATAAAACCAAACTTTTATTAGATTCCTGTGTTATCAGTGACCATCCCAAAATACAGATCAAGA  1027
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  960  AGAATGCAAAGATAAAACCAAACTTTTACTAGATTCCTGTGTTATCGGTGACCATCCCAAGATACAGATCAAGA  1033

Query 1028  ACTCGACTTTCTGCATGACCGCTTATCCCAACGTGACAATGGTTAATTTCACCAGCCAGGCCAATAAGACATTT  1101
            ||||.||||||||||||||.||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1034  ACTCTACTTTCTGCATGACTGCCTATCCGAACTTGACAATGGTTAACTTCACCAGCCAGACCAATAAGACATTT  1107

Query 1102  GTCAGTGGAAGTGAAGAGTACTTCAAGTACTTTGTGCTGAAGATTTCTGCAGGGATTGAATATCCTGGCGAGAT  1175
            |||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1108  GTCAGCGGGAGTGAAGAGTACTTCAAGTATTTTGTGCTGAAGATTTCTGCAGGGATTGAATATCCGGGTGAGAT  1181

Query 1176  CAGGTGGCCACTAGCTCTCTGCCTCTTCCTGGCTTGGGTCATTGTGTATGCATCGTTGGCTAAAGGAATCAAGA  1249
            |.|||||||..|.||..|||||||.|||.||||||||||.||||||||.|||||..||||.||||||||.|||.
Sbjct 1182  CCGGTGGCCCTTGGCCTTCTGCCTTTTCTTGGCTTGGGTGATTGTGTACGCATCACTGGCGAAAGGAATTAAGT  1255

Query 1250  CTTCAGGAAAAGTGGTGTACTTCACGGCCACGTTCCCGTATGTCGTACTCGTGATCCTCCTCATCCGAGGAGTC  1323
            |.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1256  CATCAGGAAAAGTAGTCTACTTCACAGCCACATTCCCTTATGTCGTCCTGGTCATCCTCCTTATTCGAGGAGTC  1329

Query 1324  ACCCTGCCTGGAGCTGGAGCTGGGATCTGGTACTTCATCACACCCAAGTGGGAGAAACTCACGGATGCCACGGT  1397
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  ACCCTGCCTGGAGCTGGAGCCGGCATCTGGTACTTCATCACACCTAAGTGGGAAAAACTCACGGATGCCACGGT  1403

Query 1398  GTGGAAAGATGCTGCCACTCAGATTTTCTTCTCTTTATCTGCTGCATGGGGAGGCCTGATCACTCTCTCTTCTT  1471
            .|||||.|||||.||||||||||||||||||||..|.|||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1404  ATGGAAGGATGCGGCCACTCAGATTTTCTTCTCCCTGTCTGCGGCCTGGGGAGGGCTCATCACTCTTTCTTCTT  1477

Query 1472  ACAACAAATTCCACAACAACTGCTACAGGGACACTCTAATTGTCACCTGCACCAACAGTGCCACAAGCATCTTT  1545
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1478  ACAACAAATTCCACAACAACTGCTACAGGGATACGTTAATTGTAACCTGCACTAACAGTGCCACTAGCATCTTT  1551

Query 1546  GCCGGCTTCGTCATCTTCTCCGTTATCGGCTTCATGGCCAATGAACGCAAAGTCAACATTGAGAATGTGGCAGA  1619
            ||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1552  GCTGGGTTTGTCATCTTCTCTGTCATCGGCTTCATGGCCAACGAGCGCAAAGTCAACATTGAGAATGTGGCCGA  1625

Query 1620  CCAAGGGCCAGGCATTGCATTTGTGGTTTACCCGGAAGCCTTAACCAGGCTGCCTCTCTCTCCGTTCTGGGCCA  1693
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1626  CCAAGGGCCTGGCATTGCATTTGTGGTTTACCCTGAGGCCTTAACTAGGCTGCCTCTCTCTCCATTCTGGGCCA  1699

Query 1694  TCATCTTTTTCCTGATGCTCCTCACTCTTGGACTTGACACTATGTTTGCCACCATCGAGACCATAGTGACCTCC  1767
            ||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1700  TCATCTTTTTTCTGATGCTTCTCACGCTTGGACTCGACACCATGTTTGCCACCATTGAGACCATCGTGACCTCC  1773

Query 1768  ATCTCAGACGAGTTTCCCAAGTACCTACGCACACACAAGCCAGTGTTTACTCTGGGCTGCTGCATTTGTTTCTT  1841
            |||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1774  ATCTCGGATGAGTTTCCCAAGTACCTGCGCACACACAAGCCTGTGTTCACCCTGGGCTGCTGCATCTGCTTCTT  1847

Query 1842  CATCATGGGTTTTCCAATGATCACTCAGGGTGGAATTTACATGTTTCAGCTTGTGGACACCTATGCTGCCTCCT  1915
            |||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1848  CATTATGGGCTTCCCTATGATCACACAGGGTGGAATCTACATGTTTCAGCTTGTGGACACCTACGCTGCCTCCT  1921

Query 1916  ATGCCCTTGTCATCATTGCCATTTTTGAGCTCGTGGGGATCTCTTATGTGTATGGCTTGCAAAGATTCTGTGAA  1989
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1922  ATGCCCTTGTCATCATTGCCATATTTGAGCTTGTTGGCATCTCCTATGTGTATGGCTTGCAGAGATTCTGTGAA  1995

Query 1990  GATATAGAGATGATGATTGGATTCCAGCCTAACATCTTCTGGAAAGTCTGCTGGGCATTTGTAACCCCAACCAT  2063
            ||.||.||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1996  GACATCGAGATGATGATTGGATTCAAGCCCAACATTTTCTGGAAAGTCTGCTGGGCATTCGTCACACCGACCAT  2069

Query 2064  TTTAACCTTTATCCTTTGCTTCAGCTTTTACCAGTGGGAACCCATGACCTATGGCTCTTACCGCTATCCTAACT  2137
            |||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2070  TTTGACTTTTATCCTTTGCTTCAGCTTCTACCAGTGGGAGCCCATGACCTATGGCTCTTACCGCTACCCTAACT  2143

Query 2138  GGTCCATGGTGCTCGGATGGCTAATGCTCGCCTGTTCCGTCATCTGGATCCCAATTATGTTTGTGATAAAAATG  2211
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 2144  GGTCCATGGTGCTTGGATGGCTGATGCTCGCCTGCTCCGTTATCTGGATCCCGATTATGTTCGTGATAAAAATG  2217

Query 2212  CATCTGGCCCCTGGAAGATTTATTGAGAGGCTGAAGTTGGTGTGCTCGCCACAGCCGGACTGGGGCCCATTCTT  2285
            .|||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2218  TATCTGGCTCCCGGGAGATTTATTGAGAGGCTGAAGTTGGTATGCTCGCCACAGCCCGACTGGGGCCCATTCTT  2291

Query 2286  AGCTCAACACCGCGGGGAGCGTTACAAGAACATGATCGACCCCTTGGGAACCTCTTCCTTGGGACTCAAACTGC  2359
            ||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||..||||||||||.||||
Sbjct 2292  AGCTCAGCACCGCGGGGAACGCTACAAGAATATGATCGACCCCTTGGGAACTTCGTCGCTGGGACTCAAGCTGC  2365

Query 2360  CAGTGAAGGATTTGGAACTGGGCACTCAGTGC  2391
            |.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366  CCGTGAAGGATTTGGAACTGGGCACTCAGTGC  2397