Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07366
• Subject: XM_006540545.3
• Aligned Length: 2496
• Identities: 2124
• Gaps: 108

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCCCAGGATTACAGACGTGTCTGGCGAGTGGAGAAACACCGGTTCCGTTTGCTACCCTGTCTATTTTGTGC  74

Query    1  -----------ATG-----------GATTGCAGTGCTCCCAAGGAAATGAATAAACTGCCAGCCAACAGCCCGG  52
                       |||           |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|..||
Sbjct   75  CTGGACCTGGAATGTGTGCATCTGTGATTGCAGTGCTCCCAAGGAAATGAATAAACAGCCAGCCAACATCTTGG  148

Query   53  AGGCGGCGGCGGCGCAGGGCCACCCGGATGGCCCATGCGCTCCCAGGACGAGCCCGGAGCAGGAGCTTCCCGCG  126
            |   |||.||||.||..|||||||.||||.|.||..|.||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.||.
Sbjct  149  A---GGCAGCGGTGCCAGGCCACCGGGATAGTCCTCGTGCACCTAGGACCAGCCCTGAACAGGATCTTCCTGCT  219

Query  127  GCTGCCGCCCCG---------CCGCCGCCACGTGTGCCCAGGTCCGCTTCCACCGGCGCCCAAACTTTCCAGTC  191
            |..|||.||.||         |.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  GAGGCCCCCACGGCCACTGTCCAGCCGCCACGTGTGCCCAGGTCGGCTTCCACCGGCGCCCAAACTTTCCAGTC  293

Query  192  AGCGGACGCGCGAGCCTGCGAGGCTGAGCGGCCAGGAGTGGGGTCTTGCAAACTCAGTAGCCCGCGGGCGCAGG  265
            .|||||.|||.|||||||||||||..|||.|.|.|||||.||||.|||.||.|||||.|||||.|||||.||.|
Sbjct  294  TGCGGATGCGAGAGCCTGCGAGGCCCAGCAGTCCGGAGTAGGGTTTTGTAATCTCAGCAGCCCCCGGGCACAAG  367

Query  266  CGGCCTCTGCAGCTCTGCGGGACTTGAGAGAGGCGCAAGGCGCGCAGGCCTCGCCCCCTCCCGGGAGCTCCGGG  339
            ||.||||.||.||.||.||||||||.||.||.|.|||..||||.||||||...||||||.|||||..|.|||||
Sbjct  368  CGACCTCCGCGGCCCTCCGGGACTTAAGCGAAGGGCACAGCGCACAGGCCAATCCCCCTTCCGGGCCCGCCGGG  441

Query  340  CCCGGCAACGCGTTGCACTGTAAGATCCCTTCTCTGCGAGGCCCGGAGGGGGATGCGAACGTGAGTGTGGGCAA  413
            .|.||||||||..|||||||.|||||.||..|||||||.||||||||||.|||.||||||||||||||||||||
Sbjct  442  GCTGGCAACGCTCTGCACTGCAAGATTCCAGCTCTGCGTGGCCCGGAGGAGGACGCGAACGTGAGTGTGGGCAA  515

Query  414  GGGCACCCTGGAGCGGAACAATACCCCTGTTGTGGGCTGGGTGAACATGAGCCAGAGCACCGTGGTGCTGGGCA  487
            ||||||.|||||||..|||||||||||.|..||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.||||.|
Sbjct  516  GGGCACGCTGGAGCACAACAATACCCCAGCCGTGGGCTGGGTGAATATGAGCCAGAGCACAGTAGTGTTGGGAA  589

Query  488  CGGATGGAATCACGTCCGTGCTCCCGGGCAGCGTGGCCACCGTTGCCACCCAGGAGGACGAGCAAGGGGATGAG  561
            |.|||||.|||.||||.||||||||||||||||||||||||..|.|||..|.||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  CCGATGGCATCGCGTCGGTGCTCCCGGGCAGCGTGGCCACCACTACCATACCGGAGGACGAGCAAGGGGATGAG  663

Query  562  AATAAGGCCCGAGGGAACTGGTCCAGCAAACTGGACTTCATCCTGTCCATGGTGGGGTACGCAGTGGGGCTGGG  635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  AATAAGGCCCGAGGGAACTGGTCCAGCAAACTGGACTTCATCCTGTCCATGGTGGGGTACGCAGTGGGGCTGGG  737

Query  636  CAATGTCTGGAGGTTTCCCTACCTGGCCTTCCAGAACGGGGGAGGTGCTTTCCTCATCCCTTACCTGATGATGC  709
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  738  CAATGTTTGGAGGTTTCCCTACCTGGCCTTCCAGAACGGGGGAGGCGCGTTCCTCATCCCTTACTTGATGATGC  811

Query  710  TGGCTCTGGCTGGATTACCCATCTTCTTCTTGGAGGTGTCGCTGGGCCAGTTTGCCAGCCAGGGACCAGTGTCT  783
            ||||.||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  812  TGGCACTGGCTGGCTTACCCATCTTCTTCCTAGAGGTGTCCCTGGGCCAGTTTGCCAGCCAGGGTCCTGTGTCT  885

Query  784  GTGTGGAAGGCCATCCCAGCTCTACAAGGCTGTGGCATCGCGATGCTGATCATCTCTGTCCTAATAGCCATATA  857
            |||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  886  GTGTGGAAGGCCATCCCAGCTCTGCAGGGTTGTGGCATTGCGATGCTCATCATCTCTGTCCTCATAGCCATATA  959

Query  858  CTACAATGTGATTATTTGCTATACACTTTTCTACCTGTTTGCCTCCTTTGTGTCTGTACTACCCTGGGGCTCCT  931
            ||||||.||.||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct  960  CTACAACGTCATCATCTGCTACACGCTCTTCTACCTGTTTGCCTCCTTCGTGTCTGTGCTGCCCTGGGGGTCCT  1033

Query  932  GCAACAACCCTTGGAATACACCAGAATGCAAAGATAAAACCAAACTTTTATTAGATTCCTGTGTTATCAGTGAC  1005
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1034  GCAACAACCCGTGGAACACACCAGAATGCAAAGATAAAACCAAACTTTTACTAGATTCCTGTGTTATCGGTGAC  1107

Query 1006  CATCCCAAAATACAGATCAAGAACTCGACTTTCTGCATGACCGCTTATCCCAACGTGACAATGGTTAATTTCAC  1079
            ||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||.|||||||||||||.|||||
Sbjct 1108  CATCCCAAGATACAGATCAAGAACTCTACTTTCTGCATGACTGCCTATCCGAACTTGACAATGGTTAACTTCAC  1181

Query 1080  CAGCCAGGCCAATAAGACATTTGTCAGTGGAAGTGAAGAGTACTTCAAGTACTTTGTGCTGAAGATTTCTGCAG  1153
            |||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  CAGCCAGACCAATAAGACATTTGTCAGCGGGAGTGAAGAGTACTTCAAGTATTTTGTGCTGAAGATTTCTGCAG  1255

Query 1154  GGATTGAATATCCTGGCGAGATCAGGTGGCCACTAGCTCTCTGCCTCTTCCTGGCTTGGGTCATTGTGTATGCA  1227
            |||||||||||||.||.||||||.|||||||..|.||..|||||||.|||.||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1256  GGATTGAATATCCGGGTGAGATCCGGTGGCCCTTGGCCTTCTGCCTTTTCTTGGCTTGGGTGATTGTGTACGCA  1329

Query 1228  TCGTTGGCTAAAGGAATCAAGACTTCAGGAAAAGTGGTGTACTTCACGGCCACGTTCCCGTATGTCGTACTCGT  1301
            ||..||||.||||||||.|||.|.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||
Sbjct 1330  TCACTGGCGAAAGGAATTAAGTCATCAGGAAAAGTAGTCTACTTCACAGCCACATTCCCTTATGTCGTCCTGGT  1403

Query 1302  GATCCTCCTCATCCGAGGAGTCACCCTGCCTGGAGCTGGAGCTGGGATCTGGTACTTCATCACACCCAAGTGGG  1375
            .||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1404  CATCCTCCTTATTCGAGGAGTCACCCTGCCTGGAGCTGGAGCCGGCATCTGGTACTTCATCACACCTAAGTGGG  1477

Query 1376  AGAAACTCACGGATGCCACGGTGTGGAAAGATGCTGCCACTCAGATTTTCTTCTCTTTATCTGCTGCATGGGGA  1449
            |.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||..|.|||||.||.||||||
Sbjct 1478  AAAAACTCACGGATGCCACGGTATGGAAGGATGCGGCCACTCAGATTTTCTTCTCCCTGTCTGCGGCCTGGGGA  1551

Query 1450  GGCCTGATCACTCTCTCTTCTTACAACAAATTCCACAACAACTGCTACAGGGACACTCTAATTGTCACCTGCAC  1523
            ||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||.||||||||
Sbjct 1552  GGGCTCATCACTCTTTCTTCTTACAACAAATTCCACAACAACTGCTACAGGGATACGTTAATTGTAACCTGCAC  1625

Query 1524  CAACAGTGCCACAAGCATCTTTGCCGGCTTCGTCATCTTCTCCGTTATCGGCTTCATGGCCAATGAACGCAAAG  1597
            .|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1626  TAACAGTGCCACTAGCATCTTTGCTGGGTTTGTCATCTTCTCTGTCATCGGCTTCATGGCCAACGAGCGCAAAG  1699

Query 1598  TCAACATTGAGAATGTGGCAGACCAAGGGCCAGGCATTGCATTTGTGGTTTACCCGGAAGCCTTAACCAGGCTG  1671
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1700  TCAACATTGAGAATGTGGCCGACCAAGGGCCTGGCATTGCATTTGTGGTTTACCCTGAGGCCTTAACTAGGCTG  1773

Query 1672  CCTCTCTCTCCGTTCTGGGCCATCATCTTTTTCCTGATGCTCCTCACTCTTGGACTTGACACTATGTTTGCCAC  1745
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1774  CCTCTCTCTCCATTCTGGGCCATCATCTTTTTTCTGATGCTTCTCACGCTTGGACTCGACACCATGTTTGCCAC  1847

Query 1746  CATCGAGACCATAGTGACCTCCATCTCAGACGAGTTTCCCAAGTACCTACGCACACACAAGCCAGTGTTTACTC  1819
            |||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1848  CATTGAGACCATCGTGACCTCCATCTCGGATGAGTTTCCCAAGTACCTGCGCACACACAAGCCTGTGTTCACCC  1921

Query 1820  TGGGCTGCTGCATTTGTTTCTTCATCATGGGTTTTCCAATGATCACTCAGGGTGGAATTTACATGTTTCAGCTT  1893
            |||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1922  TGGGCTGCTGCATCTGCTTCTTCATTATGGGCTTCCCTATGATCACACAGGGTGGAATCTACATGTTTCAGCTT  1995

Query 1894  GTGGACACCTATGCTGCCTCCTATGCCCTTGTCATCATTGCCATTTTTGAGCTCGTGGGGATCTCTTATGTGTA  1967
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1996  GTGGACACCTACGCTGCCTCCTATGCCCTTGTCATCATTGCCATATTTGAGCTTGTTGGCATCTCCTATGTGTA  2069

Query 1968  TGGCTTGCAAAGATTCTGTGAAGATATAGAGATGATGATTGGATTCCAGCCTAACATCTTCTGGAAAGTCTGCT  2041
            |||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 2070  TGGCTTGCAGAGATTCTGTGAAGACATCGAGATGATGATTGGATTCAAGCCCAACATTTTCTGGAAAGTCTGCT  2143

Query 2042  GGGCATTTGTAACCCCAACCATTTTAACCTTTATCCTTTGCTTCAGCTTTTACCAGTGGGAACCCATGACCTAT  2115
            |||||||.||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2144  GGGCATTCGTCACACCGACCATTTTGACTTTTATCCTTTGCTTCAGCTTCTACCAGTGGGAGCCCATGACCTAT  2217

Query 2116  GGCTCTTACCGCTATCCTAACTGGTCCATGGTGCTCGGATGGCTAATGCTCGCCTGTTCCGTCATCTGGATCCC  2189
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2218  GGCTCTTACCGCTACCCTAACTGGTCCATGGTGCTTGGATGGCTGATGCTCGCCTGCTCCGTTATCTGGATCCC  2291

Query 2190  AATTATGTTTGTGATAAAAATGCATCTGGCCCCTGGAAGATTTATTGAGAGGCTGAAGTTGGTGTGCTCGCCAC  2263
            .||||||||.||||||||||||.|||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2292  GATTATGTTCGTGATAAAAATGTATCTGGCTCCCGGGAGATTTATTGAGAGGCTGAAGTTGGTATGCTCGCCAC  2365

Query 2264  AGCCGGACTGGGGCCCATTCTTAGCTCAACACCGCGGGGAGCGTTACAAGAACATGATCGACCCCTTGGGAACC  2337
            ||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 2366  AGCCCGACTGGGGCCCATTCTTAGCTCAGCACCGCGGGGAACGCTACAAGAATATGATCGACCCCTTGGGAACT  2439

Query 2338  TCTTCCTTGGGACTCAAACTGCCAGTGAAGGATTTGGAACTGGGCACTCAGTGC  2391
            ||.||..||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440  TCGTCGCTGGGACTCAAGCTGCCCGTGAAGGATTTGGAACTGGGCACTCAGTGC  2493