Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07366
- Subject:
- XM_006540547.1
- Aligned Length:
- 2400
- Identities:
- 2100
- Gaps:
- 36
Alignment
Query 1 ATGGATTGCAGTGCTCCCAAGGAAATGAATAAACTGCCAGCCAACAGCCCGGAGGCGGCGGCGGCGCAGGGCCA 74
||||||||||.|||||||||||.|..||| |||.||||.||..|||||
Sbjct 1 ------------------------ATGAATAAACAGCCAGCCAACATCTTGGA---GGCAGCGGTGCCAGGCCA 47
Query 75 CCCGGATGGCCCATGCGCTCCCAGGACGAGCCCGGAGCAGGAGCTTCCCGCGGCTGCCGCCCCG---------C 139
||.||||.|.||..|.||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.||.|..|||.||.|| |
Sbjct 48 CCGGGATAGTCCTCGTGCACCTAGGACCAGCCCTGAACAGGATCTTCCTGCTGAGGCCCCCACGGCCACTGTCC 121
Query 140 CGCCGCCACGTGTGCCCAGGTCCGCTTCCACCGGCGCCCAAACTTTCCAGTCAGCGGACGCGCGAGCCTGCGAG 213
.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||
Sbjct 122 AGCCGCCACGTGTGCCCAGGTCGGCTTCCACCGGCGCCCAAACTTTCCAGTCTGCGGATGCGAGAGCCTGCGAG 195
Query 214 GCTGAGCGGCCAGGAGTGGGGTCTTGCAAACTCAGTAGCCCGCGGGCGCAGGCGGCCTCTGCAGCTCTGCGGGA 287
||..|||.|.|.|||||.||||.|||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||.||||.||.||.||.|||||
Sbjct 196 GCCCAGCAGTCCGGAGTAGGGTTTTGTAATCTCAGCAGCCCCCGGGCACAAGCGACCTCCGCGGCCCTCCGGGA 269
Query 288 CTTGAGAGAGGCGCAAGGCGCGCAGGCCTCGCCCCCTCCCGGGAGCTCCGGGCCCGGCAACGCGTTGCACTGTA 361
|||.||.||.|.|||..||||.||||||...||||||.|||||..|.|||||.|.||||||||..|||||||.|
Sbjct 270 CTTAAGCGAAGGGCACAGCGCACAGGCCAATCCCCCTTCCGGGCCCGCCGGGGCTGGCAACGCTCTGCACTGCA 343
Query 362 AGATCCCTTCTCTGCGAGGCCCGGAGGGGGATGCGAACGTGAGTGTGGGCAAGGGCACCCTGGAGCGGAACAAT 435
||||.||..|||||||.||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||||||
Sbjct 344 AGATTCCAGCTCTGCGTGGCCCGGAGGAGGACGCGAACGTGAGTGTGGGCAAGGGCACGCTGGAGCACAACAAT 417
Query 436 ACCCCTGTTGTGGGCTGGGTGAACATGAGCCAGAGCACCGTGGTGCTGGGCACGGATGGAATCACGTCCGTGCT 509
|||||.|..||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.||||.||.|||||.|||.||||.|||||
Sbjct 418 ACCCCAGCCGTGGGCTGGGTGAATATGAGCCAGAGCACAGTAGTGTTGGGAACCGATGGCATCGCGTCGGTGCT 491
Query 510 CCCGGGCAGCGTGGCCACCGTTGCCACCCAGGAGGACGAGCAAGGGGATGAGAATAAGGCCCGAGGGAACTGGT 583
|||||||||||||||||||..|.|||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 492 CCCGGGCAGCGTGGCCACCACTACCATACCGGAGGACGAGCAAGGGGATGAGAATAAGGCCCGAGGGAACTGGT 565
Query 584 CCAGCAAACTGGACTTCATCCTGTCCATGGTGGGGTACGCAGTGGGGCTGGGCAATGTCTGGAGGTTTCCCTAC 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 566 CCAGCAAACTGGACTTCATCCTGTCCATGGTGGGGTACGCAGTGGGGCTGGGCAATGTTTGGAGGTTTCCCTAC 639
Query 658 CTGGCCTTCCAGAACGGGGGAGGTGCTTTCCTCATCCCTTACCTGATGATGCTGGCTCTGGCTGGATTACCCAT 731
|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 640 CTGGCCTTCCAGAACGGGGGAGGCGCGTTCCTCATCCCTTACTTGATGATGCTGGCACTGGCTGGCTTACCCAT 713
Query 732 CTTCTTCTTGGAGGTGTCGCTGGGCCAGTTTGCCAGCCAGGGACCAGTGTCTGTGTGGAAGGCCATCCCAGCTC 805
|||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 714 CTTCTTCCTAGAGGTGTCCCTGGGCCAGTTTGCCAGCCAGGGTCCTGTGTCTGTGTGGAAGGCCATCCCAGCTC 787
Query 806 TACAAGGCTGTGGCATCGCGATGCTGATCATCTCTGTCCTAATAGCCATATACTACAATGTGATTATTTGCTAT 879
|.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.
Sbjct 788 TGCAGGGTTGTGGCATTGCGATGCTCATCATCTCTGTCCTCATAGCCATATACTACAACGTCATCATCTGCTAC 861
Query 880 ACACTTTTCTACCTGTTTGCCTCCTTTGTGTCTGTACTACCCTGGGGCTCCTGCAACAACCCTTGGAATACACC 953
||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 862 ACGCTCTTCTACCTGTTTGCCTCCTTCGTGTCTGTGCTGCCCTGGGGGTCCTGCAACAACCCGTGGAACACACC 935
Query 954 AGAATGCAAAGATAAAACCAAACTTTTATTAGATTCCTGTGTTATCAGTGACCATCCCAAAATACAGATCAAGA 1027
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 936 AGAATGCAAAGATAAAACCAAACTTTTACTAGATTCCTGTGTTATCGGTGACCATCCCAAGATACAGATCAAGA 1009
Query 1028 ACTCGACTTTCTGCATGACCGCTTATCCCAACGTGACAATGGTTAATTTCACCAGCCAGGCCAATAAGACATTT 1101
||||.||||||||||||||.||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1010 ACTCTACTTTCTGCATGACTGCCTATCCGAACTTGACAATGGTTAACTTCACCAGCCAGACCAATAAGACATTT 1083
Query 1102 GTCAGTGGAAGTGAAGAGTACTTCAAGTACTTTGTGCTGAAGATTTCTGCAGGGATTGAATATCCTGGCGAGAT 1175
|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1084 GTCAGCGGGAGTGAAGAGTACTTCAAGTATTTTGTGCTGAAGATTTCTGCAGGGATTGAATATCCGGGTGAGAT 1157
Query 1176 CAGGTGGCCACTAGCTCTCTGCCTCTTCCTGGCTTGGGTCATTGTGTATGCATCGTTGGCTAAAGGAATCAAGA 1249
|.|||||||..|.||..|||||||.|||.||||||||||.||||||||.|||||..||||.||||||||.|||.
Sbjct 1158 CCGGTGGCCCTTGGCCTTCTGCCTTTTCTTGGCTTGGGTGATTGTGTACGCATCACTGGCGAAAGGAATTAAGT 1231
Query 1250 CTTCAGGAAAAGTGGTGTACTTCACGGCCACGTTCCCGTATGTCGTACTCGTGATCCTCCTCATCCGAGGAGTC 1323
|.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1232 CATCAGGAAAAGTAGTCTACTTCACAGCCACATTCCCTTATGTCGTCCTGGTCATCCTCCTTATTCGAGGAGTC 1305
Query 1324 ACCCTGCCTGGAGCTGGAGCTGGGATCTGGTACTTCATCACACCCAAGTGGGAGAAACTCACGGATGCCACGGT 1397
||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1306 ACCCTGCCTGGAGCTGGAGCCGGCATCTGGTACTTCATCACACCTAAGTGGGAAAAACTCACGGATGCCACGGT 1379
Query 1398 GTGGAAAGATGCTGCCACTCAGATTTTCTTCTCTTTATCTGCTGCATGGGGAGGCCTGATCACTCTCTCTTCTT 1471
.|||||.|||||.||||||||||||||||||||..|.|||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1380 ATGGAAGGATGCGGCCACTCAGATTTTCTTCTCCCTGTCTGCGGCCTGGGGAGGGCTCATCACTCTTTCTTCTT 1453
Query 1472 ACAACAAATTCCACAACAACTGCTACAGGGACACTCTAATTGTCACCTGCACCAACAGTGCCACAAGCATCTTT 1545
|||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1454 ACAACAAATTCCACAACAACTGCTACAGGGATACGTTAATTGTAACCTGCACTAACAGTGCCACTAGCATCTTT 1527
Query 1546 GCCGGCTTCGTCATCTTCTCCGTTATCGGCTTCATGGCCAATGAACGCAAAGTCAACATTGAGAATGTGGCAGA 1619
||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1528 GCTGGGTTTGTCATCTTCTCTGTCATCGGCTTCATGGCCAACGAGCGCAAAGTCAACATTGAGAATGTGGCCGA 1601
Query 1620 CCAAGGGCCAGGCATTGCATTTGTGGTTTACCCGGAAGCCTTAACCAGGCTGCCTCTCTCTCCGTTCTGGGCCA 1693
|||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1602 CCAAGGGCCTGGCATTGCATTTGTGGTTTACCCTGAGGCCTTAACTAGGCTGCCTCTCTCTCCATTCTGGGCCA 1675
Query 1694 TCATCTTTTTCCTGATGCTCCTCACTCTTGGACTTGACACTATGTTTGCCACCATCGAGACCATAGTGACCTCC 1767
||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1676 TCATCTTTTTTCTGATGCTTCTCACGCTTGGACTCGACACCATGTTTGCCACCATTGAGACCATCGTGACCTCC 1749
Query 1768 ATCTCAGACGAGTTTCCCAAGTACCTACGCACACACAAGCCAGTGTTTACTCTGGGCTGCTGCATTTGTTTCTT 1841
|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1750 ATCTCGGATGAGTTTCCCAAGTACCTGCGCACACACAAGCCTGTGTTCACCCTGGGCTGCTGCATCTGCTTCTT 1823
Query 1842 CATCATGGGTTTTCCAATGATCACTCAGGGTGGAATTTACATGTTTCAGCTTGTGGACACCTATGCTGCCTCCT 1915
|||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1824 CATTATGGGCTTCCCTATGATCACACAGGGTGGAATCTACATGTTTCAGCTTGTGGACACCTACGCTGCCTCCT 1897
Query 1916 ATGCCCTTGTCATCATTGCCATTTTTGAGCTCGTGGGGATCTCTTATGTGTATGGCTTGCAAAGATTCTGTGAA 1989
||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1898 ATGCCCTTGTCATCATTGCCATATTTGAGCTTGTTGGCATCTCCTATGTGTATGGCTTGCAGAGATTCTGTGAA 1971
Query 1990 GATATAGAGATGATGATTGGATTCCAGCCTAACATCTTCTGGAAAGTCTGCTGGGCATTTGTAACCCCAACCAT 2063
||.||.||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1972 GACATCGAGATGATGATTGGATTCAAGCCCAACATTTTCTGGAAAGTCTGCTGGGCATTCGTCACACCGACCAT 2045
Query 2064 TTTAACCTTTATCCTTTGCTTCAGCTTTTACCAGTGGGAACCCATGACCTATGGCTCTTACCGCTATCCTAACT 2137
|||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2046 TTTGACTTTTATCCTTTGCTTCAGCTTCTACCAGTGGGAGCCCATGACCTATGGCTCTTACCGCTACCCTAACT 2119
Query 2138 GGTCCATGGTGCTCGGATGGCTAATGCTCGCCTGTTCCGTCATCTGGATCCCAATTATGTTTGTGATAAAAATG 2211
|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 2120 GGTCCATGGTGCTTGGATGGCTGATGCTCGCCTGCTCCGTTATCTGGATCCCGATTATGTTCGTGATAAAAATG 2193
Query 2212 CATCTGGCCCCTGGAAGATTTATTGAGAGGCTGAAGTTGGTGTGCTCGCCACAGCCGGACTGGGGCCCATTCTT 2285
.|||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2194 TATCTGGCTCCCGGGAGATTTATTGAGAGGCTGAAGTTGGTATGCTCGCCACAGCCCGACTGGGGCCCATTCTT 2267
Query 2286 AGCTCAACACCGCGGGGAGCGTTACAAGAACATGATCGACCCCTTGGGAACCTCTTCCTTGGGACTCAAACTGC 2359
||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||..||||||||||.||||
Sbjct 2268 AGCTCAGCACCGCGGGGAACGCTACAAGAATATGATCGACCCCTTGGGAACTTCGTCGCTGGGACTCAAGCTGC 2341
Query 2360 CAGTGAAGGATTTGGAACTGGGCACTCAGTGC 2391
|.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2342 CCGTGAAGGATTTGGAACTGGGCACTCAGTGC 2373