Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07366
• Subject: XM_006540548.2
• Aligned Length: 2431
• Identities: 1762
• Gaps: 479

Alignment

Query    1  ATGGATTGCAGTGCTCCCAAGGAAATGAATAAACTGCCAGCCAACAGCCCGGAGGCGGCGGCGGCGCAGGGCCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCCGGATGGCCCATGCGCTCCCAGGACGAGCCCGGAGCAGGAGCTTCCCGCGGCTGCCGCCCCGCCGCCGCCAC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GTGTGCCCAGGTCCGCTTCCACCGGCGCCCAAACTTTCCAGTCAGCGGACGCGCGAGCCTGCGAGGCTGAGCGG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CCAGGAGTGGGGTCTTGCAAACTCAGTAGCCCGCGGGCGCAGGCGGCCTCTGCAGCTCTGCGGGACTTGAGAGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GGCGCAAGGCGCGCAGGCCTCGCCCCCTCCCGGGAGCTCCGGGCCCGGCAACGCGTTGCAC--TGTAAGATCCC  368
                                                                   .|||||  |.|||.|    
Sbjct    1  -------------------------------------------------------ATGCACCTTTTAAAA----  15

Query  369  TTCTCTGCGAGGCCCGGAGGGGGATGCGAACGTGAGTGTGGGCAAG----GGCACCCTGGAGCGGAACAATACC  438
            ||..|||                      ||       ||||||.|    |    ||||        |||    
Sbjct   16  TTAGCTG----------------------AC-------TGGGCAGGTTTTG----CCTG--------CAA----  44

Query  439  CCTGTTGTGGGCTGGGTGAACATGAGCCAGAGCACCGTGGTGC-TGGGCAC-GGATGGAATCACGTCCGTGCTC  510
               |||.|||                 |||||.|..|||..|| .||||.| ||.|||                
Sbjct   45  ---GTTTTGG-----------------CAGAGAAATGTGAGGCAGGGGCTCTGGCTGG----------------  82

Query  511  CCGGGCAGCGT---------------GGCCAC-CGTT----------GCCACCCA------GGAGGACGAGCAA  552
             |.||.|||.|               .||||| ||||          |  ||..|      |||||||||||||
Sbjct   83  -CTGGAAGCATTACAATTCTTATTTCTGCCACACGTTTTGAAGAAAGG--ACTGAAGAAGGGGAGGACGAGCAA  153

Query  553  GGGGATGAGAATAAGGCCCGAGGGAACTGGTCCAGCAAACTGGACTTCATCCTGTCCATGGTGGGGTACGCAGT  626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  154  GGGGATGAGAATAAGGCCCGAGGGAACTGGTCCAGCAAACTGGACTTCATCCTGTCCATGGTGGGGTACGCAGT  227

Query  627  GGGGCTGGGCAATGTCTGGAGGTTTCCCTACCTGGCCTTCCAGAACGGGGGAGGTGCTTTCCTCATCCCTTACC  700
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.
Sbjct  228  GGGGCTGGGCAATGTTTGGAGGTTTCCCTACCTGGCCTTCCAGAACGGGGGAGGCGCGTTCCTCATCCCTTACT  301

Query  701  TGATGATGCTGGCTCTGGCTGGATTACCCATCTTCTTCTTGGAGGTGTCGCTGGGCCAGTTTGCCAGCCAGGGA  774
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  302  TGATGATGCTGGCACTGGCTGGCTTACCCATCTTCTTCCTAGAGGTGTCCCTGGGCCAGTTTGCCAGCCAGGGT  375

Query  775  CCAGTGTCTGTGTGGAAGGCCATCCCAGCTCTACAAGGCTGTGGCATCGCGATGCTGATCATCTCTGTCCTAAT  848
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  376  CCTGTGTCTGTGTGGAAGGCCATCCCAGCTCTGCAGGGTTGTGGCATTGCGATGCTCATCATCTCTGTCCTCAT  449

Query  849  AGCCATATACTACAATGTGATTATTTGCTATACACTTTTCTACCTGTTTGCCTCCTTTGTGTCTGTACTACCCT  922
            |||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct  450  AGCCATATACTACAACGTCATCATCTGCTACACGCTCTTCTACCTGTTTGCCTCCTTCGTGTCTGTGCTGCCCT  523

Query  923  GGGGCTCCTGCAACAACCCTTGGAATACACCAGAATGCAAAGATAAAACCAAACTTTTATTAGATTCCTGTGTT  996
            ||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  524  GGGGGTCCTGCAACAACCCGTGGAACACACCAGAATGCAAAGATAAAACCAAACTTTTACTAGATTCCTGTGTT  597

Query  997  ATCAGTGACCATCCCAAAATACAGATCAAGAACTCGACTTTCTGCATGACCGCTTATCCCAACGTGACAATGGT  1070
            |||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||.||||||||||
Sbjct  598  ATCGGTGACCATCCCAAGATACAGATCAAGAACTCTACTTTCTGCATGACTGCCTATCCGAACTTGACAATGGT  671

Query 1071  TAATTTCACCAGCCAGGCCAATAAGACATTTGTCAGTGGAAGTGAAGAGTACTTCAAGTACTTTGTGCTGAAGA  1144
            |||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  672  TAACTTCACCAGCCAGACCAATAAGACATTTGTCAGCGGGAGTGAAGAGTACTTCAAGTATTTTGTGCTGAAGA  745

Query 1145  TTTCTGCAGGGATTGAATATCCTGGCGAGATCAGGTGGCCACTAGCTCTCTGCCTCTTCCTGGCTTGGGTCATT  1218
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||||||..|.||..|||||||.|||.||||||||||.|||
Sbjct  746  TTTCTGCAGGGATTGAATATCCGGGTGAGATCCGGTGGCCCTTGGCCTTCTGCCTTTTCTTGGCTTGGGTGATT  819

Query 1219  GTGTATGCATCGTTGGCTAAAGGAATCAAGACTTCAGGAAAAGTGGTGTACTTCACGGCCACGTTCCCGTATGT  1292
            |||||.|||||..||||.||||||||.|||.|.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  820  GTGTACGCATCACTGGCGAAAGGAATTAAGTCATCAGGAAAAGTAGTCTACTTCACAGCCACATTCCCTTATGT  893

Query 1293  CGTACTCGTGATCCTCCTCATCCGAGGAGTCACCCTGCCTGGAGCTGGAGCTGGGATCTGGTACTTCATCACAC  1366
            |||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  894  CGTCCTGGTCATCCTCCTTATTCGAGGAGTCACCCTGCCTGGAGCTGGAGCCGGCATCTGGTACTTCATCACAC  967

Query 1367  CCAAGTGGGAGAAACTCACGGATGCCACGGTGTGGAAAGATGCTGCCACTCAGATTTTCTTCTCTTTATCTGCT  1440
            |.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||..|.|||||.
Sbjct  968  CTAAGTGGGAAAAACTCACGGATGCCACGGTATGGAAGGATGCGGCCACTCAGATTTTCTTCTCCCTGTCTGCG  1041

Query 1441  GCATGGGGAGGCCTGATCACTCTCTCTTCTTACAACAAATTCCACAACAACTGCTACAGGGACACTCTAATTGT  1514
            ||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||
Sbjct 1042  GCCTGGGGAGGGCTCATCACTCTTTCTTCTTACAACAAATTCCACAACAACTGCTACAGGGATACGTTAATTGT  1115

Query 1515  CACCTGCACCAACAGTGCCACAAGCATCTTTGCCGGCTTCGTCATCTTCTCCGTTATCGGCTTCATGGCCAATG  1588
            .||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1116  AACCTGCACTAACAGTGCCACTAGCATCTTTGCTGGGTTTGTCATCTTCTCTGTCATCGGCTTCATGGCCAACG  1189

Query 1589  AACGCAAAGTCAACATTGAGAATGTGGCAGACCAAGGGCCAGGCATTGCATTTGTGGTTTACCCGGAAGCCTTA  1662
            |.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1190  AGCGCAAAGTCAACATTGAGAATGTGGCCGACCAAGGGCCTGGCATTGCATTTGTGGTTTACCCTGAGGCCTTA  1263

Query 1663  ACCAGGCTGCCTCTCTCTCCGTTCTGGGCCATCATCTTTTTCCTGATGCTCCTCACTCTTGGACTTGACACTAT  1736
            ||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1264  ACTAGGCTGCCTCTCTCTCCATTCTGGGCCATCATCTTTTTTCTGATGCTTCTCACGCTTGGACTCGACACCAT  1337

Query 1737  GTTTGCCACCATCGAGACCATAGTGACCTCCATCTCAGACGAGTTTCCCAAGTACCTACGCACACACAAGCCAG  1810
            ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1338  GTTTGCCACCATTGAGACCATCGTGACCTCCATCTCGGATGAGTTTCCCAAGTACCTGCGCACACACAAGCCTG  1411

Query 1811  TGTTTACTCTGGGCTGCTGCATTTGTTTCTTCATCATGGGTTTTCCAATGATCACTCAGGGTGGAATTTACATG  1884
            ||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1412  TGTTCACCCTGGGCTGCTGCATCTGCTTCTTCATTATGGGCTTCCCTATGATCACACAGGGTGGAATCTACATG  1485

Query 1885  TTTCAGCTTGTGGACACCTATGCTGCCTCCTATGCCCTTGTCATCATTGCCATTTTTGAGCTCGTGGGGATCTC  1958
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1486  TTTCAGCTTGTGGACACCTACGCTGCCTCCTATGCCCTTGTCATCATTGCCATATTTGAGCTTGTTGGCATCTC  1559

Query 1959  TTATGTGTATGGCTTGCAAAGATTCTGTGAAGATATAGAGATGATGATTGGATTCCAGCCTAACATCTTCTGGA  2032
            .|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||
Sbjct 1560  CTATGTGTATGGCTTGCAGAGATTCTGTGAAGACATCGAGATGATGATTGGATTCAAGCCCAACATTTTCTGGA  1633

Query 2033  AAGTCTGCTGGGCATTTGTAACCCCAACCATTTTAACCTTTATCCTTTGCTTCAGCTTTTACCAGTGGGAACCC  2106
            ||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1634  AAGTCTGCTGGGCATTCGTCACACCGACCATTTTGACTTTTATCCTTTGCTTCAGCTTCTACCAGTGGGAGCCC  1707

Query 2107  ATGACCTATGGCTCTTACCGCTATCCTAACTGGTCCATGGTGCTCGGATGGCTAATGCTCGCCTGTTCCGTCAT  2180
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1708  ATGACCTATGGCTCTTACCGCTACCCTAACTGGTCCATGGTGCTTGGATGGCTGATGCTCGCCTGCTCCGTTAT  1781

Query 2181  CTGGATCCCAATTATGTTTGTGATAAAAATGCATCTGGCCCCTGGAAGATTTATTGAGAGGCTGAAGTTGGTGT  2254
            |||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1782  CTGGATCCCGATTATGTTCGTGATAAAAATGTATCTGGCTCCCGGGAGATTTATTGAGAGGCTGAAGTTGGTAT  1855

Query 2255  GCTCGCCACAGCCGGACTGGGGCCCATTCTTAGCTCAACACCGCGGGGAGCGTTACAAGAACATGATCGACCCC  2328
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1856  GCTCGCCACAGCCCGACTGGGGCCCATTCTTAGCTCAGCACCGCGGGGAACGCTACAAGAATATGATCGACCCC  1929

Query 2329  TTGGGAACCTCTTCCTTGGGACTCAAACTGCCAGTGAAGGATTTGGAACTGGGCACTCAGTGC  2391
            ||||||||.||.||..||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1930  TTGGGAACTTCGTCGCTGGGACTCAAGCTGCCCGTGAAGGATTTGGAACTGGGCACTCAGTGC  1992