Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07366
- Subject:
- XM_006540549.3
- Aligned Length:
- 2391
- Identities:
- 1524
- Gaps:
- 702
Alignment
Query 1 ATGGATTGCAGTGCTCCCAAGGAAATGAATAAACTGCCAGCCAACAGCCCGGAGGCGGCGGCGGCGCAGGGCCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCCGGATGGCCCATGCGCTCCCAGGACGAGCCCGGAGCAGGAGCTTCCCGCGGCTGCCGCCCCGCCGCCGCCAC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GTGTGCCCAGGTCCGCTTCCACCGGCGCCCAAACTTTCCAGTCAGCGGACGCGCGAGCCTGCGAGGCTGAGCGG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CCAGGAGTGGGGTCTTGCAAACTCAGTAGCCCGCGGGCGCAGGCGGCCTCTGCAGCTCTGCGGGACTTGAGAGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GGCGCAAGGCGCGCAGGCCTCGCCCCCTCCCGGGAGCTCCGGGCCCGGCAACGCGTTGCACTGTAAGATCCCTT 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CTCTGCGAGGCCCGGAGGGGGATGCGAACGTGAGTGTGGGCAAGGGCACCCTGGAGCGGAACAATACCCCTGTT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GTGGGCTGGGTGAACATGAGCCAGAGCACCGTGGTGCTGGGCACGGATGGAATCACGTCCGTGCTCCCGGGCAG 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 CGTGGCCACCGTTGCCACCCAGGAGGACGAGCAAGGGGATGAGAATAAGGCCCGAGGGAACTGGTCCAGCAAAC 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TGGACTTCATCCTGTCCATGGTGGGGTACGCAGTGGGGCTGGGCAATGTCTGGAGGTTTCCCTACCTGGCCTTC 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 CAGAACGGGGGAGGTGCTTTCCTCATCCCTTACCTGATGATGCTGGCTCTGGCTGGATTACCCATCTTCTTCTT 740
|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|
Sbjct 1 ------------------------------------ATGATGCTGGCACTGGCTGGCTTACCCATCTTCTTCCT 38
Query 741 GGAGGTGTCGCTGGGCCAGTTTGCCAGCCAGGGACCAGTGTCTGTGTGGAAGGCCATCCCAGCTCTACAAGGCT 814
.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 39 AGAGGTGTCCCTGGGCCAGTTTGCCAGCCAGGGTCCTGTGTCTGTGTGGAAGGCCATCCCAGCTCTGCAGGGTT 112
Query 815 GTGGCATCGCGATGCTGATCATCTCTGTCCTAATAGCCATATACTACAATGTGATTATTTGCTATACACTTTTC 888
|||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.||.|||
Sbjct 113 GTGGCATTGCGATGCTCATCATCTCTGTCCTCATAGCCATATACTACAACGTCATCATCTGCTACACGCTCTTC 186
Query 889 TACCTGTTTGCCTCCTTTGTGTCTGTACTACCCTGGGGCTCCTGCAACAACCCTTGGAATACACCAGAATGCAA 962
|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 187 TACCTGTTTGCCTCCTTCGTGTCTGTGCTGCCCTGGGGGTCCTGCAACAACCCGTGGAACACACCAGAATGCAA 260
Query 963 AGATAAAACCAAACTTTTATTAGATTCCTGTGTTATCAGTGACCATCCCAAAATACAGATCAAGAACTCGACTT 1036
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 261 AGATAAAACCAAACTTTTACTAGATTCCTGTGTTATCGGTGACCATCCCAAGATACAGATCAAGAACTCTACTT 334
Query 1037 TCTGCATGACCGCTTATCCCAACGTGACAATGGTTAATTTCACCAGCCAGGCCAATAAGACATTTGTCAGTGGA 1110
||||||||||.||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.
Sbjct 335 TCTGCATGACTGCCTATCCGAACTTGACAATGGTTAACTTCACCAGCCAGACCAATAAGACATTTGTCAGCGGG 408
Query 1111 AGTGAAGAGTACTTCAAGTACTTTGTGCTGAAGATTTCTGCAGGGATTGAATATCCTGGCGAGATCAGGTGGCC 1184
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||||||
Sbjct 409 AGTGAAGAGTACTTCAAGTATTTTGTGCTGAAGATTTCTGCAGGGATTGAATATCCGGGTGAGATCCGGTGGCC 482
Query 1185 ACTAGCTCTCTGCCTCTTCCTGGCTTGGGTCATTGTGTATGCATCGTTGGCTAAAGGAATCAAGACTTCAGGAA 1258
..|.||..|||||||.|||.||||||||||.||||||||.|||||..||||.||||||||.|||.|.|||||||
Sbjct 483 CTTGGCCTTCTGCCTTTTCTTGGCTTGGGTGATTGTGTACGCATCACTGGCGAAAGGAATTAAGTCATCAGGAA 556
Query 1259 AAGTGGTGTACTTCACGGCCACGTTCCCGTATGTCGTACTCGTGATCCTCCTCATCCGAGGAGTCACCCTGCCT 1332
||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 557 AAGTAGTCTACTTCACAGCCACATTCCCTTATGTCGTCCTGGTCATCCTCCTTATTCGAGGAGTCACCCTGCCT 630
Query 1333 GGAGCTGGAGCTGGGATCTGGTACTTCATCACACCCAAGTGGGAGAAACTCACGGATGCCACGGTGTGGAAAGA 1406
|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 631 GGAGCTGGAGCCGGCATCTGGTACTTCATCACACCTAAGTGGGAAAAACTCACGGATGCCACGGTATGGAAGGA 704
Query 1407 TGCTGCCACTCAGATTTTCTTCTCTTTATCTGCTGCATGGGGAGGCCTGATCACTCTCTCTTCTTACAACAAAT 1480
|||.||||||||||||||||||||..|.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 705 TGCGGCCACTCAGATTTTCTTCTCCCTGTCTGCGGCCTGGGGAGGGCTCATCACTCTTTCTTCTTACAACAAAT 778
Query 1481 TCCACAACAACTGCTACAGGGACACTCTAATTGTCACCTGCACCAACAGTGCCACAAGCATCTTTGCCGGCTTC 1554
||||||||||||||||||||||.||..|||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 779 TCCACAACAACTGCTACAGGGATACGTTAATTGTAACCTGCACTAACAGTGCCACTAGCATCTTTGCTGGGTTT 852
Query 1555 GTCATCTTCTCCGTTATCGGCTTCATGGCCAATGAACGCAAAGTCAACATTGAGAATGTGGCAGACCAAGGGCC 1628
|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 853 GTCATCTTCTCTGTCATCGGCTTCATGGCCAACGAGCGCAAAGTCAACATTGAGAATGTGGCCGACCAAGGGCC 926
Query 1629 AGGCATTGCATTTGTGGTTTACCCGGAAGCCTTAACCAGGCTGCCTCTCTCTCCGTTCTGGGCCATCATCTTTT 1702
.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 927 TGGCATTGCATTTGTGGTTTACCCTGAGGCCTTAACTAGGCTGCCTCTCTCTCCATTCTGGGCCATCATCTTTT 1000
Query 1703 TCCTGATGCTCCTCACTCTTGGACTTGACACTATGTTTGCCACCATCGAGACCATAGTGACCTCCATCTCAGAC 1776
|.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1001 TTCTGATGCTTCTCACGCTTGGACTCGACACCATGTTTGCCACCATTGAGACCATCGTGACCTCCATCTCGGAT 1074
Query 1777 GAGTTTCCCAAGTACCTACGCACACACAAGCCAGTGTTTACTCTGGGCTGCTGCATTTGTTTCTTCATCATGGG 1850
|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 1075 GAGTTTCCCAAGTACCTGCGCACACACAAGCCTGTGTTCACCCTGGGCTGCTGCATCTGCTTCTTCATTATGGG 1148
Query 1851 TTTTCCAATGATCACTCAGGGTGGAATTTACATGTTTCAGCTTGTGGACACCTATGCTGCCTCCTATGCCCTTG 1924
.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1149 CTTCCCTATGATCACACAGGGTGGAATCTACATGTTTCAGCTTGTGGACACCTACGCTGCCTCCTATGCCCTTG 1222
Query 1925 TCATCATTGCCATTTTTGAGCTCGTGGGGATCTCTTATGTGTATGGCTTGCAAAGATTCTGTGAAGATATAGAG 1998
|||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1223 TCATCATTGCCATATTTGAGCTTGTTGGCATCTCCTATGTGTATGGCTTGCAGAGATTCTGTGAAGACATCGAG 1296
Query 1999 ATGATGATTGGATTCCAGCCTAACATCTTCTGGAAAGTCTGCTGGGCATTTGTAACCCCAACCATTTTAACCTT 2072
|||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||
Sbjct 1297 ATGATGATTGGATTCAAGCCCAACATTTTCTGGAAAGTCTGCTGGGCATTCGTCACACCGACCATTTTGACTTT 1370
Query 2073 TATCCTTTGCTTCAGCTTTTACCAGTGGGAACCCATGACCTATGGCTCTTACCGCTATCCTAACTGGTCCATGG 2146
||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1371 TATCCTTTGCTTCAGCTTCTACCAGTGGGAGCCCATGACCTATGGCTCTTACCGCTACCCTAACTGGTCCATGG 1444
Query 2147 TGCTCGGATGGCTAATGCTCGCCTGTTCCGTCATCTGGATCCCAATTATGTTTGTGATAAAAATGCATCTGGCC 2220
||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||.
Sbjct 1445 TGCTTGGATGGCTGATGCTCGCCTGCTCCGTTATCTGGATCCCGATTATGTTCGTGATAAAAATGTATCTGGCT 1518
Query 2221 CCTGGAAGATTTATTGAGAGGCTGAAGTTGGTGTGCTCGCCACAGCCGGACTGGGGCCCATTCTTAGCTCAACA 2294
||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1519 CCCGGGAGATTTATTGAGAGGCTGAAGTTGGTATGCTCGCCACAGCCCGACTGGGGCCCATTCTTAGCTCAGCA 1592
Query 2295 CCGCGGGGAGCGTTACAAGAACATGATCGACCCCTTGGGAACCTCTTCCTTGGGACTCAAACTGCCAGTGAAGG 2368
|||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||..||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1593 CCGCGGGGAACGCTACAAGAATATGATCGACCCCTTGGGAACTTCGTCGCTGGGACTCAAGCTGCCCGTGAAGG 1666
Query 2369 ATTTGGAACTGGGCACTCAGTGC 2391
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1667 ATTTGGAACTGGGCACTCAGTGC 1689
