Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07384
• Subject: XM_006504318.1
• Aligned Length: 2589
• Identities: 2125
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGACTGGGAGAGCCCGAGCCAGAGCCAGAGGAAGGGCCCGCGGTCAGGAGACAGCGCAGCTGGT--GGGCTCC  72
            ||||||||..||||||||||..|.|||.|.||.|||||.||.|||||||||||.|.|||||..||  |||||  
Sbjct    1  ATGACTGGCCGAGCCCGAGCTCGGGCCCGCGGCAGGGCACGAGGTCAGGAGACGGTGCAGCATGTTGGGGCT--  72

Query   73  ACTGCCAGTCAGCAACCTGGTTATATTCAGCCTAGGCCTCAGCCG-CCACCAGCAGAGGGGGAATTATTTGGCC  145
            .||||.||.|||||||||||.||.||.|..||.||.|||||.|.| ||.||| ||||||||||.||..||||||
Sbjct   73  GCTGCGAGCCAGCAACCTGGGTACATCCCACCGAGACCTCAACAGTCCCCCA-CAGAGGGGGACTTGGTTGGCC  145

Query  146  GTGGACGGCAGAGAGGAA---CAGCAGGAGGAACAGCCAAGTCACAAGGACTCCAGATATCTGCTGGATTTCAG  216
            |.|||||.|||||.||.|   .||..||||..|||.||||||||||||.|||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct  146  GAGGACGACAGAGGGGGATGGTAGTCGGAGCCACATCCAAGTCACAAGAACTGCAGATCTCAGCTGGGTTTCAG  219

Query  217  GAGTTATCGTTAGCAGAGAGAGGAGGTCGTCGTAGAGATTTTCATGATCTTGGTGTGAATACAAGGCAGAACCT  290
            |||.|.||..|.||||||||||||||.|||||..||||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct  220  GAGCTGTCACTGGCAGAGAGAGGAGGGCGTCGCCGAGACTTCCATGACCTTGGTGTGAACACCAGACAGAACCT  293

Query  291  AGACCATGTTAAAGAATCAAAAACAGGTTCTTCAGGCATTATAGTAAGGTTAAGCACTAACCATTTCCGGCTGA  364
            .||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||.|.|.|.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct  294  TGACCATGTCAAAGAGTCAAAGACAGGCTCCTCTGGCATCATTGTGAAGCTGAGCACCAACCACTTCCGGCTGA  367

Query  365  CATCCCGTCCCCAGTGGGCCTTATATCAGTATCACATTGACTATAACCCACTGATGGAAGCCAGAAGACTCCGT  438
            |.||.||.||.|||||||||.|.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||.||||.||.||.
Sbjct  368  CCTCGCGCCCACAGTGGGCCCTGTATCAGTACCACATCGACTACAATCCCCTGATGGAGGCCCGAAGGCTTCGC  441

Query  439  TCAGCTCTTCTTTTTCAACACGAAGATCTAATTGGAAAGTGTCATGCTTTTGATGGAACGATATTATTTTTACC  512
            ||.||.||.||.||.||.||.|||||.||.|||||||.||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  442  TCCGCACTGCTCTTCCAGCATGAAGACCTCATTGGAAGGTGTCATGCTTTCGATGGGACAATATTGTTTTTACC  515

Query  513  TAAAAGACTACAGCAAAAGGTTACTGAAGTTTTTAGTAAGACCCGGAATGGAGAGGATGTGAGGATAACGATCA  586
            |||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||.||||.||||||||.||..|.||||||||.||.||||
Sbjct  516  TAAGAGACTACAGCACAAGGTCACAGAAGTATTCAGTCAGACTCGGAATGGGGAACACGTGAGGATCACCATCA  589

Query  587  CTTTAACAAATGAACTTCCACCTACATCACCAACTTGTTTGCAGTTCTATAATATTATTTTCAGGAGGCTTTTG  660
            |..|.||.||.||.||.||.||.||.||.||.||.||..|||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||
Sbjct  590  CCCTGACCAACGAGCTGCCGCCCACCTCGCCCACCTGCCTGCAGTTCTATAACATCATCTTCAGGAGGCTCTTG  663

Query  661  AAAATCATGAATTTGCAACAAATTGGACGAAATTATTATAACCCAAATGACCCAATTGATATTCCAAGTCACAG  734
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||.||||||.|||||||||||||..|||||
Sbjct  664  AAAATCATGAATTTGCAACAAATTGGACGGAATTATTACAATCCAAGTGACCCGATTGATATTCCAAACCACAG  737

Query  735  GTTGGTGATTTGGCCTGGCTTCACTACTTCCATCCTTCAGTATGAAAACAGCATCATGCTCTGCACTGACGTTA  808
            |||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  738  GTTGGTGATCTGGCCCGGCTTCACCACCTCCATCCTTCAGTATGAGAACAACATCATGCTCTGCACAGACGTCA  811

Query  809  GCCATAAAGTCCTTCGAAGTGAGACTGTTTTGGATTTCATGTTCAACTTTTATCATCAGACAGAAGAACATAAA  882
            ||||.||.||.||.||.||.||||||||..|.||.|||||||||||..|.||.||.||||||||.||.||.||.
Sbjct  812  GCCACAAGGTGCTCCGCAGCGAGACTGTCCTAGACTTCATGTTCAATCTATACCAGCAGACAGAGGAGCACAAG  885

Query  883  TTTCAAGAACAAGTTTCCAAAGAACTAATAGGTTTAGTTGTTCTTACCAAGTATAACAATAAGACATACAGAGT  956
            ||.||.||.|||||.||.||.||.||.|||||..|..|.|||||.||||||||.||.||.|||||.|||.|.||
Sbjct  886  TTCCAGGAGCAAGTGTCGAAGGAGCTCATAGGCCTCATCGTTCTCACCAAGTACAATAACAAGACCTACCGGGT  959

Query  957  GGATGATATTGACTGGGACCAGAATCCCAAGAGCACCTTTAAGAAAGCCGACGGCTCTGAAGTCAGCTTCTTAG  1030
            ||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||.|.|
Sbjct  960  GGATGACATTGACTGGGACCAGAATCCAAAGAGCACCTTCAAGAAGGCGGATGGCTCGGAGGTCAGCTTCCTGG  1033

Query 1031  AATACTACAGGAAGCAATACAACCAAGAGATCACCGACTTGAAGCAGCCTGTCTTGGTCAGCCAGCCCAAGAGA  1104
            |.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||.||..||||.|||||.||||||.|.
Sbjct 1034  AGTACTACAGGAAGCAATACAACCAGGAGATCACGGACCTGAAGCAGCCGGTGCTGGTGAGCCAACCCAAGCGG  1107

Query 1105  AGGCGGGGCCCTGGGGGGACACTGCCAGGGCCTGCCATGCTCATTCCTGAGCTCTGCTATCTTACAGGTCTAAC  1178
            |||.|.|||||.||.||.||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 1108  AGGAGAGGCCCCGGCGGCACCCTGCCTGGCCCAGCTATGCTCATCCCTGAACTCTGCTATCTCACAGGCCTGAC  1181

Query 1179  TGATAAAATGCGTAATGATTTTAACGTGATGAAAGACTTAGCCGTTCATACAAGACTAACTCCAGAGCAAAGGC  1252
            ||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||.|.||.||.||.||..|.||.||.||.|||||..|||
Sbjct 1182  TGATAAAATGCGCAATGATTTCAATGTGATGAAGGACCTGGCAGTGCACACGCGGCTGACCCCTGAGCAGCGGC  1255

Query 1253  AGCGTGAAGTGGGACGACTCATTGATTACATTCATAAAAACGATAATGTTCAAAGGGAGCTTCGAGACTGGGGT  1326
            ||||.||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||..|.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1256  AGCGGGAGGTGGGCCGCCTCATCGACTACATCCACAAGGATGACAATGTGCAGAGAGAGCTTCGAGACTGGGGC  1329

Query 1327  TTGAGCTTTGATTCCAACTTACTGTCCTTCTCAGGAAGAATTTTGCAAACAGAAAAGATTCACCAAGGTGGAAA  1400
            .|||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||.|.||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1330  CTGAGCTTCGACTCAAACTTGCTGTCCTTCTCTGGAAGAATCTTACAATCTGAGAAGATCCACCAGGGCGGAAA  1403

Query 1401  AACATTTGATTACAATCCACAATTTGCAGATTGGTCCAAAGAAACAAGAGGTGCACCATTAATTAGTGTTAATC  1474
            .||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||..|.||.||.||.||.|
Sbjct 1404  GACGTTTGATTACAACCCACAATTTGCAGACTGGTCCAAAGAAACAAGAGGCGCGCCGCTGATCAGCGTGAAGC  1477

Query 1475  CACTAGATAACTGGCTGTTGATCTATACGCGAAGAAATTATGAAGCAGCCAATTCATTGATACAAAATCTATTT  1548
            ||.|.||||||||||||.||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.|||||||.||.||.||.
Sbjct 1478  CATTGGATAACTGGCTGCTGATCTATACCCGCAGGAATTATGAAGCAGCCAACTCACTGATACAGAACCTGTTC  1551

Query 1549  AAAGTTACACCAGCCATGGGCATGCAAATGAAAAAAGCAATAATGATTGAAGTGGATGACAGAACTGAAGCCTA  1622
            |||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1552  AAAGTGACTCCAGCCATGGGCATCCAGATGAAAAAGGCAATCATGATCGAGGTGGATGACAGAACAGAAGCTTA  1625

Query 1623  CTTAAGAGTCTTACAGCAAAAGGTCACAGCAGACACCCAGATAGTTGTCTGTCTGTTGTCAAGTAATCGGAAGG  1696
            ..|.||||.|||.|||||.|||||.||..|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1626  TCTGAGAGCCTTGCAGCAGAAGGTGACGTCAGACACTCAGATAGTTGTCTGTCTCTTGTCAAGTAATCGGAAGG  1699

Query 1697  ACAAATACGATGCTATTAAAAAATACCCGTGTACAGATTGCCCTACCCCAAGTCAGTGTGTGGTGGCCCGAACC  1770
            |||||||.|||||.||.||.||.|||..|||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1700  ACAAATATGATGCCATCAAGAAGTACTTGTGTACAGACTGCCCCACCCCAAGTCAGTGTGTGGTGGCCCGGACC  1773

Query 1771  TTAGGCAAACAGCAAACTGTCATGGCCATTGCTACAAAGATTGCCCTACAGATGAACTGCAAGATGGGAGGAGA  1844
            .|.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1774  CTGGGCAAGCAGCAAACAGTCATGGCCATTGCCACCAAGATCGCCCTGCAGATGAACTGCAAGATGGGAGGCGA  1847

Query 1845  GCTCTGGAGGGTGGACATCCCCCTGAAGCTCGTGATGATCGTTGGCATCGATTGTTACCATGACATGACAGCTG  1918
            |||||||.||||||||||.||||||||.||.|..||||||||.||||||||.|||||||||||||..|||||||
Sbjct 1848  GCTCTGGCGGGTGGACATGCCCCTGAAACTGGCAATGATCGTGGGCATCGACTGTTACCATGACACCACAGCTG  1921

Query 1919  GGCGGAGGTCAATCGCAGGATTTGTTGCCAGCATCAATGAAGGGATGACCCGCTGGTTCTCACGCTGCATATTT  1992
            ||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||
Sbjct 1922  GGCGGAGGTCCATCGCAGGATTCGTCGCCAGCATCAATGAAGGGATGACCCGCTGGTTCTCCCGCTGCGTCTTT  1995

Query 1993  CAGGATAGAGGACAGGAGCTGGTAGATGGGCTCAAAGTCTGCCTGCAAGCGGCTCTGAGGGCTTGGAATAGCTG  2066
            |||||..|.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||.|||||||.||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 1996  CAGGACCGCGGGCAGGAGCTGGTGGATGGTCTCAAGGTGTGCTTGCAAGCTGCTCTGAGGGCTTGGAGTGGCTG  2069

Query 2067  CAATGAGTACATGCCCAGCCGGATCATCGTGTACCGCGATGGCGTAGGAGACGGCCAGCTGAAAACACTGGTGA  2140
            ||||||.||||||||||||||..|||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct 2070  CAATGAATACATGCCCAGCCGTGTCATCGTGTACCGAGACGGTGTGGGGGACGGGCAGCTGAAGACCCTGGTCA  2143

Query 2141  ACTACGAAGTGCCACAGTTTTTGGATTGTCTAAAATCCATTGGTAGAGGTTACAACCCTAGACTAACGGTAATT  2214
            |.||.||.||.||||||||..|.|||||.||.||.||..|.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.
Sbjct 2144  ATTATGAGGTCCCACAGTTCCTAGATTGCCTCAAGTCAGTCGGGAGAGGTTACAACCCAAGACTGACTGTAATC  2217

Query 2215  GTGGTGAAGAAAAGAGTGAACACCAGATTTTTTGCTCAGTCTGGAGGAAGACTTCAGAATCCACTTCCTGGAAC  2288
            |||||||||||..|.||.||..||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 2218  GTGGTGAAGAAGCGTGTCAATGCCAGGTTTTTTGCTCAGTCTGGGGGAAGACTTCAGAACCCTCTTCCAGGGAC  2291

Query 2289  AGTTATTGATGTAGAGGTTACCAGACCAGAATGGTATGACTTTTTTATCGTGAGCCAGGCTGTGAGAAGTGGTA  2362
            |||.||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 2292  AGTCATCGATGTGGAAGTCACCAGACCAGAGTGGTATGACTTTTTCATCGTGAGCCAGGCAGTGAGAAGCGGGA  2365

Query 2363  GTGTTTCTCCCACACATTACAATGTCATCTATGACAACAGCGGCCTGAAGCCAGACCACATACAGCGCTTGACC  2436
            ||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||.|||.|||||||||||.||||||||.|||||..||||.
Sbjct 2366  GTGTGTCCCCAACACACTACAATGTCATCTATGACAGCAGTGGCCTGAAGCCCGACCACATCCAGCGGCTGACA  2439

Query 2437  TACAAGCTGTGCCACATCTATTACAACTGGCCAGGTGTCATTCGTGTTCCTGCTCCTTGCCAGTACGCCCACAA  2510
            ||||||||.||||||.|.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 2440  TACAAGCTCTGCCACGTGTACTATAATTGGCCTGGAGTCATCCGAGTCCCTGCACCTTGCCAGTATGCACACAA  2513

Query 2511  GCTGGCTTTTCTTGTTGGCCAGAGTATTCACAGAGAGCCAAATCTGTCACTGTCAAACCGCCTTTACTACCTC  2583
            ||||||.||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 2514  GCTGGCCTTCCTCGTGGGCCAGAGCATCCACAGAGAGCCAAACCTCTCCCTGTCCAACCGCCTCTACTACCTC  2586