Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07385
• Subject: XR_002956316.1
• Aligned Length: 2220
• Identities: 1825
• Gaps: 394

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------ATGGAG  6
                                                                                ||||||
Sbjct    1  AGTTTTCAAGCCGACTGTGTGGCAGCTGAGAGGAGTTTTGCACGTGGATCGCCGTTCGGGTGGGCGAGATGGAG  74

Query    7  ACAGCCCCCAAGCCGGGCAAGGATGTCCCGCCCAAGAAAGACAAACTTCAGACCAAGAGAAAGAAACCGCGGCG  80
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACAGCCCCCAAGCCGGGCAAGGATGTCCCGCCCAAGAAAGACAAACTTCAGACCAAGAGAAAGAAACCGCGGCG  148

Query   81  ATACTGGGAGGAAGAGACCGTTCCGACCACAGCCGGAGCCTCTCCAGGGCCTCCTCGTAACAAGAAGAATCGGG  154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATACTGGGAGGAAGAGACCGTTCCGACCACAGCCGGAGCCTCTCCAGGGCCTCCTCGTAACAAGAAGAATCGGG  222

Query  155  AGCTCCGTCCTCAGAGACCAAAAAATGCTTACATCTTAAAGAAGTCTCGGATCTCTAAGAAGCCTCAGGTCCCG  228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCTCCGTCCTCAGAGACCAAAAAATGCTTACATCTTAAAGAAGTCTCGGATCTCTAAGAAGCCTCAGGTCCCG  296

Query  229  AAGAAACCCCGAGAATGGAAGAACCCGGAGTCCCAGCGCGGCTTGTCCGGGGCCCAAGATCCATTCCCAGGCCC  302
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGAAACCCCGAGAATGGAAGAACCCGGAGTCCCAGCGCGGCTTGTCCGGGACCCAAGATCCATTCCCAGGCCC  370

Query  303  CGCCCCCGTCCCTGTGGAAGTGGTCCAGAAGTTCTGTCGCATTGACAAATCCCGAAAGCTACCACATTCTAAAG  376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGCCCCCGTCCCTGTGGAAGTGGTCCAGAAGTTCTGTCGCATTGACAAATCCCGAAAGCTACCACATTCTAAAG  444

Query  377  CCAAAACTCGAAGCCGACTTGAGGTGGCTGAAGCTGAGGAAGAGGAAACAAGTATCAAAGCTGCTCGTTCTGAG  450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCAAAACTCGAAGCCGACTTGAGGTGGCTGAAGCTGAGGAAGAGGAAACAAGTATCAAAGCTGCTCGTTCTGAG  518

Query  451  CTGCTGCTTGCTGAAGAACCTGGGTTTCTGGAAGGGGAGGATGGGGAAGACACAGCAAAGATATGCCAGGCTGA  524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGCTGCTTGCTGAAGAACCTGGGTTTCTGGAAGGGGAGGATGGGGAAGACACAGCAAAGATATGCCAGGCTGA  592

Query  525  CATTGTGGAGGCTGTGGACATTGCAAGTGCAGCCAAGCACTTTGACTTGAATCTGCGGCAGTTTGGACCCTACA  598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CATTGTGGAGGCTGTGGACATTGCAAGTGCAGCCAAGCACTTTGACTTGAATCTGCGGCAGTTTGGACCCTACA  666

Query  599  GACTAAACTACTCTCGAACTGGAAGACACCTGGCTTTTGGAGGGCGCCGAGGTCATGTGGCTGCCCTTGATTGG  672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACTAAACTACTCTCGAACTGGAAGACACCTGGCTTTTGGAGGGCGCCGAGGTCATGTGGCTGCCCTTGATTGG  740

Query  673  GTAACAAAGAAGCTTATGTGCGAGATCAACGTCATGGAGGCGGTGCGGGACATCCGGTTTCTCCATTCTGAGGC  746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTAACAAAGAAGCTTATGTGCGAGATCAACGTCATGGAGGCGGTGCGGGACATCCGGTTTCTCCATTCTGAGGC  814

Query  747  ACTGCTTGCTGTTGCTCAGAACCGCTGGCTCCACATCTATGACAATCAGGGCATTGAGCTCCACTGTATCCGCC  820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACTGCTTGCTGTTGCTCAGAACCGCTGGCTCCACATCTATGACAATCAGGGCATTGAGCTCCACTGTATCCGCC  888

Query  821  GCTGTGACCGAGTAACACGGCTTGAGTTCCTGCCCTTCCACTTCCTCCTGGCTACAGCTTCAGAAACAGGGTTT  894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCTGTGACCGAGTAACACGGCTTGAGTTCCTGCCCTTCCACTTCCTCCTGGCTACAGCTTCAGAAACAGGGTTT  962

Query  895  CTAACCTACCTGGATGTGTCAGTGGGGAAGATTGTGGCAGCTCTGAATGCTCGAGCTGGGCGGCTCGATGTTAT  968
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTAACCTACCTGGATGTGTCAGTGGGGAAGATTGTGGCAGCTCTGAATGCTCGAGCTGGGCGGCTCGATGTTAT  1036

Query  969  GAGTCAGAACCCTTACAATGCCGTCATCCATCTCGGACACAGCAATGGTACTGTGTCTTTATGGAGTCCAGCTA  1042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAGTCAGAACCCTTACAATGCCGTCATCCATCTCGGACACAGCAATGGTACTGTGTCTTTATGGAGTCCAGCTA  1110

Query 1043  TGAAGGAGCCACTGGCAAAGATTCTCTGTCATCGTGGTGGGGTCCGGGCTGTGGCAGTAGATTCTACAGGCACG  1116
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |
Sbjct 1111  TGAAGGAGCCACTGGCAAAGATTCTCTGTCATCGTGGTGGGGTCCGGGCTGTGGCAGTAGATTCTACAG----G  1180

Query 1117  TACATGGCCACCTCTGGCCTAGACCACCAGCTGAAGATCTTTGACTTGCGAGGGACGTACCAGCCTCTGAGCAC  1190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181  TACATGGCCACCTCTGGCCTAGACCACCAGCTGAAGATCTTTGACTTGCGAGGGACGTACCAGCCTCTGAGCAC  1254

Query 1191  TCGGACCCTGCCCCATGGAGCAGGGCACCTGGCCTTCTCCCAGAGGGGACTGCTGGTGGCGGGAATGGGTGACG  1264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  TCGGACCCTGCCCCATGGAGCAGGGCACCTGGCCTTCTCCCAGAGGGGACTGCTGGTGGCGGGAATGGGTGACG  1328

Query 1265  TTGTCAACATCTGGGCAGGGCAGGGCAAGGCCAGCCCACCCTCCCTTGAACAGCCCTACCTCACCCACCGGCTC  1338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  TTGTCAACATCTGGGCAGGGCAGGGCAAGGCCAGCCCACCCTCCCTTGAACAGCCCTACCTCACCCACCGGCTC  1402

Query 1339  TCAGGCCCTGTGCATGGCCTTCAGTTCTGCCCCTTTGAAGATGTGCTGGGGGTGGGGCACACTGGGGGCATCAC  1412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403  TCAGGCCCTGTGCATGGCCTTCAGTTCTGCCCCTTTGAAGATGTGCTGGGGGTGGGGCACACTGGGGGCATCAC  1476

Query 1413  CAGCATGCTGGTCCCT----------------------------------------------------------  1428
            ||||||||||||||||                                                          
Sbjct 1477  CAGCATGCTGGTCCCTGGTGAGTGGGCCAGGGGATGGGGCTTGAAGTGAATGAACTCTGGGTGGAAGTTTGGGC  1550

Query 1429  --------------------------------------------------------------------------  1428
                                                                                      
Sbjct 1551  CAGAGACATCCAGGAACTGGGGGCTTAGTTGGGCTGGAGCTGTTGGACTGAGGTTCTTCCTTATGGCTCCATGC  1624

Query 1429  -------------------GGGGCCGGTGAGCCCAACTTCGATGGCCTGGAGAGTAATCCATACAGAAGCCGGA  1483
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  TTCTCCCTCCCTCCCTTCAGGGGCCGGTGAGCCCAACTTCGATGGCCTGGAGAGTAATCCATACAGAAGCCGGA  1698

Query 1484  AGCAGCGCCAGGAGTGGGAGGTGAAGGCCCTGCTAGAGAAGGTACCTGCAGAGCTTATTTGTCTGGACCCACGA  1557
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699  AGCAGCGCCAGGAGTGGGAGGTGAAGGCCCTGCTAGAGAAGGTACCTGCAGAGCTTATTTGTCTGGACCCACGA  1772

Query 1558  GCCCTGGCCGAGGTGGATGTCATCTCCCTGGAGCAGGGAAAGAAGGAGCAGATAGAGAGGCTGGGCTATGACCC  1631
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773  GCCCTGGCCGAGGTGGATGTCATCTCCCTGGAGCAGGGAAAGAAGGAGCAGATAGAGAGGCTGGGCTATGACCC  1846

Query 1632  GCAGGCTAAGGCTCCCTTCCAGCCAAAGCCAAAGCAGAAGGGCCGCAGCTCCACGGCAAGCCTGGTGAAGAGGA  1705
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847  GCAGGCTAAGGCTCCCTTCCAGCCAAAGCCAAAGCAGAAGGGCCGCAGCTCCACGGCAAGCCTGGTGAAGAGGA  1920

Query 1706  AGAGGAAGGTCATGGATGAGGAACACAGGGACAAGGTCCGGCAGAGCCTTCAGCAGCAGCATCATAAGGAGGCG  1779
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921  AGAGGAAGGTCATGGATGAGGAACACAGGGACAAGGTCCGGCAGAGCCTTCAGCAGCAGCATCATAAGGAGGCG  1994

Query 1780  AAGGCCAAGCCCACGGGGGCCCGGCCATCTGCCCTGGACAGATTTGTGCGC-----------------------  1830
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct 1995  AAGGCCAAGCCCACGGGGGCCCGGCCATCTGCCCTGGACAGATTTGTGCGCTGAGCCAGACTCCAGGGTTGCCT  2068

Query 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830
                                                                                      
Sbjct 2069  GGGAACAGTCTCTCCCCAAGATCACCTGTAGGGAAATGAGTGTTCCCTGGAACAAGGAGGTGGGGGCAGTGTGG  2142

Query 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830
                                                                                      
Sbjct 2143  CCCCTTCCCCAACTGGGGGTGGACAGCTGTCTCCTGGGGTGGGTTGGTATTAAAGAGGAAAGCGATTTTTTGGA  2216