Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07402
Subject:
NM_001159601.1
Aligned Length:
676
Identities:
591
Gaps:
77

Alignment

Query   1  ATGTCGGACTCTGAGGAGGAGAGTCAGGACCGGCAACTGAAAATCGTCGTGCTGGGGGACGGCGCCTCCGGGAA  74
           |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGTCGGACTCTGAGGAGGAGAGCCAGGACCGGCAACTGAAAATCGTCGTGCTGGGGGACGGCGCCTCCGGGAA  74

Query  75  GACCTCCTTAACTACGTGTTTTGCTCAAGAAACTTTTGGGAAACAGTACAAACAAACTATAGGACTGGATTTCT  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GACCTCCTTAACTACGTGTTTTGCTCAAGAAACTTTTGGGAAACAGTACAAACAAACTATAGGACTGGATTTCT  148

Query 149  TTTTGAGAAGGATAACATTGCCAGGAAACTTGAATGTTACCCTTCAAATTTGGGATATAGGAGGGCAGACAATA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TTTTGAGAAGGATAACATTGCCAGGAAACTTGAATGTTACCCTTCAAATTTGGGATATAGGAGGGCAGACAATA  222

Query 223  GGAGGCAAAATGTTGGATAAATATATCTATGGAGCACAGGGAGTCCTCTTGGTATATGATATTACAAATTATCA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GGAGGCAAAATGTTGGATAAATATATCTATGGAGCACAGGGAGTCCTCTTGGTATATGATATTACAAATTATCA  296

Query 297  AAGCTTTGAGAATTTAGAAGATTGGTATACTGTGGTGAAGAAAGTGAGCGAGGAGTCAGAAACTCAGCCACTGG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AAGCTTTGAGAATTTAGAAGATTGGTATACTGTGGTGAAGAAAGTGAGCGAGGAGTCAGAAACTCAGCCACTGG  370

Query 371  TTGCCTTGGTAGGCAATAAAATTGATTTGGAGCATATGCGAACAATAAAACCTGAAAAACACTTACGGTTTTGC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TTGCCTTGGTAGGCAATAAAATTGATTTGGAGCATATGCGAACAATAAAACCTGAAAAACACTTACGGTTTTGC  444

Query 445  CAGGAAAATGGTTTTAGTAGCCACTTTGTCTCAGCCAAGACAGGAGACTCTGTCTTCCTGTGCTTTCAGAAAGT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  CAGGAAAATGGTTTTAGTAGCCACTTTGTCTCAGCCAAGACAGGAGACTCTGTCTTCCTGTGCTTTCAGAAAGT  518

Query 519  TGCTGCTGAAATCCTTGGGATCAAATTAAACAAAGCAGAAATAGAACAGTCACAGAGGGTGGTGAAGGCAGAT-  591
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| .|| 
Sbjct 519  TGCTGCTGAAATCCTTGGGATCAAATTAAACAAAGCAGAAATAGAACAGTCACAG-----------GGC-CATT  580

Query 592  -----------ATTGTAAACTACAACCAG-GAACCTATGTCAAGGACTGTTAACCCTCCTAGAAGCTCTATGTG  653
                      ||| |.|.|.||.|..|| |||                                         
Sbjct 581  TCATTATTTTCATT-TCATCAACTAATAGAGAA-----------------------------------------  612

Query 654  TGCAGTTCAG  663
                     
Sbjct 613  ----------  612