Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07402
• Subject: NM_001310589.1
• Aligned Length: 679
• Identities: 581
• Gaps: 35

Alignment

Query   1  ATGTCGGACTCTGAGGAGGAGAGTCAGGACCGGCAACTGAAAATCGTCGTGCTGGGGGACGGCGCCTCCGGGAA  74
           |||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct   1  ATGTCAGACTCTGAGGAGGAGAGCCAGGACCGGCAACTGAAAATCGTCGTGCTGGGGGACGGCACCTCGGGGAA  74

Query  75  GACCTCCTTAACTACGTGTTTTGCTCAAGAAACTTTTGGGAAACAGTACAAACAAACTATAGGACTGGATTTCT  148
           ||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  75  GACCTCCTTAGCTACGTGTTTTGCTCAAGAGACATTTGGGAAGCAGTACAAGCAGACGATAGGACTGGATTTCT  148

Query 149  TTTTGAGAAGGATAACATTGCCAGGAAACTTGAATGTTACCCTTCAAATTTGGGATATAGGAGGGCAGACAATA  222
           |||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TTTTGAGAAGGATTACCTTACCAGGAAATTTGAATGTTACTCTTCAAGTTTGGGATATAGGAGGGCAGACAATA  222

Query 223  GGAGGCAAAATGTTGGATAAATATATCTATGGAGCACAGGGAGTCCTCTTGGTATATGATATTACAAATTATCA  296
           ||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 223  GGTGGCAAGATGTTGGATAAATACATCTATGGAGCACAGGGAATCCTCTTGGTATATGATATTACAAACTACCA  296

Query 297  AAGCTTTGAGAATTTAGAAGATTGGTATACTGTGGTGAAGAAAGTGAGCGAGGAGTCAGAAACTCAGCCACTGG  370
           |||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||.|||.||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 297  AAGCTTTGAGAATTTGGAAGATTGGTATTCTGTGGTGAAGACAGTAAGTGAAGAGTCAGAAACTCAGCCCCTGG  370

Query 371  TTGCCTTGGTAGGCAATAAAATTGATTTGGAGCATATGCGAACAATAAAACCTGAAAAACACTTACGGTTTTGC  444
           ||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 371  TTGCTTTAGTGGGCAATAAAATTGACTTGGAGCATATGCGAACAGTAAAAGCTGATAAGCACTTACGATTTTGC  444

Query 445  CAGGAAAATGGTTTTAGTAGCCACTTTGTCTCAGCCAAGACAGGAGACTCTGTCTTCCTGTGCTTTCAGAAAGT  518
           |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 445  CAGGAAAATGGTTTTAGTAGCCACTTTGTTTCAGCCAAGACAGGAGACTCTGTCTTCCTGTGTTTTCAGAAAGT  518

Query 519  TGCTGCTGAAATCCTTGGGATCAAATTAAACAAAGCAGAAATAGAACAGTCACAGAGGGTGGTGAAGGCAGATA  592
           |||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|.||.|.||||||.|
Sbjct 519  TGCAGCAGAAATCCTGGGAATCAAATTAAACAAAGCAGAAATAGAACAGTCACAGCGTATTGTCAGGGCAGAAA  592

Query 593  TTGTAAACTACAACCAGGAACCTATGTCAAGGACTGTTAACC----CTCCTAGAAGCTCT------------AT  650
           |.||.||.|   |||.||||           || .|.|||||    |.||    ||||||            .|
Sbjct 593  TAGTCAAGT---ACCCGGAA-----------GA-AGATAACCAACACCCC----AGCTCTGCTCAGAGTAGAGT  647

Query 651  GTGTGCAGTTCAG  663
           .|||.||||.|||
Sbjct 648  CTGTTCAGTACAG  660