Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07402
Subject:
NM_001310590.1
Aligned Length:
663
Identities:
531
Gaps:
84

Alignment

Query   1  ATGTCGGACTCTGAGGAGGAGAGTCAGGACCGGCAACTGAAAATCGTCGTGCTGGGGGACGGCGCCTCCGGGAA  74
           |||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct   1  ATGTCAGACTCTGAGGAGGAGAGCCAGGACCGGCAACTGAAAATCGTCGTGCTGGGGGACGGCACCTCGGGGAA  74

Query  75  GACCTCCTTAACTACGTGTTTTGCTCAAGAAACTTTTGGGAAACAGTACAAACAAACTATAGGACTGGATTTCT  148
           ||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  75  GACCTCCTTAGCTACGTGTTTTGCTCAAGAGACATTTGGGAAGCAGTACAAGCAGACGATAGGACTGGATTTCT  148

Query 149  TTTTGAGAAGGATAACATTGCCAGGAAACTTGAATGTTACCCTTCAAATTTGGGATATAGGAGGGCAGACAATA  222
           |||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TTTTGAGAAGGATTACCTTACCAGGAAATTTGAATGTTACTCTTCAAGTTTGGGATATAGGAGGGCAGACAATA  222

Query 223  GGAGGCAAAATGTTGGATAAATATATCTATGGAGCACAGGGAGTCCTCTTGGTATATGATATTACAAATTATCA  296
           ||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 223  GGTGGCAAGATGTTGGATAAATACATCTATGGAGCACAGGGAATCCTCTTGGTATATGATATTACAAACTACCA  296

Query 297  AAGCTTTGAGAATTTAGAAGATTGGTATACTGTGGTGAAGAAAGTGAGCGAGGAGTCAGAAACTCAGCCACTGG  370
           |||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||.|||.||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 297  AAGCTTTGAGAATTTGGAAGATTGGTATTCTGTGGTGAAGACAGTAAGTGAAGAGTCAGAAACTCAGCCCCTGG  370

Query 371  TTGCCTTGGTAGGCAATAAAATTGATTTGGAGCATATGCGAACAATAAAACCTGAAAAACACTTACGGTTTTGC  444
           ||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 371  TTGCTTTAGTGGGCAATAAAATTGACTTGGAGCATATGCGAACAGTAAAAGCTGATAAGCACTTACGATTTTGC  444

Query 445  CAGGAAAATGGTTTTAGTAGCCACTTTGTCTCAGCCAAGACAGGAGACTCTGTCTTCCTGTGCTTTCAGAAAGT  518
           |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 445  CAGGAAAATGGTTTTAGTAGCCACTTTGTTTCAGCCAAGACAGGAGACTCTGTCTTCCTGTGTTTTCAGAAAGT  518

Query 519  TGCTGCTGAAATCCTTGGGATCAAATTAAACAAAGCAGAAATAGAACAGTCACAGAGGGTGGTGAAGGCAGATA  592
           |||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.             
Sbjct 519  TGCAGCAGAAATCCTGGGAATCAAATTAAACAAAGCAGAAATAGAACAGTCACAGACTGTA-------------  579

Query 593  TTGTAAACTACAACCAGGAACCTATGTCAAGGACTGTTAACCCTCCTAGAAGCTCTATGTGTGCAGTTCAG  663
                                                                                  
Sbjct 580  -----------------------------------------------------------------------  579