Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07407
• Subject: XM_006713416.3
• Aligned Length: 2025
• Identities: 1779
• Gaps: 243

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTGACCCTCACCATTCCCAGCTCACCCCAAGGACCTCCCCACCCCATTGTGACACTACTTCCTGGACACCA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GTGGAGCTCAAAGGTTCTGCTTCCAAGGGTCTGGCTGGGCCTGGATTGTGGTCAGGTGGGCCCTGGCTTTGGCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGCGGTCCTGCCTACAGGGAGGCAGGGCCGGGAGGGTGTGGAGAGTAGAAATTATGATGACCCCTGGCAATTTT  222

Query    1  ---------------------ATGGCAGGAGAGGAGAACTTCAAGGAAGAGCTCAGATCCCAGGATGCTTCCAG  53
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCGGCCGCGTTCTCAGCACAGATGGCAGGAGAGGAGAACTTCAAGGAAGAGCTCAGATCCCAGGATGCTTCCAG  296

Query   54  GAACTTGAACCAGCATGAGGTAGCAGGACATCCACATTCCTGGTCTCTGGAGATGCTGTTACGCAGATTGAGGG  127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAACTTGAACCAGCATGAGGTAGCAGGACATCCACATTCCTGGTCTCTGGAGATGCTGTTACGCAGATTGAGGG  370

Query  128  CTGTCCACACCAAGCAGGATGACAAGTTTGCCAACCTCCTGGATGCGGTGGGGGAGTTTGGCACATTCCAGCAG  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGTCCACACCAAGCAGGATGACAAGTTTGCCAACCTCCTGGATGCGGTGGGGGAGTTTGGCACATTCCAGCAG  444

Query  202  AGGCTAGTAGCCCTCACCTTTATCCCCAGCATCATGTCGGCCTTCTTCATGTTTGCTGACCACTTCGTGTTCAC  275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGGCTAGTAGCCCTCACCTTTATCCCCAGCATCATGTCGGCCTTCTTCATGTTTGCTGACCACTTCGTGTTCAC  518

Query  276  AGCCCAGAAGCCCTATTGCAATACCAGCTGGATCCTGGCAGTGGGCCCCCACCTGTCCAAAGCTGAGCAGCTGA  349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCCAGAAGCCCTATTGCAATACCAGCTGGATCCTGGCAGTGGGCCCCCACCTGTCCAAAGCTGAGCAGCTGA  592

Query  350  ATCTGACCATACCCCAAGCACCCAATGGCAGTTTCCTGACATGCTTCATGTACCTTCCTGTGCCTTGGAATCTG  423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATCTGACCATACCCCAAGCACCCAATGGCAGTTTCCTGACATGCTTCATGTACCTTCCTGTGCCTTGGAATCTG  666

Query  424  GATTCTATCATCCAGTTTGGCCTCAATGACACAGACACATGCCAAGATGGGTGGATCTATCCTGACGCTAAGAA  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATTCTATCATCCAGTTTGGCCTCAATGACACAGACACATGCCAAGATGGGTGGATCTATCCTGACGCTAAGAA  740

Query  498  GCGATCGCTGATCAATGAGTTTGACTTGGTATGTGGCATGGAGACGAAGAAGGACACTGCACAGATCATGTTCA  571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCGATCGCTGATCAATGAGTTTGACTTGGTATGTGGCATGGAGACGAAGAAGGACACTGCACAGATCATGTTCA  814

Query  572  TGGCAGGGCTCCCGATAGGCTCTCTCATCTTCAGGCTCATAACTGACAAGATGGGCCGCTACCCTGCCATCCTG  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGCAGGGCTCCCGATAGGCTCTCTCATCTTCAGGCTCATAACTGACAAGATGGGCCGCTACCCTGCCATCCTG  888

Query  646  CTGTCACTGCTGGGGCTGATCATCTTCGGCTTTGGGACAGCCTTCATGAACAGCTTTCACCTGTATTTGTTCTT  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGTCACTGCTGGGGCTGATCATCTTCGGCTTTGGGACAGCCTTCATGAACAGCTTTCACCTGTATTTGTTCTT  962

Query  720  TCGCTTTGGCATCTCGCAGTCAGTGGTGGGCTACGCCATCAGCAGCATTTCTTTGGCCACTGAGTGGTTAGTGG  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCGCTTTGGCATCTCGCAGTCAGTGGTGGGCTACGCCATCAGCAGCATTTCTTTGGCCACTGAGTGGTTAGTGG  1036

Query  794  GTGAGCACCGGGCCCACGCCATTATCCTGGGACACTGCTTTTTCGCTGTTGGGGCCATGTTGCTGACAGGGATC  867
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGAGCACCGGGCCCATGCCATTATCCTGGGACACTGCTTTTTCGCTGTTGGGGCCGTGTTGCTGACAGGGATC  1110

Query  868  GCCTACGGTCTTCCCCACTGGCAGCTGCTGTTTCTGGTGGGTGGGATACTTGTGATCCCCTTCATCTCCTATAT  941
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCTACAGTCTTCCCCACTGGCAGCTGCTGTTTCTGGTGGGTGGGATACTTGTGATCCCCTTCATCTCCTATAT  1184

Query  942  CTGGATTCTCCCGGAGTCCCCGCGGTGGCTGATGATGAAAGGGAAGGTGAAGGAGGCCAAGCAGGTGCTGTGCT  1015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTGGATTCTCCCGGAGTCCCCGCGGTGGCTGATGATGAAAGGGAAGGTGAAGGAGGCCAAGCAGGTGCTGTGCT  1258

Query 1016  ACGCCGCAAGTGTGAACAAGAAGACCATTCCTTCAAATCTGCTGGACGAGCTGCAGCTGCCCAGAAAGAAGGTG  1089
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACGCCGCAAGTGTGAACAAGAAGACCATTCCTTCAAATCTGCTGGACGAGCTGCAGCTGCCCAGAAAGAAGGTG  1332

Query 1090  ACTCGGGCCTCTGTCCTGGACTTCTGTAAGAATAGGCAGCTCTGCAAGGTGACCTTGGTGATGAGCTGTGTGTG  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACTCGGGCCTCTGTCCTGGACTTCTGTAAGAATAGGCAGCTCTGCAAGGTGACCTTGGTGATGAGCTGTGTGTG  1406

Query 1164  GTTTACCGTCAGTTACACCTATTTTACGTTGAGCCTGAGAATGAGAGAGCTGGGCGTGAGCGTCCACTTCAGAC  1237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTTTACCGTCAGTTACACCTATTTTACGTTGAGCCTGAGAATGAGAGAGCTGGGCGTGAGCGTCCACTTCAGAC  1480

Query 1238  ACGTGGTCCCCAGCATCATGGAGGTGCCTGCCCGGCTGTGCTGCATCTTTCTCCTCCAGCAGATTGGGAGGAAG  1311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACGTGGTCCCCAGCATCATGGAGGTGCCTGCCCGGCTGTGCTGCATCTTTCTCCTCCAGCAGATTGGGAGGAAG  1554

Query 1312  TGGAGCCTGGCTGTGACTCTCCTCCAAGCCATCATCTGGTGCTTGCTTCTCCTTTTCCTCCCTGAAGGGGAGGA  1385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGGAGCCTGGCTGTGACTCTCCTCCAAGCCATCATCTGGTGCTTGCTTCTCCTTTTCCTCCCTGAAGGGGAGGA  1628

Query 1386  TGGCCTCAGACTCAAGTGGCCACGTTGTCCGGCCACAGAGCTGAAATCCATGACGATCTTGGTGCTCATGCTCA  1459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGGCCTCAGACTCAAGTGGCCACGTTGTCCGGCCACAGAGCTGAAATCCATGACGATCTTGGTGCTCATGCTCA  1702

Query 1460  GAGAGTTCAGCCTGGCCGCCACTGTCACTGTGTTCTTCCTCTACACCGCTGAGCTCCTCCCCACTGTGCTCAGG  1533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GAGAGTTCAGCCTGGCCGCCACTGTCACTGTGTTCTTCCTCTACACCGCTGAGCTCCTCCCCACTGTGCTCAGG  1776

Query 1534  GCGACAGGTCTGGGGCTGGTGTCTCTGGCCTCGGTGGCTGGAGCCATCTTGTCCCTGACAATCATCAGCCAGAC  1607
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCGACAGGTCTGGGGCTGGTGTCTCTGGCCTCGGTGGCTGGAGCCATCTTGTCCCTGACAATCATCAGCCAGAC  1850

Query 1608  CCCCTCCCTCCTGCCCATCTTTCTCTGCTGCGTCTTAGCCATCGTGGCCTTTTCCCTCTCCTCCCTGCTGCCGG  1681
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCCCTCCCTCCTGCCCATCTTTCTCTGCTGCGTCTTAGCCATCGTGGCCTTTTCCCTCTCCTCCCTGCTGCCGG  1924

Query 1682  AAACGCGAGATCAGCCCCTCTCCGAGAGCCTGAACCACTCCTCACAGATAAGGAATAAGGTCAAGGACATGAAG  1755
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAACGCGAGATCAGCCCCTCTCCGAGAGCCTGAACCACTCCTCACAGATAAGGAATAAGGTCAAGGACATGAAG  1998

Query 1756  ACTAAGGAAACATCATCTGATGATGTC  1782
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ACTAAGGAAACATCATCTGATGATGTC  2025