Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07408
• Subject: XM_006496300.2
• Aligned Length: 2612
• Identities: 2224
• Gaps: 37

Alignment

Query    1  ---------------------------ATGATGAGCATCAAAGCCTTTACGCTT-GTCTCTGCTGTGGAGCGGG  46
                                       |||||||.||||||.|||||.|| ||| ||||||||.|||||.||||
Sbjct    1  ATGACTGGGCCAGATCACCCGGTAGACATGATGAACATCAAGGCCTTCAC-CTTGGTCTCTGCAGTGGAACGGG  73

Query   47  AGCTGCTGATGGGCGACAAGGAGCGCGTCAACATAGAGTGCGTGGAGTGCTGCGGCAGGGACCTCTACGTGGGC  120
            |.||||||||||||||||..||.|.|.|||.|||.|||||.|||||||||||.||||||.|.||.||.||.|||
Sbjct   74  AACTGCTGATGGGCGACAGAGACCACATCAGCATTGAGTGTGTGGAGTGCTGTGGCAGGAATCTTTATGTCGGC  147

Query  121  ACCAACGACTGCTTCGTCTACCACTTCCTGTTGGAGGAG-AGGCCAGTGCCTGCTGGGCCAGCCACGTTCACTG  193
            |||||.|||||||||.|.|||||.||||||.|||||||| |||||| |||||.|.|||.||||.||.|||..||
Sbjct  148  ACCAATGACTGCTTCATTTACCATTTCCTGCTGGAGGAGAAGGCCA-TGCCTACAGGGACAGCTACATTCGTTG  220

Query  194  CCACCAAACAGCTGCAGAGACACTTGGGCTTCAAGAAGCCCGTGAACGAGCTGCGCGCGGCCTCAGCACTCAAC  267
            |||||||||||||.||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||.|||||.
Sbjct  221  CCACCAAACAGCTACACAGACACCTGGGCTTCAAGAAACCTGTGAACGAGCTGTGTGCGGCCTCAGCTCTCAAT  294

Query  268  AGGCTGCTGGTGCTGTGTGACAACTCCATCAGCCTGGTCAACATGCTGAACCTCGAGCCAGTGCCTTCGGGGGC  341
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.|.||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||
Sbjct  295  AGGCTGCTGGTGCTCTGTGACAACTCTATAACCCTGGTTAACATGCTGAACCTGGAGCCAGTCCCCTCAGGAGC  368

Query  342  CCGCATCAAGGGGGCAGCCACGTTTGCACTGAACGAGAACCCTGTGAGTGGGGACCCCTTCTGTGTAGAAGTTT  415
            |||||||||.|||||..|.||.||||||.|||||||||.|||.||||.|||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct  369  CCGCATCAAAGGGGCTACAACATTTGCAGTGAACGAGAGCCCCGTGAATGGGGACCCGTTCTGCGTGGAGGTGT  442

Query  416  GCATCATCTCTGTCAAACGCAGAACCATCCAGATGTTTCTGGTGTACGAGGACCGGGTGCAGATCGTCAAGGAG  489
            |||||||.||.||.||.|||||.||..||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct  443  GCATCATTTCCGTGAAGCGCAGGACTGTCCAAATGTTTCTGGTGTATGAGGACCGAGTGCAGATTGTCAAGGAA  516

Query  490  GTGTCGACTGCCGAACAGCCCCTCGCTGTGGCTGTGGACGGCCACTTCCTGTGTCTGGCTCTGACCACTCAGTA  563
            |||||.||..|.||.|||||.||.||||||||||||||.|||.|.|||.||||.|||||..|||||||.||.||
Sbjct  517  GTGTCCACCCCAGAGCAGCCTCTTGCTGTGGCTGTGGATGGCTATTTCTTGTGCCTGGCCTTGACCACACAATA  590

Query  564  CATCATCCACAATTACAGCACAGGCGTCTCCCAGGACCTTTTTCCCTACTGCAGTGAGGAGAGGCCGCCGATCG  637
            ||||||||..||.||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||.||.||||
Sbjct  591  CATCATCCTGAACTACAGCACAGGCCTTTCCCAGGACCTGTTTCCCTACTGCAGTGAGGAGAAGCCACCCATCG  664

Query  638  TCAAGAGGATAGGGAGACAGGAGTTCCTGCTGGCGGGCCCCGGAGGGCTGGGCATGTTTGCCACAGTCGCAGGG  711
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||..||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct  665  TCAAGAGGATAGGCAGACAGGAGTTCCTGCTGGCTGGCCCAGGAGGCTTGGGCATGTTTGCCACCGTGGCCGGG  738

Query  712  ATATCCCAGCGTGCCCCCGTGCACTGGTCGGAGAATGTGATTGGGGCGGCTGTGTCCTTTCCATACGTCATAGC  785
            ||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|.|||.||.||.||||||||
Sbjct  739  ATTTCCCAGCGTGCCCCTGTGCACTGGTCAGAAAATGTGATTGGGGCAGCTGTTTGCTTCCCCTATGTCATAGC  812

Query  786  GCTCGATGACGAATTCATCACAGTCCACAGCATGTTGGATCAGCAACAGAAGCAGACGCTGCCCTTTAAGGAGG  859
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  813  GCTCGATGACGAATTCATCACAGTTCACAGCATGTTGGATCAGCAGCAGAAACAGACCCTGCCCTTTAAGGAGG  886

Query  860  GCCATATCCTACAGGACTTTGAAGGAAGAGTGATCGTTGCCACAAGTAAAGGAGTTTACATCTTGGTTCCATTA  933
            |.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  GGCACATCCTGCAGGACTTTGAAGGAAGAGTGATTGTTGCCACAAGTAAAGGAGTTTACATCTTGGTTCCATTA  960

Query  934  CCTTTGGAAAAACAAATACAGGATCTTCTAGCAAGCCGCAGAGTAGAAGAGGCTTTGGTTTTAGCAAAAGGAGC  1007
            |||.||||||||||||||||||||||..||||||.|||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  961  CCTCTGGAAAAACAAATACAGGATCTGTTAGCAAACCGGAGAGTGGAGGAGGCTTTGGTCTTGGCAAAAGGAGC  1034

Query 1008  CCGGAGGAACATTCCAAAGGAAAAATTTCAGGTAATGTACAGAAGGATTCTGCAGCAGGCGGGATTTATACAGT  1081
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1035  CCGGAGGAACATTCCAAAGGAGAAATTTCAGGTAATGTACAGGAGGATTCTGCAGCAGGCAGGCTTTATACAGT  1108

Query 1082  TTGCACAACTTCAGTTCCTGGAAGCTAAAGAGCTCTTCAGAAGCGGCCAGCTTGATGTCCGGGAGCTGATCTCT  1155
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  TTGCACAACTCCAGTTCCTGGAAGCCAAAGAGCTCTTCAGAAGCAGCCAGCTGGATGTCCGGGAGCTGATCTCT  1182

Query 1156  CTCTACCCCTTCCTGTTGCCCACCTCCTCCTCCTTCACCCGGTCCCACCCTCCTCTTCATGAGTACGCAGACCT  1229
            |||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  CTCTACCCCTTTCTGCTGCCCACCTCCTCCTCCTTCACCCGCTCTCACCCTCCTCTTCATGAGTACGCAGACCT  1256

Query 1230  GAACCAGCTGACCCAGGGGGACCAGGAGAAGATGGCCAAGTGCAAACGCTTCCTCATGAGCTACCTGAACGAGG  1303
            |||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||..
Sbjct 1257  GAACCAGCTGACCCAAGGTGACCAGGAGAAGATGGCCAAGTGCAAGCGCTTCCTCATGAGCTACCTGAATGAAA  1330

Query 1304  TCCGCAGCACAGAGGTAGCAAATGGCTACAAGGAGGACATCGACACAGCCTTGCTCAAACTGTATGCAGAGGCT  1377
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1331  TCCGCAGCACAGAGGTAGCTAATGGCTACAAGGAAGACATCGACACGGCCTTGCTCAAGCTGTATGCAGAGGCT  1404

Query 1378  GACCACGACAGCCTGCTGGACCTCCTGGTCACTGAGAACTTCTGTCTT-CTGACGGACAGTGCTGCCTGGCTAG  1450
            ||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||||| ||| |||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1405  GACCACGACAGCCTCCTGGACCTCTTGGTCACTGAGAATTTCTG-CTTGCTGACAGACAGTGCTGCCTGGCTGG  1477

Query 1451  AGAAGCACAAAAAGTATTTTGCACTTGGACTGCTCTATCATTATAATAACCAAGATGCTGCTGCAGTTCAGTTG  1524
            ||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||..||||.|||||||||
Sbjct 1478  AGAAGCACAAAAAGTACTTTGCACTGGGGCTGCTCTATCATTACAACAAACAAGATGCCTCTGCGGTTCAGTTG  1551

Query 1525  TGGGTGAACATTGTGAATGGCGATGTCCAGGACTCCACACGCTCAGACCTGTATGAATACATCGTGGATTTTCT  1598
            ||||||||||||||||||||.||..||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1552  TGGGTGAACATTGTGAATGGGGACATCCAGGACTCTACACGCTCGGACCTGTATGAATACATCGTTGATTTCCT  1625

Query 1599  TACCTACTGCTTAGACGAGGAACTAGTGTGGGCCTATGCTGATTGGGTCCTGCAGAAAAGTGAAGAGGTCGGAG  1672
            ||||||||||.|||||.|.||.||.||||||.||.|||||||.|||.|.||||||||||||||.|||.|.||||
Sbjct 1626  TACCTACTGCCTAGACCAAGAGCTGGTGTGGACCCATGCTGACTGGCTGCTGCAGAAAAGTGAGGAGATTGGAG  1699

Query 1673  TTCAGGTTTTCACCAAGAGACCTTTGGATGAACAGCAGAAGAACAGTTTTAATCCAGACGACATTATCAATTGC  1746
            ||||..||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||..|||||||||||||||.|||||||.|.||.|
Sbjct 1700  TTCAAATTTTCACCAAGAGACCTTTGGACGAGCAGCAGCAGACTAGTTTTAATCCAGACAACATTATTAGTTCC  1773

Query 1747  CTTAAAAAATACCCTAAAGCCCTTGTGAAGTATCTGGAACATCTTGTGATAGACAAGAGACTGCAGAAAGAAGA  1820
            |||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||.||||.|||||||||||||
Sbjct 1774  CTTAAGAAATACCCTAAAGCCCTGGTTAAGTATCTGGAACATCTCGTGATCGACAGGAGATTGCAGAAAGAAGA  1847

Query 1821  GTATCACACCCACTTAGCTGTGCTGTACCTGGAAGAGGTGCTGCTGCAGAGGGCCTCCGCCAGTGGCAAGGGTG  1894
            |||.|||||||||.|.||..|.||.||||||||.||.|||||||.||||||||..|||.|..|.|||||.|.||
Sbjct 1848  GTACCACACCCACCTTGCCATCCTCTACCTGGAGGAAGTGCTGCGGCAGAGGGTATCCACTGGGGGCAAAGATG  1921

Query 1895  CAGAGGCCACCGAGACGCAGGCCAAGCTGCGGCGGCTGCTCCAGAAATCTGATTTATACCGAGTCCACTTTCTT  1968
            .|||.|||||.|||||.||||||||.||.|||.|.||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||..|.
Sbjct 1922  TAGAAGCCACTGAGACACAGGCCAAACTCCGGAGACTACTCCAGAAGTCTGACTTGTACCGCGTCCACTTGTTG  1995

Query 1969  CTCGAGAGGCTGCAGGGAGCTGGCCTGCCCATGGAGAGCGCCATCCTGCACGGGAAGCTGGGCGAGCATGAGAA  2042
            ...||||...|.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1996  AAAGAGAAAGTCCAGGGTGCCGGCCTGCCCATGGAAAGTGCCATCCTCCACGGGAAGCTGGGCGAGCACGAGAA  2069

Query 2043  GGCGCTGCATATCCTGGTGCACGAGCTGCAGGACTTTGCAGCGGCCGAGGACTACTGCCTGTGGTGCTCCGAGG  2116
            |||.|||||.|||||||||||||||.||..||||||..|.||.||.||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2070  GGCCCTGCACATCCTGGTGCACGAGATGGGGGACTTCTCTGCAGCTGAGGACTACTGCCTGTGGAGCTCCGAGG  2143

Query 2117  GCCGAGACCCACCCCACCGCCAGCAACTCTTTCACACGCTGCTGGCCATCTACCTGCATGCTGGCCCCACTGCC  2190
            |.|..|...||.||..|||.||||..|||||.||||||.||||.|||||.|||||.|.|||.||||||.|||||
Sbjct 2144  GTCAGGGTGCAGCCTGCCGTCAGCGCCTCTTCCACACGTTGCTCGCCATGTACCTCCGTGCAGGCCCCTCTGCC  2217

Query 2191  CACGAGCTGGCCGTGGCTGCCGTGGACCTGCTGAACCGCCACGCCACCGAATTTGATG-CAGCCCAGGTGCTGC  2263
            ||.||.|||.|.|||||.||.||||||.|||||||||..||.||||..|||||||||| || |||||||.||.|
Sbjct 2218  CAGGATCTGACAGTGGCCGCTGTGGACTTGCTGAACCATCATGCCAGGGAATTTGATGTCA-CCCAGGTCCTAC  2290

Query 2264  AGATGCTGCCTGACACCTGGTCAGTGCAGCTCCTCTGCCCATTCCTGATGGGGGCCATGAGGGACAGCATCCAT  2337
            ||.|||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 2291  AGCTGCTGCCAGACACCTGGTCCGTGCAGCTTCTCTGCCCATTCCTCATGGGGGCTATGAGGGACAGTATCCAT  2364

Query 2338  GCCAGGAGGACCATGCAGGTGGCTCTCGGCCTGGCCAGGTCCGAAAACTTAATCTACACCTACGATAAGATGAA  2411
            |||||||||||||..||||||||.||.||||||||||..||.||||||.|.||.||||..||.|||||||||||
Sbjct 2365  GCCAGGAGGACCACACAGGTGGCCCTTGGCCTGGCCAAATCAGAAAACCTGATTTACATGTATGATAAGATGAA  2438

Query 2412  GTTGAAAGGAAGCTCAATCCAACTCTCAGACAAAAAGCTTTGTCAGATATGCCAAAATCCCTTT-TGTGAGCCT  2484
            |.||||.||.|...||.|||..||||||||...|.|||||||.|||.|.|||||.|| |||||| .||||.|||
Sbjct 2439  GCTGAAGGGCAATGCAGTCCGGCTCTCAGAACGAGAGCTTTGCCAGCTCTGCCAGAA-CCCTTTCGGTGAACCT  2511

Query 2485  GTGTTTGTTAGATACCCAAATGGTGGTCTTGTGCACACCCACTGTGCCGCCAGCAGACACACAAACCCCAGCTC  2558
            ||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||||||||
Sbjct 2512  GTGTTTGTCAGATACCCAAATGGAGGGCTTGTGCACACCCACTGTGCCGCCAGCAGACACACGGCCCCCAGCTC  2585

Query 2559  ATCCAGTCCTGGCACTCGGACT  2580
            ..||||.|||||||||||||||
Sbjct 2586  GCCCAGCCCTGGCACTCGGACT  2607