Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07414
- Subject:
- NM_001145078.2
- Aligned Length:
- 1885
- Identities:
- 1326
- Gaps:
- 407
Alignment
Query 1 ATGGCGGCAGCGGTGCTGACGGACCGGGCCCAGGTGTCTGTGACCTTTGATGATGTGGCTGTGACTTTCACCAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGAGGAGTGGGGGCAGCTGGACCTAGCTCAGCGGACCCTGTACCAGGAGGTGATGCTGGAAAACTGTGGGCTCC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGGTGTCTCTGGGGTGTCCTGTTCCCAAAGCTGAGCTGATCTGCCACCTAGAGCATGGGCAGGAGCCATGGACC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AGGAAGGAAGACCTCTCCCAAGACACCTGTCCAGGCGACAAAGGAAAACCTAAGACCACAGAACCTACCACTTG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TGAGCCAGCCTTGTCAGAGGGAATCTCACTTCAGGGACAAGTGACACAAGGAAACTCAGTGGACTCACAGTTGG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GGCAAGCCGAGGATCAGGATGGGCTATCAGAAATGCAGGAAGGACACTTCAGACCAGGAATAGATCCCC---AG 441
|||||||.||.||.|||.||||||||..|||||.||| ||
Sbjct 1 --------------------------------ATGCAGGGAGAACGCTTGAGACCAGGGTTAGATTCCCAAAAG 42
Query 442 GAGAAGTCTCCTGGGAAGATGAGCCCTGAATGTGATGGTTTAGGGACAGCTGATGGTGTGTGTTCAAGGATTGG 515
||||||..||||||.||.||||||||..||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..
Sbjct 43 GAGAAGCTTCCTGGAAAAATGAGCCCCAAACATGATGGTTTAGGGACAGCTGATAGTGTGTGTTCAAGGATTAT 116
Query 516 ACAGGAGCAAGTCTCTCCAGGAGATACAGTCCATAGCCATAACTCATGTGAGTCAGGTAAAGATCCCATGATTC 589
||||||.|.||||||...|||||||...||||||..|..|.|||||..||..|||||||||.||||..|.||||
Sbjct 117 ACAGGATCGAGTCTCCTTAGGAGATGATGTCCATGACTGTGACTCACATGGATCAGGTAAAAATCCAGTTATTC 190
Query 590 AGGAAGAGGAAAATAACTTTAAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTATTTAACAAGAAACACCTCCTTGCTGGACAT 663
|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||||.|||.||||||.|.|||
Sbjct 191 AGGAAGAGGAAAATATCTTTAAATGCAATGAATGTGAAAAAGTGTTTAACAAGAAACGCCTGCTTGCTCGGCAT 264
Query 664 GAGAAAATTCACTCTGGAGTTAAGCCCTATGAATGCACAGAATGTGGGAAAACCTTTATTAAGAGCACACATCT 737
||||..||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..|||||.|||.|.||
Sbjct 265 GAGAGGATTCACTCTGGAGTGAAGCCCTATGAATGCACAGAGTGTGGAAAAACCTTTAGCAAGAGTACATACCT 338
Query 738 CCTGCAACATCACATGATCCACACTGGGGAGAGGCCCTATGAGTGCATGGAGTGTGGAAAGGCCTTCAACCGCA 811
||||||.||.||||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 339 CCTGCAGCACCACATGGTCCACACTGGGGAGAAGCCCTATAAGTGCATGGAGTGTGGGAAGGCTTTTAATCGGA 412
Query 812 AGTCATACCTTACCCAGCACCAGCGGATTCACAGTGGAGAGAAGCCTTACAAGTGCAATGAATGCGGAAAGGCC 885
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||.|||||||||
Sbjct 413 AGTCACACCTTACCCAGCACCAGCGGATTCACAGTGGAGAGAAGCCTTATAAGTGCAGTGAATGTGGAAAGGCC 486
Query 886 TTCACCCACCGCTCCAATTTTGTCTTGCATAACAGGAGACACACTGGAGAAAAATCCTTTGTGTGCACAGAATG 959
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.|||.||
Sbjct 487 TTCACCCACCGCTCCACTTTTGTCTTGCATAACAGGAGCCACACTGGAGAAAAACCCTTTGTGTGCAAAGAGTG 560
Query 960 TGGCCAAGTCTTTCGACATAGGCCAGGCTTTC-TCCGGCACTATGTTGTCCACAGTGGTGAGAATCCCTATGAG 1032
||||.|||.|||||||.|||||||||| |||| |.||.|||||..|..||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 561 TGGCAAAGCCTTTCGAGATAGGCCAGG-TTTCATTCGACACTACATCATCCACAGTGGTGAGAATCCCTACGAG 633
Query 1033 TGCTTGGAGTGTGGCAAGGTCTTCAAACACAGGTCATATCTCATGTGGCACCAGCAGACTCATACCGGGGAGAA 1106
|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 634 TGCTTCGAATGTGGCAAGGTCTTCAAACACAGATCATACCTCATGTGGCACCAGCAGACTCATACCGGGGAGAA 707
Query 1107 GCCCTATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAGGTCTTCTTGGAGAGTGCAGCCCTGATTCACCACTATGTCATCCACA 1180
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 708 GCCCTATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAGGCCTTCTGTGAGAGCGCAGCGCTGATTCACCACTATGTCATCCACA 781
Query 1181 CTGGAGAGAAGCCCTTTGAGTGCCTCGAGTGTGGGAAGGCTTTCAACCACCGATCCTACCTCAAGAGGCACCAG 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 782 CTGGAGAGAAGCCCTTTGAGTGCCTCGAGTGTGGGAAGGCTTTCAACCACCGATCCTACCTCAAAAGGCACCAG 855
Query 1255 CGGATTCACACTGGGGAGAAGCCCTTCGTGTGCAGTGAATGTGGAAAGGCCTTCACCCACTGCTCTACTTTTAT 1328
|||||||||||||||||||||||.|..|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 856 CGGATTCACACTGGGGAGAAGCCATATGTGTGTAGTGAATGCGGAAAGGCCTTCACCCACTGCTCTACTTTCAT 929
Query 1329 CTTGCATAAAAGGGCCCACACTGGAGAAAAGCCTTTCGAGTGCAAAGAGTGTGGGAAAGCCTTTAGCAATCGGA 1402
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 930 CTTGCATAAAAGGGCCCACACTGGAGAAAAACCTTTCGAGTGCAAAGAGTGTGGGAAAGCCTTTAGCAATAGGG 1003
Query 1403 AGGACCTCATTCGCCACTTCAGCATCCACACTGGAGAGAAGCCCTATGAGTGCGTGGAGTGTGGAAAGGCCTTC 1476
..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1004 CAGACCTCATTCGCCACTTCAGCATCCACACTGGAGAGAAGCCCTATGAGTGCATGGAGTGTGGAAAGGCCTTC 1077
Query 1477 ACCCGCATGTCGGGCCTCACGAGGCACAAGCGGATTCATAGTGGAGAGAAGCCCTATGAATGTGTTGAGTGTGG 1550
|.|||||.|||.||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||
Sbjct 1078 AACCGCAGGTCAGGCCTCACAAGGCACCAGCGGATTCATAGTGGAGAGAAGCCCTATGAATGCATCGAGTGTGG 1151
Query 1551 GAAATCGTTTTGCTGGAGCACAAACCTCATTCGACATGCCATTATCCACACTGGAGAGAAGCCCTATAAATGTA 1624
||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||..|.||.||||||||||||||||||||.|||.|.||.|
Sbjct 1152 GAAAACATTTTGCTGGAGCACAAACCTCATTCGACACTCTATCATCCACACTGGAGAGAAGCCGTATGAGTGCA 1225
Query 1625 GTGAATGTGGAAAGGCCTTCAGTCGCAGCTCGTCCCTCACTCAGCATCAAAGGATGCATACTGGGAAAAATCCC 1698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.
Sbjct 1226 GTGAATGTGGAAAGGCCTTCAGTCGCAGCTCGTCCCTCACTCAGCATCAAAGGATGCATACTGGGAGAAATCCT 1299
Query 1699 ATCAGTGTAACAGATGTGGGAAGACCTTTTACAAGTGGACAAACCTCAGTTACCCTTCGAGAACTTCTTTTAGG 1772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|.|.|.|.|||||||.|.||.||
Sbjct 1300 ATCAGTGTAACAGATGTGGGAAGACCTTTTACAAGTGGGCAGACCTCAGTCAACATCCAAGAACTTTTATTGGG 1373
Query 1773 GAAGGACTTTTTGAATGTAACCACTGAGGCAAATATTTTGCCAGAGGAAACATCTTCCTCTGCATCTGATCAAC 1846
|||..|||||||||||||.||||||||||.||||.||||||.|||||||.||||||.|...||||||||||...
Sbjct 1374 GAAAAACTTTTTGAATGTCACCACTGAGGAAAATCTTTTGCAAGAGGAAGCATCTTACATGGCATCTGATCGTA 1447
Query 1847 CATACCAAAGAGAAACCCCACAAGTGTCTTCACTG 1881
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1448 CATACCAAAGAGAAACCCCACAAGTGTCTTCACTG 1482