Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07414
• Subject: XM_011527522.2
• Aligned Length: 1881
• Identities: 1783
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGGCGGCAGCGGTGCTGACGGACCGGGCCCAGGTGTCTGTGACCTTTGATGATGTGGCTGTGACTTTCACCAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCAGCGGTGCTGACGGACCGGGCCCAGGTGTCTGTGACCTTTGATGATGTGGCTGTGACTTTCACCAA  74

Query   75  GGAGGAGTGGGGGCAGCTGGACCTAGCTCAGCGGACCCTGTACCAGGAGGTGATGCTGGAAAACTGTGGGCTCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGGAGTGGGGGCAGCTGGACCTAGCTCAGCGGACCCTGTACCAGGAGGTGATGCTGGAAAACTGTGGGCTCC  148

Query  149  TGGTGTCTCTGGGGTGTCCTGTTCCCAAAGCTGAGCTGATCTGCCACCTAGAGCATGGGCAGGAGCCATGGACC  222
            |||||||||||                                                               
Sbjct  149  TGGTGTCTCTG---------------------------------------------------------------  159

Query  223  AGGAAGGAAGACCTCTCCCAAGACACCTGTCCAGGCGACAAAGGAAAACCTAAGACCACAGAACCTACCACTTG  296
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  160  ---------------------------------GGCGACAAAGGAAAACCTAAGACCACAGAACCTACCACTTG  200

Query  297  TGAGCCAGCCTTGTCAGAGGGAATCTCACTTCAGGGACAAGTGACACAAGGAAACTCAGTGGACTCACAGTTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  201  TGAGCCAGCCTTGTCAGAGGGAATCTCACTTCAGGGACAAGTGACACAAGGAAACTCAGTGGACTCACAGTTGG  274

Query  371  GGCAAGCCGAGGATCAGGATGGGCTATCAGAAATGCAGGAAGGACACTTCAGACCAGGAATAGATCCCCAGGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  275  GGCAAGCCGAGGATCAGGATGGGCTATCAGAAATGCAGGAAGGACACTTCAGACCAGGAATAGATCCCCAGGAG  348

Query  445  AAGTCTCCTGGGAAGATGAGCCCTGAATGTGATGGTTTAGGGACAGCTGATGGTGTGTGTTCAAGGATTGGACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  349  AAGTCTCCTGGGAAGATGAGCCCTGAATGTGATGGTTTAGGGACAGCTGATGGTGTGTGTTCAAGGATTGGACA  422

Query  519  GGAGCAAGTCTCTCCAGGAGATACAGTCCATAGCCATAACTCATGTGAGTCAGGTAAAGATCCCATGATTCAGG  592
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  423  GGAGCAAGTCTCTCCAGGAGATAGAGTCCGTAGCCATAACTCATGTGAGTCAGGTAAAGATCCCATGATTCAGG  496

Query  593  AAGAGGAAAATAACTTTAAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTATTTAACAAGAAACACCTCCTTGCTGGACATGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  497  AAGAGGAAAATAACTTTAAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTATTTAACAAGAAACACCTCCTTGCTGGACATGAG  570

Query  667  AAAATTCACTCTGGAGTTAAGCCCTATGAATGCACAGAATGTGGGAAAACCTTTATTAAGAGCACACATCTCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  571  AAAATTCACTCTGGAGTTAAGCCCTATGAATGCACAGAATGTGGGAAAACCTTTATTAAGAGCACACATCTCCT  644

Query  741  GCAACATCACATGATCCACACTGGGGAGAGGCCCTATGAGTGCATGGAGTGTGGAAAGGCCTTCAACCGCAAGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  GCAACATCACATGATCCACACTGGGGAGAGGCCCTATGAGTGCATGGAGTGTGGAAAGGCCTTCAACCGCAAGT  718

Query  815  CATACCTTACCCAGCACCAGCGGATTCACAGTGGAGAGAAGCCTTACAAGTGCAATGAATGCGGAAAGGCCTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  CATACCTTACCCAGCACCAGCGGATTCACAGTGGAGAGAAGCCTTACAAGTGCAATGAATGCGGAAAGGCCTTC  792

Query  889  ACCCACCGCTCCAATTTTGTCTTGCATAACAGGAGACACACTGGAGAAAAATCCTTTGTGTGCACAGAATGTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  ACCCACCGCTCCAATTTTGTCTTGCATAACAGGAGACACACTGGAGAAAAATCCTTTGTGTGCACAGAATGTGG  866

Query  963  CCAAGTCTTTCGACATAGGCCAGGCTTTCTCCGGCACTATGTTGTCCACAGTGGTGAGAATCCCTATGAGTGCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  CCAAGTCTTTCGACATAGGCCAGGCTTTCTCCGGCACTATGTTGTCCACAGTGGTGAGAATCCCTATGAGTGCT  940

Query 1037  TGGAGTGTGGCAAGGTCTTCAAACACAGGTCATATCTCATGTGGCACCAGCAGACTCATACCGGGGAGAAGCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  941  TGGAGTGTGGCAAGGTCTTCAAACACAGGTCATATCTCATGTGGCACCAGCAGACTCATACCGGGGAGAAGCCC  1014

Query 1111  TATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAGGTCTTCTTGGAGAGTGCAGCCCTGATTCACCACTATGTCATCCACACTGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  TATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAGGTCTTCTTGGAGAGTGCAGCCCTGATTCACCACTATGTCATCCACACTGG  1088

Query 1185  AGAGAAGCCCTTTGAGTGCCTCGAGTGTGGGAAGGCTTTCAACCACCGATCCTACCTCAAGAGGCACCAGCGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  AGAGAAGCCCTTTGAGTGCCTCGAGTGTGGGAAGGCTTTCAACCACCGATCCTACCTCAAGAGGCACCAGCGGA  1162

Query 1259  TTCACACTGGGGAGAAGCCCTTCGTGTGCAGTGAATGTGGAAAGGCCTTCACCCACTGCTCTACTTTTATCTTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  TTCACACTGGGGAGAAGCCCTTCGTGTGCAGTGAATGTGGAAAGGCCTTCACCCACTGCTCTACTTTTATCTTG  1236

Query 1333  CATAAAAGGGCCCACACTGGAGAAAAGCCTTTCGAGTGCAAAGAGTGTGGGAAAGCCTTTAGCAATCGGAAGGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  CATAAAAGGGCCCACACTGGAGAAAAGCCTTTCGAGTGCAAAGAGTGTGGGAAAGCCTTTAGCAATCGGAAGGA  1310

Query 1407  CCTCATTCGCCACTTCAGCATCCACACTGGAGAGAAGCCCTATGAGTGCGTGGAGTGTGGAAAGGCCTTCACCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  CCTCATTCGCCACTTCAGCATCCACACTGGAGAGAAGCCCTATGAGTGCGTGGAGTGTGGAAAGGCCTTCACCC  1384

Query 1481  GCATGTCGGGCCTCACGAGGCACAAGCGGATTCATAGTGGAGAGAAGCCCTATGAATGTGTTGAGTGTGGGAAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385  GCATGTCGGGCCTCACGAGGCACAAGCGGATTCATAGTGGAGAGAAGCCCTATGAATGTGTTGAGTGTGGGAAA  1458

Query 1555  TCGTTTTGCTGGAGCACAAACCTCATTCGACATGCCATTATCCACACTGGAGAGAAGCCCTATAAATGTAGTGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459  TCGTTTTGCTGGAGCACAAACCTCATTCGACATGCCATTATCCACACTGGAGAGAAGCCCTATAAATGTAGTGA  1532

Query 1629  ATGTGGAAAGGCCTTCAGTCGCAGCTCGTCCCTCACTCAGCATCAAAGGATGCATACTGGGAAAAATCCCATCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1533  ATGTGGAAAGGCCTTCAGTCGCAGCTCGTCCCTCACTCAGCATCAAAGGATGCATACTGGGAAAAATCCCATCA  1606

Query 1703  GTGTAACAGATGTGGGAAGACCTTTTACAAGTGGACAAACCTCAGTTACCCTTCGAGAACTTCTTTTAGGGAAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1607  GTGTAACAGATGTGGGAAGACCTTTTACAAGTGGACAAACCTCAGTTACCCTTCGAGAACTTCTTTTAGGGAAG  1680

Query 1777  GACTTTTTGAATGTAACCACTGAGGCAAATATTTTGCCAGAGGAAACATCTTCCTCTGCATCTGATCAACCATA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681  GACTTTTTGAATGTAACCACTGAGGCAAATATTTTGCCAGAGGAAACATCTTCCTCTGCATCTGATCAACCATA  1754

Query 1851  CCAAAGAGAAACCCCACAAGTGTCTTCACTG  1881
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1755  CCAAAGAGAAACCCCACAAGTGTCTTCACTG  1785