Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07422
- Subject:
- XM_006529669.1
- Aligned Length:
- 781
- Identities:
- 644
- Gaps:
- 83
Alignment
Query 1 ATGAACAACAAGTTCGACGGTTTGAAAGATGATGACAGTGGGGACCATGATCAGAATGAAGAAAACAGCACACA 74
|||| |.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGA---------------GCTTAAAAGATGATGACAGTGGAGACCATGATCAGAATGAAGAAAACAGCACACA 59
Query 75 GAAAGATGGTGAGAAGGAAAAAACGGAACGAGACAAGAATCAGAGCAGTAGCAAGAGAAAGGCTGTTGTCCCTG 148
||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||..|||||||||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct 60 GAAAGATGGTGAGAAGGAAAAAACAGACCGAGACAAGAGCCAGAGCAGTGGCAAGAGGAAGGCTGTTGTCCCTG 133
Query 149 GACCGGCAGAGCATCCCCTGCAGTACAACTACACTTTTTGGTACTCCAGGAGAACCCCCGGCCGTCCCACGAGC 222
||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 134 GACCAGCAGAGCATCCCCTGCAGTACAACTACACCTTTTGGTACTCGAGGAGAACCCCTGGCCGTCCCACCAGC 207
Query 223 TCACAGAGCTATGAACAGAATATCAAACAGATTGGCACCTTTGCCTCTGTGGAGCAGTTCTGGAGGTTTTATAG 296
||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||
Sbjct 208 TCGCAGAGCTATGAGCAGAACATCAAGCAGATTGGCACCTTTGCCTCTGTGGAGCAGTTCTGGAAGTTTTACAG 281
Query 297 CCACATGGTACGTCCTGGGGACCTGACAGGCCACAGTGACTTCCATCTCTTCAAAGAAGGAATTAAACCCATGT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 282 CCACATGGTACGTCCTGGGGACCTGACAGGCCACAGTGACTTTCATCTCTTCAAAGAAGGGATTAAACCTATGT 355
Query 371 GGGAGGATGATGCAAATAAAAATGGTGGCAAGTGGATTATTCGGCTGCGGAAGGGCTTGGCCTCCCGTTGCTGG 444
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 356 GGGAGGATGATGCAAATAAAAATGGGGGCAAGTGGATCATTCGACTCCGGAAGGGCTTAGCTTCCCGCTGCTGG 429
Query 445 GAGAATCTCATTTTGGCCATGCTGGGGGAACAGTTCATGGTTGGGGAGGAGATCTGTGGGGCTGTGGTGTCTGT 518
|||||||||||..||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 430 GAGAATCTCATCCTGGCTATGCTCGGGGAGCAATTCATGGTTGGGGAGGAGATCTGCGGGGCTGTGGTCTCTGT 503
Query 519 CCGCTTTCAGGAAGACATTATTTCAATATGGAATAAGACTGCCAGTGACCAAGCAACCACAGCCCGAATCCGGG 592
||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 504 CCGCTTTCAGGAGGACATTATTTCTATATGGAATAAGACTGCCAGCGACCAAGCAACTACAGCCCGAATCCGGG 577
Query 593 ACACACTTCGGCGAGTGCTTAACCTACCTCCCAACACCATTATGGAATACAAAACTCACACCGACAGCATCAAA 666
|.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 578 ATACTCTTCGGCGCGTGCTTAACCTACCTCCCAACACCATTATGGAATACAAAACTCACACCGACAGCATCAAT 651
Query 667 ATGCC-AG-GCAGGCTGGGCCCCCAAAGGCTCCTTTTTCAAAACCTCTGGAAGCCGCGGTTGAATGTGCCG--- 735
.|.|| || ||| ||| |.||| |.||| ||.|||.| ||| |.|||| |||| |.|
Sbjct 652 TTCCCTAGAGCA-GCT---CACCC---GTCTC---TTGCAACA------GAA----CAGTTG-ATGT-CTGGTT 703
Query 736 ----------------------------------------- 735
Sbjct 704 GTGGAACTCTCAGTCGCTTGCTTCCAGCAGCCAGTAGCAGG 744