Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07422
Subject:
XM_006529674.3
Aligned Length:
781
Identities:
664
Gaps:
50

Alignment

Query   1  ATGAACAACAAGTTCGACGGTTTGAAAGATGATGACAGTGGGGACCATGATCAGAATGAAGAAAACAGCACACA  74
           |||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAACAACAAGTTCGACGCCTTAAAAGATGATGACAGTGGAGACCATGATCAGAATGAAGAAAACAGCACACA  74

Query  75  GAAAGATGGTGAGAAGGAAAAAACGGAACGAGACAAGAATCAGAGCAGTAGCAAGAGAAAGGCTGTTGTCCCTG  148
           ||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||..|||||||||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct  75  GAAAGATGGTGAGAAGGAAAAAACAGACCGAGACAAGAGCCAGAGCAGTGGCAAGAGGAAGGCTGTTGTCCCTG  148

Query 149  GACCGGCAGAGCATCCCCTGCAGTACAACTACACTTTTTGGTACTCCAGGAGAACCCCCGGCCGTCCCACGAGC  222
           ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 149  GACCAGCAGAGCATCCCCTGCAGTACAACTACACCTTTTGGTACTCGAGGAGAACCCCTGGCCGTCCCACCAGC  222

Query 223  TCACAGAGCTATGAACAGAATATCAAACAGATTGGCACCTTTGCCTCTGTGGAGCAGTTCTGGAGGTTTTATAG  296
           ||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||
Sbjct 223  TCGCAGAGCTATGAGCAGAACATCAAGCAGATTGGCACCTTTGCCTCTGTGGAGCAGTTCTGGAAGTTTTACAG  296

Query 297  CCACATGGTACGTCCTGGGGACCTGACAGGCCACAGTGACTTCCATCTCTTCAAAGAAGGAATTAAACCCATGT  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 297  CCACATGGTACGTCCTGGGGACCTGACAGGCCACAGTGACTTTCATCTCTTCAAAGAAGGGATTAAACCTATGT  370

Query 371  GGGAGGATGATGCAAATAAAAATGGTGGCAAGTGGATTATTCGGCTGCGGAAGGGCTTGGCCTCCCGTTGCTGG  444
           |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 371  GGGAGGATGATGCAAATAAAAATGGGGGCAAGTGGATCATTCGACTCCGGAAGGGCTTAGCTTCCCGCTGCTGG  444

Query 445  GAGAATCTCATTTTGGCCATGCTGGGGGAACAGTTCATGGTTGGGGAGGAGATCTGTGGGGCTGTGGTGTCTGT  518
           |||||||||||..||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 445  GAGAATCTCATCCTGGCTATGCTCGGGGAGCAATTCATGGTTGGGGAGGAGATCTGCGGGGCTGTGGTCTCTGT  518

Query 519  CCGCTTTCAGGAAGACATTATTTCAATATGGAATAAGACTGCCAGTGACCAAGCAACCACAGCCCGAATCCGGG  592
           ||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 519  CCGCTTTCAGGAGGACATTATTTCTATATGGAATAAGACTGCCAGCGACCAAGCAACTACAGCCCGAATCCGGG  592

Query 593  ACACACTTCGGCGAGTGCTTAACCTACCTCCCAACACCATTATGGAATACAAAACTCACACCGACAGCATCAA-  665
           |.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 593  ATACTCTTCGGCGCGTGCTTAACCTACCTCCCAACACCATTATGGAATACAAAACTCACACCGACAGCATCAAC  666

Query 666  AATGC----CAGGCAGGC-TGGGCCCCCAAA----GGCTCCTTTTTCAAAACCTCTGGAAG---------CCGC  721
           |.|||    ||||.|..| ||.| ..|||||    |.|||.|..||   ||||.||..|||         ||.|
Sbjct 667  ATTGCACCTCAGGGAACCATGAG-TTCCAAACTATGTCTCATGGTT---AACCCCTTAAAGGTCACCAGACCTC  736

Query 722  --GGTTGAATGTGCCG-------------------------  735
             |.||..|.||.||.                         
Sbjct 737  ATGCTTCTACGTTCCCGCTTGGCTCCGTGCACCAACAGATC  777