Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07427
- Subject:
- XM_005254795.5
- Aligned Length:
- 1662
- Identities:
- 1176
- Gaps:
- 483
Alignment
Query 1 ATGAGGAGGCCCCTAAGCAAGTGCGGAATGGAGCCGGGGGGCGGAGATGCCAGCCTCACTTTGCATGGTCTCCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAACCGCTCCCACGGCAAGATAAAGCTGCGAAAGAGAAAGTCTACCTTGTACTTCAACACCCAGGAGAAGAGCG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CCAGGCGCCGCGGGGATCTTCTTGGAGAAAATATTTATCTGCTCTTGTTTACCTTAGCTTTACGAATATTAAAC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TGCTTTTTAGTGCAGACAAGTTTTGTTCCAGATGAATACTGGCAGTCTCTTGAAGTTTCACATCACATGGTTTT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CAATTATGGTTATTTGACTTGGGAATGGACAGAGAGACTGAGGAGTTACACTTATCCCTTAATCTTTGCAAGCA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TTTACAAGATTCTTCATCTTTTAGGGAAAGATAGTGTTCAGTTGCTGATTTGGATTCCTAGACTTGCCCAAGCA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 CTTCTGTCTGCTGTAGCAGATGTGAGACTTTACTCATTAATGAAGCAACTAGAAAATCAGGAAGTGGCAAGATG 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------ATGAAGCAACTAGAAAATCAGGAAGTGGCAAGATG 35
Query 519 GGTGTTTTTTTGCCAGTTGTGCTCCTGGTTCACATGGTATTGCTGTACCAGAACCCTTACAAACACCATGGAAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 36 GGTGTTTTTTTGCCAGTTGTGCTCCTGGTTCACATGGTATTGCTGTACCAGAACCCTTACAAACACCATGGAAA 109
Query 593 CTGTTCTCACTATAATTGCTCTTTTCTACTATCCTTTGGAAGGTTCAAAGTCTATGAACAGTGTCAAATACTCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 110 CTGTTCTCACTATAATTGCTCTTTTCTACTATCCTTTGGAAGGTTCAAAGTCTATGAACAGTGTCAAATACTCA 183
Query 667 TCCCTGGTGGCACTTGCCTTCATAATTCGTCCCACAGCTGTCATTCTGTGGACACCTTTGCTCTTCAGACATTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 TCCCTGGTGGCACTTGCCTTCATAATTCGTCCCACAGCTGTCATTCTGTGGACACCTTTGCTCTTCAGACATTT 257
Query 741 CTGTCAAGAACCAAGAAAGCTTGATCTTATTCTACATCATTTTTTACCTGTAGGCTTTGTTACTTTGAGTTTGT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 258 CTGTCAAGAACCAAGAAAGCTTGATCTTATTCTACATCATTTTTTACCTGTAGGCTTTGTTACTTTGAGTTTGT 331
Query 815 CTCTGATGATTGATCGTATTTTTTTTGGCCAATGGACTCTGGTTCAATTTAATTTTTTGAAATTTAACGTGCTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 332 CTCTGATGATTGATCGTATTTTTTTTGGCCAATGGACTCTGGTTCAATTTAATTTTTTGAAATTTAACGTGCTG 405
Query 889 CAGAACTTGGGAACATTTTATGGTTCTCATCCATGGCACTGGTACTTCAGTCAAGGATTTCCAGTTATCTTGGG 962
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 406 CAGAACTGGGGAACATTTTATGGTTCTCATCCATGGCACTGGTACTTCAGTCAAGGATTTCCAGTTATCTTGGG 479
Query 963 TACTCACTTACCCTTCTTTATTCATGGCTGCTATCTAGCACCAAAGAGATACCGGATACTTTTGGTGACTGTGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 TACTCACTTACCCTTCTTTATTCATGGCTGCTATCTAGCACCAAAGAGATACCGGATACTTTTGGTGACTGTGC 553
Query 1037 TGTGGACACTGCTTGTTTATAGCATGTTGAGCCACAAAGAATTCAGGTTTATTTATCCAGTTTTACCATTCTGT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 554 TGTGGACACTGCTTGTTTATAGCATGTTGAGCCACAAAGAATTCAGGTTTATTTATCCAGTTTTACCATTCTGT 627
Query 1111 ATGGTGTTCTGTGGATACTCATTAACCCACCTGAAAACATGGAAGAAACCAGCTCTAAGTTTCCTGTTTTTATC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 628 ATGGTGTTCTGTGGATACTCATTAACCCACCTGAAAACATGGAAGAAACCAGCTCTAAGTTTCCTGTTTTTATC 701
Query 1185 AAATTTGTTCCTCGCCCTTTATACTGGTTTAGTTCATCAACGAGGTACTCTTGATGTCATGAGTCATATTCAAA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 702 AAATTTGTTCCTCGCCCTTTATACTGGTTTAGTTCATCAACGAGGTACTCTTGATGTCATGAGTCATATTCAAA 775
Query 1259 AAGTTTGTTACAACAATCCCAATAAATCTTCAGCTTCAATATTTATAATGATGCCTTGCCACTCTACTCCTTAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 776 AAGTTTGTTACAACAATCCCAATAAATCTTCAGCTTCAATATTTATAATGATGCCTTGCCACTCTACTCCTTAT 849
Query 1333 TACAGCCATGTTCACTGCCCACTTCCCATGAGATTTCTCCAGTGCCCGCCAGACCTGACTGGAAAAAGTCATTA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 850 TACAGCCATGTTCACTGCCCACTTCCCATGAGATTTCTCCAGTGCCCGCCAGACCTGACTGGAAAAAGTCATTA 923
Query 1407 TCTTGATGAAGCAGATGTATTTTACCTAAATCCCTTAAACTGGTCACATAGAGAGTTTCATGATGATGCATCAT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 924 TCTTGATGAAGCAGATGTATTTTACCTAAATCCCTTAAACTGGTTACATAGAGAGTTTCATGATGATGCATCAT 997
Query 1481 TGCCTACTCACTTGATCACCTTCAGCATTTTGGAAGAGGAAATAAGTGCTTTCCTAATTTCAAGCAATTATAAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 998 TGCCTACTCACTTGATCACCTTCAGCATTTTGGAAGAGGAAATAAGCGCTTTCCTAATTTCAAGCAATTATAAA 1071
Query 1555 AGAACTGCTGTTTTCTTCCACACTCACTTGCCAGAGGGTCGAATTGGAAGTCACATATATGTCTATGAACGGAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072 AGAACTGCTGTTTTCTTCCACACTCACTTGCCAGAGGGTCGAATTGGAAGTCACATATATGTCTATGAACGGAA 1145
Query 1629 GTTAAAAGGGAAATTCAACATGAAGATGAAATTC 1662
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146 GTTAAAAGGGAAATTCAACATGAAGATGAAATTC 1179
