Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07427
• Subject: XM_011522235.3
• Aligned Length: 1662
• Identities: 1613
• Gaps: 45

Alignment

Query    1  ATGAGGAGGCCCCTAAGCAAGTGCGGAATGGAGCCGGGGGGCGGAGATGCCAGCCTCACTTTGCATGGTCTCCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGAGGCCCCTAAGCAAGTGCGGAATGGAGCCGGGGGGCGGAGATGCCAGCCTCACTTTGCATGGTCTCCA  74

Query   75  GAACCGCTCCCACGGCAAGATAAAGCTGCGAAAGAGAAAGTCTACCTTGTACTTCAACACCCAGGAGAAGAGCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAACCGCTCCCACGGCAAGATAAAGCTGCGAAAGAGAAAGTCTACCTTGTACTTCAACACCCAGGAGAAGAGCG  148

Query  149  CCAGGCGCCGCGGGGATCTTCTTGGAGAAAATATTTATCTGCTCTTGTTTACCTTAGCTTTACGAATATTAAAC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAGGCGCCGCGGGGATCTTCTTGGAGAAAATATTTATCTGCTCTTGTTTACCATAGCTTTACGAATATTAAAC  222

Query  223  TGCTTTTTAGTGCAGACAAGTTTTGTTCCAGATGAATACTGGCAGTCTCTTGAAGTTTCACATCACATGGTTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGCTTTTTAGTGCAGACAAGTTTTGTTCCAGATGAATACTGGCAGTCTCTTGAAGTTTCACATCACATGGTTTT  296

Query  297  CAATTATGGTTATTTGACTTGGGAATGGACAGAGAGACTGAGGAGTTACACTTATCCCTTAATCTTTGCAAGCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAATTATGGTTATTTGACTTGGGAATGGACAGAGAGACTGAGGAGTTACACTTATCCCTTAATCTTTGCAAGCA  370

Query  371  TTTACAAGATTCTTCATCTTTTAGGGAAAGATAGTGTTCAGTTGCTGATTTGGATTCCTAGACTTGCCCAAGCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTTACAAGATTCTTCATCTTTTAGGGAAAGATAGTGTTCAGTTGCTGATTTGGATTCCTAGACTTGCCCAAGCA  444

Query  445  CTTCTGTCTGCTGTAGCAGATGTGAGACTTTACTCATTAATGAAGCAACTAGAAAATCAGGAAGTGGCAAGATG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTCTGTCTGCTGTAGCAGATGTGAGACTTTACTCATTAATGAAGCAACTAGAAAATCAGGAAGTGGCAAGATG  518

Query  519  GGTGTTTTTTTGCCAGTTGTGCTCCTGGTTCACATGGTATTGCTGTACCAGAACCCTTACAAACACCATGGAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGTGTTTTTTTGCCAGTTGTGCTCCTGGTTCACATGGTATTGCTGTACCAGAACCCTTACAAACACCATGGAAA  592

Query  593  CTGTTCTCACTATAATTGCTCTTTTCTACTATCCTTTGGAAGGTTCAAAGTCTATGAACAGTGTCAAATACTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGTTCTCACTATAATTGCTCTTTTCTACTATCCTTTGGAAGGTTCAAAGTCTATGAACAGTGTCAAATACTCA  666

Query  667  TCCCTGGTGGCACTTGCCTTCATAATTCGTCCCACAGCTGTCATTCTGTGGACACCTTTGCTCTTCAGACATTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCCTGGTGGCACTTGCCTTCATAATTCGTCCCACAGCTGTCATTCTGTGGACACCTTTGCTCTTCAGACATTT  740

Query  741  CTGTCAAGAACCAAGAAAGCTTGATCTTATTCTACATCATTTTTTACCTGTAGGCTTTGTTACTTTGAGTTTGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGTCAAGAACCAAGAAAGCTTGATCTTATTCTACATCATTTTTTACCTGTAGGCTTTGTTACTTTGAGTTTGT  814

Query  815  CTCTGATGATTGATCGTATTTTTTTTGGCCAATGGACTCTGGTTCAATTTAATTTTTTGAAATTTAACGTGCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct  815  CTCTGATGATTGATCGTATTTTTTTTGGCCAA------------------------------------------  846

Query  889  CAGAACTTGGGAACATTTTATGGTTCTCATCCATGGCACTGGTACTTCAGTCAAGGATTTCCAGTTATCTTGGG  962
               ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  847  ---AACTGGGGAACATTTTATGGTTCTCATCCATGGCACTGGTACTTCAGTCAAGGATTTCCAGTTATCTTGGG  917

Query  963  TACTCACTTACCCTTCTTTATTCATGGCTGCTATCTAGCACCAAAGAGATACCGGATACTTTTGGTGACTGTGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  918  TACTCACTTACCCTTCTTTATTCATGGCTGCTATCTAGCACCAAAGAGATACCGGATACTTTTGGTGACTGTGC  991

Query 1037  TGTGGACACTGCTTGTTTATAGCATGTTGAGCCACAAAGAATTCAGGTTTATTTATCCAGTTTTACCATTCTGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  992  TGTGGACACTGCTTGTTTATAGCATGTTGAGCCACAAAGAATTCAGGTTTATTTATCCAGTTTTACCATTCTGT  1065

Query 1111  ATGGTGTTCTGTGGATACTCATTAACCCACCTGAAAACATGGAAGAAACCAGCTCTAAGTTTCCTGTTTTTATC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1066  ATGGTGTTCTGTGGATACTCATTAACCCACCTGAAAACATGGAAGAAACCAGCTCTAAGTTTCCTGTTTTTATC  1139

Query 1185  AAATTTGTTCCTCGCCCTTTATACTGGTTTAGTTCATCAACGAGGTACTCTTGATGTCATGAGTCATATTCAAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140  AAATTTGTTCCTCGCCCTTTATACTGGTTTAGTTCATCAACGAGGTACTCTTGATGTCATGAGTCATATTCAAA  1213

Query 1259  AAGTTTGTTACAACAATCCCAATAAATCTTCAGCTTCAATATTTATAATGATGCCTTGCCACTCTACTCCTTAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1214  AAGTTTGTTACAACAATCCCAATAAATCTTCAGCTTCAATATTTATAATGATGCCTTGCCACTCTACTCCTTAT  1287

Query 1333  TACAGCCATGTTCACTGCCCACTTCCCATGAGATTTCTCCAGTGCCCGCCAGACCTGACTGGAAAAAGTCATTA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1288  TACAGCCATGTTCACTGCCCACTTCCCATGAGATTTCTCCAGTGCCCGCCAGACCTGACTGGAAAAAGTCATTA  1361

Query 1407  TCTTGATGAAGCAGATGTATTTTACCTAAATCCCTTAAACTGGTCACATAGAGAGTTTCATGATGATGCATCAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1362  TCTTGATGAAGCAGATGTATTTTACCTAAATCCCTTAAACTGGTTACATAGAGAGTTTCATGATGATGCATCAT  1435

Query 1481  TGCCTACTCACTTGATCACCTTCAGCATTTTGGAAGAGGAAATAAGTGCTTTCCTAATTTCAAGCAATTATAAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1436  TGCCTACTCACTTGATCACCTTCAGCATTTTGGAAGAGGAAATAAGCGCTTTCCTAATTTCAAGCAATTATAAA  1509

Query 1555  AGAACTGCTGTTTTCTTCCACACTCACTTGCCAGAGGGTCGAATTGGAAGTCACATATATGTCTATGAACGGAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1510  AGAACTGCTGTTTTCTTCCACACTCACTTGCCAGAGGGTCGAATTGGAAGTCACATATATGTCTATGAACGGAA  1583

Query 1629  GTTAAAAGGGAAATTCAACATGAAGATGAAATTC  1662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1584  GTTAAAAGGGAAATTCAACATGAAGATGAAATTC  1617