Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07467
• Subject: XM_017021836.1
• Aligned Length: 1749
• Identities: 1699
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  ATGACTTTCTATTTGTTTGGTATTCGAAGCTTTCCGAAGCTTTGGAAGAGCCCATACCTTGGGCTAGGCCCAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACTTTCTATTTGTTTGGTATTCGAAGCTTTCCGAAGCTTTGGAAGAGCCCATACCTTGGGCTAGGCCCAGG  74

Query   75  GCACTCTTATGTGTCGCTGTTTCTGGCAGACCGCTGTGGCATCAGGAACCAGCAGAGGTTGTTTTCTCTTAAAA  148
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCACTCTTATGTCTCGCTGTTTCTGGCAGACCGCTGTGGCATCAGGAACCAGCAGAGGTTGTTTTCTCTTAAAA  148

Query  149  CAATGTCTCCACAGAATACCAAAGCAACGAATCTGATTGCCAAGGCCAGATATCTCAGGAAAGATGAGGGCAGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAATGTCTCCACAGAATACCAAAGCAACGAATCTGATTGCCAAGGCCAGATATCTCAGGAAAGATGAGGGCAGT  222

Query  223  AATAAGCAAGTTTATTCTGTTCCTCATTTTTTTTTAGCTGGAGCAGCTAAGGAGAGATCACAGATGAATTCTCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATAAGCAAGTTTATTCTGTTCCTCATTTTTTTTTAGCTGGAGCAGCTAAGGAGAGATCACAGATGAATTCTCA  296

Query  297  AACTGAAGATCATGCCTTGGCACCTGTGAGGAACACTATTCAACTCCCAACACAACCTTTGAATTCAGAGGAGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACTGAAGATCATGCCTTGGCACCTGTGAGGAACACTATTCAACTCCCAACACAACCTTTGAATTCAGAGGAGT  370

Query  371  GGGATAAACTTAAGGAAGATTTAAAAGAAAACACCGGAAAGACCAGTTTCGAAAGTTGGATCATTTCACAGATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGATAAACTTAAGGAAGATTTAAAAGAAAACACCGGAAAGACCAGTTTCGAAAGTTGGATCATTTCACAGATG  444

Query  445  GCTGGCTGTCATAGCTCTATAGATGTGGCTAAATCTCTGCTGGCATGGGTAGCAGCCAAAAATAATGGTATTGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTGGCTGTCATAGCTCTATAGATGTGGCTAAATCTCTGCTGGCATGGGTAGCAGCCAAAAATAATGGTATTGT  518

Query  519  AAGTTACGATTTACTGGTCAAGTATTTGTATCTCTGTGTCTTTCATATGCAGACATCTGAAGTTATTGATGTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGTTACGATTTACTGGTCAAGTATTTGTATCTCTGTGTCTTTCATATGCAGACATCTGAAGTTATTGATGTCT  592

Query  593  TTGAAATTATGAAAGCCAGATATAAGACTTTAGAACCTAGAGGTTACAGTCTTCTCATCCGGGGATTGATCCAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGAAATTATGAAAGCCAGATATAAGACTTTAGAACCTAGAGGTTACAGTCTTCTCATCCGGGGATTGATCCAT  666

Query  667  TCAGACAGATGGAGAGAAGCATTGTTGCTGTTAGAGGACATCAAAAAAGTTATAACTCCTTCAAAAAAGAACTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCAGACAGATGGAGAGAAGCATTGTTGCTGTTAGAGGACATCAAAAAAGTTATAACTCCTTCAAAAAAGAACTA  740

Query  741  TAATGACTGTATCCAGGGAGCTCTCCTTCATCAAGATGTAAACACAGCTTGGAATTTATATCAGGAATTGCTAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAATGACTGTATCCAGGGAGCTCTCCTTCATCAAGATGTAAACACAGCTTGGAATTTATATCAGGAATTGCTAG  814

Query  815  GTCATGATATTGTTCCTATGTTGGAAACTTTAAAAGCTTTCTTTGATTTTGGAAAAGACATAAAGGATGATAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTCATGATATTGTTCCTATGTTGGAAACTTTAAAAGCTTTCTTTGATTTTGGAAAAGACATAAAGGATGATAAC  888

Query  889  TATTCAAATAAACTACTAGATATTCTTTCATATCTAAGAAATAATCAGCTGTATCCAGGGGAGTCATTTGCACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TATTCAAATAAACTACTAGATATTCTTTCATATCTAAGAAATAATCAGCTGTATCCAGGGGAGTCATTTGCACA  962

Query  963  CAGTATAAAAACATGGTTTGAGAGTGTTCCTGGAAAACAATGGAAAGGACAATTCACCACAGTCCGAAAAAGTG  1036
            ||||||||||||||||||||||                                                ||||
Sbjct  963  CAGTATAAAAACATGGTTTGAG------------------------------------------------AGTG  988

Query 1037  GCCAGTGTTCGGGCTGTGGAAAAACCATAGAGTCTATTCAGCTGAGTCCAGAAGAATATGAATGTCTTAAGGGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  989  GCCAGTGTTCGGGCTGTGGAAAAACCATAGAGTCTATTCAGCTGAGTCCAGAAGAATATGAATGTCTTAAGGGA  1062

Query 1111  AAAATCATGAGGGATGTGATAGATGGAGGTGACCAGTACAGAAAGACAACACCTCAGGAACTTAAGAGATTTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063  AAAATCATGAGGGATGTGATAGATGGAGGTGACCAGTACAGAAAGACAACACCTCAGGAACTTAAGAGATTTGA  1136

Query 1185  GAACTTCATAAAATCTCGTCCTCCTTTTGATGTTGTCATTGATGGTCTCAATGTTGCCAAAATGTTTCCTAAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137  GAACTTCATAAAATCTCGTCCTCCTTTTGATGTTGTCATTGATGGTCTCAATGTTGCCAAAATGTTTCCTAAAG  1210

Query 1259  TTCGTGAATCTCAACTTCTCTTGAATGTCGTCTCTCAACTAGCCAAACGGAATCTGCGACTGCTGGTCCTAGGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211  TTCGTGAATCTCAACTTCTCTTGAATGTCGTCTCTCAACTAGCCAAACGGAATCTGCGACTGCTGGTCCTAGGC  1284

Query 1333  CGGAAGCACATGCTAAGACGGAGTTCCCAGTGGAGTCGGGATGAGATGGAAGAGGTGCAAAAGCAAGCCAGCTG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285  CGGAAGCACATGCTAAGACGGAGTTCCCAGTGGAGTCGGGATGAGATGGAAGAGGTGCAAAAGCAAGCCAGCTG  1358

Query 1407  TTTTTTTGCTGATGACATCTCGGAGGATGATCCATTCCTTCTGTATGCCACACTGCACTCCGGGAATCACTGCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1359  TTTTTTTGCTGATGACATCTCGGAGGATGATCCATTCCTTCTGTATGCCACACTGCACTCCGGGAATCACTGCA  1432

Query 1481  GGTTTATCACAAGAGACCTGATGCGGGACCACAAGGCCTGTCTGCCTGATGCCAAGACCCAACGCCTGTTTTTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433  GGTTTATCACAAGAGACCTGATGCGGGACCACAAGGCCTGTCTGCCTGATGCCAAGACCCAACGCCTGTTTTTT  1506

Query 1555  AAGTGGCAGCAGGGACATCAGCTGGCAATTGTAAATAGGTTTCCAGGATCAAAACTAACCTTTCAGCGTATTCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1507  AAGTGGCAGCAGGGACATCAGCTGGCAATTGTAAATAGGTTTCCAGGATCAAAACTAACCTTTCAGCGTATTCT  1580

Query 1629  CAGCTATGACACAGTGGTGCAAACAACTGGAGACTCGTGGCACATACCATATGATGAAGACTTGGTAGAAAGAT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581  CAGCTATGACACAGTGGTGCAAACAACTGGAGACTCGTGGCACATACCATATGATGAAGACTTGGTAGAAAGAT  1654

Query 1703  GTTCCTGTGAAGTACCAACCAAATGGCTTTGCCTCCACCAANAGACA  1749
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1655  GTTCCTGTGAAGTACCAACCAAATGGCTTTGCCTCCACCAAAAGACA  1701