Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07480
• Subject: NM_001100165.2
• Aligned Length: 1935
• Identities: 1660
• Gaps: 273

Alignment

Query    1  ATG--------------GACAACGC-------------------CGTTGACGGACTGGACAAAGCTTCTATAGC  41
            |||              |.|.||||                   ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCCAGACCTCGGTGTCCACGCTGTCCCCGCAGCCCGGCAGCGTTGACGGACTGGACAAAGCTTCTATAGC  74

Query   42  AAACTCAGATGGCCCCACAGCAGGTTCCCAAACACCTCCCTTCAAAAGAAAGGGGAAACTATCCACCATTGGTA  115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAACTCAGATGGCCCCACAGCAGGTTCCCAAACACCTCCCTTCAAAAGAAAGGGGAAACTATCCACCATTGGTA  148

Query  116  AAATCTTTAAGCCTTGGAAATGGAGGAAAAAGAAGACCAGCGACAAATTTAGAGAAACCTCGGCAGTATTAGAA  189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAATCTTTAAGCCTTGGAAATGGAGGAAAAAGAAGACCAGCGACAAATTTAGAGAAACCTCGGCAGTATTAGAA  222

Query  190  AGGAAGATATCCACACGACAAAGTAGAGAGGAGCTGATAAGAAGGGGAGTGCTTAAGGAATTGCCTGATCAAGA  263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGGAAGATATCCACACGACAAAGTAGAGAGGAGCTGATAAGAAGGGGAGTGCTTAAGGAATTGCCTGATCAAGA  296

Query  264  TGGAGATGTAACAGTTAACTTTGAAAATTCAAACGGGCACATGATACCCATCGGAGAGGAATCTACCCGAGAGG  337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGAGATGTAACAGTTAACTTTGAAAATTCAAACGGGCACATGATACCCATCGGAGAGGAATCTACCCGAGAGG  370

Query  338  AAAATGTAGTAAAGTCTGAAGAAGGTAATGGCTCTGTATCTGAAAAAACACCACCTCTGGAGGAACAGGCAGAA  411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAATGTAGTAAAGTCTGAAGAAGGTAATGGCTCTGTATCTGAAAAAACACCACCTCTGGAGGAACAGGCAGAA  444

Query  412  GATAAGAAAGAGAACACTGAAAACCACTCTGAAACACCGGCAGCTCCTGCTCTACCTCCTTCTGCTCCTCCTAA  485
            |||||||||                                                                 
Sbjct  445  GATAAGAAA-----------------------------------------------------------------  453

Query  486  GCCTAGACCCAAACCTAAACCCAAAAAATCACCTGTGCCTCCGAAAGGGGCCACTGCTGGGGCCAGCCACAAAG  559
                                                                                      
Sbjct  454  --------------------------------------------------------------------------  453

Query  560  GTGATGAAGTGCCTCCCATTAAAAAAAATATCAAGGCTCCTGGTAAGCAGGCCCCCGTCCCTCCACCCAAGCCA  633
                                                                                      
Sbjct  454  --------------------------------------------------------------------------  453

Query  634  GCAAGCCGAAACACGACCCGAGAGGCTGCTGGCTCCTCTCATTCAAAAAAAACAACTGGCTCTAAAGCATCAGC  707
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  454  ---------------------------GCTGGCTCCTCTCATTCAAAAAAAACAACTGGCTCTAAAGCATCAGC  500

Query  708  TTCGCCATCCACTTCATCCACCTCATCTCGTCCCAAAGCTTCAAAGGAGACAGTTTCTAGCAAAGCAGGGACAG  781
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  501  TTCGCCATCCACTTCATCCACCTCATCTCGTCCCAAAGCTTCAAAGGAGACAGTTTCTAGCAAAGCAGGGACAG  574

Query  782  TGGGGACCACCAAGGGCAAGAGAAAAACTGACAAGCAGCCAATAACTTCTCACCTGTCCTCAGACACAACAACT  855
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  575  TGGGGACCACCAAGGGCAAGAGAAAAACTGACAAGCAGCCAATAACTTCTCACCTGTCCTCAGACACAACAACT  648

Query  856  TCTGGCACATCCGACCTGAAAGGAGAGCCTGCAGAGACCAGAGTGGAGAGTTTCAAACTCGAACAGACTGTCCC  929
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  649  TCTGGCACATCCGACCTGAAAGGAGAGCCTGCAGAGACCAGAGTGGAGAGTTTCAAACTCGAACAGACTGTCCC  722

Query  930  TGGAGCTGAGGAGCAGAACACAGGCAAATTCAAGTCCATGGTCCCTCCACCCCCTGTGGCTCCAGCACCTTCTC  1003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  723  TGGAGCTGAGGAGCAGAACACAGGCAAATTCAAGTCCATGGTCCCTCCACCCCCTGTGGCTCCAGCACCTTCTC  796

Query 1004  CTCTGGCCCCCCCTCTCCCTCTTGAGGATCAGTGCATTACTGCCTCAGACACTCCAGTTGTCCTCGTCAGCGTT  1077
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  797  CTCTGGCCCCCCCTCTCCCTCTTGAGGATCAGTGCATTACTGCCTCAGACACTCCAGTTGTCCTCGTCAGCGTT  870

Query 1078  GGAGCTGACCTGCCCGTCTCTGCCTTAGACCCAAGTCAGCTTCTTTGGGCTGAAGAGCCGACGAACAGAACCAC  1151
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  871  GGAGCTGACCTGCCCGTCTCTGCCTTAGACCCAAGTCAGCTTCTTTGGGCTGAAGAGCCGACGAACAGAACCAC  944

Query 1152  TCTCTACTCAGGCACTGGCTTAAGTGTTAACAGAGAAAATGCAAAATGTTTCACAACCAAAGAGGAGCTGGGGA  1225
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  945  TCTCTACTCAGGCACTGGCTTAAGTGTTAACAGAGAAAATGCAAAATGTTTCACAACCAAAGAGGAGCTGGGGA  1018

Query 1226  AGACAGTGCCTCAGCTACTGACTCCTGGGCTGATGGGCGAATCTTCAGAATCCTTTAGTGCCTCAGAAGATGAA  1299
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019  AGACAGTGCCTCAGCTACTGACTCCTGGGCTGATGGGCGAATCTTCAGAATCCTTTAGTGCCTCAGAAGATGAA  1092

Query 1300  GGCCACAGGGAATACCAAGCCAATGACTCTGACTCGGACGGGCCTATCTTGTACACCGATGATGAGGACGAAGA  1373
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093  GGCCACAGGGAATACCAAGCCAATGACTCTGACTCGGACGGGCCTATCTTGTACACCGATGATGAGGACGAAGA  1166

Query 1374  CGAAGATGAGGATGGCAGTGGAGAAAGTGCTTTGGCAAGTAAAATACGCCGGAGGGATACTCTTGCTATCAAAC  1447
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1167  CGAAGATGAGGATGGCAGTGGAGAAAGTGCTTTGGCAAGTAAAATACGCCGGAGGGATACTCTTGCTATCAAAC  1240

Query 1448  TTGGCAACAGACCATCTAAGAAAGAACTAGAGGACAAAAACATCTTGCAGCGTACATCTGAAGAAGAGAGGCAG  1521
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1241  TTGGCAACAGACCATCTAAGAAAGAACTAGAGGACAAAAACATCTTGCAGCGTACATCTGAAGAAGAGAGGCAG  1314

Query 1522  GAAATCCGACAACAAATTGGAACCAAGTTAGTCAGGAGGCTGAGCCAGAGGCCCACAACTGAAGAATTAGAGCA  1595
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315  GAAATCCGACAACAAATTGGAACCAAGTTAGTCAGGAGGCTGAGCCAGAGGCCCACAACTGAAGAATTAGAGCA  1388

Query 1596  AAGAAACATCCTAAAACAAAAGAATGAAGAAGAGGAACAAGAAGCAAAAATGGAACTTAAACGCAGACTCAGCA  1669
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1389  AAGAAACATCCTAAAACAAAAGAATGAAGAAGAGGAACAAGAAGCAAAAATGGAACTTAAACGCAGACTCAGCA  1462

Query 1670  GAAAGCTCAGCCTGAGACCCACAGTGGCAGAGCTACAAGCTCGAAGGATCCTGCGATTTAACGAGTATGTAGAA  1743
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1463  GAAAGCTCAGCCTGAGACCCACAGTGGCAGAGCTACAAGCTCGAAGGATCCTGCGATTTAACGAGTATGTAGAA  1536

Query 1744  GTCACGGATTCTCCTGACTATGACCGCCGAGCAGACAAGCCCTGGGCCAGGTTAACACCTGCAGACAAGGCAGC  1817
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1537  GTCACGGATTCTCCTGACTATGACCGCCGAGCAGACAAGCCCTGGGCCAGGTTAACACCTGCAGACAAGGCAGC  1610

Query 1818  AATAAGGAAAGAACTAAATGAATTTAAAAGCACAGAAATGGAAGTTCATGAAGAGAGTCGACAGTTTACAAGGT  1891
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1611  AATAAGGAAAGAACTAAATGAATTTAAAAGCACAGAAATGGAAGTTCATGAAGAGAGTCGACAGTTTACAAGGT  1684

Query 1892  TTCATCGTCCA  1902
            |||||||||||
Sbjct 1685  TTCATCGTCCA  1695