Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07503
• Subject: XM_011540428.1
• Aligned Length: 2090
• Identities: 1585
• Gaps: 502

Alignment

Query    1  ATGGACGCTGACATGGACTACGAAAGACCCAACGTTGAAACTATCAAATGTGTGGTCGTGGGTGACAATGCCGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGCTGACATGGACTACGAAAGACCCAACGTTGAAACTATCAAATGTGTGGTCGTGGGTGACAATGCCGT  74

Query   75  GGGGAAGACGCGCTTGATCTGTGCCAGGGCGTGCAACACCACACTCACGCAGTATCAGCTGCTGGCCACCCACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGGAAGACGCGCTTGATCTGTGCCAGGGCGTGCAACACCACACTCACGCAGTATCAGCTGCTGGCCACCCACG  148

Query  149  TGCCAACAGTGTGGGCGATTGACCAGTACCGCGTGTGCCAGGAGGTCTTGGAGCGTTCTCGGGATGTTGTTGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCCAACAGTGTGGGCGATTGACCAGTACCGCGTGTGCCAGGAGGTCTTGGAGCGTTCTCGGGATGTTGTTGAT  222

Query  223  GAAGTGAGTGTTTCTCTCAGGCTTTGGGATACTTTTGGTGATCATCACAAAGACAGACGCTTTGCATATGGCAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGTGAGTGTTTCTCTCAGGCTTTGGGATACTTTTGGTGATCATCACAAAGACAGACGCTTTGCATATGGCAG  296

Query  297  GTCTGATGTTGTGGTCCTCTGTTTTTCGATTGCTAATCCCAATTCCCTAAATCATGTGAAAAGCATGTGGTATC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTCTGATGTTGTGGTCCTCTGTTTTTCGATTGCTAATCCCAATTCCCTAAATCATGTGAAAAGCATGTGGTATC  370

Query  371  CAGAAATCAAGCACTTTTGCCCTCGAACACCCGTTATCCTTGTTGGGTGCCAGCTTGATCTCCGCTATGCCGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGAAATCAAGCACTTTTGCCCTCGAACACCCGTTATCCTTGTTGGGTGCCAGCTTGATCTCCGCTATGCCGAC  444

Query  445  CTGGAAGCTGTTAATCGAGCCAGGCGCCCGTTAGCAAGGCCCATAAAGAGAGGGGATATTTTGCCCCCAGAAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGAAGCTGTTAATCGAGCCAGGCGCCCGTTAGCAAGGCCCATAAAGAGAGGGGATATTTTGCCCCCAGAAAA  518

Query  519  AGGCCGAGAGGTAGCAAAGGAACTTGGCTTACCATACTATGAAACAAGCGTGTTTGACCAGTTTGGTATCAAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGCCGAGAGGTAGCAAAGGAACTTGGCTTACCATACTATGAAACAAGCGTGTTTGACCAGTTTGGTATCAAGG  592

Query  593  ATGTGTTTGACAATGCAATCCGAGCAGCGCTGATTTCCCGCAGGCACCTGCAATTCTGGAAATCCCACCTAAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGTGTTTGACAATGCAATCCGAGCAGCGCTGATTTCCCGCAGGCACCTGCAATTCTGGAAATCCCACCTAAAG  666

Query  667  AAAGTCCAGAAACCTTTACTTCAGGCACCCTTCCTACCTCCAAAAGCCCCTCCACCGGTCATCAAAATTCCAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAGTCCAGAAACCTTTACTTCAGGCACCCTTCCTACCTCCAAAAGCCCCTCCACCGGTCATCAAAATTCCAGA  740

Query  741  GTGTCCTTCCATGGGGACAAATGAAGCTGCCTGTTTACTGGACAATCCTCTATGTGCCGATGTTCTGTTCATCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTGTCCTTCCATGGGGACAAATGAAGCTGCCTGTTTACTGGACAATCCTCTATGTGCCGATGTTCTGTTCATCC  814

Query  815  TTCAGGACCAGGAACACATCTTTGCACATCGAATTTACCTCGCTACCTCTTCTTCCAAATTTTATGATCTGTTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCAGGACCAGGAACACATCTTTGCACATCGAATTTACCTCGCTACCTCTTCTTCCAAATTTTATGATCTGTTT  888

Query  889  TTAATGGAATGTGAAGAATCCCCAAACGGGAGTGAAGGAGCCTGTGAGAAAGAGAAGCAGAGCAGAGATTTCCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTAATGGAATGTGAAGAATCCCCAAATGGGAGTGAAGGAGCCTGTGAGAAAGAGAAGCAGAGCAGAGATTTCCA  962

Query  963  GGGGCGGATATTGAGTGTCGACCCAGAGGAAGAAAGGGAGGAGGGCCCGCCTAGGATTCCTCAGGCCGACCAGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGGGCGGATATTGAGTGTCGACCCAGAGGAAGAAAGGGAGGAGGGCCCGCCTAGGATTCCTCAGGCCGACCAGT  1036

Query 1037  GGAAGTCTTCAAACAAGAGCCTGGTGGAGGCTCTGGGGCTGGAAGCCGAGGGTGCAGTTCCTGAGACACAGACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGAAGTCTTCAAACAAGAGCCTGGTGGAGGCTCTGGGGCTGGAAGCCGAGGGTGCAGTTCCTGAGACACAGACT  1110

Query 1111  TTGACCGGATGGAGTAAGGGGTTCATTGGCATGCACAGGGAAATGCAAGTCAACCCCATTTCAAAGCGGATGGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTGACCGGATGGAGTAAGGGGTTCATTGGCATGCACAGGGAAATGCAAGTCAACCCCATTTCAAAGCGGATGGG  1184

Query 1185  GCCCATGACTGTGGTCAGGATGGACGCTTCAGTCCAGCCAGGCCCTTTTCGGACCCTGCTCCAGTTTCTTTATA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCCATGACTGTGGTCAGGATGGACGCTTCAGTCCAGCCAGGCCCTTTTCGGACCCTGCTCCAGTTTCTTTATA  1258

Query 1259  CGGGACAACTGGATGAAAAGGAAAAGGATTTGGTGGGCCTGGCTCAGATCGCAGAGGTCCTCGAGATGTTCGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGGGACAACTGGATGAAAAGGAAAAGGATTTGGTGGGCCTGGCTCAGATCGCAGAGGTCCTCGAGATGTTCGAT  1332

Query 1333  TTGAGGATGATGGTGGAAAACATCATGAACAAGGAAGCCTTCATGAACCAGGAGATTACGAAAGCCTTTCACGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTGAGGATGATGGTGGAAAACATCATGAACAAGGAAGCCTTCATGAACCAGGAGATTACGAAAGCCTTTCACGT  1406

Query 1407  AAGGAAAGCCAATCGGATAAAAGAGTGTCTCAGCAAGGGAACGTTCTCGGACGTGACATTTAAATTGGACGATG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAGGAAAGCCAATCGGATAAAAGAGTGTCTCAGCAAGGGAACGTTCTCGGACGTGACATTTAAATTGGACGATG  1480

Query 1481  GAGCCATCAGTGCCCACAAGCCGCTGCTGATCTGTAGCTGTGAGTGGATGGCAGCCATGTTCGGGGGGTCATTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GAGCCATCAGTGCCCACAAGCCGCTGCTGATCTGTAGCTGTGAGTGGATGGCAGCCATGTTCGGGGGGTCATTT  1554

Query 1555  GTGGAAAGTGCCAACAGTGAGGTGTATC--TCCCGAACATAAACAAGATATCAATGCAAGCAGTATTGGATTAT  1626
            |||||||||||||||||||||    |.|  |||                 || ||.||                
Sbjct 1555  GTGGAAAGTGCCAACAGTGAG----AGCCGTCC-----------------TC-ATCCA----------------  1590

Query 1627  CTCTATACCAAGCAGTTGTCTCCTAACTTGGATCTGGACCCGCTGGAATTAATTGCCTTGGCAAACAGATTTTG  1700
                                                                                      
Sbjct 1591  --------------------------------------------------------------------------  1590

Query 1701  CCTGCCACACTTGGTTGCACTTGCAGAACAGCATGCCGTTCAGGAGTTGACCAAAGCCGCCACGAGTGGCGTGG  1774
                                                                                      
Sbjct 1591  --------------------------------------------------------------------------  1590

Query 1775  GCATTGACGGAGAAGTGCTCTCTTACTTGGAATTGGCTCAGTTTCACAATGCCCACCAGTTGGCCGCCTGGTGT  1848
                                                                                      
Sbjct 1591  --------------------------------------------------------------------------  1590

Query 1849  TTGCACCACATCTGCACCAACTACAACAGTGTATGCTCCAAGTTCCGTAAGGAAATCAAATCAAAATCTGCAGA  1922
                                                                                      
Sbjct 1591  --------------------------------------------------------------------------  1590

Query 1923  CAACCAGGAATACTTCGAGCGGCACCGCTGGCCCCCTGTGTGGTACCTGAAGGAAGAAGATCACTACCAGCGTG  1996
                                                                                      
Sbjct 1591  --------------------------------------------------------------------------  1590

Query 1997  TGAAAAGGGAACGAGAGAAGGAAGATATTGCACTAAATAAGCATCGCTCAAGACGAAAGTGGTGCTTCTGGAAT  2070
                                                                                      
Sbjct 1591  --------------------------------------------------------------------------  1590

Query 2071  TCATCTCCAGCAGTGGCC  2088
                              
Sbjct 1591  ------------------  1590