Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07503
• Subject: XM_024448272.1
• Aligned Length: 2088
• Identities: 2087
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGACGCTGACATGGACTACGAAAGACCCAACGTTGAAACTATCAAATGTGTGGTCGTGGGTGACAATGCCGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGCTGACATGGACTACGAAAGACCCAACGTTGAAACTATCAAATGTGTGGTCGTGGGTGACAATGCCGT  74

Query   75  GGGGAAGACGCGCTTGATCTGTGCCAGGGCGTGCAACACCACACTCACGCAGTATCAGCTGCTGGCCACCCACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGGAAGACGCGCTTGATCTGTGCCAGGGCGTGCAACACCACACTCACGCAGTATCAGCTGCTGGCCACCCACG  148

Query  149  TGCCAACAGTGTGGGCGATTGACCAGTACCGCGTGTGCCAGGAGGTCTTGGAGCGTTCTCGGGATGTTGTTGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCCAACAGTGTGGGCGATTGACCAGTACCGCGTGTGCCAGGAGGTCTTGGAGCGTTCTCGGGATGTTGTTGAT  222

Query  223  GAAGTGAGTGTTTCTCTCAGGCTTTGGGATACTTTTGGTGATCATCACAAAGACAGACGCTTTGCATATGGCAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGTGAGTGTTTCTCTCAGGCTTTGGGATACTTTTGGTGATCATCACAAAGACAGACGCTTTGCATATGGCAG  296

Query  297  GTCTGATGTTGTGGTCCTCTGTTTTTCGATTGCTAATCCCAATTCCCTAAATCATGTGAAAAGCATGTGGTATC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTCTGATGTTGTGGTCCTCTGTTTTTCGATTGCTAATCCCAATTCCCTAAATCATGTGAAAAGCATGTGGTATC  370

Query  371  CAGAAATCAAGCACTTTTGCCCTCGAACACCCGTTATCCTTGTTGGGTGCCAGCTTGATCTCCGCTATGCCGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGAAATCAAGCACTTTTGCCCTCGAACACCCGTTATCCTTGTTGGGTGCCAGCTTGATCTCCGCTATGCCGAC  444

Query  445  CTGGAAGCTGTTAATCGAGCCAGGCGCCCGTTAGCAAGGCCCATAAAGAGAGGGGATATTTTGCCCCCAGAAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGAAGCTGTTAATCGAGCCAGGCGCCCGTTAGCAAGGCCCATAAAGAGAGGGGATATTTTGCCCCCAGAAAA  518

Query  519  AGGCCGAGAGGTAGCAAAGGAACTTGGCTTACCATACTATGAAACAAGCGTGTTTGACCAGTTTGGTATCAAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGCCGAGAGGTAGCAAAGGAACTTGGCTTACCATACTATGAAACAAGCGTGTTTGACCAGTTTGGTATCAAGG  592

Query  593  ATGTGTTTGACAATGCAATCCGAGCAGCGCTGATTTCCCGCAGGCACCTGCAATTCTGGAAATCCCACCTAAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGTGTTTGACAATGCAATCCGAGCAGCGCTGATTTCCCGCAGGCACCTGCAATTCTGGAAATCCCACCTAAAG  666

Query  667  AAAGTCCAGAAACCTTTACTTCAGGCACCCTTCCTACCTCCAAAAGCCCCTCCACCGGTCATCAAAATTCCAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAGTCCAGAAACCTTTACTTCAGGCACCCTTCCTACCTCCAAAAGCCCCTCCACCGGTCATCAAAATTCCAGA  740

Query  741  GTGTCCTTCCATGGGGACAAATGAAGCTGCCTGTTTACTGGACAATCCTCTATGTGCCGATGTTCTGTTCATCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTGTCCTTCCATGGGGACAAATGAAGCTGCCTGTTTACTGGACAATCCTCTATGTGCCGATGTTCTGTTCATCC  814

Query  815  TTCAGGACCAGGAACACATCTTTGCACATCGAATTTACCTCGCTACCTCTTCTTCCAAATTTTATGATCTGTTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCAGGACCAGGAACACATCTTTGCACATCGAATTTACCTCGCTACCTCTTCTTCCAAATTTTATGATCTGTTT  888

Query  889  TTAATGGAATGTGAAGAATCCCCAAACGGGAGTGAAGGAGCCTGTGAGAAAGAGAAGCAGAGCAGAGATTTCCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTAATGGAATGTGAAGAATCCCCAAATGGGAGTGAAGGAGCCTGTGAGAAAGAGAAGCAGAGCAGAGATTTCCA  962

Query  963  GGGGCGGATATTGAGTGTCGACCCAGAGGAAGAAAGGGAGGAGGGCCCGCCTAGGATTCCTCAGGCCGACCAGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGGGCGGATATTGAGTGTCGACCCAGAGGAAGAAAGGGAGGAGGGCCCGCCTAGGATTCCTCAGGCCGACCAGT  1036

Query 1037  GGAAGTCTTCAAACAAGAGCCTGGTGGAGGCTCTGGGGCTGGAAGCCGAGGGTGCAGTTCCTGAGACACAGACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGAAGTCTTCAAACAAGAGCCTGGTGGAGGCTCTGGGGCTGGAAGCCGAGGGTGCAGTTCCTGAGACACAGACT  1110

Query 1111  TTGACCGGATGGAGTAAGGGGTTCATTGGCATGCACAGGGAAATGCAAGTCAACCCCATTTCAAAGCGGATGGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTGACCGGATGGAGTAAGGGGTTCATTGGCATGCACAGGGAAATGCAAGTCAACCCCATTTCAAAGCGGATGGG  1184

Query 1185  GCCCATGACTGTGGTCAGGATGGACGCTTCAGTCCAGCCAGGCCCTTTTCGGACCCTGCTCCAGTTTCTTTATA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCCATGACTGTGGTCAGGATGGACGCTTCAGTCCAGCCAGGCCCTTTTCGGACCCTGCTCCAGTTTCTTTATA  1258

Query 1259  CGGGACAACTGGATGAAAAGGAAAAGGATTTGGTGGGCCTGGCTCAGATCGCAGAGGTCCTCGAGATGTTCGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGGGACAACTGGATGAAAAGGAAAAGGATTTGGTGGGCCTGGCTCAGATCGCAGAGGTCCTCGAGATGTTCGAT  1332

Query 1333  TTGAGGATGATGGTGGAAAACATCATGAACAAGGAAGCCTTCATGAACCAGGAGATTACGAAAGCCTTTCACGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTGAGGATGATGGTGGAAAACATCATGAACAAGGAAGCCTTCATGAACCAGGAGATTACGAAAGCCTTTCACGT  1406

Query 1407  AAGGAAAGCCAATCGGATAAAAGAGTGTCTCAGCAAGGGAACGTTCTCGGACGTGACATTTAAATTGGACGATG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAGGAAAGCCAATCGGATAAAAGAGTGTCTCAGCAAGGGAACGTTCTCGGACGTGACATTTAAATTGGACGATG  1480

Query 1481  GAGCCATCAGTGCCCACAAGCCGCTGCTGATCTGTAGCTGTGAGTGGATGGCAGCCATGTTCGGGGGGTCATTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GAGCCATCAGTGCCCACAAGCCGCTGCTGATCTGTAGCTGTGAGTGGATGGCAGCCATGTTCGGGGGGTCATTT  1554

Query 1555  GTGGAAAGTGCCAACAGTGAGGTGTATCTCCCGAACATAAACAAGATATCAATGCAAGCAGTATTGGATTATCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTGGAAAGTGCCAACAGTGAGGTGTATCTCCCGAACATAAACAAGATATCAATGCAAGCAGTATTGGATTATCT  1628

Query 1629  CTATACCAAGCAGTTGTCTCCTAACTTGGATCTGGACCCGCTGGAATTAATTGCCTTGGCAAACAGATTTTGCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTATACCAAGCAGTTGTCTCCTAACTTGGATCTGGACCCGCTGGAATTAATTGCCTTGGCAAACAGATTTTGCC  1702

Query 1703  TGCCACACTTGGTTGCACTTGCAGAACAGCATGCCGTTCAGGAGTTGACCAAAGCCGCCACGAGTGGCGTGGGC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGCCACACTTGGTTGCACTTGCAGAACAGCATGCCGTTCAGGAGTTGACCAAAGCCGCCACGAGTGGCGTGGGC  1776

Query 1777  ATTGACGGAGAAGTGCTCTCTTACTTGGAATTGGCTCAGTTTCACAATGCCCACCAGTTGGCCGCCTGGTGTTT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATTGACGGAGAAGTGCTCTCTTACTTGGAATTGGCTCAGTTTCACAATGCCCACCAGTTGGCCGCCTGGTGTTT  1850

Query 1851  GCACCACATCTGCACCAACTACAACAGTGTATGCTCCAAGTTCCGTAAGGAAATCAAATCAAAATCTGCAGACA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCACCACATCTGCACCAACTACAACAGTGTATGCTCCAAGTTCCGTAAGGAAATCAAATCAAAATCTGCAGACA  1924

Query 1925  ACCAGGAATACTTCGAGCGGCACCGCTGGCCCCCTGTGTGGTACCTGAAGGAAGAAGATCACTACCAGCGTGTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACCAGGAATACTTCGAGCGGCACCGCTGGCCCCCTGTGTGGTACCTGAAGGAAGAAGATCACTACCAGCGTGTG  1998

Query 1999  AAAAGGGAACGAGAGAAGGAAGATATTGCACTAAATAAGCATCGCTCAAGACGAAAGTGGTGCTTCTGGAATTC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AAAAGGGAACGAGAGAAGGAAGATATTGCACTAAATAAGCATCGCTCAAGACGAAAGTGGTGCTTCTGGAATTC  2072

Query 2073  ATCTCCAGCAGTGGCC  2088
            ||||||||||||||||
Sbjct 2073  ATCTCCAGCAGTGGCC  2088