Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07529
• Subject: XM_016999985.1
• Aligned Length: 1440
• Identities: 1196
• Gaps: 231

Alignment

Query    1  ATGAGCGATGTTACCATTGTGAAAGAAGGTTGGGTTCAGAAGAGGGGAGAATATATAAAAAACTGGAGGCCAAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ATACTTCCTTTTGAAGACAGATGGCTCATTCATAGGATATAAAGAGAAACCTCAAGATGTGGATTTACCTTATC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCCTCAACAACTTTTCAGTGGCAAAATGCCAGTTAATGAAAACAGAACGACCAAAGCCAAACACATTTATAATC  222
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------ATGAAAACAGAACGACCAAAGCCAAACACATTTATAATC  39

Query  223  AGATGTCTCCAGTGGACTACTGTTATAGAGAGAACATTTCATGTAGATACTCCAGAGGAAAGGGAAGAATGGAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   40  AGATGTCTCCAGTGGACTACTGTTATAGAGAGAACATTTCATGTAGATACTCCAGAGGAAAGGGAAGAATGGAC  113

Query  297  AGAAGCTATCCAGGCTGTAGCAGACAGACTGCAGAGGCAAGAAGAGGAGAGAATGAATTGTAGTCCAACTTCAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  114  AGAAGCTATCCAGGCTGTAGCAGACAGACTGCAGAGGCAAGAAGAGGAGAGAATGAATTGTAGTCCAACTTCAC  187

Query  371  AAATTGATAATATAGGAGAGGAAGAGATGGATGCCTCTACAACCCATCATAAAAGAAAGACAATGAATGATTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  188  AAATTGATAATATAGGAGAGGAAGAGATGGATGCCTCTACAACCCATCATAAAAGAAAGACAATGAATGATTTT  261

Query  445  GACTATTTGAAACTACTAGGTAAAGGCACTTTTGGGAAAGTTATTTTGGTTCGAGAGAAGGCAAGTGGAAAATA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  262  GACTATTTGAAACTACTAGGTAAAGGCACTTTTGGGAAAGTTATTTTGGTTCGAGAGAAGGCAAGTGGAAAATA  335

Query  519  CTATGCTATGAAGATTCTGAAGAAAGAAGTCATTATTGCAAAGGATGAAGTGGCACACACTCTAACTGAAAGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  336  CTATGCTATGAAGATTCTGAAGAAAGAAGTCATTATTGCAAAGGATGAAGTGGCACACACTCTAACTGAAAGCA  409

Query  593  GAGTATTAAAGAACACTAGACATCCCTTTTTAACATCCTTGAAATATTCCTTCCAGACAAAAGACCGTTTGTGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  410  GAGTATTAAAGAACACTAGACATCCCTTTTTAACATCCTTGAAATATTCCTTCCAGACAAAAGACCGTTTGTGT  483

Query  667  TTTGTGATGGAATATGTTAATGGGGGCGAGCTGTTTTTCCATTTGTCGAGAGAGCGGGTGTTCTCTGAGGACCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  484  TTTGTGATGGAATATGTTAATGGGGGCGAGCTGTTTTTCCATTTGTCGAGAGAGCGGGTGTTCTCTGAGGACCG  557

Query  741  CACACGTTTCTATGGTGCAGAAATTGTCTCTGCCTTGGACTATCTACATTCCGGAAAGATTGTGTACCGTGATC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  558  CACACGTTTCTATGGTGCAGAAATTGTCTCTGCCTTGGACTATCTACATTCCGGAAAGATTGTGTACCGTGATC  631

Query  815  TCAAGTTGGAGAATCTAATGCGGGACAAAGATGGCCACATAAAAATTACAGATTTTGGACTTTGCAAAGAAGGG  888
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  632  TCAAGTTGGAGAATCTAATGCTGGACAAAGATGGCCACATAAAAATTACAGATTTTGGACTTTGCAAAGAAGGG  705

Query  889  ATCACAGATGCAGCCACCATGAAGACATTCTGTGGCACTCCAGAATATCTGGCACCAGAGGTGTTAGAAGATAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  706  ATCACAGATGCAGCCACCATGAAGACATTCTGTGGCACTCCAGAATATCTGGCACCAGAGGTGTTAGAAGATAA  779

Query  963  TGACTATGGCCGAGCAGTAGACTGGTGGGGCCTAGGGGTTGTCATGTATGAAATGATGTGTGGGAGGTTACCTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780  TGACTATGGCCGAGCAGTAGACTGGTGGGGCCTAGGGGTTGTCATGTATGAAATGATGTGTGGGAGGTTACCTT  853

Query 1037  TCTACAACCAGGACCATGAGAAACTTTTTGAATTAATATTAATGGAAGACATTAAATTTCCTCGAACACTCTCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  854  TCTACAACCAGGACCATGAGAAACTTTTTGAATTAATATTAATGGAAGACATTAAATTTCCTCGAACACTCTCT  927

Query 1111  TCAGATGCAAAATCATTGCTTTCAGGGCTCTTGATAAAGGATCCAAATAAACGCCTTGGTGGAGGACCAGATGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  928  TCAGATGCAAAATCATTGCTTTCAGGGCTCTTGATAAAGGATCCAAATAAACGCCTTGGTGGAGGACCAGATGA  1001

Query 1185  TGCAAAAGAAATTATGAGACACAGTTTCTTCTCTGGAGTAAACTGGCAAGATGTATATGATAAAAAGCTTGTAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002  TGCAAAAGAAATTATGAGACACAGTTTCTTCTCTGGAGTAAACTGGCAAGATGTATATGATAAAAAGCTTGTAC  1075

Query 1259  CTCCTTTTAAACCTCAAGTAACATCTGAGACAGATACTAGATATTTTGATGAAGAATTTACAGCTCAGACTATT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076  CTCCTTTTAAACCTCAAGTAACATCTGAGACAGATACTAGATATTTTGATGAAGAATTTACAGCTCAGACTATT  1149

Query 1333  ACAATAACACCACCTGAAAAATGTCA-----------------------GCAATCAG-----------------  1366
            ||||||||||||||||||||||.|.|                       .||||.||                 
Sbjct 1150  ACAATAACACCACCTGAAAAATATGATGAGGATGGTATGGACTGCATGGACAATGAGAGGCGGCCGCATTTCCC  1223

Query 1367  ---ATTGTGGCATGCTGGGTAACTGGA--AAAAA  1395
               |||.|  |.|.||..|.||.||||  |.|| 
Sbjct 1224  TCAATTTT--CCTACTCTGCAAGTGGACGAGAA-  1254