Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07531
• Subject: XM_017316913.1
• Aligned Length: 1280
• Identities: 1085
• Gaps: 46

Alignment

Query    1  ATGGATAAAAACATTGGCGAGCAACTCAATAAAGCGTATGAAGCCTTCCGGCAGGCATGCATGGATAGAGATTC  74
            |||||||||||||||||.|||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATAAAAACATTGGTGAGCAACTCAATAGAGCATATGAAGCCTTCCGACAGGCATGCATGGATAGAGATTC  74

Query   75  TGCAGTAAAAGAATTACAGCAAAAGACTGAGAACTATGAGCAGAGAATACGTGAACAACAGGAACAGCTGTCAC  148
            .|||||||.|||..|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||.
Sbjct   75  AGCAGTAAGAGAGCTACAGCAAAAGACTGAGAACTATGAACAAAGAATACGCGAGCAACAGGAACAGCTGTCAT  148

Query  149  TTCAACAGA--CTATTATTGACAAGCTAAAATCTCAGTTACTTCTTGTGAATTCCACTCAAGATAACAATTATG  220
            |||||||.|  |||  |||||||.|||.|||||.|||.|||||||.|||.||||.|.||.||||||||.|||||
Sbjct  149  TTCAACAAAACCTA--ATTGACAGGCTGAAATCACAGCTACTTCTCGTGGATTCTAGTCGAGATAACAGTTATG  220

Query  221  GCTGTGTTCCTCTGCTTGAAGACAGTGAAACAAGAAAGAATAATTTGACTCTTGATCAGCCACAAGATAAAGTG  294
            |||.|||.|||.||||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||||||
Sbjct  221  GCTATGTACCTTTGCTTGAAGACAGTGACAGAAGGAAGAATAATTTGACCCTTGATGAACCACATGATAAAGTG  294

Query  295  ATTTCAGGAATAGCAAGAGAAAAACTACCAAAGGTAAGAAGACAAGAGGTTTCTTCTCCTAGAAAAGAAACTTC  368
            |....|||||.|...|||||.||.|.|.|||||||.|||.|||||||.|||||||   ||.||||||||   ||
Sbjct  295  AAACTAGGAACACTGAGAGATAAGCAATCAAAGGTGAGACGACAAGAAGTTTCTT---CTGGAAAAGAA---TC  362

Query  369  AG-CAAGGAGTCTTGGCAGTCCTTTGCTCCATGAAAGGGGTAATATAGAGAAGACTTTCTGGGATCTGAAAGAA  441
            .| ||||| ||||...||..|||.|||..||.|||||||.||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  363  CGCCAAGG-GTCTCAACATCCCTCTGCATCACGAAAGGGATAATATAGAGAAGACTTTCTGGGACCTTAAAGAA  435

Query  442  GAATTTCATAAAATATGCATGCTAGCAAAAGCACAGAAAGACCACTTAAGCAAACTTAATATACCAGACACTGC  515
            ||||||||||..||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||
Sbjct  436  GAATTTCATAGGATTTGCTTGCTAGCAAAAGCACAGAAAGATCACTTAAGCAAACTTAATATACCAGATATTGC  509

Query  516  AACTGAAACACAGTGCTCTGTGCCTATACAGTGTACGGATAAAACAGATAAACAAGAAGCGCTGTTTAAGCCTC  589
            ||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  510  AACTGACACACAGTGTTCTGTGCCTATACAGTGTACTGATAAAACAGAGAAACAAGAAGCGCTGTTTAAGCCCC  583

Query  590  AGGCTAAAGATGATATAAATAGAGGTGCACCATCCATCACATCTGTCACACCAAGAGGACTGTGCAGAGATGAG  663
            ||||||||||||||||||||||||||....|.|.|.|||||.||||||||||||||||||||.||.|.||||||
Sbjct  584  AGGCTAAAGATGATATAAATAGAGGTATGTCGTGCGTCACAGCTGTCACACCAAGAGGACTGGGCCGGGATGAG  657

Query  664  GAAGACACCTCTTTTGAATCACTTTCTAAATTCAATGTCAAGTTTCCACCTATGGACAATGACTCAACTTTCTT  737
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||..|
Sbjct  658  GAAGATACCTCTTTTGAATCACTTTCTAAATTCAATGTCAAGTTTCCGCCTATGGACAATGACTCTATTTTTCT  731

Query  738  ACATAGCACTCCAGAGAGACCCG-GCATCCTTAGTCCTGCCACGTCTGAGGTAGTGTGCCAAGAGAAATTTAAT  810
            |||||||||||||||| |.|||| ||||||||..|||||||||..|||||..|||||||||.||...|||||||
Sbjct  732  ACATAGCACTCCAGAG-GCCCCGAGCATCCTTGCTCCTGCCACACCTGAGACAGTGTGCCAGGACCGATTTAAT  804

Query  811  ATGGAGTTCAGAGACAACCCAGGGAACTTTGTTAAAACAGAAGAAACTTTATTTGAAATTCAGGGAATTGACCC  884
            |||||..||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  805  ATGGAAGTCAGAGACAACCCAGGAAACTTTGTTAAAACAGAAGAAACTTTATTTGAAATTCAGGGAATTGACCC  878

Query  885  CATAGCTTCAGCTATACAAAACCTTAAAACAACTGACAAAACAAAGCCCTCAAATCTCGTAAACACTTGTATCA  958
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||                 
Sbjct  879  CATAACTTCAGCTATACAAAACCTTAAAACAACTGACAAAACAAACCCCTCAAATCT-----------------  935

Query  959  GGACAACTCTGGATAGAGCTGCGTGTTTGCCACCTGGAGACCATAATGCATTATATGTAAATAGCTTCCCACTT  1032
                         ||||||..|||||||||||.||||||||||.||||..||.||||||||||..|||||||||
Sbjct  936  -------------TAGAGCGACGTGTTTGCCAGCTGGAGACCACAATGTGTTCTATGTAAATACGTTCCCACTT  996

Query 1033  CTGGACCCATCTGATGCACCTTTTCCCTCACTCGATTCCCCGGGAAAAGCAATCCGAGGACCACAGCAGCCCAT  1106
            |..|||||..||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||..||||||||||||||||||||.|
Sbjct  997  CAAGACCCGCCTGACGCACCTTTTCCCTCACTGGATTCCCCAGGAAAGGCTGTCCGAGGACCACAGCAGCCCTT  1070

Query 1107  TTGGAAGCCCTTTCCTAATCAAGACAGTGACTCGGTGGTACTAAGTGGCACAGACTCAGAACTGCATATACCTC  1180
            |||||||||.||||.|||.|||||||.|||||..|||||||.|||||...||||||||||.||.|.||.|||||
Sbjct 1071  TTGGAAGCCTTTTCTTAACCAAGACACTGACTTAGTGGTACCAAGTGATTCAGACTCAGAGCTCCTTAAACCTC  1144

Query 1181  GAGTATGTGAATTCTGTCAAGCAG-TTTTCCCACCATCCATTACATCCAGGGGGGATTTCCTTCGGCATCTTAA  1253
            .|||.|||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1145  TAGTGTGTGAATTCTGTCAAG-AGCTTTTCCCACCATCCATTACATCCAGAGGGGATTTCCTCCGGCATCTTAA  1217

Query 1254  TTCACACTTCAATGGAGAGACT  1275
            |.|||||||.|||||.||||||
Sbjct 1218  TACACACTTTAATGGGGAGACT  1239