Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07541
• Subject: NM_011811.4
• Aligned Length: 1769
• Identities: 1546
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGCCGACTGTCAGCGTGAAGCGTGATCTGCTCTTCCAAGCCCTGGGCCGCACCTACACTGACGAAGAATTTGA  74
            |||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct    1  ATGCCGACTGTCAGCGTAAAGCGAGACCTGCTCTTCCAAGCCCTGGGCCGGACCTACACTGATGAAGAGTTTGA  74

Query   75  TGAACTATGTTTTGAATTTGGTCTGGAGCTTGATGAAATTACATCTGAGAAGGAAATAATAAGTAAAGAACAAG  148
            .|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.||||.|||||.||.|||||||
Sbjct   75  CGAACTGTGTTTTGAATTTGGTCTGGAACTTGATGAAATTACTTCTGAAAAGCAAATCATAAGCAAGGAACAAG  148

Query  149  GTAATGTAAAGGCAGCA-GGAGCCTCTGATGTTGTTCTTTACAAAATTGACGTCCCTGCCAATAGATATGATCT  221
            ||.|||..|||||| || ||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  149  GTCATGGGAAGGCA-CAGGGGGCCTCAGATGTTGTGCTTTACAAGATTGACGTCCCTGCCAACAGATACGACCT  221

Query  222  CCTGTGTCTGGAAGGATTGGTTCGAGGACTTCAGGTCTTCAAAGAAAGGATAAAGGCTCCAGTGTATAAACGGG  295
            ||||||||||||||||.|||.|||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.|
Sbjct  222  CCTGTGTCTGGAAGGACTGGCTCGGGGCCTCCAGGTCTTCAAAGAAAGGATCAAAGCTCCGGTATATAAGCGAG  295

Query  296  TAATGCCTGATGGAAAAATCCAGAAATTGATTATCACAGAAGAGACAGCTAAGATACGTCCTTTTGCGGTAGCA  369
            |.|||||..|.|||.|.|||||.||..||.|||||||||||||||||||.||..|.||.||||||||.||||||
Sbjct  296  TGATGCCCAAGGGAGACATCCAAAAGCTGGTTATCACAGAAGAGACAGCCAAAGTGCGCCCTTTTGCTGTAGCA  369

Query  370  GCAGTTCTCCGTAATATAAAGTTTACTAAAGATCGATATGACAGCTTCATTGAACTTCAGGAGAAATTACATCA  443
            |||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||
Sbjct  370  GCAGTTCTCCGGAATATCAAGTTCACTAAAGACCGATATGACAGCTTCATTGAACTTCAGGAGAAACTACACCA  443

Query  444  GAATATTTGCAGGAAAAGAGCACTGGTTGCCATTGGTACCCATGATTTGGACACTTTGTCGGGCCCATTTACTT  517
            ||||||.||||||||||||||..|||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  444  GAATATCTGCAGGAAAAGAGCGTTGGTTGCTATTGGAACTCACGACTTGGACACTTTATCAGGCCCATTTACTT  517

Query  518  ATACTGCAAAGCGTCCTTCAGATATCAAATTCAAGCCTCTAAATAAGACCAAGGAGTATACAGCCTGTGAACTG  591
            |.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.|.
Sbjct  518  ACACCGCGAAACGTCCTTCAGATATCAAATTCAAGCCTCTGAATAAGACCAAGGAGTATACAGCTTGTGAATTA  591

Query  592  ATGAACATATACAAGACTGACAATCACCTGAAACATTATTTACATATCATTGAAAACAAACCCCTGTATCCAGT  665
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||..||.||||||||||||||
Sbjct  592  ATGAACATATACAAGACTGACAACCACCTTAAACATTATTTACATATCATTGAAAGTAAGCCCCTGTATCCAGT  665

Query  666  TATCTATGATAGCAATGGTGTCGTCCTTTCAATGCCTCCCATCATCAATGGGGATCATTCCAGAATAACAGTAA  739
            |||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||.|||||||.|.|||||||||||
Sbjct  666  TATCTATGACAGCAATGGTGTGGTCCTGTCGATGCCTCCGATTATAAATGGGAATCATTCAAAAATAACAGTAA  739

Query  740  ATACTAGAAATATTTTTATTGAATGCACGGGAACTGACTTTACTAAGGCAAAAATAGTTCTTGATATTATTGTC  813
            |||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  740  ATACTAGGAATATATTTATTGAATGCACAGGGACTGACTTCACTAAAGCAAAAATCGTGCTTGACATTATTGTC  813

Query  814  ACCATGTTCAGTGAATATTGTGAGAATCAATTTACGGTCGAAGCTGCTGAAGTGGTTTTTCCTAATGGAAAATC  887
            |||||||||||||||.|.|||||.|||||.|||||.||.|||||.|.||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct  814  ACCATGTTCAGTGAACACTGTGAAAATCAGTTTACAGTTGAAGCAGTTGAAGTAGTTTCTCCTAATGGAAAATC  887

Query  888  ACATACCTTTCCAGAATTAGCTTACCGAAAGGAGATGGTGAGAGCTGACCTAATTAACAAAAAAGTTGGAATCA  961
            |..||||||||||||..|..|||||.||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  888  AAGTACCTTTCCAGAGCTGCCTTACAGAAAGGAGATGGTGAGAGCTGATTTAATTAACAAGAAAGTTGGAATCA  961

Query  962  GAGAAACTCCAGAAAATCTTGCCAAACTTCTGACCAGGATGTATTTAAAATCAGAAGTCATAGGTGATGGGAAT  1035
            ||||||||||.|.||||||.|||||.||.|||||||||||||.|.|.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  962  GAGAAACTCCTGCAAATCTCGCCAAGCTCCTGACCAGGATGTGTCTGAAGTCAGAAGTCATAGGTGACGGCAAT  1035

Query 1036  CAGATTGAGATTGAAATCCCTCCAACCAGAGCTGACATTATCCATGCATGTGATATTGTAGAAGATGCAGCTAT  1109
            |||||||||.|||||||.|||||.||||||||.||..|.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 1036  CAGATTGAGGTTGAAATTCCTCCGACCAGAGCAGATGTCATCCATGCATGTGACATTGTGGAGGACGCAGCTAT  1109

Query 1110  TGCTTATGGATATAACAACATTCAGATGACTCTCCCGAAAACTTACACCATAGCTAATCAATTTCCTCTTAATA  1183
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1110  TGCTTATGGCTATAACAACATTCAGATGACTCTGCCGAAAACGTACACCATAGCTAATCAATTTCCTCTCAACA  1183

Query 1184  AGCTCACTGAACTTCTCCGACATGACATGGCAGCCGCTGGCTTCACTGAAGCACTTACCTTTGCCCTGTGCTCC  1257
            |||||||.||.||.|||.|||.|||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1184  AGCTCACCGAGCTCCTCAGACTTGACATGGCTGCGGCTGGCTTCACCGAAGCACTGACTTTTGCTCTGTGCTCC  1257

Query 1258  CAAGAAGATATTGCTGATAAACTAGGTGTGGATATCTCTGCAACAAAGGCAGTCCACATAAGTAATCCTAAAAC  1331
            |||||||||||||||||.||.||.||..|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  CAAGAAGATATTGCTGACAAGCTTGGCCTGGATATCTCTGCAACAAAGGCAGTGCACATAAGTAATCCTAAAAC  1331

Query 1332  AGCTGAATTTCAGGTGGCACGCACTACCCTTCTTCCTGGCCTCCTGAAGACCATAGCAGCAAATCGTAAGATGC  1405
            .|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 1332  CGCTGAGTTCCAGGTGGCGCGCACTACCCTTCTTCCTGGCCTTCTAAAGACCATTGCAGCAAACCGGAAGATGC  1405

Query 1406  CCCTTCCACTGAAACTGTTTGAAATCTCTGACATTGTAATAAAAGATTCTAATACAGATGTAGGTGCAAAAAAC  1479
            |||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||...|.||||||||||||.||||||
Sbjct 1406  CCCTTCCTCTCAAACTGTTTGAAATCTCTGACGTTGTAGTAAAAGATTCTGGCAAAGATGTAGGTGCGAAAAAC  1479

Query 1480  TACAGACATCTCTGTGCTGTTTATTACAACAAGAATCCTGGGTTTGAGATCATTCATGGGCTGCTGGACAGAAT  1553
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||||..|||||||||||||
Sbjct 1480  TACAGGCATCTCTGTGCTGTTTATTACAACAAGACTCCCGGGTTTGAGATCATCCATGGCTTGCTGGACAGAAT  1553

Query 1554  TATGCAGTTGCTCGATGTGCCTCCTGGTGAAGACAAG-GGGGGATATGTGATCAAAGCATCAGAAGGGCCTGCT  1626
            |||||||.||||||||||||||||||||||.|| ||| |||||.||..||||||||||.||.|.|||..||||.
Sbjct 1554  TATGCAGCTGCTCGATGTGCCTCCTGGTGAGGA-AAGCGGGGGCTACATGATCAAAGCGTCTGCAGGTTCTGCC  1626

Query 1627  TTCTTCCCCGGGCGATGTGCAGAGATTTTTGCCAGGGGTCAAAGCGTCGGGAAGCTTGGGGTCCTTCATCCTGA  1700
            ||.|||||.||.||.|||||.|||||.||||...|.|||||||||.|.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1627  TTTTTCCCTGGACGGTGTGCTGAGATCTTTGTTGGAGGTCAAAGCATTGGGAAGCTAGGCGTCCTTCATCCTGA  1700

Query 1701  CGTTATCACCAAATTTGAGCTGACCATGCCCTGCTCCTCCCTAGAAATCAATATTGGACCCTTTTTG  1767
            .||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||..|||||||||
Sbjct 1701  TGTTATCACCAAATTTGAGCTGACCATGCCCTGTTCCTCTCTGGAAATCAATATTGAGCCCTTTTTG  1767